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| Input | Putative repression domain | ||||
|---|---|---|---|---|---|
| AT1G04240.1 | NLKETELRLGLPGTDN at 10/189 in AT1G04240.1 | ||||
| Ortholog | Putative repression domain | Reverse top hit | Relation | Blast score ratio | Type |
| Gm004012 | NLEATELRLGLPGSDE in 18/202 | AT5G43700.1 | not_not | 0.579746835 | III |
| Gm007180 | NLKATELRLGLPGCDE in 15/206 | AT5G43700.1 | not_not | 0.531645569 | III |
| Gm052264 | NLKATELRLGLPGCDE in 14/204 | AT5G43700.1 | not_not | 0.531645569 | III |
| Gm055526 | NFEETELRLGLPGNDS in 8/227 | AT3G04730.1 | not_not | 0.473417721 | III |
| ETASVDLKLNLSSCIN in 36/227 | |||||
| Gm027863 | NFEETELRLGLPGGSA in 8/231 | AT3G04730.1 | not_not | 0.443037974 | III |
| ETASVDLKLNLSSSDD in 43/231 | |||||
| Gm052265 | NLKATELRLGLPGCDE in 14/181 | AT5G43700.1 | not_not | 0.435443037 | III |
| Gm028045 | LTNEHGLSLNLKETEL in 10/239 | AT3G23050.1 | not_not | 0.435443037 | III |
| FSETVDLKLNLQTKED in 47/239 | |||||
| Gm008159 | NFEETELRLGLPLSGN in 17/243 | AT3G04730.1 | not_not | 0.435443037 | III |
| SDTAVDLKLNLSSTSN in 47/243 | |||||
| Gm053213 | NFEETELRLGLPLSGN in 17/230 | AT3G04730.1 | not_not | 0.422784810 | III |
| SDTSVDLKLNLSSTSN in 48/230 | |||||
| Gm017314 | GLEITELRLGLPDAEH in 12/187 | AT3G15540.1 | not_not | 0.422784810 | III |
| HKGYSDLALALDKLFG in 104/187 | |||||
| Gm040862 | NLKETELRLGLPGCES in 41/314 | AT4G29080.1 | not_not | 0.420253164 | III |
| Gm055369 | NLKETELCLGLPGGGG in 76/306 | AT4G14550.1 | not_not | 0.420253164 | III |
| FSETVDLKLNLHSKED in 115/306 | |||||
| Gm026656 | NLEATELRLGLPGSDE in 14/215 | AT5G43700.1 | not_not | 0.417721518 | III |
| Gm040859 | NLKETELRLGLPGCES in 41/319 | AT4G29080.1 | not_not | 0.412658227 | III |
| Gm052267 | GFEETELRLGLPGNGG in 16/252 | AT3G04730.1 | not_not | 0.412658227 | III |
| SATTVDLMLNLSSKEA in 53/252 | |||||
| Gm052266 | NLKATELRLGLPGCDE in 14/177 | AT5G43700.1 | not_not | 0.412658227 | III |
| Gm007181 | GFEETELRLGLPGNVG in 17/254 | AT4G14550.1 | not_not | 0.410126582 | III |
| SATTVDLMLNLSSKEA in 58/254 | |||||
| Gm038262 | NLKETELRLGLPGCES in 32/307 | AT4G29080.1 | not_not | 0.402531645 | III |
| Gm022022 | GLEITELRLGLPDAEH in 12/195 | AT3G15540.1 | not_not | 0.402531645 | III |
| HKGYSDLALALDKLFG in 112/195 | |||||
| Gm040251 | NLKATELRLGLPGLQS in 72/367 | AT5G65670.2 | not_not | 0.4 | III |
Get sequence file
Get alignment file
Get formatted file made by BOXSHADE
Sequence file prepared (0 sec required). Alignment has started.
