Input
| Putative repression domain
|
|
AT1G08465.1 |
not found |
|
Ortholog
| Putative repression domain
| Reverse top hit
| Relation
| Blast score ratio
| Type
|
Os027003 |
not found in 169aa |
AT1G08465.1 |
1st_1st |
0.452879581 |
Ia |
Os014123 |
not found in 186aa |
AT2G26580.2 |
not_not |
0.450261780 |
III |
Os014122 |
not found in 186aa |
AT2G26580.2 |
not_not |
0.450261780 |
III |
Os041930 |
not found in 207aa |
AT2G26580.2 |
not_not |
0.450261780 |
III |
Os041929 |
not found in 207aa |
AT2G26580.2 |
not_not |
0.450261780 |
III |
Os008985 |
not found in 256aa |
AT2G45190.1 |
not_not |
0.439790575 |
III |
Os018243 |
not found in 266aa |
AT2G45190.1 |
not_not |
0.434554973 |
III |
Os036589 |
not found in 313aa |
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not_not |
0.410994764 |
III |
Sb031935 |
not found in 385aa |
AT2G26580.2 |
1st_not |
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II |
Sb022660 |
not found in 280aa |
AT1G08465.1 |
not_1st |
0.455497382 |
II |
Sb027997 |
not found in 453aa |
AT4G00180.1 |
not_not |
0.442408376 |
III |
Sb029682 |
not found in 431aa |
AT4G00180.1 |
not_not |
0.413612565 |
III |
Sb000956 |
not found in 320aa |
AT2G45190.1 |
not_not |
0.410994764 |
III |
Gm034118 |
not found in 181aa |
AT1G08465.1 |
1st_1st |
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Ia |
Gm037785 |
not found in 181aa |
AT1G08465.1 |
not_1st |
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II |
Gm033262 |
not found in 185aa |
AT1G08465.1 |
not_1st |
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II |
Gm016718 |
not found in 188aa |
AT1G08465.1 |
not_1st |
0.591623036 |
II |
Gm016717 |
not found in 188aa |
AT1G08465.1 |
not_1st |
0.591623036 |
II |
Gm033264 |
not found in 183aa |
AT1G08465.1 |
not_1st |
0.591623036 |
II |
Gm033263 |
not found in 181aa |
AT1G08465.1 |
not_1st |
0.581151832 |
II |
Gm016716 |
not found in 191aa |
AT1G08465.1 |
not_1st |
0.510471204 |
II |
Gm046764 |
not found in 186aa |
AT2G26580.2 |
not_not |
0.473821989 |
III |
Gm036154 |
not found in 186aa |
AT2G26580.2 |
not_not |
0.465968586 |
III |
Gm047022 |
not found in 215aa |
AT2G45190.1 |
not_not |
0.452879581 |
III |
Gm001387 |
not found in 215aa |
AT2G45190.1 |
not_not |
0.447643979 |
III |
Gm011376 |
not found in 214aa |
AT2G45190.1 |
not_not |
0.445026178 |
III |
Gm006033 |
not found in 216aa |
AT2G45190.1 |
not_not |
0.445026178 |
III |
Gm034120 |
not found in 131aa |
AT1G08465.1 |
not_1st |
0.416230366 |
II |
Gm034119 |
not found in 131aa |
AT1G08465.1 |
not_1st |
0.416230366 |
II |
Gm037786 |
not found in 131aa |
AT1G08465.1 |
not_1st |
0.413612565 |
II |
Pt029907 |
not found in 206aa |
AT1G08465.1 |
1st_1st |
0.494764397 |
Ia |
Pt033007 |
not found in 214aa |
AT2G45190.1 |
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0.460732984 |
III |
Pt005407 |
not found in 188aa |
AT2G26580.2 |
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0.458115183 |
III |
Pt009491 |
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AT2G26580.2 |
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0.455497382 |
III |
Pt010908 |
MSSSSTLSLDLLPSSE in 6/213 |
AT2G45190.1 |
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III |
Pt016250 |
not found in 212aa |
AT2G45190.1 |
not_not |
0.445026178 |
III |
Get sequence file
Get alignment file
Get formatted file made by BOXSHADE
Sequence file prepared (0 sec required). Alignment has started.
