◆◆◆RE_0218 detail◆◆◆

Code nameRE_0218
LocusAT1G68920
Forward primer
Reverse primer
Alignment with TAIR7CDSアミノ酸配列100%一致
comment0311_塩基配列100%一致
sequence
>RE_0218_1458bp
ATGGATTTAAGTGCGAAAGATGAGTTTTCAGCAGAGAAGAGGAATCCTGATAACTATGATTCTGTTAATAATCCGTCTGGAGATTGGCGAGTTGATTCAT
ATCCTTCAGAGAATCTGATTTCAGCTGGTCCTGCGTCTTGTTCTCCTTCTCAGATGATGGATTCATTTGGGCAAACTCTTTGGTATGATCCCACGAGTGT
TCAGGCTGTTGGTTATGCCGGTTTTAATGGTGGTAATGCTTCGTCTTCTTCGTTTAGGGGTAGTATTGATAGATCTCTTGAAATGGGTTGGAATCTGCCT
AATTTGTTGCCTCCTAAAGGCAATGGTCTTTTCTTACCGAATGCGAGTAGTTTCCTTCCTCCGAGTATGGCTCAGTTCCCGGCTGATTCAGGTTTTATAG
AGCGTGCAGCGAGGTTTTCGCTCTTTAGCGGTGGGAATTTTAGTGATATGGTGAATCAACCACTTGGGAATTCTGAGGCTATTGGTTTGTTTCTTCAAGG
TGGTGGAACAATGCAAGGGCAGTGTCAAAGTAATGAACTTAATGTTGGTGAACCTCACAATGATGTATCTGTAGCAGTGAAAGAATCAACTGTTAGATCT
AGTGAACAAGCTAAACCGAATGTTCCTGGATCGGGCAATGTATCCGAGGATACTCAGTCTAGTGGTGGTAATGGTCAGAAAGGCAGAGAAACCTCTTCCA
ACACAAAGAAGAGGAAAAGAAATGGGCAGAAGAACTCTGAAGCAGCTCAATCACACAGATCCCAGCAGTCTGAGGAAGAACCAGACAACAATGGTGATGA
AAAGCGCAATGATGAGCAAAGTCCAAATTCACCTGGAAAGAAGTCAAACAGTGGGAAACAACAGGGCAAACAAAGTTCTGATCCTCCAAAAGATGGATAT
ATTCATGTACGGGCACGAAGAGGCCAGGCCACAAATAGCCATAGTCTTGCAGAAAGAGTTAGGAGAGAAAAAATTAGTGAAAGGATGAAGTTTCTTCAAG
ATCTAGTACCGGGTTGCAACAAGGTGACTGGGAAGGCAGTTATGCTTGACGAAATCATAAACTACGTACAATCACTACAACGCCAAGTTGAGTTTTTATC
GATGAAACTTGCAACTGTGAACCCACAAATGGACTTTAACCTTGAAGGTCTTCTTGCAAAAGATGCACTTCAACTACGAGCTGGTTCTTCATCTACAACA
CCATTCCCACCAAATATGTCAATGGCTTATCCTCCTCTACCTCATGGATTCATGCAACAAACTCTTTCCAGCATTGGAAGGACCATTACCTCTCCATTGT
CTCCTATGAATGGTGGATTCAAGCGACAGGAAACAAATGGATGGGAGGGTGATTTGCAAAATGTGATCCACATTAACTATGGAGCTGGTGATGTCACACC
TGACCCTCAAGCAGCAGCTACAGCATCTCTTCCAGCTGCAAATATGAAGGTTGAGCCA

>RE_0218_translated
MDLSAKDEFSAEKRNPDNYDSVNNPSGDWRVDSYPSENLISAGPASCSPSQMMDSFGQTLWYDPTSVQAVGYAGFNGGNASSSSFRGSIDRSLEMGWNLP
NLLPPKGNGLFLPNASSFLPPSMAQFPADSGFIERAARFSLFSGGNFSDMVNQPLGNSEAIGLFLQGGGTMQGQCQSNELNVGEPHNDVSVAVKESTVRS
SEQAKPNVPGSGNVSEDTQSSGGNGQKGRETSSNTKKRKRNGQKNSEAAQSHRSQQSEEEPDNNGDEKRNDEQSPNSPGKKSNSGKQQGKQSSDPPKDGY
IHVRARRGQATNSHSLAERVRREKISERMKFLQDLVPGCNKVTGKAVMLDEIINYVQSLQRQVEFLSMKLATVNPQMDFNLEGLLAKDALQLRAGSSSTT
PFPPNMSMAYPPLPHGFMQQTLSSIGRTITSPLSPMNGGFKRQETNGWEGDLQNVIHINYGAGDVTPDPQAAATASLPAANMKVEP
Alignment CDS(TAIRver.9)_without_stop_codonとのalignment

100%一致しました。

このページのTOPに戻る