CLUSTAL format alignment by MAFFT FFT-NS-2 (v7.475)
AT1G04240.1 ------------------------------------------------------------
gm052264_Glyma1 ------------------------------------------------------------
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gm052266_Glyma1 ------------------------------------------------------------
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gm052267_Glyma1 -----------------------------------------------------------M
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gm004012_Glyma0 -----------------------------------------------------------M
gm017314_Glyma0 -----------------------------------------------------------M
gm040862_Glyma1 -----------------------------------------------------------M
gm053213_Glyma1 MEAEP--------------------------------------------------DKYKM
gm007181_Glyma0 -----------------------------------------------------------M
gm040251_Glyma1 -----------------------------------------------------------M
gm055369_Glyma2 MTAKQTKQHYNRKRTQSEREGSYSHKEKNFQRGESKRVLLFLFYIYLGAKLCEFIDKPEM
gm055526_Glyma2 -----------------------------------------------------------M
gm038262_Glyma1 -----------------------------------------------------------M
gm040859_Glyma1 -----------------------------------------------------------M
gm052265_Glyma1 ------------------------------------------------------------
AT1G04240.1 ---------------------------------------------------------MDE
gm052264_Glyma1 ---M-------G-------------------------------------------SFETE
gm007180_Glyma0 ---M-------G-------------------------------------------SFETE
gm028045_Glyma1 TTML-------------------------------TNEHGL-------------------
gm052266_Glyma1 ---M-------G-------------------------------------------SFETE
gm026656_Glyma1 ---M-------G-------------------------------------------KYEKE
gm027863_Glyma1 ------------------------------------------------------------
gm022022_Glyma0 AK--------EG------------------------------------------------
gm052267_Glyma1 EVGL--------------------------------KKEN--------------------
gm008159_Glyma0 ------------------------------------------------------------
gm004012_Glyma0 ENSL-------G-------------------------------------------KYGKE
gm017314_Glyma0 AK--------EG------------------------------------------------
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gm053213_Glyma1 ------------------------------------------------------------
gm007181_Glyma0 EVGL-------------------------------NKKEN--------------------
gm040251_Glyma1 SKPLLGIGEEEGQSNVTLLVSSSVIMESVCLNSSKLKERNYMGLSDCSSVDSSAPSFSDE
gm055369_Glyma2 ATML-------------------------------TKEHG--------------------
gm055526_Glyma2 ------------------------------------------------------------
gm038262_Glyma1 SRAL---------------------------------EHDYIGLAENPSMDGKN------
gm040859_Glyma1 SRAL---------------------------------EHDYIGLAENPSMDGSSDKLSSE
gm052265_Glyma1 ---M-------G-------------------------------------------SFETE
AT1G04240.1 F-----VNLKETELRLGLPGTDN-----------VC-------------------EAKER
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gm007180_Glyma0 L-----MNLKATELRLGLPGCD---------------------------------ETNEK
gm028045_Glyma1 -----SLNLKETELCLGLP-----------GGG------------------------SEV
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gm027863_Glyma1 ------INFEETELRLGLP------------GGSAS-------------------DHNES
gm022022_Glyma0 ------LGLEITELRLGLP------------------------------------DAEHQ
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gm004012_Glyma0 L------NLEATELRLGLPGSD---------------------------------EPEKR
gm017314_Glyma0 ------LGLEITELRLGLP------------------------------------DAEH-
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gm053213_Glyma1 ------INFEETELRLGLPL----------SG-------------------------NET
gm007181_Glyma0 ------MGFEETELRLGLPGNV------GGTG-------------------------TEE
gm040251_Glyma1 T--KSNLNLKATELRLGLPGLQSPERD---SD--LCLRSSIQFDEKPLFPLHPATDDHHS
gm055369_Glyma2 ------LNLKETELCLGLPGGGGGGGGGGGGGG------------------------GEV
gm055526_Glyma2 ------INFEETELRLGLP------------G-------------------------NDS
gm038262_Glyma1 ---SSSLNLKETELRLGLPGCESPERK---SGSALC-----------LFGKELQNNNNNV
gm040859_Glyma1 DGKTSSLNLKETELRLGLPGCESPERK---SGSALC-----------LFGKELQ-NNNNV
gm052265_Glyma1 L------NLKATELRLGLPGCD---------------------------------ETHDK
.:: *** **** .