CLUSTAL format alignment by MAFFT FFT-NS-2 (v7.475)
AT1G08465.1 ------------------------------------------------------------
pt009491_POPTR_ ------------------------------------------------------------
Os018243_Os04t0 -----------------------------------------------------------M
Sb029682_Sorbi1 --------AAQARR------------------STGSFASFG-----------------AM
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gm033263_Glyma1 ------------------------------------------------------------
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gm016716_Glyma0 ------------------------------------------------MY--------VL
pt005407_POPTR_ ------------------------------------------------------------
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gm047022_Glyma1 ------------------------------------------------------------
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Os041930_Os12t0 ------------------------------------------------------------
Os014123_Os03t0 ------------------------------------------------------------
Os008985_Os02t0 ------------------------------------------------------------
gm034120_Glyma1 ------------------------------------------------------------
Sb027997_Sorbi1 --------PDRARRRVLDDDSSLHRSSDRSIFSTASAPQVDQVVVGASCYISVLLGDRIM
gm046764_Glyma1 ------------------------------------------------------------
Sb022660_Sorbi1 LCFASSLPPSRSR---------LH--------GDGGYLEIEE------------------
gm034118_Glyma1 ------------------------------------------------------------
gm016718_Glyma0 ------------------------------------------------------------
Sb000956_Sorbi1 ------------------------------------------------------------
AT1G08465.1 -MSVDFSS--------------------------------------------------E-
pt009491_POPTR_ MSSC-VDVV-------------------------------------P----------HE-
Os018243_Os04t0 MSSAPET---------FSLD------HLSQH---QQQQ------PPPLA-------EQE-
Sb029682_Sorbi1 MSSVPET---------FNLD------Q--QHLVVQQQQ------PPP-A-------EQE-
Os027003_Os07t0 -MSVQFT--------------------------------------------------SE-
gm037785_Glyma1 MSMDMMAT--------------------------------------------------E-
Os036589_Os10t0 MSSSSSSSASSAAAAAFRPAVVQREQQVVEEKFPAAAAAMREMVLPPVAAA-AADSEQE-
gm034119_Glyma1 ------------------------------------------------------------
gm036154_Glyma1 MSSCSIDVA-------------------------------------P-----------E-
gm033262_Glyma1 MSMEMMAT--------------------------------------------------E-
pt029907_POPTR_ LARVLLKF--------------------------------------------------EA
gm033263_Glyma1 MSMEMMAT--------------------------------------------------E-
gm001387_Glyma0 MSSSSTS---------FSPD-----QHL-----------------SP----------SD-
pt033007_POPTR_ -MSSSSS---------LSLD------HL-----------------PP----------SE-
gm033264_Glyma1 MSMEMMAT--------------------------------------------------E-
gm037786_Glyma1 ------------------------------------------------------------
