◆◆◆IE_04G07 detail◆◆◆

Code nameIE_04G07
LocusAT1G20910
TemplateIT_04G07 (HR3618)
Donor VectorpDONR207
Forward primerIPF_04G07 (ggggacaagtttgtacaaaaaagcaggcttcATGGTGGATACCGAAATGCAAGAGCAAG)
Reverse primerIPR_04G07 (ggggaccactttgtacaagaaagctgggttCTGCTCAAACGGAACTCGTATGAACAACCG)
Alignment with template seq.1stアミノ酸配列100%一致2nd-
Alignment with TAIR7CDSアミノ酸配列100%一致-
comment
sequence
>IE_04G07_1194bp
ATGGTGGATACCGAAATGCAAGAGCAAGATGTGACTTTTGGTGCCCTTGTTGAGACAAAGTATTTAGAGGAAGAACCTTTGGAGCCAGAAAATGATCACA
ACCCTAGTGAAATCCCGCAGCCCCTTCTTCTTGGAGATGGTCAGGCTAATAATGGTCATGGCATGAATGGTGGTGCTGTTGGAGTTGTTGACCACTCTGA
AAGGAAGACTCGTAGGGTGCAAATGTTGAGTCCTAAGACTGAAGGTGAGAATGCCAAAAAGAGGAAGACTTGGCTGCTGGATTCTGAGGCACAGGGAACT
GATGAAGCAGGGACACCGGTAGAACAAGTGGCGTTTCTAAGAGAAGTGGAGGCCTTTTACAAAGAGAGTTTCCTGGAATTTAAACCTCCTAAGTTTTATG
GACAGCCTTTAAACATTCTCAAGCTTTGGCGAGCAGTCGTGAACCTAGGTGGCTATGAAGTGGTCACCACAAATAAGCTGTGGCGGCAAGTTGGAGAATC
CTTCAATCCTCCCAAGACATGCACAACAGTCTCCTACACATTCCGCAATTTCTATGAGAAGGCACTTTTGGAGTACGAAAAGTGTTTAAGGAATAATGGT
GAGCTTAACCTTCCTGGTTCAACATTGATTCTGTCTTCCAGTGTCGAGAAAGAGCCAAGTAGCCATCAAGGTTCAGGGTCAGGCAGGGCACGAAGAGATT
CTGCAGCTCGTGCTATGCAAGGTTGGCATGCGCAGCGCCTTGTTGGATCTGGAGAGGTTACTGCGCCTGCTGTTAAGGATAAGGGCTTAATTTCCACCCC
AAAGCACAAGAAACTCAAAAGCATTGGGCTGCAAAAACACAAACAACAAACTAGCATGGACCATGTTGTTACAAATGAAGCTGACAAACAGTTGGCTGCT
GAGGTTGTTGATGTTGGACCCGTTGCTGACTGGGTGAAGATAAATGTCAAAGAATCTAAGGATTCCTTCGAGATATTTGCCTTGGTACCTGGACTTCTTC
GCAAAGAGGTTCGAATTCAATCAGATCCTGCGGGAAAGGTGGTTATAACAGGCCAGCCAGAGCAGCTTGACAATCCTTGGGGGATTACACCCTTCAAAAA
GATTGTTGACTTATCAGCAAGAATTGATCCGCTTCACACATCCGCGGTCATGAGCATGCATGGACGGTTGTTCATACGAGTTCCGTTTGAGCAG

>IE_04G07_translated
MVDTEMQEQDVTFGALVETKYLEEEPLEPENDHNPSEIPQPLLLGDGQANNGHGMNGGAVGVVDHSERKTRRVQMLSPKTEGENAKKRKTWLLDSEAQGT
DEAGTPVEQVAFLREVEAFYKESFLEFKPPKFYGQPLNILKLWRAVVNLGGYEVVTTNKLWRQVGESFNPPKTCTTVSYTFRNFYEKALLEYEKCLRNNG
ELNLPGSTLILSSSVEKEPSSHQGSGSGRARRDSAARAMQGWHAQRLVGSGEVTAPAVKDKGLISTPKHKKLKSIGLQKHKQQTSMDHVVTNEADKQLAA
EVVDVGPVADWVKINVKESKDSFEIFALVPGLLRKEVRIQSDPAGKVVITGQPEQLDNPWGITPFKKIVDLSARIDPLHTSAVMSMHGRLFIRVPFEQ
Alignment CDS(TAIRver.9)_without_stop_codonとのalignment

100%一致しました。

このページのTOPに戻る