AT1G04240.1 VS----CCNNNNKRVLST----DTEKE---------------------------------
gm052264_Glyma1 SSSSSGSVVRSNKRSSPE----PSVEE---------SRC---------------------
gm007180_Glyma0 SSSSSGSVVRSNKRSSPE----PSVEE---------SRC---------------------
gm028045_Glyma1 ET-PR----ATGKRGFSE-----T---------------------------VDLKL----
gm052266_Glyma1 SSSSSGSVVRSNKRSSPE----PSVEE---------SRC---------------------
gm026656_Glyma1 ------SIVRSNKRSSTE----ASEEEC-------ISKG---------------------
gm027863_Glyma1 TT-VK-G--SGGKRGFSE-----TA-------------------------SVDLKL----
gm022022_Glyma0 VSVVN--KKNEKKRAFSE---------------------------------IDDGV----
gm052267_Glyma1 VL-IR-------KRGFSE-----TET-GHEDES---------------ATTVDLML----
gm008159_Glyma0 -T-LK-TTCSTGKRVFSD-----TA--------------------------VDLKL----
gm004012_Glyma0 ------SAVRSNKRSSPE----ASEEEC-------ISKG---------------------
gm017314_Glyma0 VTVVN---KNEKKRAFSQ---------------------------------ID-------
gm040862_Glyma1 CSVVS-PLKAGAKRGFSD------VTEG--------SQGA-ALFSPR-GANVG-KPIIGL
gm053213_Glyma1 -T-LK-NTCSTGKRVFSD-----TS--------------------------VDLKL----
gm007181_Glyma0 VL-IR-------KRGFSE-----TETETEEDES---------------ATTVDLML----
gm040251_Glyma1 SS--K-PAVLGNKRGFSD------VMSGFAEEKLLVSSEVNTILSPRPSSNVALKP----
gm055369_Glyma2 ET-PR----ATGKRGFSE-----T---------------------------VDLKL----
gm055526_Glyma2 -A-LK-G--SAAKRGFSE-----TA-------------------------SVDLKL----
gm038262_Glyma1 CS-----LKAGAKRGFSDAIDTSSVTEG--------SQGASALFSPR-GGNVG-KPLIGL
gm040859_Glyma1 CSVVS-PLKAGAKRGFSD------VTEG--------SQGA-ALFSPR-GANVG-KPIIGL
gm052265_Glyma1 SSSSSGSVVRSNKRSSPE----PSVEE---------SRC---------------------
** .
AT1G04240.1 ---------IESSSRK----------------------------------TETS------
gm052264_Glyma1 --------NSNGSSDS----------------------------------TTTS------
gm007180_Glyma0 --------NSNGSSDS----------------------------------TTTS------
gm028045_Glyma1 --------NLQT--KE----------DLNENLKNVSKE-------------KTL------
gm052266_Glyma1 --------NSNGSSDS----------------------------------TTTS------
gm026656_Glyma1 --------NMN-SNGS----------------------------------DITS------
gm027863_Glyma1 --------NLSSS-DD----------SASDSPSSASTE-------------KTTTAAPPP
gm022022_Glyma0 -----GDENSSSGGGD--------------------------------RKMETN------
gm052267_Glyma1 --------NLSS--KEAATT-AAAAADPTDKHKTLPKE-------------KTL---LPA
gm008159_Glyma0 --------NLSSTSNS----------ASSD----LTKE-------------KNITAAAPP
gm004012_Glyma0 --------NMNSSDGS----------------------------------DITS------
gm017314_Glyma0 ------DENSSS-GGD--------------------------------RKIKTN------
gm040862_Glyma1 DTQTNTQQQANTTIKEVGAVLPQSTKPVQEKNDQVA----------------------AT
gm053213_Glyma1 --------NLSSTSNN-----------------------------------------APP
gm007181_Glyma0 --------NLSS--KE-----AAAAADPTDKHKTLPKE-------------KTL---LPA
gm040251_Glyma1 ----------SSMLENVGAQ--------QSKAKELATAKVGLERSHVFNDSRTN-LNDSA
gm055369_Glyma2 --------NLHS--KE----------DLNENLKNVSKE-------------KTL------
gm055526_Glyma2 --------NLSSCIND----------SASDSPSSVSTEKP--------KENKTTTAEPPP
gm038262_Glyma1 DTQT------NTTIKEVGAV-PQSAKPVQENNDQFA----------------------AT
gm040859_Glyma1 DTQTNTQQQANTTIKEVGAVLPQSTKPVQEKNDQVA----------------------AT
gm052265_Glyma1 --------NSNGSSDS----------------------------------TTTS------
.