pt010908_POPTR_ -MSSSST---------LSLD------LL-----------------PS----------SE-
gm011376_Glyma0 MSSSSTT---------LSLD------HL-----------------PP----------SE-
pt016250_POPTR_ MASSSAA---------FSPD------HL-----------------SS----------SD-
gm016717_Glyma0 MSMEMMAT--------------------------------------------------E-
gm016716_Glyma0 LCQCVYIS--------------------------------------------------E-
pt005407_POPTR_ MSSC-IDAV-------------------------------------P----------NE-
gm006033_Glyma0 MSSSSTS---------FSPDQ----QHL-----------------SP----------SD-
gm047022_Glyma1 MSSSSST---------LSLD------HL-----------------PP----------SE-
Os014122_Os03t0 -MSAQIV---------------------------------------P---------APE-
Os041929_Os12t0 -MSAQIA---------------------------------------P---------A-E-
Sb031935_Sorbi1 MSSAQIA---------------------------------------P---------A-D-
Os041930_Os12t0 -MSAQIA---------------------------------------P---------A-E-
Os014123_Os03t0 -MSAQIV---------------------------------------P---------APE-
Os008985_Os02t0 MSSSSSSSA------VFPLD------HL--------AA------PSP----------TE-
gm034120_Glyma1 ------------------------------------------------------------
Sb027997_Sorbi1 MSSSSSSSA------AFPLD------HL---------A------PSP----------TE-
gm046764_Glyma1 MSSCSIDVA-------------------------------------P-----------E-
Sb022660_Sorbi1 KMSAQFA--------------------------------------------------SE-
gm034118_Glyma1 MSMDMMAT--------------------------------------------------E-
gm016718_Glyma0 MSMEMMAT--------------------------------------------------E-
Sb000956_Sorbi1 MSSSSSSSSAASAATVFPPSPQLPPSPLLVENLPPLHQ------LTPVAAAEAAAPASE-
AT1G08465.1 -----RVCYVHCS---------FCTTILAVSVPYASLFTLVTVRCGHCTNLLSLNIGVSL
pt009491_POPTR_ -----QLCYIPCN---------FCNIVLAVSVPCSNLFDIVTVRCGHCTNLWSVNMAAAF
Os018243_Os04t0 -----QLCYVHCN---------FCDTILAVGVPCSSLFKTVTVRCGHCANLLSVNLRGLL
Sb029682_Sorbi1 -----QICYVHCS---------YCDTILAVGVPCSSLFQTVTVRCGHCSNLLYVNLRALL
Os027003_Os07t0 -----HVCYVNCN---------YCNTILVVNVPNNCSYNIVTVRCGHCTMVLSMD-----
gm037785_Glyma1 -----RVCYVHCN---------FCNTTLAVSVPCSSLLTIVTVRCGHCANLLTVNMGASL
Os036589_Os10t0 -----QLCYVHCH---------YCDTVLVVSVPSSSLFETVTVRCGHCSSLLTVNMRGLL
gm034119_Glyma1 -------------------------------------------------------MGASL
gm036154_Glyma1 -----QLCYIPCN---------FCNIVLAVSVPCSSLFDIVTVRCGHCTNLWSVNMAAAF
gm033262_Glyma1 -----RVCYVHCN---------FCNTILAVSVPYSSLLTIVTVRCGHCANLLSVNMGASL
pt029907_POPTR_ NYTFGSIQVISCDNTRRAFLSCFTNSSWQVSVPSSSLFNIVTVRCGHCGNLLSVNMGASL
gm033263_Glyma1 -----RVCYVHCN---------FCNTILAVSVPYSSLLTIVTVRCGHCANLLSVNMGASL
gm001387_Glyma0 -----QLCYVHCN---------FCDTVLAVSVPCTSLFKTVTVRCGHCTNLLSVNMRGLL
pt033007_POPTR_ -----QLCYVHCN---------ICDTVLAVSVPCTSLFKTVTVRCGHCTNLLPVNMRGLF
gm033264_Glyma1 -----RVCYVHCN---------FCNTILAVSVPYSSLLTIVTVRCGHCANLLSVNMGASL
gm037786_Glyma1 -------------------------------------------------------MGASL
