Input
| Putative repression domain
|
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AT1G04370.1 |
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|
Ortholog
| Putative repression domain
| Reverse top hit
| Relation
| Blast score ratio
| Type
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Gm002627 |
not found in 157aa |
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III |
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AT3G23230.1 |
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0.507614213 |
III |
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not found in 138aa |
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III |
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III |
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0.497461928 |
III |
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III |
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III |
Get sequence file
Get alignment file
Get formatted file made by BOXSHADE
Sequence file prepared (0 sec required). Alignment has started.
CLUSTAL format alignment by MAFFT FFT-NS-2 (v7.475)
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AT1G04370.1 ------------------------------------------------------------
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gm035755_Glyma1 ESSSSDYSNSSGS--LVST---ES-------QLEVSSNLTHAS-HQL-ETHAS--PQPPK
gm042339_Glyma1 --------------------------------------GEQDK-----------------
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gm047103_Glyma1 ESVSS--GF-PA----VKLE-PDVMPALINPCPPPAPAVEEKK-----------------
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gm028117_Glyma1 ERASS----------------------------EESAAARK-------------------
gm029720_Glyma1 SRRPSLQISLPKKTEWIQFGEPEVTETVS--QSNP------NAE----------------
gm041538_Glyma1 NALTN--TFLPQ----RLHQ-PQL-------CLEPTRNITK-------------------
gm027425_Glyma1 TTATT--TTIA-----TTMY-NNN-------QVSSSSFSSDET-----------------
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gm050324_Glyma1 -------AVVA----------RD-------------------------------------
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gm055217_Glyma2 --QSSIATSPPQNFNF-----PE----------EPMVSMKKEATC---------------
AT1G04370.1 GGGAEQGKYRGVRRRPWGKYAAEIRDSRKHGERVWLGTFDTAEDAARAYDRAAYSMRGKA
gm006738_Glyma0 TPPKKGLSYRGVRRRPWGKYAAEIRDTKRNGVRVWLGTYETAEDAALAYDRAAFKMRGSK
gm026388_Glyma1 -----RSSFRGVRRRPWGKFAAEIRDSTRHGVRVWLGTFDNAEAAALAYDQAAFSMRGSG
gm002627_Glyma0 DEDQEHVKYRGVRRRPWGKFAAEIRDSMRQGQRLWLGTFNTAEEAARAYDRAAYAMRGPF
gm026696_Glyma1 ETNKDKRPFRGVRRRPWGKFAAEIRDSTRNGVRVWIGTFDTAEAAALAYDQAALSTRGSM
gm035752_Glyma1 EVQNKERSYTGVRKRPWGKYAAEIRDTTRNGTRVWLGTFDTAEAAALAYDQAAFSMRGHN
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gm026695_Glyma1 ---NVEVRYRGIRRRPWGKFAAEIRDPTRKGTRIWLGTFDTAEQAARAYDAAAFHFRGHR
gm007221_Glyma0 QVAKEPRMYRGVRKRPWGKFAAEIRDSTRNGVRVWIGTFDTAEAAALAYDQAAFSTRGSL
gm018171_Glyma0 VPPRRGLSFRGVRRRPWGKYAAEIRDAKRNGVRVWLGTYETAENAALAYDRAAFKMHGSK
gm053254_Glyma1 --------YRGVRRRPWGKFAAEIRDSTRNGVRVWLGTFDTAEAAALAYDQAALVMRGSM
gm036964_Glyma1 -QKAITKHYRGVRRRPWGKYAAEIRDSSKKGARVWLGTFDTAEEAALAYDKAALRIRGPK
gm055291_Glyma2 -----KKSYRGVRRRPWGKFAAEIRDSTRHGMRVWLGTFDSAEAAALAYDQAAFSMRGSA
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gm024138_Glyma0 EKRGEEVKYRGVRRRPWGKFGAEIRDPTKPTGRQWLGTFDTAEEAARAYDRAAIELRGVL
gm029721_Glyma1 VVPAKGKHYRGVRQRPWGKFAAEIRDPAKNGARVWLGTFETAEDAALAYDRAAYRMRGSR
gm041539_Glyma1 IEKSVTKHYRGVRRRPWGKYAAEIRDSSKKGARVWLGTFDTAEEAALSYDKAALRIRGPK
gm053963_Glyma2 NNIKENKHYRGVRRRPWGKYAAEIRDPNRKGSRVWLGTFDTAIEAAKAYDKAAFKMRGSK
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gm011460_Glyma0 ----EKKHYRGVRQRPWGKFAAEIRDPNKRGSRVWLGTFDTAIEAAKAYDRAAFRLRGSK
gm035755_Glyma1 EGNKDKRPFRGVRRRPWGKFAAEIRDSTRNGVRVWIGTFDTAEAAALAYDQAALSTRGSM
gm042339_Glyma1 EKGGEEVKYRGVRRRPWGKFGAEIRDPTKSTGRQWLGTFDTAEEAARAYDRAAIELRGAL
gm028118_Glyma1 LQGKEEVRFRGVRRRPWGKYAAEIRDPSKQGSRLWLGTFDTAEEAARAYDRAAFNLRGHL
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gm055217_Glyma2 |
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AT1G04370.1 |
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