AT1G04240.1 ---------PPRKAQIVGWPPVRSYRKNN---IQSKKN-E--S-EHEGQ---------GI
gm052264_Glyma1 --DHDEDSVQPAKVQVVGWPPIRSFRKNS---LQQQKKVE--Q-QGDGS---------GT
gm007180_Glyma0 --DHDQDSAQPEKVQVVGWPPIRSFRKNS---LQQQKKVE--QLQGDGG---------GM
gm028045_Glyma1 ---LKDPAKPPAKAQVVGWPPVRSYRKNMMA-VQKVSN-E--E-VAEKTTSSTIANSG-A
gm052266_Glyma1 --DHDEDSVQPAKVQVVGWPPIRSFRKNS---LQQQKKVE--Q-QGDGS---------GT
gm026656_Glyma1 --DDQDNLVPPAKAQVVGWPPVRSYRKNT---LQQKK--E--E-QGEGS---------GM
gm027863_Glyma1 PSRANDPAKPPAKAQVVGWPPVRSFRKNI---VQRNKN-E--E-EA-------------A
gm022022_Glyma0 ------------KSQVVGWPPVCSYRKKN-------------S-MNEGAS--------KM
gm052267_Glyma1 -----DPAKPPAKTQVVGWPPVRSFRKNMLA-VQKSVG-E--E-SEKN-SSPN-----AS
gm008159_Glyma0 ---ANDPAKPPAKAQVVGWPPVRSFRKNI---VQRSNN-NEGE-KAATSSSNN-VNTGAA
gm004012_Glyma0 --DDQDNVVPPAKAQVVGWPPVRSYRKNS---LQQKK--E--E-QAEGA---------GM
gm017314_Glyma0 ------------KSQVVGWPPVCSYRKKN-------------S-MNEG-S--------KM
gm040862_Glyma1 ---NGHASAPAAKAQVVGWPPIRSFRKNTMA-SNLTKN-N--D-DDEGKSGFG-----CL
gm053213_Glyma1 ------PAKPPAKAQVVGWPPVRSFRKNIVNNVQRSNN-NDGE-KAATSSSNN-VNMGAA
gm007181_Glyma0 -----DPAKPPAKAQVVGWPPVRSFRKNMLA-VQKSVG-E--E-NEKNSSSPN-----AS
gm040251_Glyma1 ---NNNSSAPATKAQVVGWPPIRSFRKNSLA-TT-TKN-V--E-EVDGKAGSG-----AL
gm055369_Glyma2 ---LKDPAKPPAKAQVVGWPPVRSYRKNMMA-VQKVST-E--D-VAEKTTSST-ANPG-A
gm055526_Glyma2 ---ANDPAKPPAKAQVVGWPPVRSFRKNI---VQRNSN-E--E-EAEKSTKN-------A
gm038262_Glyma1 ---NAHAIAPAAKAQVVGWPPIRSFRKNTMA-SNLTKN-N--D-EAEGKSGFG-----CL
gm040859_Glyma1 ---NGHASAPAAKAQVVGWPPIRSFRKNTMA-SNLTKN-N--D-DDEGKSGFG-----CL
gm052265_Glyma1 --DHDEDSVQPAKVQVVGWPPIRSFRKNS---LQQQKKVE--Q-QGDGS---------GT
* *:*****: *:**: .
