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Get sequence file Get alignment file Get formatted file made by BOXSHADE Sequence file prepared (0 sec required). Alignment has started. CLUSTAL format alignment by MAFFT FFT-NS-2 (v7.475) AT1G04250.1 ------------------------------------------------------------ pt042254_POPTR_ MTT--------------------------------------------------------- gm040794_Glyma1 MSS------------------------------ESHAV---------------------- Os041779_Os12t0 MAA--------------------------------------------------------- gm055369_Glyma2 MTAKQTKQHYNRKRTQSEREGSYSHKEKNFQRGESKRVLLFLFYIYLGAKLCEFIDKPEM gm040791_Glyma1 MSS------------------------------ESHAV---------------------- Sb031861_Sorbi1 LDE-----HLPRHVA------------------DEHPV---------------------A gm040793_Glyma1 MSS------------------------------ESHAV---------------------- AT1G04250.1 -MMGSVE--LNLRETELCLGL--------P-------------GGDTVAP---------- pt042254_POPTR_ SVLGTERTDLNYKETELCLGL--------P--------GAVGAKNEVETP---------- gm040794_Glyma1 --------DCNLKETELTLGL--------P--------GT-------------------- Os041779_Os12t0 --------DLAFEATELRLGL--------P--------GGGGDGDAAAAA---------- gm055369_Glyma2 ATMLTKEHGLNLKETELCLGL--------PGGGGGGGGGGGGGGGEVETP---------- gm040791_Glyma1 --------DCNLKETELTLGL--------P--------GT-------------------- Sb031861_Sorbi1 VLVLVGRHVLGAVEQIHQLALVHAVHPLRP-------TASNGEGAEHLLERLGQLLVALV gm040793_Glyma1 --------DCNLKETELTLGL--------P--------GT-------------------- *.* * AT1G04250.1 ---------------------VTGN---KRGFSETVDLKLNLNNEP--------ANKEG- pt042254_POPTR_ -------------------NKATG----KRGFAETVDLKLNLQ------------AKEGV gm040794_Glyma1 --------------------KTTAT---KRGFSDTL---------PP------------- Os041779_Os12t0 -------------------ARSSSG---KRGFAETIDLKLKLE--PAAAAVDDDDDKEEA gm055369_Glyma2 --------------------RATG----KRGFSETVDLKLNLH------------SKE-- gm040791_Glyma1 --------------------KTTAT---KRGFSDTL---------PP------------- Sb031861_Sorbi1 HLEVHLAQVRRAVQAHLHERRTTASCRRRRGLVGVF---------AAAGAL--------- gm040793_Glyma1 --------------------KTTAT---KRGFSDTL---------PP------------- :. :**: .. AT1G04250.1 ---STTHDVVTFDSKEKSACP----------------------KDPAKPPA------KAQ pt042254_POPTR_ --MDLNENIKNITSKDKNHLPA------------------VTIKDPAKPPA------KAQ gm040794_Glyma1 -------------SQNKILRPT------------------------SKFPTP-----KEQ Os041779_Os12t0 AADDREKKVDIVGADNDDASPPAAAAAGGMKRSPSQSSVVTAAADPEKPRAP-----KAQ gm055369_Glyma2 ---DLNENLKNV-SKEKTLL-----------------------KDPAKPPA------KAQ gm040791_Glyma1 -------------SQNKILRPT------------------------SKFPTP----NREQ Sb031861_Sorbi1 -----------VGLHGHDVLP----------------------ERPDRWPSHHLSLGGAR gm040793_Glyma1 -------------SQNKILRPT------------------------SKFPTP-----KEQ . . : : : AT1G04250.1 VVGWPPVRSYRKNVMV------------SCQKSSGGPEA--AAFVKVSMDGAPYLRKIDL pt042254_POPTR_ VVGWPPVRSYRKNVMAQK-----NASEEGEKASTGGSSA---AFVKVCMDGAPYLRKVDL gm040794_Glyma1 LVGWPPVRASRKNAMKSC-----------------------CKLVKVAVDGAPYLRKVDL Os041779_Os12t0 VVGWPPVRSYRKNILAVQADKGKDAADGGGDKSGAGAAA--AAFVKVSMDGAPYLRKVDL gm055369_Glyma2 VVGWPPVRSYRKNMMAVQ-----KVSTEDVAEKTTSSTANPGAFVKVSMDGAPYLRKVDL gm040791_Glyma1 LVGWPPVRASRKNAMKSC-----------------------CKLVKVAVDGAPYLRKVDL Sb031861_Sorbi1 LLGGVSLHGGGGDDAALARGPLHLPADGGLLR--GGHAA--GVFLG---GGNTVLMLVRL gm040793_Glyma1 LVGWPPVRASRKNAMKSC-----------------------CKLVKVAVDGAPYLRKVDL ::* .::. : :: .* . * : * AT1G04250.1 RMYKSYDELSNALSNMFSSFTMGKHGGEEGMIDFMNERKLMDLVNSWDYVPSYEDK---- pt042254_POPTR_ KMYRSYQELSDALAKMFSSFTMGNYGA-QGMIDFMNESKLMDLLNSSEYVPSYEDK---- gm040794_Glyma1 DMYDSYEHLMRELETMFCGLAIRNH--------LMNERKLMDPGNGIEYMPTYEDK---- Os041779_Os12t0 KMYKSYLELSKALEKMFSSFTIGNCGS-HG-VNGMNESKIADLLNGSEYVPTYEDK---- gm055369_Glyma2 TMYKSYKELSDALAKMFSSFTMGNYGA-QGMIDFMNESKLMDLLNSSEYVPSYEDK---- gm040791_Glyma1 DMYDSYEHLMRELETMFCGLAIRNH--------LMNERKLMDPGNGIEYMPTYEDK---- Sb031861_Sorbi1 RRLQ-YGRGSRRLQLQLE-------------VDGLCEAPLP---GGDDRAPPFADHLSPA gm040793_Glyma1 DMYDSYEHLMRELETMFCGLAIRNH--------LMNERKLMDPGNGIEYMPTYEDK---- * . * : : * : .. : *.: *: AT1G04250.1 -------------------------------DGDWMLVGDVPWPMFVDTCKRLRLMKGSD pt042254_POPTR_ -------------------------------DGDWMLVGDVPWEMFVNSCKRLRIMKGSE gm040794_Glyma1 -------------------------------DGDWMLVGDVPWKMFVESCKRIRLMISSE Os041779_Os12t0 -------------------------------DGDWMLVGDVPWEMFVESCKRLRIMKGSE gm055369_Glyma2 -------------------------------DGDWMLVGDVPWEMFVESCKRLRIMKGSE gm040791_Glyma1 -------------------------------DGDWMLVGDVPWKMFVESCKRIRLMISSE Sb031861_Sorbi1 AGQAQTELRLLEPQVRRRHCCCRRHWPSSSPLGSRLLL--LPCFCFV--CFALLASQDEE gm040793_Glyma1 -------------------------------DGDWMLVGDVPWKMFVESCKRIRLMISSE *. :*: :* ** * : ..: AT1G04250.1 AIGLAPRAM-EKCKSRA-------------- pt042254_POPTR_ AIGLAPRAM-EKCKSRT-------------- gm040794_Glyma1 AVGLGPRSTSSKCTGST-------------- Os041779_Os12t0 AIGLAPRAM-EKCKNRS-------------- gm055369_Glyma2 AIGLAPRAM-EKCKSRS-------------- gm040791_Glyma1 AVGLGPRSTSSKCTGST-------------- Sb031861_Sorbi1 AGWL------CKCKGGGFANARGLGRGATTT gm040793_Glyma1 AVGLG-SSTSSKCTGST-------------- * * **..
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