| Input
| Putative repression domain
|
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| AT2G30130.1 |
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|
| Ortholog
| Putative repression domain
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| Gm031502 |
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AT2G30130.1 |
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II |
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II |
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AT2G30130.1 |
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III |
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III |
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AT5G66870.1 |
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III |
Get sequence file
Get alignment file
Get formatted file made by BOXSHADE
Sequence file prepared (0 sec required). Alignment has started.
CLUSTAL format alignment by MAFFT FFT-NS-2 (v7.475)
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AT2G30130.1 ------------SSPCASCKLLRRRCAKDCIFAPYFPPDDPHKFAIVHKVFGASNVSKML
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gm021573_Glyma0 ------------MSPCAACKLLRRRCTRDCVFAPYFPADEPQKFGSVHKVFGASNVNKML
* ::*** : :* .*::*****: *:*
AT2G30130.1 QELPVHQRADAVNSLVFEANARVRDPVYGCVGAISYLQNQVSQLQMQLAVAQAEILCIQM
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gm031502_Glyma1 QELPIHQRADAVSSLVYEANARVRDPVYGCVGAISYLQNQVSQLQMQLAVAQTEILCIQM
gm010535_Glyma0 MEVPECQRADAANSLVYEANVRLRDPVYGCMGAISALQQQVQSLQAELNAVRGEILKYK-
gm023827_Glyma0 QDLPMHQRGDAVSSMVYEANARVRDPVYGCVGAISSLQQQIDVLQTQLARAQAEVAHLRV
gm044124_Glyma1 NEVQPHQREDAVNSLAYEAEARIKDPVYGCVGAISVLQRQVIRLQKELDATSADLIR---
gm048790_Glyma1 QELPIHQRADAVSSLVYEANARVRDPVYGSVGAISYLQSQVSQLQMQLAVAQAEILCIQM
gm055039_Glyma2 QELPESQRADAVSSMVYEANARIRDPVYGCAGAICQLQKQVSELQAQLAKAQAEVVNMQC
gm053637_Glyma2 QDLPEHQRGDAVSSMVYEANARVRDPVYGCVGAISSLQQQIDVLQTQLAVAQAEAVHLRV
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gm009557_Glyma0 NELNAAQREDAIKSLAYEAEARLRDPVYGCVGLISILQHRLKQLQSELHRAKKELASYVG
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gm005177_Glyma0 QELPVHQRADAVSSLVYEANARVRDPVYGCVGAISYLQNQVSELQMQLAVAQAEILCIQM
gm051368_Glyma1 NEVQPHQREDAVNSLAYEAEARIKDPVYGCVGAISVLQRQVIRLQKELDATNADLIRYT-
gm001871_Glyma0 NELSAAQRDDAVKSLAYEAEARLRDPVYGCVGLISVLQHKLRQIQVELNNAKKELATYIG
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gm036494_Glyma1 NDLHPHQREDAVNSLAYEAEMRLRDPVYGCVGVISLLQHQLRQLQMDLYCAKSELSR---
gm042027_Glyma1 QDLPMHQRGDAVSSMVYEANARVRDPVYGCVGAISSLQQQIDVLQTQLALAQAEVAHLRA
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gm028397_Glyma1 QELPESQREDAVSSMVYEANARIRDPVYGCAGAICQLQKQVSELQAQLAKAQAEVVNMQC
gm030990_Glyma1 QELPESQRADAVTSMVYEASARIRDPVYGCAGAICQLQKQVNELQAQLAKAQGELVNMQL
gm010185_Glyma0 NELLPHQREDAVNSLAYEAEARVRDPVYGCVGAISFLQRQVQKLQKELDSANADLLRFA-
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gm021573_Glyma0 QELPEHQRSDAVSSMVYEANARVRDPVYGCVGAISSLQQQVDVLQTQLALAQAEVVHMRM
:: ** *: *:.:** *::*****. * *. ** :: :* :*
AT2G30130.1 -Q-----------------------------------------------NEPTL------
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gm051368_Glyma1 ---CN----------EM----------------------------------PTT------
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gm050795_Glyma1 --ACN----------EM----------------------------------PNL------
gm036494_Glyma1 ------------------------------------------------------------
gm042027_Glyma1 RQNRC---------------------------------------FSHHGLRPTS------
gm039058_Glyma1 -E-----------------------------------------------HEPVM------
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gm048472_Glyma1 -Q-----------------------------------------------QEPLM------
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gm005195_Glyma0 AAATA----TTTPSNST----------------------------------SHDAFFNAH
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gm010185_Glyma0 ---CN----------DM----------------------------------PPPSL----
gm019156_Glyma0 RQTAS---------------------------------------LYS----PTS------
gm031876_Glyma1 AATAAATTTTTT---SI----------------------------------PSPDILHAN
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gm011722_Glyma0 ------------------------------------TTHHGGRRMSDDGGG---------
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gm005177_Glyma0 -----------------------------------PAASGI-------------------
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gm001871_Glyma0 -QQHPNNPFPGAMYGNMPTATAAVHGGQLVIRDAQPAPQQQQQQILEAQQLAAAVAAREQ
gm050795_Glyma1 ----------------------------------------GGRSRIGDI-----------
gm036494_Glyma1 ------------------TCLVLVL--------FFPRDQHQQQQVVRS------------
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