fioreDB : Database for Flower Bio-engineering by CRES-T system
fioreDB : Database for Flower Bio-engineering by CRES-T system

Locus Common name Short description
AT1G70920 ATHB18 homeobox-leucine zipper protein 18 (.1)

>AT1G70920.1 genomic map

>>Show CDS map




Uncut enzymes: AscI, KpnI, NotI, PstI, SmaI, XhoI
Name Recognition sequence Cut positions
ApaI GGGCC|C 3060
BamHI G|GATCC 492, 1516, 2025
BglII A|GATCT 1923
EcoRI G|AATTC 143, 237, 7006, 7153
EcoRV GAT|ATC 875, 3370
HindIII A|AGCTT 1667, 3266, 3303, 4700, 6992
HpaI GTT|AAC 3014
NcoI C|CATGG 547, 796, 4168
NdeI CA|TATG 3340
NheI G|CTAGC 456, 485
PacI TTAAT|TAA 714, 3778, 5672, 7946
PvuII CAG|CTG 917, 1374
SacI GAGCT|C 2214, 4743
SalI G|TCGAC 1448
SpeI A|CTAGT 1743, 1787, 3716, 7319
StyI C|C[AT][AT]GG 547, 796, 2397, 3024, 4168
XbaI T|CTAGA 5804


Click here to view TAIR data

>AT1G70920 genomic sequence (4170-4245,4334-4536,4670-4749,6202-6463,) length:8209
aaggtccgtt ctctactcaa atctcgcata ttccttatgt catcactgag 
50
ctaaatcttt tctgtattat gattcaatcg tgtctatgct ttgtctctgt 
100
ttctccggta acctaattcg ttgcaaaatt aataattaga tagaattcga 
150
atctattgca tgcttaccag atcaattttg gataaattga atccagtaat 
200
ttacgaaact cttggaacaa ttagtgttaa tcctatgaat tcttgttgtt 
250
ttaaacagtt agagcaaatc taattataga tgacaggatc ttaaaacgac 
300
ttgtacctaa tttctcaatc tggcaaaact taatttatta gttagttgat 
350
tagtgttttt tttgtttcca aaattgcaat ttattgttaa tggtgaatgt 
400
ttttattttc ttgtggtgat tgtagcagta gctgaaatca atagtattaa 
450
gccaggctag ctagaccagc aagtaaattt gctggctagc aggatcctcA 
500
TGAGCCCTCA GAGCGTATCG AAGACTAGCA AATCCCTTGA GGGTGTCCAT 
550
GGGGTTCATG TTGTATCTCA TTCTCATTTC GGATTTGAAA GTATTGGCCA 
600
AGTCTCTGGC TTTGAGTCTG CGGATGCAGG AACAAAGCAG AGACTTTTCA 
650
TTGAgtaagt tcattggtta gggtgatgtc tagttcaaag atgtatttgg 
700
aaattagatg tttaattaag tgctctttct tttatcttct gtagACGTGT 
750
TTGGCAACAA AGACCTCCAT GCCTAAGACC CATCCATTGC AGCATCCATG 
800
gtactaatgc tactgtgtgc cttccatctt gttttcatct cagtgtgttg 
850
tttcgatctt ttggtattca ttacgatatc tgactttgtt gacagGTGAT 
900
CAGAGTATCT TAGAAACAGC TGCTAATGTG ATCACATCGA TCCCTTTCAT 
950
TTTCCTCGGT ATGCAGGCAC CGAGgtaatc atccttttct tgtctatctg 
1000
atcgtatata tacagtttta tgttctgtga aacagataat tgaatatgga 
1050
agatatattt gcgactgtag GAAAAACCTG AACATGAAGG TATATGCAAA 
1100
CTCCTTAATC GGAGTTGGAA TTGCATCGAG TTTGTATCAT TCTTCAAGAG 
1150
GGAAGTTTAG GAAGTACCTT AGATGGGCTG ATTACACAAT GATAGCTACA 
1200
GCGACAATAg taagtcttta atattactac ttgcaagtaa ctatcaatag 
1250
tacctctact tactatctgt ttgtatatgt gacagTGTCT AACGAGGGCG 
1300
CTTAGAGAAG AGAACCCAAA GTTCTTGATG GCTGCATCAG CTTTGGCTCT 
1350
ACCGTTTCAG CCTCTCGTGG TATCAGCTGT TCACACTGGA ATGATGGAGg 
1400
ttctataaga aatctcaact tttctcactc catttaacta aacctcggtc 
1450
gacgctaatc taacacaaat ctctcaactt ttgactcagG TAGCATTTGC 