AT1G04240.1 YVKVSMDGAPYLRKIDLSCYKGYSELLKALEVMFKF-SV---------------------
gm052264_Glyma1 YLKVSMAGAPYLRKIDLKVYNSYPELLMALQNLFKC-TF---------------------
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gm028045_Glyma1 FVKVSMDGAPYLRKVDLTMYKSYKDLSDALAKMFSSFTMGNYGAQGM--IDFM-------
gm052266_Glyma1 YLKVSMAGAPYLRKIDLKVYNSYPELLMALQNLFKC-TF---------------------
gm026656_Glyma1 YVKVSMAGAPYLRKIDLNVYKSYPELLKALGNMFKC-TFGKNLEQVL--NNLLLFFLAFL
gm027863_Glyma1 FVKVSMDGAPYLRKVDIKLYKSYQELSDALAKMFSSFTIEKCGSQGM--KDFM-------
gm022022_Glyma0 YVKVSMDGAPFLRKIDLGLHKGYSDLALALDKLFGCYGM----------VEAL-------
gm052267_Glyma1 FVKVSMDGAPYLRKVDLKMYKSYRELSDSLGKMFSSFTFGNCESQGM--KDFM-------
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gm004012_Glyma0 YVKVSMEGAPYLRKIDLKVYKSYPELLKALENMFKC-TF---------------------
gm017314_Glyma0 YVKVSMDGAPFLRKIDLGLHKGYSDLALALDKLFGSYGM----------VEAL-------
gm040862_Glyma1 YVKVSMDGAPYLRKVDLKTYNNYMELSSALEKMFSCFTIGQCNSPGLPGKDGL-------
gm053213_Glyma1 FVKVSMDGAPYLRKVDLKMYKSHQELLDALAKMFSSFTIDKCSSQGM--KDFM-------
gm007181_Glyma0 FVKVSMDGAPYLRKVDLKMYKSYRELSDSLGKMFSSFTIGNCESQGM--KDFM-------
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gm055369_Glyma2 FVKVSMDGAPYLRKVDLTMYKSYKELSDALAKMFSSFTMGNYGAQGM--IDFM-------
gm055526_Glyma2 FVKVSMDGAPYLRKVDIKLYKSYQELSDALAKMFSSFTIEKCGSQGM--KDFM-------
gm038262_Glyma1 YVKVSMDGAPYLRKVDLKTYNNYMELSSALEKMFSCFTIGQCNSPGLPGKDGL-------
gm040859_Glyma1 YVKVSMDGAPYLRKVDLKTYNNYMELSSALEKMFSCFTIGQCNSPGLPGKDGL-------
gm052265_Glyma1 YLKVSMAGAPYLRKIDLKVYNSYPELLMALQNLFKC-TF---------------------
::**** ***:***:*: :. : :* :* :* .
