|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Get sequence file Get alignment file Get formatted file made by BOXSHADE Sequence file prepared (0 sec required). Alignment has started. CLUSTAL format alignment by MAFFT FFT-NS-2 (v7.475) AT1G06850.1 ----------MEKSDPP------------PVPKP----GATIIP---------------S pt014180_POPTR_ ------METRDPLSKPPQNSDPPKPN--NPNPNP------TVSP---------SSSSSSS gm048734_Glyma1 ---------------------------------------MSATP---------------S Os012927_Os03t0 -------MQEPKHTDPAAM----------------------------------------- gm040434_Glyma1 --------MQDPSSNPNSN----------PNPNPHNANAASQLPRPPPAT--TAGAGASS pt014165_POPTR_ -------------MHDSSNSD------------------ASAFP-------FRS------ gm031558_Glyma1 --------MATQTQDPPSN----------PNPNP---NATSATP---------------S Os029606_Os07t0 ------------------------------------------------------------ Sb024339_Sorbi1 ADLPVAMAMPPKPGDPPQRSPGRSPNLNLPCPLPPVPGGAPAPP--PQHQ---------P gm010555_Glyma0 ------------------------------------------------------------ gm004901_Glyma0 --------MQDPSSNPNSN----------PNPNPHNANAASQLPRPPQATASTAVAGAFS pt013863_POPTR_ --MSSSMETQDPQSKPPQNSDPTKPH----NPNP------TTPP---------------A Os012928_Os03t0 -------MQEPKHTDPAAM----------------------------------------- AT1G06850.1 SDPIPNA--------DPIPSS----SFHRRSRS-------DDMSMFMFMDPLSS------ pt014180_POPTR_ SSMFNNIRGG---------------AHHRRAHSEMSFRLPEDMTM-MMMDLHPSDQING- gm048734_Glyma1 SSFFIRAAGGNGPSAAPVAGSGESHSHHRRAHSEVSFRLPDD-----MIDLSPSDPFNGG Os012927_Os03t0 -------RG----------------AHHRRARSEVAFRLPDD------LDL-------GG gm040434_Glyma1 SSLFARSGG----------------PHHRRAHSEVSFRLPDD-----MMDLSPSDPFAGG pt014165_POPTR_ -------------------------SCHRRAHSDVPFRVTDD------LDLVP------- gm031558_Glyma1 SSFFFRAGGANGASVAPVAGSGESHSHHRRAQSEVSFRLPED-----MMDLSPSDPFNGG Os029606_Os07t0 ------------------------------------------------------------ Sb024339_Sorbi1 GAGLPPPRV----------------GHHRRARSEVAFRFPD--------DL-------AG gm010555_Glyma0 ----------------------MSFSHHRRSQSEMHFRISDDFDL--EVDLSPSHHFQYP gm004901_Glyma0 SSLFARSGG----------------PHHRRAHSEMSFRLPDD-----MMDLSPSDPFAGG pt013863_POPTR_ SSMLNNIRGG---------------ALHRRARSEMSFRLPEDMTM-MMMDIHPSDQINGG Os012928_Os03t0 -------RG----------------AHHRRARSEVAFRLPDD------LDL-------GG AT1G06850.1 AAPPSSDDLPSDDDLFSSFIDVDSLTSNPNPFQNPS---LSSNSV------------SGA pt014180_POPTR_ ---GSLEEIGSEDDLFSTYIDVDKLTGGNNGNGTGVGNQNDNDNT-------INGEKGGV gm048734_Glyma1 SSTASFEEIGSEDDLFSTYIDVEKL-----GAGRGG---NGSDQS--VRAPPLRGRDTG- Os012927_Os03t0 GGAGAFDEIGSEDDLFSTFMDIEKISSG--PAAAGG---SDRDRA--------------- gm040434_Glyma1 SSTASMEEIGSEDDLFSTYIDVDKL-GGANGSGASG---NGADPT-------------GE pt014165_POPTR_ ------DELVSEEDLFCSYMNMEKL-GSRPEEGPSG---LKQDNA--------------- gm031558_Glyma1 SSTASFEEIGSEDDLFSTYIDVEKLSGGANGAGRGG---NGSDQSGYGNGAGTSGHNDGE