pt010908_POPTR_ -----QLCYVHCN---------ICDTVLAVSVPCTSLFKTVTVRCGHCTNLLPVNMRGLL
gm011376_Glyma0 -----QLCYVHCN---------ICDTVLAVSVPCTSLFKTVTVRCGHCTNLLPVNMRGLL
pt016250_POPTR_ -----QLCYVHCN---------FCDTVLAVSVPCSSLFKTVTVRCGHCTNLFSVNMRS-L
gm016717_Glyma0 -----RVCYVHCN---------FCNTILAVSVPYSSLLTIVTVRCGHCANLLSVNMGASL
gm016716_Glyma0 -----SVLVLAFY---------FLVYIL-VSVPYSSLLTIVTVRCGHCANLLSVNMGASL
pt005407_POPTR_ -----QLCYIPCN---------FCNIVLAVSVPCSSLFDIVTVRCGHCTNIWSVNMAAAF
gm006033_Glyma0 -----QLCYVHCN---------FCDTVLAVSVPCTSLFKNVTVRCGHCTNLLSVNMRGLL
gm047022_Glyma1 -----QLCYVHCN---------ICDTVLAVSVPCTSLFKTVTVRCGHCTNLLPVNMRGLL
Os014122_Os03t0 -----HVCYVHCN---------FCNTIFAVSVPSNSMLNIVTVRCGHCTSLLSVNLRGLV
Os041929_Os12t0 -----QVCYVHCN---------FCNTILAVSVPGNSMLNIVTVRCGHCTNLLSVNLRGLM
Sb031935_Sorbi1 -----HVCYVHCN---------FCNTVLAVSVPGNSMLNIVTVRCGHCTNLLSVNLRALM
Os041930_Os12t0 -----QVCYVHCN---------FCNTILAVSVPGNSMLNIVTVRCGHCTNLLSVNLRGLM
Os014123_Os03t0 -----HVCYVHCN---------FCNTIFAVSVPSNSMLNIVTVRCGHCTSLLSVNLRGLV
Os008985_Os02t0 -----QLCYVHCN---------CCDTILAVGVPCSSLFKTVTVRCGHCANLLSVNLRGLL
gm034120_Glyma1 -------------------------------------------------------MGASL
Sb027997_Sorbi1 -----QLCYVHCN---------CCDTILAVGVPCSSLFKTVTVRCGHCANLLSVNLRGLL
gm046764_Glyma1 -----QLCYIPCN---------FCNIVLAVSVPCSSLFDIVTVRCGHCTNLWSVNMAAAF
Sb022660_Sorbi1 -----HACYVNCN---------YCNTILVVNVPNSCSHNIVTVKCGHCTMVLSMD-----
gm034118_Glyma1 -----RVCYVHCN---------FCNTTLAVSVPCSSLLTIVTVRCGHCANLLTVNMGASL
gm016718_Glyma0 -----RVCYVHCN---------FCNTILAVSVPYSSLLTIVTVRCGHCANLLSVNMGASL
Sb000956_Sorbi1 -----QLCYVHCH---------FCDTVLVVSVPTSSLFKTVTVRCGHCSSLLTVNMRGLL
AT1G08465.1 HQ----------------------------------TS----------------APPIH-
pt009491_POPTR_ Q------------------------------------S----------------LSW---
Os018243_Os04t0 LP-----------------------------AAASTAN-----QLP--FGQAL-LSP---
Sb029682_Sorbi1 LP-----------------------------AA---AN-----QLPPFGGQAL-LSP---
Os027003_Os07t0 ------------------------------------------------------LAPFH-
gm037785_Glyma1 Q------------------------------------T----------------FPS---
Os036589_Os10t0 LP----TTAAAAPPPPPPPPP----------PPPPPAA-------H--FPHSLNLAP---
gm034119_Glyma1 Q------------------------------------T----------------FPS---
gm036154_Glyma1 Q------------------------------------S----------------LSW---
gm033262_Glyma1 Q------------------------------------A----------------FPP---
pt029907_POPTR_ Q------------------------------------T----------------LPL---
gm033263_Glyma1 Q------------------------------------A----------------FPP---
gm001387_Glyma0 LP---------------------------------SAN-----QLH--LGHSF-FTP---
pt033007_POPTR_ LP---------------------------------SAS-----QFP--LGHNL-YSP---
gm033264_Glyma1 Q------------------------------------A----------------FPP---
gm037786_Glyma1 Q------------------------------------T----------------FPS---
