◆◆◆RE_0209 detail◆◆◆

Code name	RE_0209
Locus	AT1G32640
Forward primer
Reverse primer
Alignment with TAIR7CDS	アミノ酸配列100%一致
comment	0311_アミノ酸配列100%一致
sequence	>RE_0209_1869bp ATGACTGATTACCGGCTACAACCAACGATGAATCTTTGGACCACCGACGACAACGCTTCTATGATGGAAGCTTTCATGAGCTCTTCCGATATCTCAACTT TATGGCCTCCGGCGTCGACGACAACCACGACGGCGACGACTGAAACAACTCCGACGCCGGCGATGGAGATTCCGGCACAGGCGGGATTTAATCAAGAGAC TCTTCAGCAACGTTTACAAGCTTTGATTGAAGGAACACACGAAGGTTGGACCTACGCTATATTCTGGCAACCGTCGTATGATTTCTCCGGCGCCTCCGTG CTCGGATGGGGAGATGGTTATTACAAAGGTGAAGAAGATAAAGCAAACCCGAGACGGAGATCGAGTTCGCCGCCGTTTTCTACTCCGGCGGATCAGGAGT ACAGGAAAAAAGTGTTGAGAGAGCTTAACTCGTTGATCTCCGGTGGTGTTGCTCCGTCGGATGACGCTGTTGATGAGGAGGTGACGGATACGGAATGGTT TTTCTTGGTTTCGATGACGCAGAGCTTCGCTTGCGGTGCGGGATTAGCTGGTAAAGCGTTTGCAACGGGTAACGCGGTTTGGGTTTCCGGGTCAGATCAA TTATCCGGGTCGGGTTGTGAACGGGCTAAGCAAGGAGGAGTGTTTGGGATGCATACTATTGCGTGTATTCCTTCGGCGAACGGAGTTGTGGAAGTCGGGT CAACGGAGCCGATCCGACAGAGTTCGGACCTTATTAACAAGGTTCGAATTCTTTTCAATTTCGACGGCGGAGCTGGAGATTTATCGGGTCTTAATTGGAA TCTTGACCCGGATCAAGGTGAGAACGACCCGTCTATGTGGATTAATGACCCGATTGGAACACCTGGATCTAACGAACCGGGTAACGGAGCTCCAAGTTCT AGCTCCCAGCTTTTTTCAAAGTCTATTCAGTTTGAGAACGGTAGCTCAAGCACAATAACCGAAAACCCGAATCTGGATCCGACTCCGAGTCCGGTTCATT CTCAGACCCAGAATCCGAAATTCAATAACACTTTCTCCCGAGAACTTAATTTTTCGACGTCAAGTTCTACTTTAGTGAAACCAAGATCCGGCGAGATATT AAACTTCGGCGATGAAGGTAAACGAAGCTCCGGAAACCCGGATCCAAGTTCTTATTCGGGTCAAACACAATTCGAAAACAAAAGAAAGAGGTCGATGGTT TTGAACGAAGATAAAGTTCTATCATTCGGAGATAAAACCGCCGGAGAATCAGATCACTCCGATCTAGAAGCTTCCGTCGTGAAAGAAGTAGCAGTAGAGA AACGTCCAAAGAAACGAGGAAGAAAGCCAGCAAACGGTAGAGAAGAGCCACTAAACCACGTCGAAGCAGAGAGACAAAGACGCGAGAAACTAAACCAAAG ATTCTACGCGTTACGAGCGGTTGTGCCAAACGTTTCAAAAATGGATAAAGCTTCGTTACTCGGTGACGCAATCGCTTACATCAACGAGCTTAAATCCAAA GTAGTCAAAACAGAGTCAGAGAAACTCCAAATCAAGAACCAGCTCGAGGAAGTGAAACTCGAGCTCGCCGGAAGAAAAGCGAGTGCTAGTGGAGGAGATA TGTCGTCTTCGTGTTCTTCGATTAAACCGGTGGGGATGGAGATTGAAGTGAAGATAATTGGTTGGGACGCAATGATTAGAGTTGAATCTAGTAAGAGGAA TCATCCGGCGGCGAGGTTGATGTCGGCGTTGATGGATTTGGAGTTGGAAGTGAATCACGCGAGTATGTCGGTGGTTAACGATTTGATGATTCAACAAGCG ACGGTGAAGATGGGTTTTAGGATCTATACGCAAGAACAGCTCAGAGCAAGTTTGATTTCAAAAATCGGT >RE_0209_translated MTDYRLQPTMNLWTTDDNASMMEAFMSSSDISTLWPPASTTTTTATTETTPTPAMEIPAQAGFNQETLQQRLQALIEGTHEGWTYAIFWQPSYDFSGASV LGWGDGYYKGEEDKANPRRRSSSPPFSTPADQEYRKKVLRELNSLISGGVAPSDDAVDEEVTDTEWFFLVSMTQSFACGAGLAGKAFATGNAVWVSGSDQ LSGSGCERAKQGGVFGMHTIACIPSANGVVEVGSTEPIRQSSDLINKVRILFNFDGGAGDLSGLNWNLDPDQGENDPSMWINDPIGTPGSNEPGNGAPSS