◆◆◆IE_06E01 detail◆◆◆

Code nameIE_06E01
LocusAT5G60130
TemplateIT_06E01 (ABRC_106)
Donor VectorpDONR207
Forward primerIPF_06E01 (ggggacaagtttgtacaaaaaagcaggcttcATGGTACTACCCATTTCTTTCACCAGA)
Reverse primerIPR_06E01 (ggggaccactttgtacaagaaagctgggttTCCACTGATAATGTGAATCTTGATTGTTTG)
Alignment with template seq.1stアミノ酸配列100%一致2nd-
Alignment with TAIR7CDSアミノ酸配列100%一致-
comment
sequence
>IE_06E01_900bp
ATGGTACTACCCATTTCTTTCACCAGATTTTTACCAAAGTCTTTGCCTGAAACTGTAACTGTTAGAAGCATTTCTGGAAATATTTGGAAATTGGAGTTAA
AGAAATGTTGTGGTGATGATGATACTGAGAAATTCGTTATGGTTAATGGGTGGAAGAGGATTGTGAAGGACGAAGATCTCAAGGGAGGAGATTTCTTAGA
GTTTGAGTTTGATGGCTCTAGTTGTTTCCATTTCTGTATCTATGAGCATAGGACAATGTGTAAAAAGATAAGAAGAAGTTCAGATCAAAGCGAGGAGATC
AAAGTGGAATCTGATAGTGATGAACAAAATCAGGCCAGTGATGATGTTTTATCTCTTGATGAGGATGATGACGATTCTGATTATAATTGTGGTGAAGACA
ATGATAGTGATGATTATGCTGATGAAGCTGCTGTCGAGAAAGATGATAATGATGCTGATGATGAAGATGTTGATAATGTTGCTGATGATGTTCCTGTTGA
AGATGATGATTATGTTGAGGCTTTTGATTCTAGAGATCATGCTAAGGCTGATGATGATGATGAAGATGAAAGACAGTATCTGGATGATCGTGAGAACCCA
TCTTTTACTCTGATCCTTAATCCGAAGAAGAAAAGCCAACTGCTCATCCCAGCTCGGGTTATCAAAGACTATGACTTGCACTTCCCTGAGAGTATCACTC
TTGTCGATCCACTTGTGAAAAAATTCGGGACATTGGAGAAGCAGATCAAGATTCAGACAAATGGTAGTGTGTTTGTCAAGGGATTTGGCAGTATCATCAG
AAGGAATAAAGTGAAGACAACGGATAAGATGATATTTGAGATCAAGAAGACTGGTGATAATAACCTGGTTCAAACAATCAAGATTCACATTATCAGTGGA


>IE_06E01_translated
MVLPISFTRFLPKSLPETVTVRSISGNIWKLELKKCCGDDDTEKFVMVNGWKRIVKDEDLKGGDFLEFEFDGSSCFHFCIYEHRTMCKKIRRSSDQSEEI
KVESDSDEQNQASDDVLSLDEDDDDSDYNCGEDNDSDDYADEAAVEKDDNDADDEDVDNVADDVPVEDDDYVEAFDSRDHAKADDDDEDERQYLDDRENP
SFTLILNPKKKSQLLIPARVIKDYDLHFPESITLVDPLVKKFGTLEKQIKIQTNGSVFVKGFGSIIRRNKVKTTDKMIFEIKKTGDNNLVQTIKIHIISG

Alignment CDS(TAIRver.9)_without_stop_codonとのalignment

100%一致しました。

このページのTOPに戻る