Os029606_Os07t0 -------------------MDMEKIA---------G---ADRDRA--------------- Sb024339_Sorbi1 AGAGGFDEIGSEDDLFSTFMDMDKIA---------G---ADRDRA--------------- gm010555_Glyma0 AP-------------------------------------LLQDSGSIPQ----------- gm004901_Glyma0 SSTASMEEIGSEDDLFSTYIDVDKL-SGANGSGGAG---NGADPT-------------GE pt013863_POPTR_ NGNGSLEEIGSEDDLFSTYIDVDKLTGGNSGNGAGGGVQNDNDNN-------MNGEKAGV Os012928_Os03t0 GGAGAFDEIGSEDDLFSTFMDIEKISSG--PAAAGG---SDRDRA--------------- : AT1G06850.1 AN-PPPPPSSRP-RHRHSNSVD-----------------------AGCAMYA-GDIMDAK pt014180_POPTR_ SDSGPGSGTSRP-KHRHSYSVDGS-------------------------VFGGGEVMEAK gm048734_Glyma1 ----TVAPSTVP-RRRACSERSWMR--------------RKPCLLISSQSF--GTLI--- Os012927_Os03t0 ---AETSSPPRP-KHRHSSSVDGSGFFAAA---------RKD---AAASL---AEVMEAK gm040434_Glyma1 ----TEKSPARP-RHRHSSSVD----------------------------F--GEIMDAK pt014165_POPTR_ ---EQEKAYVRP-RHKHSNSVDGSSL---------------------------MESIDSK gm031558_Glyma1 K--SSSAAAARP-RHRHSSSVDGS---------------------TSTCMF--GEIMDAK Os029606_Os07t0 ---AETSSPPRPTKHRHSASFDGFAFGAGAGGPGPGLGKQQD---GAGGVF--SEVMEAK Sb024339_Sorbi1 ---AETSSPPRPAKHRHSASFDGFGMGAGAGGP----GGQQD---GGGGVF--GEVMEAK gm010555_Glyma0 ---SPQPETARS-AHQRSNSADAS---------------YSSL----------VDGIEAK gm004901_Glyma0 ----REKSPARP-RHRQSSSVD----------------------------F--GEIMDAK pt013863_POPTR_ S----GSGTSRP-KHRHSNSVDGS-------------------------VFGGGEVMDAK Os012928_Os03t0 ---AETSSPPRP-KHRHSSSVDGSGFFAAA---------RKD---AAASL---AEVMEAK . :: . . . : AT1G06850.1 KAMPPEKLSELWNIDPKR--AKRILANRQSAARSKERKARYIQELERKVQSLQTEATTLS pt014180_POPTR_ KAMPPNKLAELWSIDPKR--AKRILANRQSAARSKERKARYILELERKVQTLQTEATTLS gm048734_Glyma1 QSVPKESECDGLKLMSRKFLSTVILANRQSAARSKERKARYIQELERKVQTLQTEATTLS Os012927_Os03t0 KAMTPEQLSELAAIDPKR--AKRILANRQSAARSKERKARYITELERKVQTLQTEATTLS gm040434_Glyma1 KAMPPDKLAELWTIDPKR--AKRILANRQSAARSKERKARYIQELERKVQTLQTEATTLS pt014165_POPTR_ KAMAPEKLAELWALDPKR--AKRIMANRQSAARSKERKARYVSELERKVHTLQTEATTLS gm031558_Glyma1 KAMPPDKLAELWNIDPKR--AKRILANRQSAARSKERKARYIQELEHKVQTLQTEATTLS Os029606_Os07t0 KAMSSEQLAELAAIDPKR--AKRILANRQSAARSKERKARYITELERKVQTLQTEATTLS Sb024339_Sorbi1 KAMSSEQLAELAAIDPKR--AKRIIANRQSAARSKERKARYITELERKVQTLQTEATTLS gm010555_Glyma0 KALSPDKLAELWTADPKR--AKRILANRQSAARSKERKACYVLQLERKFQSLQTEATALC gm004901_Glyma0 KAMPPDKLAELWTIDPKR--AKRILANRQSAARSKERKARYIQELERKVQTLQTEATTLS pt013863_POPTR_ KAMPPDKLAELWNIDPKR--AKRILANRQSAARSKERKARYILELERKVQTLQTEATTLS Os012928_Os03t0 KAMTPEQLSELAAIDPKR--AKRILANRQSAARSKERKARYITELERKVQTLQTEATTLS :::. :. .: .:: :. *:************** *: :**:*.::******:*. AT1G06850.1 AQLTLYQRDTNGLANENTELKLRLQAMEQQAQLRNALNEALRKEVERMKMETGEISGNSD pt014180_POPTR_ AQLSLFQRDTTGLSTENTELKLRLQAMEQQAQLRDALNEALKKEVGRLKIATGEMLSPSD gm048734_Glyma1 AQLTLYQRDTTGLSSENTELKLRLQAMEQQAQLRDVLNDALMKEVERLKIATGEALNQSE