pt010908_POPTR_ LP---------------------------------SAN-----QFH--LGHSF-FSP---
gm011376_Glyma0 MP---------------------------------SPT-----QFH--LGHSF-FSP---
pt016250_POPTR_ LP---------------------------------AAN-----QFY--LGHGF-FNP---
gm016717_Glyma0 Q------------------------------------A----------------FPP---
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pt005407_POPTR_ Q------------------------------------S----------------LSW---
gm006033_Glyma0 LP---------------------------------SAN-----QLH--LGHTF-FTP---
gm047022_Glyma1 MP---------------------------------SPT-----QFH--LGHSF-FSP---
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Os041929_Os12t0 HS----------------------------------------------------APAL--
Sb031935_Sorbi1 HS----------------------------------------------------LPE---
Os041930_Os12t0 HS----------------------------------------------------APAL--
Os014123_Os03t0 QA----------------------------------------------------LPA---
Os008985_Os02t0 LPA----------------------------PAPAPAN-----QLH--FGPSL-LSP---
gm034120_Glyma1 Q------------------------------------T----------------FPS---
Sb027997_Sorbi1 LP-----------------------------PAAPPAN-----HLN--FGHSL-LSP---
gm046764_Glyma1 Q------------------------------------S----------------LSW---
Sb022660_Sorbi1 ------------------------------------------------------LSPFHQ
gm034118_Glyma1 Q------------------------------------T----------------FPS---
gm016718_Glyma0 Q------------------------------------A----------------FPP---
Sb000956_Sorbi1 FPGTPTNTAAAAAPPAAVTASTTTTTTTTITTAPPPATSVNNGQFH--FPQSVDLAP---
AT1G08465.1 Q----------DL---------QPHRQHT---------T--SLVTRKDCA---SSSRSTN
pt009491_POPTR_ Q----------DH--------VQASNHI-------------SHDYRIDMG----SSSKFN
Os018243_Os04t0 TSP---HGLL-D--E-VPS--FQAPASLM--TEQ------ASPNVSSITS--SNSSCANN
Sb029682_Sorbi1 TSP---HGLL-DAET-MSS--FQAPRSLQPSTDP------PSACVSTITS--INNTCGGG
Os027003_Os07t0 Q-----ARTVQDH-Q-VQNRGFQGNNFGS----------------------YDIA-SRNQ
gm037785_Glyma1 Q----------DT--------TQLQRQHL---------SVQEACS-KELG----SSSKCK
Os036589_Os10t0 ANPPHHHSLL-D--E-IST--ANSPTQLL-LEQHGLGGLMASAA-----------SCRNN
gm034119_Glyma1 Q----------DT--------TQLQRQHL---------SVQEACS-KELG----SSSKCK
gm036154_Glyma1 Q----------D---------VQGSGHC-------------NPEYRIDTG----STSKCN
gm033262_Glyma1 Q----------DP---------QSQKQHL---------SFQEPSS-KELG----SSSKCS
pt029907_POPTR_ Q----------DP-----------QKLLL---------INSEDLN-KNFG----SSSKCN
gm033263_Glyma1 Q----------DP-------------QHL---------SFQEPSS-KELG----SSSKCS
gm001387_Glyma0 Q------NLL-E--E-IRN--APSTNMMM--NQL------PNP----------------N
pt033007_POPTR_ S-----HNLLDD--Q-IPN---PTPNFLI--NQ-------THV----------------N
gm033264_Glyma1 Q----------DP-----------QKQHL---------SFQEPSS-KELG----SSSKCS
gm037786_Glyma1 Q----------DT--------TQLQRQHL---------SVQEACS-KELG----SSSKCK
