◆◆◆RE_0569 detail◆◆◆

Code name	RE_0569
Locus	AT4G40060
Forward primer
Reverse primer
Alignment with TAIR7CDS	アミノ酸配列100%一致
comment	(RE_03G10_x)->0229_アミノ酸配列100%一致/0420_アミノ酸配列70%以上一致
sequence	>RE_0569_882bp ATGAAGAGACTAAGCAGCTCAGATTCAATGTGTGGTCTAATCTCCACTTCTACAGATGAACAGAGTCCAAGAGGGTACGGAAGTAATTACCAATCTATGC TTGAAGGTTACGATGAAGATGCTACACTAATCGAGGAATATTCCGGCAACCACCACCACATGGGTCTATCGGAGAAGAAGAGAAGATTAAAAGTTGACCA AGTCAAAGCTCTTGAGAAGAATTTCGAACTTGAGAATAAACTCGAACCTGAGAGGAAAACTAAATTAGCACAAGAGCTTGGACTTCAACCTCGTCAAGTA GCTGTTTGGTTTCAGAACCGTCGTGCACGGTGGAAAACAAAACAGCTTGAAAAAGATTACGGTGTTCTTAAGGGTCAATACGATTCTCTCCGCCACAATT TCGATTCTCTCCGCCGTGACAATGATTCCCTTCTCCAAGAGATTAGTAAAATCAAAGCTAAGGTAAACGGTGAAGAAGATAACAACAACAACAAAGCTAT TACGGAGGGTGTTAAGGAAGAGGAAGTTCACAAGACGGATTCGATTCCTTCGTCTCCTCTGCAGTTTCTAGAACATTCCTCTGGTTTTAACTACCGGCGA AGCTTCACTGACCTCCGTGACCTTCTACCGAATTCCACCGTTGTCGAGGCTGGATCTTCCGATAGTTGCGATTCAAGCGCCGTTCTTAACGACGAAACAA GTTCTGATAACGGAAGATTGACGCCGCCTGTGACGGTTACTGGCGGGAGTTTCTTACAGTTTGTGAAAACAGAGCAAACAGAGGATCACGAGGATTTCCT AAGCGGTGAAGAAGCTTGTGGTTTCTTCTCCGATGAACAGCCGCCGTCACTTCATTGGTACTCTGCTTCAGATCATTGGACT >RE_0569_translated MKRLSSSDSMCGLISTSTDEQSPRGYGSNYQSMLEGYDEDATLIEEYSGNHHHMGLSEKKRRLKVDQVKALEKNFELENKLEPERKTKLAQELGLQPRQV AVWFQNRRARWKTKQLEKDYGVLKGQYDSLRHNFDSLRRDNDSLLQEISKIKAKVNGEEDNNNNKAITEGVKEEEVHKTDSIPSSPLQFLEHSSGFNYRR SFTDLRDLLPNSTVVEAGSSDSCDSSAVLNDETSSDNGRLTPPVTVTGGSFLQFVKTEQTEDHEDFLSGEEACGFFSDEQPPSLHWYSASDHWT
Alignment	◆CDS（TAIRver.9）_without_stop_codonとのalignment◆ 881/882 (99.9%)（アミノ酸配列で100%）一致しました。 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 AT4G40 ATGAAGAGACTAAGCAGCTCAGATTCAATGTGTGGTCTAATCTCCACTTCTACAGATGAACAGAGTCCAAGAGGGTACGGAAGTAATTACCAATCTATGC :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: RE_056 ATGAAGAGACTAAGCAGCTCAGATTCAATGTGTGGTCTAATCTCCACTTCTACAGATGAACAGAGTCCAAGAGGGTACGGAAGTAATTACCAATCTATGC 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 AT4G40 TTGAAGGTTACGATGAAGATGCTACACTAATCGAGGAATATTCCGGCAACCACCACCACATGGGTCTATCGGAGAAGAAGAGAAGATTAAAAGTTGACCA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: RE_056 TTGAAGGTTACGATGAAGATGCTACACTAATCGAGGAATATTCCGGCAACCACCACCACATGGGTCTATCGGAGAAGAAGAGAAGATTAAAAGTTGACCA 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 AT4G40 AGTCAAAGCTCTTGAGAAGAATTTCGAACTTGAGAATAAACTCGAACCTGAGAGGAAAACTAAATTAGCACAAGAGCTTGGACTTCAACCTCGTCAAGTA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: RE_056 AGTCAAAGCTCTTGAGAAGAATTTCGAACTTGAGAATAAACTCGAACCTGAGAGGAAAACTAAATTAGCACAAGAGCTTGGACTTCAACCTCGTCAAGTA 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 AT4G40 GCTGTTTGGTTTCAGAACCGTCGTGCACGGTGGAAAACAAAACAGCTTGAAAAAGATTACGGTGTTCTTAAGGGTCAATACGATTCTCTCCGCCACAATT :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: RE_056 GCTGTTTGGTTTCAGAACCGTCGTGCACGGTGGAAAACAAAACAGCTTGAAAAAGATTACGGTGTTCTTAAGGGTCAATACGATTCTCTCCGCCACAATT 