1500
GAAACGAGCC TTAGAGGATC CGGATTTGAA AATGGCTCAT GATGTACACA 
1550
AGATGTCTTC GTTATTAGGC GGAGCATTGT TCATAGCTGA TGATCTTTTC 
1600
CCTGAAACAC CATTCATTCA CGCCGGTTGG CATCTCGCCG CAGCCATTGG 
1650
CGTTGGAACT TGCAATAAGC TTCTTCAGTA Atccacagta ccaactatat 
1700
tgagtgattg tggaactgcc acattcttgg cttaatgaaa ccactagtac 
1750
gtgtggtttc actaagctca taaatcagcc gacataacta gtagtagtca 
1800
tctctatctt taaatcaatg taaggaaccg aaacaagtca cctgttgtaa 
1850
tataaggaca aaggccactc gtctctatat attcgacttt gaacaaccat 
1900
gaagaaattg ccgaattgga gaagatcttg atgctaaatt gctgatacaa 
1950
ctttctaggt cgttatgggt tttaattagg cccattgggc tctgagttta 
2000
taacgctgcc gactatatcc gcttggatcc atgtggttac caccgttgtt 
2050
taattttctc ataaaaggga aatagaagat ttcctttttt ttggttttgg 
2100
ttttcctaat cctaactcgt ttaggttttg atatatctat atatatcgac 
2150
acactgccat tcttcttttt cattaaatct cttcagtaat tccatagaAT 
2200
GAGTGAGATT GAAGAGCTCG TGTGTATTGA AGCAAGTGTT ACGCGCAAAT 
2250
CTACATCAAA CACGGTGGAG ATCAGAGAAT CGCGTCGAAA CAAGGTTACT 
2300
TTAGGATCAA GCGATTCTCC TGCGTTCCCG ACCCCTCACC TCTTTTTGAA 
2350
AAACATCGTG AGCTTTGATG AACAAAGCAT GTATAATCTT CTCTATCCAA 
2400
GGCTCCAAGA TCCCAACTTA TGCAGTATTC TCTCCTTCAA GATCGCTTTC 
2450
GAAGCCAAGC GAGTTCCAGG GCCGTTGTAC ATCTCCTATG ACGTCACATT 
2500
AACCCCACAA ATATTCGAGG AACCAGACAT GGAAACATGC GGTCTTTGCT 
2550
TGTTGGAGGA ACAGCACTTA TTCGACATGC CAAATTGTGC GCATGTGTTT 
2600
CATGGTGATT GTATCGATAA GTGGTTAAGT ACAAGTAATA ATTGCCCTCT 
2650
CTGTGGTGTT GAAATTATGG ATGACGACGA GTGAcgagca tcgtcatgaa 
2700
gaaacgatta cgcattatga tattctgtat tgaaacctat cacttgattt 
2750
tttaatatgt taatgggaga atgttcctaa acgagatgta ctctccggtt 
2800
tggaaaggaa ctcatgaaat tgtttgtgtt aatctgcata ctaacctaaa 
2850
tatctaagca taatcggata ataaccttca cggcttcaca tcatgtcgaa 
2900
attgtgttat cagaatcaac aaagttgtgc gcgcgtatac aaacttgtga 
2950
ggaatttggt tcaattcgta agaacaaact tattcatcag aaccggagaa 
3000
aagacaacat atagttaacc ggaccaaggt cggctagata aaacaaaagc 
3050
aggtaatgag ggcccagaag cactccactt aggatacaaa agccgtaagg 
3100
catggatata ttggaggaaa tgacccgtaa atatatgaca tttgggtaat 
3150
ttgggtcatg catgcccatc ctaaccaatg ataacgagtt cattattaca 
3200
caatccgtgg aggatatgtg tataatatca tttaaaacta tatattatcc 
3250
caattaaaaa acgtcaagct taatctcctt tttttttaag ttcaaaaaca 
3300
tcaagcttaa tctaatatat atacagtaat aataataaac atatgtatat 
3350
aatgttacta atattgatag atatctatta aagaattttg ttaattattt 
3400
tattttttat ataatctata gattcgaaac tattagattt atatatttct 
3450
tatttatagt ttagatggta aatgatttaa gtttcagtta ttaaagatag 
3500
ctattgcttt atttttaaat ctacacggtt ttaatagatc catttaagta 
3550
tagaccattg tcatttgtct aagattattg catttgtaac gctcaacgca 
3600
taacaatgct ttgactaccc gttattgtcc cacacacggc cattactaaa 
3650
ccccaaaata caaattggca aaacattatt gtttgattat acgaatctga 
3700
tttgacttaa acgacactag tcaaacccct tattttcttt ccaaatccac 
