|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Get sequence file Get alignment file Get formatted file made by BOXSHADE Sequence file prepared (0 sec required). Alignment has started. CLUSTAL format alignment by MAFFT FFT-NS-2 (v7.475) AT1G04250.1 -----------------------------------------MMG--SV------------ pt033721_POPTR_ ------------------------------------MATATVLG--TE------------ pt030401_POPTR_ MYSIP--------------------------------KEHDYIGL-SETPSMENISEKLS pt039463_POPTR_ ----------------------------------------------ME------------ pt028468_POPTR_ -MSPE--------------------------------NGSNLLE--SD------------ pt039771_POPTR_ -MSPPLLGVVEEEGHSNVTLLASPASAESACLNGLELKERNYMGL-SDCSSVDS------ pt005605_POPTR_ -MSMP--------------------------------LEHDYIGISSEVSSMENTSG--- pt015737_POPTR_ --------------------------------------MTSIMG--AE------------ pt001265_POPTR_ ----------------------------------------------ME------------ pt011954_POPTR_ MSSIP--------------------------------KEHDYIGL-SETPSMEKISDKLS pt001264_POPTR_ ----------------------------------------------ME------------ pt042254_POPTR_ -------------------------------------MTTSVLG--TE------------ pt002101_POPTR_ --------------------------------------MTSIMG--AET----------- AT1G04250.1 -------------------------------ELNLRETELCLGLPGG------------- pt033721_POPTR_ -----------------------------MADLNYKETELCLGLPGAVG----------- pt030401_POPTR_ SSSTSSSTLSTEEKNNSSSSNSNNNNKNNNTSLNMKETELRLGLPGSQSPERKPTVPAAG pt039463_POPTR_ --------------------------VEKGTKMGFEETELRLGLPGNGG----------- pt028468_POPTR_ -----------------------------AANVSFKETELTLGLPGESR----------G pt039771_POPTR_ -------------------SAVSAASDERKTSLNLKATELRLGLPGSQSPERNHELSLLS pt005605_POPTR_ -------------------TDTINISTTASKGLNLKATELRLGLPGSDSPERGNENQQLG pt015737_POPTR_ --------------------------PEKYSMINFEETELRLGLPGGIG----------- pt001265_POPTR_ --------------------------VEKGTKMRFEETELRLGLPGNGG----------- pt011954_POPTR_ S---SSSTLSTEENIN---SNSNSNSNSTNTSLNLKETELRLGLPGYQSPERKLTLPAAG pt001264_POPTR_ --------------------------VEKGTKMRFEETELRLGLPGNGG----------- pt042254_POPTR_ -----------------------------RTDLNYKETELCLGLPGAVG----------- pt002101_POPTR_ --------------------------ADTYSMINYEETELRLGLPGGAS----------- : . *** ***** AT1G04250.1 -------------------DTVAP----VTGNKRGFSETVD-------------LKLNLN pt033721_POPTR_ --------------VKNEVETPNK----ATG-KRGFAETVD-------------LKLNL- pt030401_POPTR_ VSLVGKD----IDTNNTNAYSLIPVKNLVSGAKRVFSDAIDGSTGKWVFSG--------- pt039463_POPTR_ --------------GAE--GEMVR--------KRGFSETVD-------------LKLKL- pt028468_POPTR_ LALIEK----------------------TSG-KRGFLETVD---------------LNL- pt039771_POPTR_ SALLDEKPFFPLHPSNDGHYSSTQ-KNVVSGNKRVFSDAMDEFSESKFLSN---SEVN-- pt005605_POPTR_ FSL-----------NNNNSKD----KSFVSGARRGFSVAIHGGSANWVFSGNAGSDPN-- pt015737_POPTR_ --------------NGND-GEVAK----SNG-KRGFSETVD-------------LKLNL- pt001265_POPTR_ --------------GGTEGGEFAR--------KRGFSETVD-------------LKLNL- pt011954_POPTR_ VSLFGKD----IDTNNTNGYPLRPLKNLVSGTKRGFSDAIVGSSGKWVFSGSNGSEVDLG pt001264_POPTR_ --------------GGTEGGEFAR--------KRGFSETVD-------------LKLNL- pt042254_POPTR_ --------------AKNEVETPNK----ATG-KRGFAETVD-------------LKLNL- pt002101_POPTR_ --------------NGND-GEAAK----GNG-KRGFSETVD-------------LKLNL- :* * :: AT1G04250.1 NE-----------------------------------PANKEG---STTHDVVTFDSKEK pt033721_POPTR_ --------------------------------------QAKEGVM-DLNENIKNIASKDK pt030401_POPTR_ ------------------------GDNGNPQKSRVAGPAKK-DVA----QSPKP-VQEKN pt039463_POPTR_ --------------------------------------SSKESGA-DPNHEKTSSLQREK pt028468_POPTR_ ------------------------GRSSNV----------------DSDHNKY--SGESE pt039771_POPTR_ ---AMLSPRPSPNMGLKPGMLENLGVQQAKVKEIVAPKAGQE----------RPHAANET pt005605_POPTR_ -----FSLR---------------GAN-----------SGKEGFP----HSSKPVVQENK pt015737_POPTR_ --------------------------------------STKESGK-GGDEEK---VMKEK pt001265_POPTR_ --------------------------------------SSKEGGI-DPNHEKT---QREK pt011954_POPTR_ KGAILFSPR---------------GDNGNSQKSCVAGPAKKDDVA----QSPKP-VQEKI pt001264_POPTR_ --------------------------------------SSKEGGI-DPNHEKT---QREK pt042254_POPTR_ --------------------------------------QAKEGVM-DLNENIKNITSKDK pt002101_POPTR_ --------------------------------------STKETGKDGSDQEKV--VMKEK .. AT1G04250.1 SAC-P----K-DPAKPP-AKAQVVGWPPVRSYRKNVMVS--------------------- pt033721_POPTR_ NHL-PADTIK-DPAKPP-AKAQVVGWPPVRSYRKNVLAQKNASEEGFRAQVVGWPPLRSY pt030401_POPTR_ SQV-AAANEN--SSAPA-AKTQVVGWPPIRSFRKNTMASS-------------------- pt039463_POPTR_ NLL---AT---DPAKPP-AKAQVVGWPPVRSFRKNMLA---------------------- pt028468_POPTR_ TDV-P------NTAKPPAAKAQVVGWPPVRAYRKNAMK---------------------- pt039771_POPTR_ RPL-RNSSAN-NSSAPA-PKAQVVGWPPIKSFRKNSLATT-------------------- pt005605_POPTR_ SQV-DGANTNGHGAAPA-SKAQVVGWPPIRSFRKNTMASH-------------------- pt015737_POPTR_ TVAPPAST---DPAKPP-AKAQVVGWPPIRSFRKNVMA---------------------- pt001265_POPTR_ NLL---AT---DPAKPP-AKAQVVGWPPVRSFRKNMLA---------------------- pt011954_POPTR_ SQV-AAANEN--SSAPA-AKAQVVGWPPIRSFRKNTMASS-------------------- pt001264_POPTR_ NLL---AT---DPAKPP-AKAQVVGWPPVRSFRKNMLA---------------------- pt042254_POPTR_ NHL-PAVTIK-DPAKPP-AKAQVVGWPPVRSYRKNVMA---------------------- pt002101_POPTR_ TVA-PRPN---DPAKPP-SKAQVVGWPPIRSFRKNVMA---------------------- : *. .