Input
| Putative repression domain
|
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AT1G02065.1 |
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|
Ortholog
| Putative repression domain
| Reverse top hit
| Relation
| Blast score ratio
| Type
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Os025905 |
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AT1G02065.1 |
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Ib |
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not found in 336aa |
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0.447540983 |
II |
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not found in 338aa |
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II |
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not found in 311aa |
AT1G02065.1 |
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II |
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not found in 328aa |
AT1G02065.1 |
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Ia |
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not found in 325aa |
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II |
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AT1G02065.1 |
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Ib |
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AT1G02065.1 |
1st_1st |
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Ib |
Get sequence file
Get alignment file
Get formatted file made by BOXSHADE
Sequence file prepared (0 sec required). Alignment has started.
CLUSTAL format alignment by MAFFT FFT-NS-2 (v7.475)
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Sm013718_Selmo1 ------------------------------------------------------------
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Sm013718_Selmo1 ------------------------------------------------------------
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Sm013718_Selmo1 ------------------------------------------------------------
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Sm013718_Selmo1 ------------------------------------------------------------
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Sm013718_Selmo1 ------------------------------------------------------------
gm006790_Glyma0 ------------SM----------LSLDPLPHVNAV--GPGH---------------GPG
Os025905_Os06t0 ------------------------MAAPP-PPPMPMPLQMPMTM------------PMPG
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Sm013718_Selmo1 ------------------------------------------------------------
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Sm013718_Selmo1 --------------------------------------------GA--Q--VPLCQAEGC
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Os025905_Os06t0 QDAAAGRIGLNLGRRTYFSPGDMLAVDRLLMRSRLGGVFGLGFGGA--HHQPPRCQAEGC
pt037928_POPTR_ SDLITSRIGLNLGGRTYFSSAEDDFVKRLYRRSRPLD------PGS--SSNALRCQAEGC
pp001220_Pp1s25 H-A---RIGLNLGVRTYFSTEDT-TTNRLVKRHRAGS------PGP--H--IPLCQAEGC
* ******
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Sm013718_Selmo1 KADLSGAKHYHRRHKVCELHSKAATVTANGQTQRFCQQCSRFHPLSEFDEGKRSCRKRLA
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Os025905_Os06t0 KADLSGAKHYHRRHKVCEYHAKASVVAASGKQQRFCQQCSRFHVLTEFDEAKRSCRKRLA
pt037928_POPTR_ NADLTHAKHYHRRHKVCEFHSKASTVIAAGLTQRFCQQCSRFHILSEFDNGKRSCRKRLA
pp001220_Pp1s25 KSDLSTAKQYHRRHKVCELHSKAPNVVAGGQTQRFCQQCSRFHSLGEFDDGKRSCRKRLA
::**: **:********* *:**. * * * *********** * ***: *********
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pp001220_Pp1s25 DHNRRRRKPQPYAS-----APGG------TSAE--CIGIKNGEDNLSGSNHANDSKS---
:*******
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.
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*
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pt037928_POPTR_ ------------------------------------------------------------
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AT1G02065.1 ----
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gm006791_Glyma0 ----
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Os025905_Os06t0 VDFM
pt037928_POPTR_ ----
pp001220_Pp1s25 ----
BoxShade v3.31 C (beta, 970507) Output
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