AT1G04240.1 ----------------------GEYFERDGYKGSDFVPTYEDKDGDWMLIGDVPWEMFIC
gm052264_Glyma1 ----------------------GEYSEREGYNGSEYAPTYEDKDGDWMLVGDVPWNMFVS
gm007180_Glyma0 ----------------------GEYSEREGYNGSEYAPTYEDKDGDWMLVGDVPWNMFVS
gm028045_Glyma1 ----------------------NESKLMDLLNSSEYVPTYEDKDGDWMLVGDVPWEMFVG
gm052266_Glyma1 --------------------------EREGYNGSEYAPTYEDKDGDWMLVGDVPWK----
gm026656_Glyma1 RLIWHIYVYVERRNKVVIACDPGEYSEREGYNGSEYAPTYEDKDGDWMLVGDVPWK----
gm027863_Glyma1 ----------------------NETKLIDLLNGSDYVPTYQDKDGDWMLVGDVPWEMFVE
gm022022_Glyma0 ------------KNA----------------DNSEHVPIYEDKDGDWMLVGDVPWEMFME
gm052267_Glyma1 ----------------------NESKLNDLLNSSDYVPTYEDKDGDWMLVGDVPWEMFVE
gm008159_Glyma0 ----------------------NESKLIDLLNGSDYVPTYEDKDADWMLVGDVPWEMFVE
gm004012_Glyma0 ----------------------GQYSEREGYNGSEYAPTYEDKDGDWMLVGDVPWNMFVS
gm017314_Glyma0 ------------KNA----------------DNSEHVPIYEDKDGDWMLVGDVPWEMFME
gm040862_Glyma1 ----------------------SESSLRDLLHGSEYVLTYEDKDGDWMLVGDVPWEMFTD
gm053213_Glyma1 ----------------------NEGKLIDLLNGSDYVPTCEDKDGDWMLVGDVPWEILVE
gm007181_Glyma0 ----------------------NESKLNDLLNSSDYVPTYEDKDGDWMLVGDVPWEMFVE
gm040251_Glyma1 ----------------------NETKLKDLLHGSEYVLTYKDKDGDWMLVGDVPWEMFIE
gm055369_Glyma2 ----------------------NESKLMDLLNSSEYVPSYEDKDGDWMLVGDVPWEMFVE
gm055526_Glyma2 ----------------------NET------NGSDYVPTYEDKDGDWMLVGDVPWEMFVE
gm038262_Glyma1 ----------------------SESSLRDLLHGSEYVLTYEDKDGDWMLVGDVPWEMFTD
gm040859_Glyma1 ----------------------SESSLRDLLHGSEYVLTYEDKDGDWMLVGDVPWEMFTD
gm052265_Glyma1 ----------------------GEYSEREGYNGSEYAPTYEDKDGDWMLVGDVPWK----
..*:.. :***.****:*****:
AT1G04240.1 TCKRLRIMKGSEAK--GLGCGV-----------
gm052264_Glyma1 SCKRLKIIKGSEAK--GLGCL------------
gm007180_Glyma0 SCKRLKIIKGSEAK--GLGCL------------
gm028045_Glyma1 SCKRLRIMKGSEAI--GLAPRAMEKCKSRS---
gm052266_Glyma1 ---------------------------------
gm026656_Glyma1 ---------------------------------
gm027863_Glyma1 SCQRLRIMKGSEAI--GLAPRAVEKCKNRS---
gm022022_Glyma0 SCKRLRIMKKSDAKGFGLQPKGSLKGFIESAAK
gm052267_Glyma1 SCKRLRIMKGKEAIGLGLAPRAMAKCKNRS---
gm008159_Glyma0 SCKRLRIMKGSEAI--GLAPRAVEKCKNRS---
gm004012_Glyma0 SCKRLRIMKGSEAK--GLGCF------------
gm017314_Glyma0 SCKRLRIMKRSDAKGFGLQPKGSLKGFIESAAK
gm040862_Glyma1 SCRRLRIMKGSEAI--GL---GMSYSYF-----
gm053213_Glyma1 SCKRLRIMKGSAAI--GLAPRAVQKCKNRS---
gm007181_Glyma0 SCKRLRIMKGKEAIGLGLAPRAMAKSKNRS---
gm040251_Glyma1 TCKRLRIMKSSEAI--GLAPRAVEKSKRRN---
gm055369_Glyma2 SCKRLRIMKGSEAI--GLAPRAMEKCKSRS---
gm055526_Glyma2 SCKRLRIMKGSEAI--GLAPRAVEKCKNRS---
gm038262_Glyma1 SCRRLRIMKGSEAI--GLAPRAMEKSRSQN---
gm040859_Glyma1 SCRRLRIMKGSEAI--GLAPRAMEKSRSQN---
gm052265_Glyma1 ---------------------------------
| AT1G04240.1 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| gm052264_Glyma1 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| gm007180_Glyma0 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| gm028045_Glyma1 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | M |
| gm052266_Glyma1 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
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