3750
caatcacaca tatacacaca cctctttaat taaaatctat tcgttttttt 
3800
ttattccatc aacttaccac tggccattat atttctccct taaattttgt 
3850
tccttcgtat ttgacctgct tgaaagattt tttttttaat aatcttttgt 
3900
cgtgtttcat acttttaaat attttacata tttcgatatt tctcttatgc 
3950
ttaattcctt attccatatt ccacattcca cgcttatcac aaaatctttc 
4000
tcctttgtct cgcttttttc ttttgttctt tcacatgtgt atatacacac 
4050
agaacacaca cttacatttc tattatcata taaaacttca actttacctt 
4100
ttatcttcca aaaaaaacac tatcttcttc atcaaattct cttgattctg 
4150
tttcttttta tcctcctccA TGGCCCTCTC ACCTAATTCA AGCTCTTTAG 
4200
ATTTAACAAT CTCAATTCCG AGCTTCTCTC CATCTCCTTC ACTTGgtaag 
4250
atcatatcca aattaaagat ttattaaatc ttatatatta tatagtttta 
4300
atactatgtc ttccaattaa aataatttgg tagGTGATCA TCACGGGATG 
4350
AGAGATTTTG ACATAAACCA AACACCAAAG ACGGAAGAAG ATCGTGAGTG 
4400
GATGATCGGT GCAACACCAC ATGTCAACGA AGATGATAGC AACTCGGGTG 
4450
GCCGGCGGCG CAAAAAGCTC CGTCTAACGA AAGAACAATC ACATCTTCTT 
4500
GAAGAGAGTT TCATACAAAA CCATACCTTA ACCCCTgtaa gtatatatta 
4550
atggctccgt ctatgttttg cttacgttga atagagaaat aagaaagaga 
4600
aaagagttaa tcttttctga tgatcatgtc ggctgatgat gttttgggtg 
4650
gctgattatg aaaccacagA AGCAAAAAAA AGATTTGGCC ACCTTTTTGA 
4700
AGCTTAGTCA AAGGCAAGTT GAGGTGTGGT TTCAAAATCG AAGAGCTCGg 
4750
tacgtatata tctacctctt catatattac atcattcata cataaaatta 
4800
aattcgtata aatcgaagaa aataagaatt atatatcgta tgtttatata 
4850
tatacggcat gttatgtata tatatatata tatatatata tagggttttt 
4900
gaaaatatac tttttacttt ttaagtggtt gagaatattt taatatatga 
4950
gagtgcgttg acagaatatt atatctaaag agattgtgtc gtaacttaga 
5000
ttctcaacat aattcaccat atatacaatt atagtttagg aaaatgtagt 
5050
aaagtggaag tgatcctttt ttatccaagt gtttcacgtt gattcccaca 
5100
tatatagcta tcagttatca cccattttat gcgacacatg aaatcccgta 
5150
ctcttaattt atgtgcctac gtgtctatat ataaatgtcc aatgattcaa 
5200
aaatcaaaat atagaatgta ataaatgtat caacaagaaa aaagcgatag 
5250
ggaacatgag ggacaaagtt agagacaata aatgatctgt ttattttttc 
5300
agctcatctt tggccagtcc ataattatga tgtttgtccc atagagtata 
5350
catataactt taatgaaact taaacacact catacacttt ttgtgaatgt 
5400
tttctctata ttgtctatat attcacatac atctacacga atgtgtgtaa 
5450
atatatacat acatttgtta atgtataaat actaagatac atgtatatgc 
5500
atggtagata gagttagttc attaagtcca taaagaatgg atctaattgc 
5550
gttctataca taactctaca acgttataat tttgattaat gaagtgtgaa 
5600
gagcctctat aattttcaat atctattttt cagttcgtaa aagtatcgta 
5650
gtagtgttat tttcagtttt taattaatgc cttaatgggg ccattttagt 
5700
ataattaaaa aaatacggaa cctgcatgtg tgaaaaaata tcagaataat 
5750
ggacatttga aacaaaagtt actgtattag tacaagaagt agaactgtag 
5800
acgtctagaa caatatgata tatcatatat gtcaagatga tcttcttctt 
5850
acgtatgggc attccgggtc aattaagcaa tcacttatat agtataacat 
5900
gtgaacacat attacacaca ggtttataaa cttatagtta tatgcaaagg 
5950