SSQLFSKSIQFENGSSSTITENPNLDPTPSPVHSQTQNPKFNNTFSRELNFSTSSSTLVKPRSGEILNFGDEGKRSSGNPDPSSYSGQTQFENKRKRSMV LNEDKVLSFGDKTAGESDHSDLEASVVKEVAVEKRPKKRGRKPANGREEPLNHVEAERQRREKLNQRFYALRAVVPNVSKMDKASLLGDAIAYINELKSK VVKTESEKLQIKNQLEEVKLELAGRKASASGGDMSSSCSSIKPVGMEIEVKIIGWDAMIRVESSKRNHPAARLMSALMDLELEVNHASMSVVNDLMIQQA TVKMGFRIYTQEQLRASLISKIG
Alignment	◆CDS（TAIRver.9）_without_stop_codonとのalignment◆ 1868/1869 (99.9%)（アミノ酸配列で100%）一致しました。 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 AT1G32 ATGACTGATTACCGGCTACAACCAACGATGAATCTTTGGACCACCGACGACAACGCTTCTATGATGGAAGCTTTCATGAGCTCTTCCGATATCTCAACTT :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: RE_020 ATGACTGATTACCGGCTACAACCAACGATGAATCTTTGGACCACCGACGACAACGCTTCTATGATGGAAGCTTTCATGAGCTCTTCCGATATCTCAACTT 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 AT1G32 TATGGCCTCCGGCGTCGACGACAACCACGACGGCGACGACTGAAACAACTCCGACGCCGGCGATGGAGATTCCGGCACAGGCGGGATTTAATCAAGAGAC :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: RE_020 TATGGCCTCCGGCGTCGACGACAACCACGACGGCGACGACTGAAACAACTCCGACGCCGGCGATGGAGATTCCGGCACAGGCGGGATTTAATCAAGAGAC 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 AT1G32 TCTTCAGCAACGTTTACAAGCTTTGATTGAAGGAACACACGAAGGTTGGACCTACGCTATATTCTGGCAACCGTCGTATGATTTCTCCGGCGCCTCCGTG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: RE_020 TCTTCAGCAACGTTTACAAGCTTTGATTGAAGGAACACACGAAGGTTGGACCTACGCTATATTCTGGCAACCGTCGTATGATTTCTCCGGCGCCTCCGTG 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 AT1G32 CTCGGATGGGGAGATGGTTATTACAAAGGTGAAGAAGATAAAGCAAACCCGAGACGGAGATCGAGTTCGCCGCCGTTTTCTACTCCGGCGGATCAGGAGT :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: RE_020 CTCGGATGGGGAGATGGTTATTACAAAGGTGAAGAAGATAAAGCAAACCCGAGACGGAGATCGAGTTCGCCGCCGTTTTCTACTCCGGCGGATCAGGAGT 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 480 490 500 AT1G32 ACAGGAAAAAAGTGTTGAGAGAGCTTAACTCGTTGATCTCCGGTGGTGTTGCTCCGTCGGATGACGCTGTTGATGAGGAGGTGACGGATACGGAATGGTT :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: RE_020 ACAGGAAAAAAGTGTTGAGAGAGCTTAACTCGTTGATCTCCGGTGGTGTTGCTCCGTCGGATGACGCTGTTGATGAGGAGGTGACGGATACGGAATGGTT 410 420 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 540 550 560 570 580 590 600 AT1G32 TTTCTTGGTTTCGATGACGCAGAGCTTCGCTTGCGGTGCGGGATTAGCTGGTAAAGCGTTTGCAACGGGTAACGCGGTTTGGGTTTCCGGGTCAGATCAA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: RE_020 TTTCTTGGTTTCGATGACGCAGAGCTTCGCTTGCGGTGCGGGATTAGCTGGTAAAGCGTTTGCAACGGGTAACGCGGTTTGGGTTTCCGGGTCAGATCAA 510 520 530 540 550 560 570 580 590 600 610 620 630 640 650 660 670 680 690 700 AT1G32 TTATCCGGGTCGGGTTGTGAACGGGCTAAGCAAGGAGGAGTGTTTGGGATGCATACTATTGCGTGTATTCCTTCGGCGAACGGAGTTGTGGAAGTCGGGT :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: RE_020 TTATCCGGGTCGGGTTGTGAACGGGCTAAGCAAGGAGGAGTGTTTGGGATGCATACTATTGCGTGTATTCCTTCGGCGAACGGAGTTGTGGAAGTCGGGT 610 620 630 640 650 660 670 680 690 700 710 720 730 740 750 760 770 780 790 800 AT1G32 CAACGGAGCCGATCCGACAGAGTTCGGACCTTATTAACAAGGTTCGAATTCTTTTCAATTTCGACGGCGGAGCTGGAGATTTATCGGGTCTTAATTGGAA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: RE_020 CAACGGAGCCGATCCGACAGAGTTCGGACCTTATTAACAAGGTTCGAATTCTTTTCAATTTCGACGGCGGAGCTGGAGATTTATCGGGTCTTAATTGGAA 710 720 730 740 750 760 770 780 790 800 810 820 830 840 850 860 870 880 890 900 AT1G32 TCTTGACCCGGATCAAGGTGAGAACGACCCGTCTATGTGGATTAATGACCCGATTGGAACACCTGGATCTAACGAACCGGGTAACGGAGCTCCAAGTTCT :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: RE_020 TCTTGACCCGGATCAAGGTGAGAACGACCCGTCTATGTGGATTAATGACCCGATTGGAACACCTGGATCTAACGAACCGGGTAACGGAGCTCCAAGTTCT 810 820 830 840 850 860 870 880 890 900 910 920 930 940 950 960 970 980 990 1000 AT1G32 AGCTCCCAGCTTTTTTCAAAGTCTATTCAGTTTGAGAACGGTAGCTCAAGCACAATAACCGAAAACCCGAATCTGGATCCGACTCCGAGTCCGGTTCATT :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: RE_020 AGCTCCCAGCTTTTTTCAAAGTCTATTCAGTTTGAGAACGGTAGCTCAAGCACAATAACCGAAAACCCGAATCTGGATCCGACTCCGAGTCCGGTTCATT 910 920 930 940 950 960 970 980 990 1000 1010 1020 1030 1040 1050 1060 1070 1080 1090 1100 AT1G32 CTCAGACCCAGAATCCGAAATTCAATAACACTTTCTCCCGAGAACTTAATTTTTCGACGTCAAGTTCTACTTTAGTGAAACCAAGATCCGGCGAGATATT :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: RE_020 CTCAGACCCAGAATCCGAAATTCAATAACACTTTCTCCCGAGAACTTAATTTTTCGACGTCAAGTTCTACTTTAGTGAAACCAAGATCCGGCGAGATATT 1010 1020 1030 1040 1050 1060 1070 1080 1090 1100 1110 1120 1130 1140 1150 1160 1170 1180 1190 1200 AT1G32 AAACTTCGGCGATGAAGGTAAACGAAGCTCCGGAAACCCGGATCCAAGTTCTTATTCGGGTCAAACACAATTCGAAAACAAAAGAAAGAGGTCGATGGTT :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: RE_020 AAACTTCGGCGATGAAGGTAAACGAAGCTCCGGAAACCCGGATCCAAGTTCTTATTCGGGTCAAACACAATTCGAAAACAAAAGAAAGAGGTCGATGGTT 1110 1120 1130 1140 1150 1160 1170 1180 1190 1200 1210 1220 1230 