|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Get sequence file Get alignment file Get formatted file made by BOXSHADE Sequence file prepared (0 sec required). Alignment has started. CLUSTAL format alignment by MAFFT FFT-NS-2 (v7.475) AT1G04250.1 -----------------------------------------MMG--S----VE------- pt039771_POPTR_ -MSPPLLGVVEEEGHSNVTLLASPASAESACLNGLELKERNYMGL-SDCSSVDS------ pt002101_POPTR_ --------------------------------------MTSIMG--AE--TADT------ pt005605_POPTR_ -MSMP--------------------------------LEHDYIGISSEVSSMENTSG--- pt030401_POPTR_ MYSIP--------------------------------KEHDYIGL-SETPSMENISEKLS pt033721_POPTR_ ------------------------------------MATATVLG--TE--MAD------- pt015737_POPTR_ --------------------------------------MTSIMG--AE---PEK------ pt001265_POPTR_ ----------------------------------------------ME---VEK------ pt011954_POPTR_ MSSIP--------------------------------KEHDYIGL-SETPSMEKISDKLS pt028468_POPTR_ -MSPE---------------------------NG------------SN--LLES------ pt001264_POPTR_ ----------------------------------------------ME---VEK------ pt039463_POPTR_ ----------------------------------------------ME---VEK------ : AT1G04250.1 --------------------------------LNLRETELCLGLPGG------------- pt039771_POPTR_ -------------------SAVSAASDERKTSLNLKATELRLGLPGSQSPERNHELSLLS pt002101_POPTR_ -----------------------------YSMINYEETELRLGLPGGAS----------- pt005605_POPTR_ -------------------TDTINISTTASKGLNLKATELRLGLPGSDSPERGNENQQLG pt030401_POPTR_ SSSTSSSTLSTEEKNNSSSSNSNNNNKNNNTSLNMKETELRLGLPGSQSPERKPTVPAAG pt033721_POPTR_ --------------------------------LNYKETELCLGLPGAVG----------- pt015737_POPTR_ -----------------------------YSMINFEETELRLGLPGGIG----------- pt001265_POPTR_ -----------------------------GTKMRFEETELRLGLPGNGG----------- pt011954_POPTR_ S---SSSTLSTEENIN---SNSNSNSNSTNTSLNLKETELRLGLPGYQSPERKLTLPAAG pt028468_POPTR_ ----------------------------DAANVSFKETELTLGLPGESR----------G pt001264_POPTR_ -----------------------------GTKMRFEETELRLGLPGNGG----------- pt039463_POPTR_ -----------------------------GTKMGFEETELRLGLPGNGG----------- : . *** ***** AT1G04250.1 -------------------DTVAP----VTGNKRGFSETVD-------------LKLNLN pt039771_POPTR_ SALLDEKPFFPLHPSNDGHYSSTQ-KNVVSGNKRVFSDAMDEFSESKFLSN---SEVN-- pt002101_POPTR_ --------------NGND-GEAAK----GNG-KRGFSETVD-------------LKLNL- pt005605_POPTR_ FSL-----------NNNNSKD----KSFVSGARRGFSVAIHGGSANWVFSGNAGSDPN-- pt030401_POPTR_ VSLVGKD----IDTNNTNAYSLIPVKNLVSGAKRVFSDAIDGSTGKWVFSG--------- pt033721_POPTR_ --------------VKNEVETPNK----ATG-KRGFAETVD-------------LKLNL- pt015737_POPTR_ --------------NGND-GEVAK----SNG-KRGFSETVD-------------LKLNL- pt001265_POPTR_ --------------GGTEGGEFAR--------KRGFSETVD-------------LKLNL- pt011954_POPTR_ VSLFGKD----IDTNNTNGYPLRPLKNLVSGTKRGFSDAIVGSSGKWVFSGSNGSEVDLG pt028468_POPTR_ LALIEK----------------------TSG-KRGFLETVD---------------LNL- pt001264_POPTR_ --------------GGTEGGEFAR--------KRGFSETVD-------------LKLNL- pt039463_POPTR_ --------------GAE--GEMVR--------KRGFSETVD-------------LKLKL- :* * :: AT1G04250.1 NE-----------------------------------PANKEG---STTHDVVTFDSKEK pt039771_POPTR_ ---AMLSPRPSPNMGLKPGMLENLGVQQAKVKEIVAPKAGQE----------RPHAANET pt002101_POPTR_ --------------------------------------STKETGKDGSDQEKV--VMKEK pt005605_POPTR_ -----FSLR---------------GAN-----------SGKEGFP----HSSKPVVQENK pt030401_POPTR_ ------------------------GDNGNPQKSRVAGPAKK-DVA----QSPKP-VQEKN pt033721_POPTR_ --------------------------------------QAKEGVM-DLNENIKNIASKDK pt015737_POPTR_ --------------------------------------STKESGK-GGDEEK---VMKEK pt001265_POPTR_ --------------------------------------SSKEGGI-DPNHEKT---QREK pt011954_POPTR_ KGAILFSPR---------------GDNGNSQKSCVAGPAKKDDVA----QSPKP-VQEKI pt028468_POPTR_ ------------------------GRSSNV----------------DSDHNKYS-GESET pt001264_POPTR_ --------------------------------------SSKEGGI-DPNHEKT---QREK pt039463_POPTR_ --------------------------------------SSKESGA-DPNHEKTSSLQREK . AT1G04250.1 SAC-P----KDPAKPP-AKAQVVGWPPVRSYRKNVMVS---------------------- pt039771_POPTR_ RPLRNSSAN-NSSAPA-PKAQVVGWPPIKSFRKNSLATT--------------------- pt002101_POPTR_ TVA-PRPN--DPAKPP-SKAQVVGWPPIRSFRKNVMA----------------------- pt005605_POPTR_ SQVDGANTNGHGAAPA-SKAQVVGWPPIRSFRKNTMASH--------------------- pt030401_POPTR_ SQVAAANEN--SSAPA-AKTQVVGWPPIRSFRKNTMASS--------------------- pt033721_POPTR_ NHL-PADTIKDPAKPP-AKAQVVGWPPVRSYRKNVLAQKNASEEGFRAQVVGWPPLRSYR pt015737_POPTR_ TVAPPAST--DPAKPP-AKAQVVGWPPIRSFRKNVMA----------------------- pt001265_POPTR_ NLL---AT--DPAKPP-AKAQVVGWPPVRSFRKNMLA----------------------- pt011954_POPTR_ SQVAAANEN--SSAPA-AKAQVVGWPPIRSFRKNTMASS--------------------- pt028468_POPTR_ DVP-------NTAKPPAAKAQVVGWPPVRAYRKNAMK----------------------- pt001264_POPTR_ NLL---AT--DPAKPP-AKAQVVGWPPVRSFRKNMLA----------------------- pt039463_POPTR_ NLL---AT--DPAKPP-AKAQVVGWPPVRSFRKNMLA----------------------- : *. .