*:*******::::*** : AT1G04250.1 -----CQKSS----------GGPEAAAFVKVSMDGAPYLRKIDLRMYKSYDELSNALSNM pt033721_POPTR_ RKNVLTQKNASEEGDKASTGGS--SAAFVKVCMDGAPYLRKVDLKMYKSYQELSDALAKM pt030401_POPTR_ -----LAKNNEDVDGKS---GY--GYLYVKVSMDGAPYLRKVDLKTYGNYLELSSALEKM pt039463_POPTR_ -----VQKSSTDQE-CEKVPGG--NATFVKVSMDGAPYLRKVDLKMYKTYQELSDALGKM pt028468_POPTR_ ------------------------SCKYVKVAVDGAPYLRKVDLEMYNSYQQLLNALQDM pt039771_POPTR_ ------SKNTEEVDGKA---GP--GALFIKVSMDGAPYLRKVDLRNYSAYQELSSALEKM pt005605_POPTR_ -----LSKNDDGAEVKS---GS--GCLYVKVSMDGAPYLRKVDLKTFGSYMELSSALEKM pt015737_POPTR_ -----VQKNSNDNGEKSGSSGT--GVAFVKVSMDGAPYLRKVDLKLYKSYQELSDALGKM pt001265_POPTR_ -----VQKSSTDQESTDKVPGG--NATFVKVSMDGAPYLRKVDLKMYKTYHELSDALGKM pt011954_POPTR_ -----LVKNNEDVEGKS---GY--GCLYVKVSMDGAPYLRKVDLKTYSNYLELSSALEKM pt001264_POPTR_ -----VQKSSTDQESTDKVPGG--NATFVKVSMDGAPYLRKVDLKMYKTYHELSDALGKM pt042254_POPTR_ ------QKNASEEGEKASTGGS--SAAFVKVCMDGAPYLRKVDLKMYRSYQELSDALAKM pt002101_POPTR_ -----VQKNSNDEGEKASSSGTTGTAAFVKVSMDGAPYLRKVDLKLYKSYRELSDALGKM ::**.:********:**. : * :* .** .* AT1G04250.1 FSSFTMGKHGGEEGM--IDFMNERKLMD--LVNSWDYVPSYEDKDGDWMLVGDVPWPMFV pt033721_POPTR_ FSSFTMGNYGA-QGM--IDFMNESKLMD--LLNSSEYVPSYEDKDGDWMLVGDVPWEMFV pt030401_POPTR_ FGCFTIGQCGS-HGLAARDGLTESCLKD---LHGSEYVLTFEDKDGDWMLVGDVPWDMFT pt039463_POPTR_ FSSFTIGNCGS-HGL--KDFLNESKLID--LLNGTDYVPTYEDKDGDWMLVGDVPWDMFV pt028468_POPTR_ FSCFS-------FTI--RNYLNERTIMEQEVNNGVEYVPTYEDKDGDWMMLGDVPWKMFV pt039771_POPTR_ FSCFTIGQYGS-HGAPGREMLSESKLKD--LLHGSEYVLTYEDKDGDWMLVGDVPWEMFI pt005605_POPTR_ FSCFTIGQCGS-HVVPGQDGLSESRLMD--LLHGSEYVLTYEDKDNDWMLVGDVPWKMFT pt015737_POPTR_ FSSFTIGNCGS-QGM--KDFMNESKLID--LLNGSDYVPTYEDKDGDWMLVGDVPWEMFV pt001265_POPTR_ FSSFTIGNCGS-HGM--KDFLNESKLID--LLNGTDYVPTYEDKDGDWMLVGDVPWDMFV pt011954_POPTR_ FSCFTIGQCGS-HGLRGQDGLTESRLKD--ILHGSEYVLTYEDKDGDWMLVGDVPWDMFT pt001264_POPTR_ FSSFTIGNCGS-HGM--KDFLNESKLID--LLNGTDYVPTYEDKDGDWMLVGDVPWDMFV pt042254_POPTR_ FSSFTMGNYGA-QGM--IDFMNESKLMD--LLNSSEYVPSYEDKDGDWMLVGDVPWEMFV pt002101_POPTR_ FSSFTIGNCGS-QGT--KDFMNESKLID--LLNSSEYVPTYEDKDGDWMLVGDVPWGMFV *..*: : :.* : : :. :** ::****.***::***** ** AT1G04250.1 DTCKRLRLMKGSDAIGLAPRAMEKCKSRA-- pt033721_POPTR_ DSCKRLRIMKGSEAIGLAPRAMEKCKSRT-- pt030401_POPTR_ DSCRRLRIMKGSEAIGLAPRAMEKCKNRN-- pt039463_POPTR_ ESCKRLRIMKGTEATGLAPRAMEKCKNRSYK pt028468_POPTR_ ESCKRLRLMKSSEATGFAPRTPSKCSSSS-- pt039771_POPTR_ ETCKRLRIMKSSDAIGLAPRAMEKCKNRN-- pt005605_POPTR_ DSCRRLRIMKGSEAIGLAPRAMEKCKSRN-- pt015737_POPTR_ DSCKRLRIMKGSEAIGLAPRAVEKCKNRI-- pt001265_POPTR_ ESCKRLRIMKGTEATGLGNEYTA-------- pt011954_POPTR_ NSCRRLRIMKGSEAIGLAPRAMEKCKNRN-- pt001264_POPTR_ ESCKRLRIMKGTEATGLAPRAMEKCKNRSFK pt042254_POPTR_ NSCKRLRIMKGSEAIGLAPRAMEKCKSRT-- pt002101_POPTR_ DSCKRLRIMKGSEAIGLAPRAVEKCKNRS-- ::*:***:**.::* *:. .
|