◆◆◆RE_0598 detail◆◆◆

Code name	RE_0598
Locus	AT1G52890
Forward primer
Reverse primer
Alignment with TAIR7CDS	アミノ酸配列100%一致
comment	0229_アミノ酸配列100%一致
sequence	>RE_0598_951bp ATGGGTATCCAAGAAACTGACCCGTTAACGCAATTGAGTTTACCACCGGGTTTCCGATTTTACCCGACCGATGAAGAGCTTATGGTTCAATATCTCTGTA GAAAAGCAGCTGGTTACGATTTCTCTCTTCAGCTCATCGCCGAAATAGATCTTTACAAATTCGATCCATGGGTTTTACCAAATAAAGCATTATTTGGAGA AAAAGAATGGTATTTTTTTAGTCCTAGGGATAGAAAATATCCAAACGGGTCAAGACCTAACCGGGTTGCCGGATCGGGTTATTGGAAAGCTACGGGTACG GATAAAATAATCTCGACGGAAGGACAAAGAGTTGGTATCAAAAAAGCTTTGGTGTTTTACATCGGAAAAGCTCCTAAAGGTACTAAAACCAATTGGATCA TGCATGAGTATCGTCTCATTGAACCTTCTCGTAGAAACGGAAGCACTAAGTTGGATGATTGGGTTCTATGTCGAATATACAAGAAGCAATCAAGTGCACA AAAACAAGTTTACGATAATGGAATCGCGAATGCTAGAGAATTCAGCAACAACGGTACTTCGTCCACGACGTCGTCTTCTTCTCACTTTGAAGACGTTCTT GATTCGTTTCATCAAGAGATCGACAACAGAAATTTCCAGTTTTCTAACCCAAACCGCATCTCGTCGCTCAGACCGGACTTAACCGAACAGAAAACCGGGT TCCACGGTCTTGCGGATACTTCTAACTTCGATTGGGCTAGTTTTGCCGGTAATGTTGAGCATAATAACTCGGTACCGGAACTCGGAATGAGTCATGTTGT TCCTAATCTCGAGTACAACTGTGGCTACCTGAAGACGGAGGAGGAAGTCGAGAGCAGTCACGGGTTTAATAACTCGGGCGAGTTAGCTCAAAAGGGTTAT GGTGTTGACTCGTTTGGGTATTCGGGGCAAGTTGGTGGGTTTGGGTTTATG >RE_0598_translated MGIQETDPLTQLSLPPGFRFYPTDEELMVQYLCRKAAGYDFSLQLIAEIDLYKFDPWVLPNKALFGEKEWYFFSPRDRKYPNGSRPNRVAGSGYWKATGT DKIISTEGQRVGIKKALVFYIGKAPKGTKTNWIMHEYRLIEPSRRNGSTKLDDWVLCRIYKKQSSAQKQVYDNGIANAREFSNNGTSSTTSSSSHFEDVL DSFHQEIDNRNFQFSNPNRISSLRPDLTEQKTGFHGLADTSNFDWASFAGNVEHNNSVPELGMSHVVPNLEYNCGYLKTEEEVESSHGFNNSGELAQKGY GVDSFGYSGQVGGFGFM
Alignment	◆CDS（TAIRver.9）_without_stop_codonとのalignment◆ 950/951 (99.9%)（アミノ酸配列で100%）一致しました。 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 AT1G52 ATGGGTATCCAAGAAACTGACCCGTTAACGCAATTGAGTTTACCACCGGGTTTCCGATTTTACCCGACCGATGAAGAGCTTATGGTTCAATATCTCTGTA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: RE_059 ATGGGTATCCAAGAAACTGACCCGTTAACGCAATTGAGTTTACCACCGGGTTTCCGATTTTACCCGACCGATGAAGAGCTTATGGTTCAATATCTCTGTA 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 AT1G52 GAAAAGCAGCTGGTTACGATTTCTCTCTTCAGCTCATCGCCGAAATAGATCTTTACAAATTCGATCCATGGGTTTTACCAAATAAAGCATTATTTGGAGA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: RE_059 GAAAAGCAGCTGGTTACGATTTCTCTCTTCAGCTCATCGCCGAAATAGATCTTTACAAATTCGATCCATGGGTTTTACCAAATAAAGCATTATTTGGAGA 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 AT1G52 AAAAGAATGGTATTTTTTTAGTCCTAGGGATAGAAAATATCCAAACGGGTCAAGACCTAACCGGGTTGCCGGATCGGGTTATTGGAAAGCTACGGGTACG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: RE_059 AAAAGAATGGTATTTTTTTAGTCCTAGGGATAGAAAATATCCAAACGGGTCAAGACCTAACCGGGTTGCCGGATCGGGTTATTGGAAAGCTACGGGTACG 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 AT1G52 GATAAAATAATCTCGACGGAAGGACAAAGAGTTGGTATTAAAAAAGCTTTGGTGTTTTACATCGGAAAAGCTCCTAAAGGTACTAAAACCAATTGGATCA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: RE_059 GATAAAATAATCTCGACGGAAGGACAAAGAGTTGGTATCAAAAAAGCTTTGGTGTTTTACATCGGAAAAGCTCCTAAAGGTACTAAAACCAATTGGATCA 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 480 490 500 AT1G52 TGCATGAGTATCGTCTCATTGAACCTTCTCGTAGAAACGGAAGCACTAAGTTGGATGATTGGGTTCTATGTCGAATATACAAGAAGCAATCAAGTGCACA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: RE_059 TGCATGAGTATCGTCTCATTGAACCTTCTCGTAGAAACGGAAGCACTAAGTTGGATGATTGGGTTCTATGTCGAATATACAAGAAGCAATCAAGTGCACA 410 420 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 540 550 560 570 580 590 600 AT1G52 AAAACAAGTTTACGATAATGGAATCGCGAATGCTAGAGAATTCAGCAACAACGGTACTTCGTCCACGACGTCGTCTTCTTCTCACTTTGAAGACGTTCTT :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: RE_059 AAAACAAGTTTACGATAATGGAATCGCGAATGCTAGAGAATTCAGCAACAACGGTACTTCGTCCACGACGTCGTCTTCTTCTCACTTTGAAGACGTTCTT 510 520 530 540 550 560 570 580 590 600 610 620 630 640 650 660 670 680 690 700 AT1G52 GATTCGTTTCATCAAGAGATCGACAACAGAAATTTCCAGTTTTCTAACCCAAACCGCATCTCGTCGCTCAGACCGGACTTAACCGAACAGAAAACCGGGT :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: RE_059 GATTCGTTTCATCAAGAGATCGACAACAGAAATTTCCAGTTTTCTAACCCAAACCGCATCTCGTCGCTCAGACCGGACTTAACCGAACAGAAAACCGGGT 610 620 630 640 650 660 670 680 690 700 710 720 730 740 750 760 770 780 790 800 AT1G52 TCCACGGTCTTGCGGATACTTCTAACTTCGATTGGGCTAGTTTTGCCGGTAATGTTGAGCATAATAACTCGGTACCGGAACTCGGAATGAGTCATGTTGT :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: RE_059 TCCACGGTCTTGCGGATACTTCTAACTTCGATTGGGCTAGTTTTGCCGGTAATGTTGAGCATAATAACTCGGTACCGGAACTCGGAATGAGTCATGTTGT 710 720 730 740 750 760 770 780 790 800 810 820 830 840 850 860 870 880 890 900 AT1G52 TCCTAATCTCGAGTACAACTGTGGCTACCTGAAGACGGAGGAGGAAGTCGAGAGCAGTCACGGGTTTAATAACTCGGGCGAGTTAGCTCAAAAGGGTTAT :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: RE_059 TCCTAATCTCGAGTACAACTGTGGCTACCTGAAGACGGAGGAGGAAGTCGAGAGCAGTCACGGGTTTAATAACTCGGGCGAGTTAGCTCAAAAGGGTTAT 810 820 830 840 850 860 870 880 890 900 910 920 930 940 950 AT1G52 GGTGTTGACTCGTTTGGGTATTCGGGGCAAGTTGGTGGGTTTGGGTTTATG ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: RE_059 GGTGTTGACTCGTTTGGGTATTCGGGGCAAGTTGGTGGGTTTGGGTTTATG 910 920 930 940 950 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 AT1G52 MGIQETDPLTQLSLPPGFRFYPTDEELMVQYLCRKAAGYDFSLQLIAEIDLYKFDPWVLPNKALFGEKEWYFFSPRDRKYPNGSRPNRVAGSGYWKATGT :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: RE_059 MGIQETDPLTQLSLPPGFRFYPTDEELMVQYLCRKAAGYDFSLQLIAEIDLYKFDPWVLPNKALFGEKEWYFFSPRDRKYPNGSRPNRVAGSGYWKATGT 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 AT1G52 DKIISTEGQRVGIKKALVFYIGKAPKGTKTNWIMHEYRLIEPSRRNGSTKLDDWVLCRIYKKQSSAQKQVYDNGIANAREFSNNGTSSTTSSSSHFEDVL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: RE_059 DKIISTEGQRVGIKKALVFYIGKAPKGTKTNWIMHEYRLIEPSRRNGSTKLDDWVLCRIYKKQSSAQKQVYDNGIANAREFSNNGTSSTTSSSSHFEDVL 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 AT1G52 DSFHQEIDNRNFQFSNPNRISSLRPDLTEQKTGFHGLADTSNFDWASFAGNVEHNNSVPELGMSHVVPNLEYNCGYLKTEEEVESSHGFNNSGELAQKGY :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: RE_059 DSFHQEIDNRNFQFSNPNRISSLRPDLTEQKTGFHGLADTSNFDWASFAGNVEHNNSVPELGMSHVVPNLEYNCGYLKTEEEVESSHGFNNSGELAQKGY 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 310 AT1G52 GVDSFGYSGQVGGFGFM ::::::::::::::::: RE_059 GVDSFGYSGQVGGFGFM 310

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