*:*******::::*** : AT1G04250.1 ----CQKSS----------GGPEAAAFVKVSMDGAPYLRKIDLRMYKSYDELSNALSNMF pt039771_POPTR_ -----SKNTEEVDGKA---GP--GALFIKVSMDGAPYLRKVDLRNYSAYQELSSALEKMF pt002101_POPTR_ ----VQKNSNDEGEKASSSGTTGTAAFVKVSMDGAPYLRKVDLKLYKSYRELSDALGKMF pt005605_POPTR_ ----LSKNDDGAEVKS---GS--GCLYVKVSMDGAPYLRKVDLKTFGSYMELSSALEKMF pt030401_POPTR_ ----LAKNNEDVDGKS---GY--GYLYVKVSMDGAPYLRKVDLKTYGNYLELSSALEKMF pt033721_POPTR_ KNVLTQKNASEEGDKASTGGS--SAAFVKVCMDGAPYLRKVDLKMYKSYQELSDALAKMF pt015737_POPTR_ ----VQKNSNDNGEKSGSSGT--GVAFVKVSMDGAPYLRKVDLKLYKSYQELSDALGKMF pt001265_POPTR_ ----VQKSSTDQESTDKVPGG--NATFVKVSMDGAPYLRKVDLKMYKTYHELSDALGKMF pt011954_POPTR_ ----LVKNNEDVEGKS---GY--GCLYVKVSMDGAPYLRKVDLKTYSNYLELSSALEKMF pt028468_POPTR_ -----------------------SCKYVKVAVDGAPYLRKVDLEMYNSYQQLLNALQDMF pt001264_POPTR_ ----VQKSSTDQESTDKVPGG--NATFVKVSMDGAPYLRKVDLKMYKTYHELSDALGKMF pt039463_POPTR_ ----VQKSSTDQE-CEKVPGG--NATFVKVSMDGAPYLRKVDLKMYKTYQELSDALGKMF ::**.:********:**. : * :* .** .** AT1G04250.1 SSFTMGKHGGEEGM--IDFMNERKLMD--LVNSWDYVPSYEDKDGDWMLVGDVPWPMFVD pt039771_POPTR_ SCFTIGQYGS-HGAPGREMLSESKLKD--LLHGSEYVLTYEDKDGDWMLVGDVPWEMFIE pt002101_POPTR_ SSFTIGNCGS-QGT--KDFMNESKLID--LLNSSEYVPTYEDKDGDWMLVGDVPWGMFVD pt005605_POPTR_ SCFTIGQCGS-HVVPGQDGLSESRLMD--LLHGSEYVLTYEDKDNDWMLVGDVPWKMFTD pt030401_POPTR_ GCFTIGQCGS-HGLAARDGLTESCLKD---LHGSEYVLTFEDKDGDWMLVGDVPWDMFTD pt033721_POPTR_ SSFTMGNYGA-QGM--IDFMNESKLMD--LLNSSEYVPSYEDKDGDWMLVGDVPWEMFVD pt015737_POPTR_ SSFTIGNCGS-QGM--KDFMNESKLID--LLNGSDYVPTYEDKDGDWMLVGDVPWEMFVD pt001265_POPTR_ SSFTIGNCGS-HGM--KDFLNESKLID--LLNGTDYVPTYEDKDGDWMLVGDVPWDMFVE pt011954_POPTR_ SCFTIGQCGS-HGLRGQDGLTESRLKD--ILHGSEYVLTYEDKDGDWMLVGDVPWDMFTN pt028468_POPTR_ SCFS-------FTI--RNYLNERTIMEQEVNNGVEYVPTYEDKDGDWMMLGDVPWKMFVE pt001264_POPTR_ SSFTIGNCGS-HGM--KDFLNESKLID--LLNGTDYVPTYEDKDGDWMLVGDVPWDMFVE pt039463_POPTR_ SSFTIGNCGS-HGL--KDFLNESKLID--LLNGTDYVPTYEDKDGDWMLVGDVPWDMFVE ..*: : :.* : : :. :** ::****.***::***** ** : AT1G04250.1 TCKRLRLMKGSDAIGLAPRAMEKCKSRA-- pt039771_POPTR_ TCKRLRIMKSSDAIGLAPRAMEKCKNRN-- pt002101_POPTR_ SCKRLRIMKGSEAIGLAPRAVEKCKNRS-- pt005605_POPTR_ SCRRLRIMKGSEAIGLAPRAMEKCKSRN-- pt030401_POPTR_ SCRRLRIMKGSEAIGLAPRAMEKCKNRN-- pt033721_POPTR_ SCKRLRIMKGSEAIGLAPRAMEKCKSRT-- pt015737_POPTR_ SCKRLRIMKGSEAIGLAPRAVEKCKNRI-- pt001265_POPTR_ SCKRLRIMKGTEATGLGNEYTA-------- pt011954_POPTR_ SCRRLRIMKGSEAIGLAPRAMEKCKNRN-- pt028468_POPTR_ SCKRLRLMKSSEATGFAPRTPSKCSSSS-- pt001264_POPTR_ SCKRLRIMKGTEATGLAPRAMEKCKNRSFK pt039463_POPTR_ SCKRLRIMKGTEATGLAPRAMEKCKNRSYK :*:***:**.::* *:. .
|