◆◆◆IE_08D06（IE_09D02） detail◆◆◆

Code nameIE_08D06（IE_09D02）
LocusAT1G19040
TemplateIT_08D06 (CR622)
Donor VectorpDONR207
Forward primerIPF_08D06 (ggggacaagtttgtacaaaaaagcaggcttcATGTCAGAGGTGTTAACACGCGGGTTT)
Reverse primerIPR_08D06 (ggggaccactttgtacaagaaagctgggttCAAAGTAGTACCATTCACTGTCCTTGTAAA)
Alignment with template seq.1stアミノ酸配列99.40%一致2ndアミノ酸配列100%一致
Alignment with TAIR7CDSアミノ酸配列99.40%一致アミノ酸配列100%一致
comment1st:(Sequence解析まで行ったが、フレームはずれないが塩基置換がある)→2nd(09D02):100%
sequence 
>IE_08D06_516bp
ATGTCAGAGGTGTTAACACGCGGGTTTCGATTTCGCCCAGCTGATGAAGAAGTGACAGACTACCTTATGCGGAAGACACAATCGCCGGAGTTCAGCTGCT
TTATCAAAACCATAGACTTGTACGACAAGGATCCGTGGGTACTTGGGCATGTGAGAGATCCGTGTTACAATCACTATGAATGGTATTACTTTGTTAAGAA
AAACCCCCTCGGGAATGAGTACTTAGATAAGCCTAGATTGAACGGGTTTGAACATCCACGCTTGAAATGGGATGTGTTGAAGCAGATACATGATGCTCTG
AGTTCTGGTCAGAACGTCCCACCAAGTGTCTTTACTTACGGATTCCGATTTCATCCGACTGATCAAGAGCTACTCTCTTTGTACCTCACTCCAAAGGCCC
ATTCACCAGACTTCAGCTGCTTCATAAGAGAGAGAGAGAGCTATATGCCATGGAGCCATGGCTTCTTGAACATGTTAGATCTCCTTTTTACAAGGACAGT
GAATGGTACTACTTTG

>IE_08D06_translated
MSEVLTRGFRFRPADEEVTDYLMRKTQSPEFSCFIKTIDLYDKDPWVLGHVRDPCYNHYEWYYFVKKNPLGNEYLDKPRLNGFEHPRLKWDVLKQIHDAL
SSGQNVPPSVFTYGFRFHPTDQELLSLYLTPKAHSPDFSCFIRERESYMPWSHGFLNMLDLLFTRTVNGTTL
Alignment ◆CDS（TAIRver.9）_without_stop_codonとのalignment◆

100%一致しました。

このページのTOPに戻る