Input
| Putative repression domain
|
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AT1G04370.1 |
not found |
|
Ortholog
| Putative repression domain
| Reverse top hit
| Relation
| Blast score ratio
| Type
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Gm055289 |
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AT1G04370.1 |
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II |
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III |
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III |
Get sequence file
Get alignment file
Get formatted file made by BOXSHADE
Sequence file prepared (0 sec required). Alignment has started.
CLUSTAL format alignment by MAFFT FFT-NS-2 (v7.475)
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AT1G04370.1 ------------------------------------------------------------
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gm036964_Glyma1 LQRLPSLGRWISMGADFWEEVLDGII---------------------------LPNTSNR
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gm029721_Glyma1 --------------------LLYGVLRDAVNVG----------------WVPSLDASSPE
AT1G04370.1 ------------------------------------------------------------
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gm035752_Glyma1 GNHS----------------------------KAKQVVVKS-------------------
gm055217_Glyma2 SEQSSFCKFLEC-FDFEA--EVVGLTSHH---KVQSSIATSP-----PQN-FNFPEEP--
gm055289_Glyma2 ------------------------------------------------------------
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gm026696_Glyma1 ESSSSD---------YSNSSGSLVSSTESSQLEVSSNLTHAS-HQLKETH-ASPQPQP--
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gm026695_Glyma1 ------------------------------------------------------------
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gm041538_Glyma1 ALTNT---------------------------FLPQ--RLHQ-PQL--------CLEP--
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gm026694_Glyma1 GNHND---------------------------EAKQLVVKS-------------------
gm036964_Glyma1 EDS-S-----------------------HNNLEIGSANET--------------------
gm025872_Glyma0 ----------KCDGDLEN-----IIVFRSE-----DATAVVA---------RDVHAPPT-
gm035755_Glyma1 ESSSSD---------YSNSSGSLVST--ESQLEVSSNLTHAS-HQL-ETH-AS--PQP--
gm047103_Glyma1 SVSSG---------------------------F-PA--VKLE-PDVMPAL-INPCPPP--
gm002107_Glyma0 SFSSG---------------------------FIPAVTVKSE-PDLFPAP-EPVYIPP--
gm029720_Glyma1 SFPTTRCKS------SRRPSLQISLPKKTEWIQFGEPEVTETVSQ----------SNP--
gm028117_Glyma1 ERASS---------------------------EESAAARK--------------------
gm052299_Glyma1 SLSSS-----------SS---------------------------------SLP-LLP--
gm007221_Glyma0 ETSSA-----------SNVSSCIGSV--ELQ-EVSSNTTYKEVKKVRPPP-PSP-PLP--
gm028119_Glyma1 ------------------------------------------------------------
gm042339_Glyma1 ------------------------------------------------------------
gm035749_Glyma1 ------------------------------------------------------------
gm028118_Glyma1 ------------------------------------------------------------
gm053254_Glyma1 ATSSV-----------SHGSGSVVEA------EVSVS-----------------------
gm006745_Glyma0 ------------------------TTFRLEG--VHDAEGSLACKREHPKVEREFHAPPA-
gm018171_Glyma0 ----------------GNGVSKVGMAVKMEN-ESQNSDKAAA---------CGTHVPPR-
gm028190_Glyma1 SEHSSFCKLLEC-IDFEADTEVVGLTSHH---KVENSIETSL-----PHN-SNLPEEP--
gm053963_Glyma2 TMSQT-----------T-TTTTIATTMYNNN-QVTS---SSD------------------
gm002626_Glyma0 EEVNS---------------------------EENNNKNKK-------------------
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gm024138_Glyma0 ------------------------------------------------------------
gm029721_Glyma1 SFSSA---------------------------FMPPVTVKSE-TDLFPAP-EPICNPP--
AT1G04370.1 ---------------GKYRGVRRRPWGKYAAEIRDSRKHGERVWLGTFDTAEDAARAYDR
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gm035752_Glyma1 ---EVQNKE------RSYTGVRKRPWGKYAAEIRDTTRNGTRVWLGTFDTAEAAALAYDQ
gm055217_Glyma2 -MVSMKKEATCYAT-RHYRGVRRRPWGKFAAEIRDPKKKGSRVWLGTFDTEIDAAKAYDC
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gm026695_Glyma1 ---------------VRYRGIRRRPWGKFAAEIRDPTRKGTRIWLGTFDTAEQAARAYDA
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gm041538_Glyma1 -TRNITK--------KHYRGVRRRPWGKYAAEIRDSARHGARIWLGTFQTAEEAAMAYDR
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gm050324_Glyma1 -------------WK-HYRGVRRRPWGKFAAEIRDPKKNGARVWLGTYDTEEKAALAYDK
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: *:* *****:.*****. : * *:**: . *. :**
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BoxShade v3.31 C (beta, 970507) Output
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gm028190_Glyma1 |
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gm053963_Glyma2 |
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gm002626_Glyma0 |
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gm007220_Glyma0 |
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gm024138_Glyma0 |
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gm029721_Glyma1 |
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