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 480 490 500 AT4G40 TCGATTCTCTCCGCCGTGACAATGATTCCCTTCTCCAAGAGATTAGTAAAATCAAAGCTAAGGTAAACGGTGAAGAAGATAACAACAACAACAAAGCTAT :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: RE_056 TCGATTCTCTCCGCCGTGACAATGATTCCCTTCTCCAAGAGATTAGTAAAATCAAAGCTAAGGTAAACGGTGAAGAAGATAACAACAACAACAAAGCTAT 410 420 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 540 550 560 570 580 590 600 AT4G40 TACGGAGGGTGTTAAGGAAGAGGAAGTTCACAAGACGGATTCGATTCCTTCGTCTCCTCTGCAGTTTCTAGAACATTCCTCTGGTTTTAACTACCGGCGA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: RE_056 TACGGAGGGTGTTAAGGAAGAGGAAGTTCACAAGACGGATTCGATTCCTTCGTCTCCTCTGCAGTTTCTAGAACATTCCTCTGGTTTTAACTACCGGCGA 510 520 530 540 550 560 570 580 590 600 610 620 630 640 650 660 670 680 690 700 AT4G40 AGCTTCACTGACCTCCGTGACCTTCTACCGAATTCCACCGTTGTCGAGGCTGGATCTTCCGATAGTTGCGATTCAAGCGCCGTTCTTAACGACGAAACAA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: RE_056 AGCTTCACTGACCTCCGTGACCTTCTACCGAATTCCACCGTTGTCGAGGCTGGATCTTCCGATAGTTGCGATTCAAGCGCCGTTCTTAACGACGAAACAA 610 620 630 640 650 660 670 680 690 700 710 720 730 740 750 760 770 780 790 800 AT4G40 GTTCTGATAACGGAAGATTGACGCCGCCTGTGACGGTTACTGGCGGGAGTTTCTTACAGTTTGTGAAAACAGAGCAAACAGAGGATCACGAGGATTTTCT ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :: RE_056 GTTCTGATAACGGAAGATTGACGCCGCCTGTGACGGTTACTGGCGGGAGTTTCTTACAGTTTGTGAAAACAGAGCAAACAGAGGATCACGAGGATTTCCT 710 720 730 740 750 760 770 780 790 800 810 820 830 840 850 860 870 880 AT4G40 AAGCGGTGAAGAAGCTTGTGGTTTCTTCTCCGATGAACAGCCGCCGTCACTTCATTGGTACTCTGCTTCAGATCATTGGACT :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: RE_056 AAGCGGTGAAGAAGCTTGTGGTTTCTTCTCCGATGAACAGCCGCCGTCACTTCATTGGTACTCTGCTTCAGATCATTGGACT 810 820 830 840 850 860 870 880 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 AT4G40 MKRLSSSDSMCGLISTSTDEQSPRGYGSNYQSMLEGYDEDATLIEEYSGNHHHMGLSEKKRRLKVDQVKALEKNFELENKLEPERKTKLAQELGLQPRQV :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: RE_056 MKRLSSSDSMCGLISTSTDEQSPRGYGSNYQSMLEGYDEDATLIEEYSGNHHHMGLSEKKRRLKVDQVKALEKNFELENKLEPERKTKLAQELGLQPRQV 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 AT4G40 AVWFQNRRARWKTKQLEKDYGVLKGQYDSLRHNFDSLRRDNDSLLQEISKIKAKVNGEEDNNNNKAITEGVKEEEVHKTDSIPSSPLQFLEHSSGFNYRR :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: RE_056 AVWFQNRRARWKTKQLEKDYGVLKGQYDSLRHNFDSLRRDNDSLLQEISKIKAKVNGEEDNNNNKAITEGVKEEEVHKTDSIPSSPLQFLEHSSGFNYRR 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 AT4G40 SFTDLRDLLPNSTVVEAGSSDSCDSSAVLNDETSSDNGRLTPPVTVTGGSFLQFVKTEQTEDHEDFLSGEEACGFFSDEQPPSLHWYSASDHWT :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: RE_056 SFTDLRDLLPNSTVVEAGSSDSCDSSAVLNDETSSDNGRLTPPVTVTGGSFLQFVKTEQTEDHEDFLSGEEACGFFSDEQPPSLHWYSASDHWT 210 220 230 240 250 260 270 280 290

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