◆◆◆RE_0596 detail◆◆◆

Code nameRE_0596
LocusAT1G34190
Forward primer
Reverse primer
Alignment with TAIR7CDSアミノ酸配列100%一致
comment0428_塩基配列100%一致
sequence
>RE_0596_1671bp
ATGGCGGATTCTTCACCCGATTCGTGTTTCAAAGGAGGCAAATTTAGTGCTCCAGGGTTTCGATTTCATCCAACTGATGAAGAGCTTGTGATGTATTATT
TGAAGAGGAAGATTTGTAGGAAGAGGCTTAGAGTTAATGTTATCGGTGTTGTTGATGTTTACAAAATGGATCCTGAGGAATTGCCTGGTCAATCAATGTT
GAAGACGGGAGATAGACAGTGGTTCTATTTCACTCCAAGGAGTAGGAAGTATCCAAACGCAGCTAGGTCTAATAGAGGAACTGAAAATGGGTATTGGAAG
GCTACAGGGAAGGATCGAGTCATTGAGTATAATTCTAGATCGGTGGGACTTAAAAAGACTCTTGTTTTCTATAGAGGCCGGGCTCCTAGTGGTGAGCGGA
CTGATTGGGTGATGCATGAGTATACGATGGATGAAGATGAACTAGGGAGATGTAAGAACCCTCAGGAGTACTATGCTCTTTATAAGTTGTTCAAGAAAAG
TGGGGCTGGTCCTAAGAATGGTGAACAGTATGGTGCTCCGTTTCAAGAAGAGGAATGGGTTGATGATGATAATGAAGATGTGAATGCTATTGCTGTAGCT
GTGCCAGAGCAACCTGTGGTTCGTTATGAGGATGCTCGTCGTGTGGATGAGAGGAGACTTTTTAATCCTGTTATTCTTCAGTTAGAGGATATCGATGAGC
TTCTCAATGGAATCCCTAATGCACCTGGTGTTCCTCAAAGATGTATTCCTCAGGTGAATAGTGAAGAAGAGCTGCAGAGTACGTTGGTGAATAATTCTGC
TAGAGAGTTCTTGCCAAACGGTCAGCAATACAACAGGCCCTCAAGTTTTGACTCATTAGAGACCGCTGAGGTCACCTCAGCTCCTCTGGTGTTTGAGAAG
GAAGATTTCATTGAAATGGATGATCTTCTTCTGATCCCTGAATTCGGAGCTTCTTCAACTGAGAAAGCCGCACAGTTCTCGAACCATGGTGAATTCGACG
ATTTTAATGAGTTTGACCAATTGTTCCATGACGTTTCCATGTCTTTGGATATGGAACCTATTGATCAGGGAACTTCTGCAAATCTGTCTTCTCTGAGTGA
TTCTGCTAACTACACATCAGACCAAAAACAGCAACTCCTTTATCAACAGTTCCAGGACCAGACTCCCGAGAACCAGCTGAACAACATCATGGATCCTAGT
ACAACTCTCAATCAAATCACTAGCGATATTTGGTTCGAGGATGATCAGGCCATTCTATTTGATCAACAACAATCCTTTTCTGGAGCATTTGCTTCACCCT
CATCAGGTGTGATGCCTGATTCCACCAATCCTACTATGAGTGTGAATGCCCAAGGCCATGAAATCCAAAATGGTGGTGGAACAACAAGCCAGTTCTCATC
GGCTTTGTGGGCATTAATGGACTCAATACCTTCAACGCCAGCCTCTGCGTGTGAGGGTCCCCTTAACCGAACCTTTGTACGTATGTCTAGCTTCAGCCGT
ATGAGGTTCAATGGAAAGGCTAATGGAACGCCAGTGAGTACTACCATAGCAAAGAAGGGTATTAGAAACAGAGGTTTTCTTCTATTATCAATCGTGGGTG
CTTTGTGTGCCATCTTCTGGGTGTTGGTAGCCACAGTTCGAGTCTCAGGTAGAAGTCTTCTCTTGAAAGAC

>RE_0596_translated
MADSSPDSCFKGGKFSAPGFRFHPTDEELVMYYLKRKICRKRLRVNVIGVVDVYKMDPEELPGQSMLKTGDRQWFYFTPRSRKYPNAARSNRGTENGYWK
ATGKDRVIEYNSRSVGLKKTLVFYRGRAPSGERTDWVMHEYTMDEDELGRCKNPQEYYALYKLFKKSGAGPKNGEQYGAPFQEEEWVDDDNEDVNAIAVA
VPEQPVVRYEDARRVDERRLFNPVILQLEDIDELLNGIPNAPGVPQRCIPQVNSEEELQSTLVNNSAREFLPNGQQYNRPSSFDSLETAEVTSAPLVFEK
EDFIEMDDLLLIPEFGASSTEKAAQFSNHGEFDDFNEFDQLFHDVSMSLDMEPIDQGTSANLSSLSDSANYTSDQKQQLLYQQFQDQTPENQLNNIMDPS
TTLNQITSDIWFEDDQAILFDQQQSFSGAFASPSSGVMPDSTNPTMSVNAQGHEIQNGGGTTSQFSSALWALMDSIPSTPASACEGPLNRTFVRMSSFSR
MRFNGKANGTPVSTTIAKKGIRNRGFLLLSIVGALCAIFWVLVATVRVSGRSLLLKD
Alignment CDS(TAIRver.9)_without_stop_codonとのalignment

100%一致しました。

このページのTOPに戻る