| Input
| Putative repression domain
|
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| AT2G30130.1 |
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|
| Ortholog
| Putative repression domain
| Reverse top hit
| Relation
| Blast score ratio
| Type
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| Sb018408 |
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not found in 331aa |
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III |
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Get alignment file
Get formatted file made by BOXSHADE
Sequence file prepared (0 sec required). Alignment has started.
CLUSTAL format alignment by MAFFT FFT-NS-2 (v7.475)
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Sb026254_Sorbi1 PLPPQIARSLPQSLTTRRRLRQVPRSSPGPVAAALHQFPGSSSEFGLVFAG-DEHRQGSR
AT2G30130.1 ------------------------------------------------------------
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Sb016397_Sorbi1 ------------------------------------------------------------
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Sb026254_Sorbi1 K-------FLRR----KCQPDCVFAPYFPPDNPQKFVHVHRVF-------------GASN
:* * . **.
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Sb026254_Sorbi1 VTKLLNELHPFQREDAVNSL--AYEA-DMRLRDPV------------------------Y
: :: * ..*: ...* : * : * :
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Sb016397_Sorbi1 GCVGAISYLQQQVSQLQVQLALAKAEILCVQMQHD----------------------ESA
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Sb018408_Sorbi1 GCVGAISFLQNQVSQLQMQLAVAQAEILCIQMQRRDDVD-------------GGGGGPNV
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Sb026254_Sorbi1 GCVGVISILQHNLRQLQQDLARAKYELSKYQAA-A------------------AASASTA
* . . . .* .
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Sb032270_Sorbi1 ---------------------A--------VLPSSHASQLLAASAAGRGLHAGSR-----
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Sb008940_Sorbi1 ---------------------GGGNR---LIDDDAHATASFVAPASAP-VHVNDV-----
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:
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Sb008940_Sorbi1 -------------STSSAVYVAEAEQPAST------------NHYSSRNPSEHPA-----
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BoxShade v3.31 C (beta, 970507) Output
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