tcagtagaat agtcttctaa aagtagaaat ttatcaaaca ccaaactcgt 
6000
taatatatta ataaaattgg atatatatca aacaccaacc tatggatata 
6050
tatggttgca ttggttggta taggataaaa cctataactt acgtatggtg 
6100
taagtatatc ttgagactga tgcttcggcg aatgaaacta aaattatgca 
6150
tggccacatt aaccatcaat catggttaca caaaatctga tgtatatata 
6200
gGAGTAAGCT AAAGCACACG GAAATGGAAT GTGAGTATCT AAAAAGATGG 
6250
TTCGGATCGT TGAAGGAACA AAATCGACGG CTACAAATAG AAGTTGAAGA 
6300
ACTACGAGCG CTAAAGCCAT CATCGACCTC GGCTTTAACC ATGTGTCCTC 
6350
GGTGTGAACG TGTGACTGAT GCAGTAGATA ATGACTCTAA TGCCGTTCAA 
6400
GAGGGGGCAG TTCTTAGCAG CCGGTCACGG ATGACAATTT CCTCTTCCTC 
6450
TTCCCTCTGT TGActggttt ggtcgaagtc aaaagtcaaa agataaacgc 
6500
ctgtttcggg gtaaaaagca aagatttgat gatgattagg aggattttgt 
6550
gtatagtttg ctaattattt attacaaatt tacaaaccag tgaggaaaaa 
6600
agataattta attctcgatc tttaattagc tttttgtgtt atttattcat 
6650
aattttattt ttcgtgttta accaaaaaat agacaaaaca aatattgctt 
6700
ttcgtgtccc ttcggattga gttgtactat tgacttgaaa atagagctgt 
6750
tgattctgtg taagaagaca aaattaaaat attggatgaa aaattcagaa 
6800
atatatatat ttatatttat aaaaataaat aggaaggaga aaatttataa 
6850
aaatctaact aagaaatagc agcactagca actaaagttt atttgatgcg 
6900
caaggagaga ttattaaaac atcaattaac gtcattgtta tttgacttcc 
6950
acgagtctca aataaggctg ctaattattc catgacgtga aaagcttata 
7000
aaattgaatt ccgatggaga atttcaccta caaatcacct gatgtctttt 
7050
ccaaatgtat atatattttt tttaataacg attccaagta cttgttgtta 
7100
ttatttattt tttttttttt gcgttttttg tgttgtaatg gtttatagag 
7150
aggaattcat atttattttc gacaacacag aacccttatt cttaattcat 
7200
gtagtatttt ttacgcgatg ttaatatgtg aatagcttat agcatttatc 
7250
ttacattcaa tataaataat actccaatac tcgatcgtga agatttcatt 
7300
tcatgtttgc taaaatcgac tagttagtta ttcaaatctc ctcaattgct 
7350
tcaattcgtg tgacacgatt actgtttgtg gagctgttag cccattgggc 
7400
tttcttatta aattaattat tgggcttata aaacccaaaa ccgaattaaa 
7450
taaagttatt aaaaagtgaa gtcattttgg tttattcaat tccaatccac 
7500
actctatcat ccatattttt cagaaagttt tttttttggg tggtacaaaa 
7550
ttcaaaaagt attaaatgat aacacgtatg tgtattcaaa attctaatat 
7600
tactcttgga tttgtcaaaa agtgattcgt aacttaaaca gagagcaaat 
7650
tttagggaaa aatcaatatc tatgatcaaa gtatatagtt tagtccaaag 
7700
atcagagtaa acagaggaat gtgtgttcga attactgatc atgaaatgga 
7750
ttatgtgact ctggcattcc catgtgcttc tcacgtgctt tcattatgga 
7800
caagacgcgt gcatgtcaaa atgtcccgcg ctttttttct gacaatgtat 
7850
atgtggactc gtctcattgg tcagtgattc attattgtgg tgaaccgaac 
7900
tagctgttgt gtggtaagtg agaaataaga gactcattag tcattaatta 
7950
aaagtttaaa acatacagtt gaattacata aattataaac catgaatcag 
8000
gtccctgaag taaaacatac aattgttgaa agggagaatc atattaaaaa 
8050
ttcttgagaa ggtttataaa aatggtatgt ttagaggggg aaaaaacaaa 
8100
caaattactc tatttgattc ttaatcttgt aatttaaaga actcagaagt 
8150
attttaaact gaataaaact gtaaattgtt ttttatatga aaattagtgg 
8200
accatatat
8250