Os012927_Os03t0 AQLTLFQRDTTGLSAENAELKIRLQAMEQQAQLRDALNDALKQELERLKLATGEMTNSNE gm040434_Glyma1 AQLTLYQRDTTGLSTENTELKLRLQAMEQQAQLRDALNEALKKEVERLKVATGEMMSHTD pt014165_POPTR_ AQLTLFQRDTSSLTTENSELKLRLQAMEQQAQLRDALNEALKKEVERLKFATGEIMTPTD gm031558_Glyma1 AQLTLYQRDTTGLSSENTELKLRLQAMEQQAQLRDALNDALMKEVERLKIATGEALNQSE Os029606_Os07t0 AQLTLFQRDTTGLSAENAELKIRLQAMEQQAQLRDALNDALKQEVERLKIATGEMAKSND Sb024339_Sorbi1 AQLTLFQRDTTGLSAENAELKIRLQAMEQQAQLRDALNDALKQEVERLKIATGEMSKSNE gm010555_Glyma0 ARLSLFQRDTTGLTTENTELKLRLQAMEQQANLCDALNEALKKEVDGLKIATGEIVMHN- gm004901_Glyma0 AQLTLYQRDTSGLSTENTELKLRLQAMEQQAQLRDALNEALKKEVERLKVATGEGMSHTE pt013863_POPTR_ AQLTLFQRDTTGLSSENTELKLRLQAMEQQAQLRDALNEALKKEVERLRIATGEMVSPSE Os012928_Os03t0 AQLTLFQRDTTGLSAENAELKIRLQAMEQQAQLRDALNDALKQELERLKLATGEMTNSNE *:*:*:****..*: **:***:*********:* :.**:** :*: ::. *** . AT1G06850.1 SFDMGMQQIQYSSSTFMAIPPYHGSMNLHDM-QMHSSFN-------------PMEMSNSQ pt014180_POPTR_ SYNLGMHQMPFTPSNFFPLPSQPGPAGHPNM-QLPS-FTHSPSSM-STR---HIHQVDSQ gm048734_Glyma1 SFNLGMHQMPYAGSNFFSIPPHSGPSGHQNM-QLPP-FGHSHSTV-PTH---QLQQTNSH Os012927_Os03t0 TYSMGLQHVPYNTP-FFPLAQHNAARQNGGT-QLPPQFQPPRPNV-PNH---MLSHPNG- gm040434_Glyma1 SFNLGMHLMPFSGSNFVPIPPQSGPSGHQNM-QMPP-FGLTPSTM-PSH---LLHQTSSH pt014165_POPTR_ SYNLGIQHIPYNHSPLVSPRPRPGSVDALNI-QIPQ-FHPLQSNLSPRQ--PGIAASHSH gm031558_Glyma1 SFNLGMHQMPYAGPNFFSIPPHSGPSGHQNM-QLPP-FGHSQSTV-PTH---QLQQTNSH Os029606_Os07t0 AYNTGMQQVPYSPS-FFQLSDQHAVQHHAGVQQLPHQFQQPHPSV-PSH--QMLSHPNS- Sb024339_Sorbi1 QFNMGMQHISYSPS-FFQLSEQHTVQQHGNI-QLPHHFQQPPPNV-PSH--QMLSHPNS- gm010555_Glyma0 AHGLGMHPLTYSQAPFFSHQSQHGQSELQAM-QMPQ-LHSLSSNV-PTSDEPLFDLDIPY gm004901_Glyma0 SFNLGMHQMPFSGSNFIPIPPQSGPSGHQNM-QMPP-FGHSPSTM-PTH---QLHQTSSH pt013863_POPTR_ SFNLGMHQMPFTQPNFFPLPPQPGSSGHPNM-QLPS-FTHTPPSM-STH---HLQQADSH Os012928_Os03t0 TYSMGLQHVPYNTP-FFPLAQHNAARQNGGT-QLPPQFQPPRPNV-PNH---MLSHPNG- .. *:: : : . :. *: : : AT1G06850.1 SVSDFLQN---GRMQGLEISSNSSS--------LVKSEGPSLSASESSSAY pt014180_POPTR_ SLSDYMQNDPIGRLQGLDISNKGSH--------IVKSEGPSLSASESSTTF gm048734_Glyma1 QMSDILQNDQLGRLQGLDISSKGTP--------VVKSEGPSISANESSTTF Os012927_Os03t0 -LQDIMQQDPLGRLQGLDIS-KGPL--------VVKSESSSISASESSSTF gm040434_Glyma1 PYSEILQNDQLGRFQGLDISSKGST--------LVKSEGPSLSASESSTTF pt014165_POPTR_ ALSEMLPQDPLRWLQGFDISSRSSV--------LVRSECPSISASEDSSL- gm031558_Glyma1 QMSDILQNDQLGRLQGLDISSKGTP--------MVKSEGPSISANESSTTF Os029606_Os07t0 -LSDMMQQDSLGRLQGLDIG-KGPVAVKNEAEVVVKSEGSSISAGESNSTF Sb024339_Sorbi1 -LSDMMQQDSLGRLQGLDIG-KGSMAVKSEAEVVVKSEGSSISAGESNTTF gm010555_Glyma0 DLSEMLSSESIGQFQGLDIG-DGVLH-------NLMPDCPSISVNNINNAF gm004901_Glyma0 PYSEILQNEQLGRFQGLDISSKGST--------LVKSEGPSLSASESSSTF pt013863_POPTR_ NLSDYMQNDPIRQLQGLDISNKGLN--------IVKSEGPSLSASENSSTF Os012928_Os03t0 -LQDIMQQDPLGRLQGLDIS-KGPL--------VVKSESSSISASESSSTF .: : . :**::*. . : .: .*:*..: ..
|