pt010908_POPTR_ S-----HNLL-D--E-IPN---PTPNFLI--NQ-------TNV----------------N
gm011376_Glyma0 S-----HNLL-E--E-IPN---PSPNFLM--NQ-------TNLS-------------ASN
pt016250_POPTR_ Q-----INIL-E--G-MRSTGAPPS-LMI--NQ-------PNP----------------N
gm016717_Glyma0 Q----------DP---------QSQKQLL---------SFEEPSSCKELG---SSSSKCN
gm016716_Glyma0 Q----------DP---------QSQKQLL---------SFEEPSSCKELG---SSSSKCN
pt005407_POPTR_ Q----------DQ--------VQASNYN-------------SHDYRIDLG----SSSKCN
gm006033_Glyma0 Q------NLM-E--E-IRN--APSTNIMM--NQL------PNP----------------N
gm047022_Glyma1 S-----HNLL-E--E-IPN---PTPNFLM--NQ-------TNFS-------------ASH
Os014122_Os03t0 E----------D--H-LQDN----------LKMHNMS--FREN--YSEYG----SSSRYG
Os041929_Os12t0 Q----------D--H-HHHH----------LQESGLSGCFRDQSGYPEFGFSAASSSSKL
Sb031935_Sorbi1 Q----------D--Q-LQEN----------IKVHGVNGTLHDQCGHLELG---SSSSSKF
Os041930_Os12t0 Q----------D--H-HHHH----------LQESGLSGCFRDQSGYPEFGFSAASSSSKL
Os014123_Os03t0 E----------D--H-LQDN----------LKMHNMS--FREN--YSEYG----SSSRYG
Os008985_Os02t0 TSP---HGLL-D--E-V-A--FQTPSLLM--EQA------ASASLSSITG-RSSSSCASN
gm034120_Glyma1 Q----------DT--------TQLQRQHL---------SVQEACS-KELG----SSSKCK
Sb027997_Sorbi1 TSP---HGLL-D--E-L-A--LQAPSLLM--EQA-----SANLSSSTMTG-GSNSSCASN
gm046764_Glyma1 Q----------D---------VQGPGQC-------------NPEYRIDTG----STSKCN
Sb022660_Sorbi1 Q-----ARTVPDN-QVVQNRGFQYNNFGS----------------------YEQASSRNL
gm034118_Glyma1 Q----------DT--------TQLQRQHL---------SVQEACS-KELG----SSSKCK
gm016718_Glyma0 Q----------DP---------QSQKQLL---------SFEEPSSCKELG---SSSSKCN
Sb000956_Sorbi1 -NPHHQSLLL-D--E-ISS--AN-PRLQL-LEQHGLGGLIPSG--------------RN-
:
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pt009491_POPTR_ NKI---------------------STRT--PAT-NIVTQERVVNRPPEKRQRVPSAYNQF
Os018243_Os04t0 APATSMASAA----NKATQREPQ-QPKNA-PSA-N---------RTSEKRQRVPSAYNRF
Sb029682_Sorbi1 NSASAMSSMAPPPPAKPALLEPQ-LPKSA-ASG-N---------KTSEKRQRVPSAYNRF
Os027003_Os07t0 RTSTAMYPMPTS------------QQQV--SPI-----------RPPEKRQRVPSAYNRF
gm037785_Glyma1 TF---------------ETVDHDQQPRI--PPI-----------RPPEKRQRVPSAYNRF
Os036589_Os10t0 NSPAAAAAPPPPTSQGKAAAKEP-SPRTNTAVI-N---------RPPEKRQRVPSAYNRF
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gm036154_Glyma1 NRI---------------------AMRA--PTT-H-VTEERVVNRPPEKRQRVPSAYNQF
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Sb031935_Sorbi1 |
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Os041930_Os12t0 |
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Os014123_Os03t0 |
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Os008985_Os02t0 |
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gm034120_Glyma1 |
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gm046764_Glyma1 |
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Sb022660_Sorbi1 |
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gm016718_Glyma0 |
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