1240 1250 1260 1270 1280 1290 1300 AT1G32 TTGAACGAAGATAAAGTTCTATCATTCGGAGATAAAACCGCCGGAGAATCAGATCACTCCGATCTAGAAGCTTCCGTCGTGAAAGAAGTAGCAGTAGAGA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: RE_020 TTGAACGAAGATAAAGTTCTATCATTCGGAGATAAAACCGCCGGAGAATCAGATCACTCCGATCTAGAAGCTTCCGTCGTGAAAGAAGTAGCAGTAGAGA 1210 1220 1230 1240 1250 1260 1270 1280 1290 1300 1310 1320 1330 1340 1350 1360 1370 1380 1390 1400 AT1G32 AACGTCCAAAGAAACGAGGAAGAAAGCCAGCAAACGGTAGAGAAGAGCCACTAAACCACGTCGAAGCAGAGAGACAAAGACGCGAGAAACTAAACCAAAG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: RE_020 AACGTCCAAAGAAACGAGGAAGAAAGCCAGCAAACGGTAGAGAAGAGCCACTAAACCACGTCGAAGCAGAGAGACAAAGACGCGAGAAACTAAACCAAAG 1310 1320 1330 1340 1350 1360 1370 1380 1390 1400 1410 1420 1430 1440 1450 1460 1470 1480 1490 1500 AT1G32 ATTCTACGCGTTACGAGCGGTTGTACCAAACGTTTCAAAAATGGATAAAGCTTCGTTACTCGGTGACGCAATCGCTTACATCAACGAGCTTAAATCCAAA :::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: RE_020 ATTCTACGCGTTACGAGCGGTTGTGCCAAACGTTTCAAAAATGGATAAAGCTTCGTTACTCGGTGACGCAATCGCTTACATCAACGAGCTTAAATCCAAA 1410 1420 1430 1440 1450 1460 1470 1480 1490 1500 1510 1520 1530 1540 1550 1560 1570 1580 1590 1600 AT1G32 GTAGTCAAAACAGAGTCAGAGAAACTCCAAATCAAGAACCAGCTCGAGGAAGTGAAACTCGAGCTCGCCGGAAGAAAAGCGAGTGCTAGTGGAGGAGATA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: RE_020 GTAGTCAAAACAGAGTCAGAGAAACTCCAAATCAAGAACCAGCTCGAGGAAGTGAAACTCGAGCTCGCCGGAAGAAAAGCGAGTGCTAGTGGAGGAGATA 1510 1520 1530 1540 1550 1560 1570 1580 1590 1600 1610 1620 1630 1640 1650 1660 1670 1680 1690 1700 AT1G32 TGTCGTCTTCGTGTTCTTCGATTAAACCGGTGGGGATGGAGATTGAAGTGAAGATAATTGGTTGGGACGCAATGATTAGAGTTGAATCTAGTAAGAGGAA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: RE_020 TGTCGTCTTCGTGTTCTTCGATTAAACCGGTGGGGATGGAGATTGAAGTGAAGATAATTGGTTGGGACGCAATGATTAGAGTTGAATCTAGTAAGAGGAA 1610 1620 1630 1640 1650 1660 1670 1680 1690 1700 1710 1720 1730 1740 1750 1760 1770 1780 1790 1800 AT1G32 TCATCCGGCGGCGAGGTTGATGTCGGCGTTGATGGATTTGGAGTTGGAAGTGAATCACGCGAGTATGTCGGTGGTTAACGATTTGATGATTCAACAAGCG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: RE_020 TCATCCGGCGGCGAGGTTGATGTCGGCGTTGATGGATTTGGAGTTGGAAGTGAATCACGCGAGTATGTCGGTGGTTAACGATTTGATGATTCAACAAGCG 1710 1720 1730 1740 1750 1760 1770 1780 1790 1800 1810 1820 1830 1840 1850 1860 AT1G32 ACGGTGAAGATGGGTTTTAGGATCTATACGCAAGAACAGCTCAGAGCAAGTTTGATTTCAAAAATCGGT ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: RE_020 ACGGTGAAGATGGGTTTTAGGATCTATACGCAAGAACAGCTCAGAGCAAGTTTGATTTCAAAAATCGGT 1810 1820 1830 1840 1850 1860 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 AT1G32 MTDYRLQPTMNLWTTDDNASMMEAFMSSSDISTLWPPASTTTTTATTETTPTPAMEIPAQAGFNQETLQQRLQALIEGTHEGWTYAIFWQPSYDFSGASV :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: RE_020 MTDYRLQPTMNLWTTDDNASMMEAFMSSSDISTLWPPASTTTTTATTETTPTPAMEIPAQAGFNQETLQQRLQALIEGTHEGWTYAIFWQPSYDFSGASV 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 AT1G32 LGWGDGYYKGEEDKANPRRRSSSPPFSTPADQEYRKKVLRELNSLISGGVAPSDDAVDEEVTDTEWFFLVSMTQSFACGAGLAGKAFATGNAVWVSGSDQ :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: RE_020 LGWGDGYYKGEEDKANPRRRSSSPPFSTPADQEYRKKVLRELNSLISGGVAPSDDAVDEEVTDTEWFFLVSMTQSFACGAGLAGKAFATGNAVWVSGSDQ 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 AT1G32 LSGSGCERAKQGGVFGMHTIACIPSANGVVEVGSTEPIRQSSDLINKVRILFNFDGGAGDLSGLNWNLDPDQGENDPSMWINDPIGTPGSNEPGNGAPSS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: RE_020 LSGSGCERAKQGGVFGMHTIACIPSANGVVEVGSTEPIRQSSDLINKVRILFNFDGGAGDLSGLNWNLDPDQGENDPSMWINDPIGTPGSNEPGNGAPSS 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 AT1G32 SSQLFSKSIQFENGSSSTITENPNLDPTPSPVHSQTQNPKFNNTFSRELNFSTSSSTLVKPRSGEILNFGDEGKRSSGNPDPSSYSGQTQFENKRKRSMV :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: RE_020 SSQLFSKSIQFENGSSSTITENPNLDPTPSPVHSQTQNPKFNNTFSRELNFSTSSSTLVKPRSGEILNFGDEGKRSSGNPDPSSYSGQTQFENKRKRSMV 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 480 490 500 AT1G32 LNEDKVLSFGDKTAGESDHSDLEASVVKEVAVEKRPKKRGRKPANGREEPLNHVEAERQRREKLNQRFYALRAVVPNVSKMDKASLLGDAIAYINELKSK :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: RE_020 LNEDKVLSFGDKTAGESDHSDLEASVVKEVAVEKRPKKRGRKPANGREEPLNHVEAERQRREKLNQRFYALRAVVPNVSKMDKASLLGDAIAYINELKSK 410 420 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 540 550 560 570 580 590 600 AT1G32 VVKTESEKLQIKNQLEEVKLELAGRKASASGGDMSSSCSSIKPVGMEIEVKIIGWDAMIRVESSKRNHPAARLMSALMDLELEVNHASMSVVNDLMIQQA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: RE_020 VVKTESEKLQIKNQLEEVKLELAGRKASASGGDMSSSCSSIKPVGMEIEVKIIGWDAMIRVESSKRNHPAARLMSALMDLELEVNHASMSVVNDLMIQQA 510 520 530 540 550 560 570 580 590 600 610 620 AT1G32 TVKMGFRIYTQEQLRASLISKIG ::::::::::::::::::::::: RE_020 TVKMGFRIYTQEQLRASLISKIG 610 620

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