◆◆◆RE_1120 detail◆◆◆

Code nameRE_1120
LocusAT3G20770
Forward primer
Reverse primer
Alignment with TAIR7CDSアミノ酸配列100%一致
comment(manual:0520_third_0.5_1120F/0708_third_1120F/W3/W1/Rrc)
sequence
>RE_1120_1884bp
ATGATGTTTAATGAGATGGGAATGTGTGGAAACATGGATTTCTTCTCTTCTGGATCACTTGGTGAAGTTGATTTCTGTCCTGTTCCACAAGCTGAGCCTG
ATTCCATTGTTGAAGATGACTATACTGATGATGAGATTGATGTTGATGAATTGGAGAGGAGGATGTGGAGAGACAAAATGCGGCTTAAACGTCTCAAGGA
GCAGGATAAGGGTAAAGAAGGTGTTGATGCTGCTAAACAGAGGCAGTCTCAAGAGCAAGCTAGGAGGAAGAAAATGTCTAGAGCTCAAGATGGGATCTTG
AAGTATATGTTGAAGATGATGGAAGTTTGTAAAGCTCAAGGCTTTGTTTATGGGATTATTCCGGAGAATGGGAAGCCTGTGACTGGTGCTTCTGATAATT
TAAGGGAGTGGTGGAAAGATAAGGTTAGGTTTGATCGTAATGGTCCTGCGGCTATTACCAAGTATCAAGCGGAGAATAATATCCCGGGGATTCATGAAGG
TAATAACCCGATTGGACCGACTCCTCATACCTTGCAAGAGCTTCAAGACACGACTCTTGGATCGCTTTTGTCTGCGTTGATGCAACACTGTGATCCTCCT
CAGAGACGTTTTCCTTTGGAGAAAGGAGTTCCTCCTCCGTGGTGGCCTAATGGGAAAGAGGATTGGTGGCCTCAACTTGGTTTGCCTAAAGATCAAGGTC
CTGCACCTTACAAGAAGCCTCATGATTTGAAGAAGGCGTGGAAAGTCGGCGTTTTGACTGCGGTTATCAAGCATATGTTTCCTGATATTGCTAAGATCCG
TAAGCTCGTGAGGCAATCTAAATGTTTGCAGGATAAGATGACTGCTAAAGAGAGTGCTACCTGGCTTGCTATTATTAACCAAGAAGAGTCCTTGGCTAGA
GAGCTTTATCCCGAGTCATGTCCACCTCTTTCTCTGTCTGGTGGAAGTTGCTCGCTTCTGATGAATGATTGCAGTCAATACGATGTTGAAGGTTTCGAGA
AGGAGTCTCACTATGAAGTGGAAGAGCTCAAGCCAGAAAAAGTTATGAATTCTTCAAACTTTGGGATGGTTGCTAAAATGCATGACTTTCCTGTCAAAGA
AGAAGTCCCAGCAGGAAACTCGGAATTCATGAGAAAGAGAAAGCCAAACAGAGATCTGAACACTATTATGGACAGAACCGTTTTCACCTGCGAGAATCTT
GGGTGTGCGCACAGCGAAATCAGCCGGGGATTTCTGGATAGGAATTCGAGAGACAACCATCAACTGGCATGTCCACATCGAGACAGTCGCTTACCGTATG
GAGCAGCACCATCCAGGTTTCATGTCAATGAAGTTAAGCCTGTAGTTGGATTTCCTCAGCCAAGGCCAGTGAACTCAGTAGCCCAACCAATTGACTTAAC
GGGTATAGTTCCTGAAGATGGACAGAAGATGATCTCAGAGCTCATGTCCATGTACGACAGAAATGTCCAGAGCAACCAAACCTCTATGGTCATGGAAAAT
CAAAGCGTGTCACTGCTTCAACCCACAGTCCATAACCATCAAGAACATCTCCAGTTCCCAGGAAACATGGTGGAAGGAAGTTTCTTTGAAGACTTGAACA
TCCCAAACAGAGCAAACAACAACAACAGCAGCAACAATCAAACGTTTTTTCAAGGGAACAACAACAACAACAATGTGTTTAAGTTCGACACTGCAGATCA
CAACAACTTTGAAGCTGCACATAACAACAACAATAACAGTAGCGGCAACAGGTTCCAGCTTGTGTTTGATTCCACACCGTTCGACATGGCGTCATTCGAT
TACAGAGATGATATGTCGATGCCAGGAGTAGTAGGAACGATGGATGGAATGCAGCAGAAGCAGCAAGATGTATCCATATGGTTC

>RE_1120_translated
MMFNEMGMCGNMDFFSSGSLGEVDFCPVPQAEPDSIVEDDYTDDEIDVDELERRMWRDKMRLKRLKEQDKGKEGVDAAKQRQSQEQARRKKMSRAQDGIL
KYMLKMMEVCKAQGFVYGIIPENGKPVTGASDNLREWWKDKVRFDRNGPAAITKYQAENNIPGIHEGNNPIGPTPHTLQELQDTTLGSLLSALMQHCDPP
QRRFPLEKGVPPPWWPNGKEDWWPQLGLPKDQGPAPYKKPHDLKKAWKVGVLTAVIKHMFPDIAKIRKLVRQSKCLQDKMTAKESATWLAIINQEESLAR
ELYPESCPPLSLSGGSCSLLMNDCSQYDVEGFEKESHYEVEELKPEKVMNSSNFGMVAKMHDFPVKEEVPAGNSEFMRKRKPNRDLNTIMDRTVFTCENL
GCAHSEISRGFLDRNSRDNHQLACPHRDSRLPYGAAPSRFHVNEVKPVVGFPQPRPVNSVAQPIDLTGIVPEDGQKMISELMSMYDRNVQSNQTSMVMEN
QSVSLLQPTVHNHQEHLQFPGNMVEGSFFEDLNIPNRANNNNSSNNQTFFQGNNNNNNVFKFDTADHNNFEAAHNNNNNSSGNRFQLVFDSTPFDMASFD
YRDDMSMPGVVGTMDGMQQKQQDVSIWF
Alignment CDS(TAIRver.9)_without_stop_codonとのalignment

100%一致しました。

このページのTOPに戻る