◆◆◆IE_06G03 detail◆◆◆

Code nameIE_06G03
LocusAT2G26940
TemplateIT_06G03 (ABRC_170)
Donor VectorpDONR207
Forward primerIPF_06G03 (ggggacaagtttgtacaaaaaagcaggcttcATGAAGAGAACAAGAGACCTTTATGGT)
Reverse primerIPR_06G03 (ggggaccactttgtacaagaaagctgggttAGGATGATCTTCATGGTAAGGAGGCTGATT)
Alignment with template seq.1stアミノ酸配列100%一致2nd-
Alignment with TAIR7CDSアミノ酸配列100%一致-
comment
sequence
>IE_06G03_858bp
ATGAAGAGAACAAGAGACCTTTATGGTGATGAATCTTCTTCATCGGAATCTGAAGAGTTTCACCGGGAAAAAATCCGGGTGAAGGTGAAGTTACCGGAAG
AAAGAAGTGAAGATGAAGATGAGTCTCCTCAGCCTCAGAGGAAGCACTTTTGTGTGATTTGTGAGAAGCAGTTTAGCTCTGGTAAGGCTTATGGTGGTCA
CGTGAGGATCCACTCCATTGAGTACAATAACAAGGGAAAGATGAAGAAGATGAAGAAGATGAAGTTGAAGAAGAAGAAGAAGAGAAAGATTGGTTTGGTG
AAGAAAGAGAAGGAGAAAGAGATAGATCTGGCTAGGACTGACGTGGAAGGTAAGATTAGGTGTTGTCTTTGTGGAAAAGAGTTTCAAACAATGCACTCTT
TGTTTGGTCATATGAGGAGACATCCTGACCGGACTTGGAAAGGGATACGACCTCCTCCACCATCGGAGAAGTTCAATCTAAGCTACTTGGATGATGATGT
CGATGATGAAGATGAGGATGATGATGATGTGATGAGTAGATCCATGATGATGAGTGATGTACCCGAGGATGTTCAGGGAGCTGCTTGCATTCTAATGATG
CTCTCTTACGCTTCAAGAAATTACTGGGCTGGGATAGAGGAATCACCAAAATCCGAGGTAAGAAGTTCGAGTTTCTACAAAGATGATGAAGGAAAAGATA
AAGTATTAGGAGATAGTAGGATGGATGAAAAGAAGGGTTTGATTGTAGATATGAAGATAAAGATGGAAATGGAAGTGAAGGTGAATAGTCCTCGAGATGA
AGCTAAGAGGTCATTAGGGTTTGATCTCAATCAGCCTCCTTACCATGAAGATCATCCT

>IE_06G03_translated
MKRTRDLYGDESSSSESEEFHREKIRVKVKLPEERSEDEDESPQPQRKHFCVICEKQFSSGKAYGGHVRIHSIEYNNKGKMKKMKKMKLKKKKKRKIGLV
KKEKEKEIDLARTDVEGKIRCCLCGKEFQTMHSLFGHMRRHPDRTWKGIRPPPPSEKFNLSYLDDDVDDEDEDDDDVMSRSMMMSDVPEDVQGAACILMM
LSYASRNYWAGIEESPKSEVRSSSFYKDDEGKDKVLGDSRMDEKKGLIVDMKIKMEMEVKVNSPRDEAKRSLGFDLNQPPYHEDHP
Alignment CDS(TAIRver.9)_without_stop_codonとのalignment

100%一致しました。

このページのTOPに戻る