Input
| Putative repression domain
|
|
AT1G08970.2 |
not found |
|
Ortholog
| Putative repression domain
| Reverse top hit
| Relation
| Blast score ratio
| Type
|
Os025982 |
not found in 250aa |
AT1G56170.2 |
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III |
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not found in 136aa |
AT1G56170.2 |
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III |
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not found in 205aa |
AT1G56170.2 |
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III |
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III |
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III |
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III |
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AT1G56170.2 |
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0.613114754 |
III |
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not found in 229aa |
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III |
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III |
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AT3G48590.1 |
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0.560655737 |
III |
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III |
Pt036437 |
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III |
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0.570491803 |
III |
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III |
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III |
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III |
Pp013244 |
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AT3G48590.1 |
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III |
Pp013246 |
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III |
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III |
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Sm021821 |
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0.498360655 |
III |
Get sequence file
Get alignment file
Get formatted file made by BOXSHADE
Sequence file prepared (0 sec required). Alignment has started.
CLUSTAL format alignment by MAFFT FFT-NS-2 (v7.475)
AT1G08970.2 ------------------MDQ------QDH---------------------------GQS
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Sm020043_Selmo1 ------------------------------------------------------------
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pt036437_POPTR_ ------------------MDQSQQTRQQQS----QQQPVV-----------------AGA
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pp005481_Pp1s37 ------------------MRALAGSFNREFAGAEVWRESL-------------------A
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pp005616_Pp1s15 --------------------------------MATQHAHV--------------------
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Sm021821_Selmo1 ------------------------------------------------------------
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Os034147_Os09t0 ------------------------------------------------------------
Os030536_Os08t0 ------------------MDPHS---------HKKAHEGL-----------------IGD
pp036540_Pp1s31 ------------------------------------------------------------
AT1G08970.2 GAMNYGTNPYQTNPM----------------------STTAATVAGGAAQPGQLAF----
pp015077_Pp1s51 QQQQQQHQQQTMNNMM--------------------AQQQPQMQYSQNMGM-QQSYQG-P
pt000315_POPTR_ GQVAYASTPYQTAPMV--------------------ASGTPSIAIPSQTQP-PATF----
pp005480_Pp1s37 AAVAMASNQHGLASLS---------------------SAKPQSSAGATTTA-QQSF----
pp036539_Pp1s31 ------------------------------------------------------------
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gm010282_Glyma0 ------SGPYP-GGA----------------------GGSAG----AGAGAGAAPF----
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pp036538_Pp1s31 -------PPSSAPQMA--------------------PHPGPVMPL--QMHY--QAQ----
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pp013246_Pp1s15 ------------------------------------------------------------
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Sm020043_Selmo1 ------------------------------------------------------------
Sb021895_Sorbi1 VPGRNMPGRHHRRRLPHRRIVVRHPGGRR-----PARGATPDDAGPGRREAEGAAG----
gm021542_Glyma0 SQMAY-SSHYPTASMV--------------------ASGTPAVTAPSPTQA-PAAF----
pt036437_POPTR_ GQMAYASTPYQTAPMV--------------------ASGTPSIAIPSPTQS-PATF----
pt027792_POPTR_ ------PTAYPTQSI----------------------TTTPPLPPAGGAPS-STPF----
Os025982_Os06t0 SQVYP--AYRPAATV----------------------PTAPAV-IPAGSQP-APSFPANP
pt022933_POPTR_ ------STAYPPHST----------------------TTTPP-PPPPGAPS-SAPF----
Os031976_Os08t0 -----APVPYPPAGAYPP-------------PVGPYAHAPPLYAPPPPAAA-AASA----
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pp005616_Pp1s15 -------PPSSTAQMS--------------------PHAAPTIRLQQQMHY-PNHA----
gm015491_Glyma0 ------SGPYPVAGA----------------------GGSAG----AGAGA-PPPF----
Sm021821_Selmo1 ------------------------------------------------------------
Os012186_Os03t0 GQPAAAGAGAPVPGVP-----------------G--AGGPPAV----------------P
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Os034147_Os09t0 ------------------------------------------------------------
Os030536_Os08t0 NPDAYAVTTYQPVLMV---------------------EPSAAAAFPPAPQV-APAYPVNP
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pp005482_Pp1s37 -------QQGKHQ---------------MQGQGQMNSHM------QHQQLQMFWQQQNQE
pp013246_Pp1s15 --------------------------------MQPQLHY---QQIQKQQLSQFWQQQMQE
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pt036437_POPTR_ -------SNSPHQ---------------LTYQQAQHFHHQ-QQQQQQQQLQMFWTIQMQE
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Os025982_Os06t0 DQ-----LSAQHQ---------------LVYQQAQQFHQQ-LQQQQQRQLQQFWAERLVD
pt022933_POPTR_ -------------------------------------HH--LLQQQQQQLQMFWSYQRQE
Os031976_Os08t0 ------AATAASQ------------------------------QAAAAQLQNFWAEQYRE
pp005481_Pp1s37 -------QQGKHQ---------------MQGQGQMNSHM------QHQQLQMFWQQQNQE
gm036664_Glyma1 -------RLHPYD------------P---------QAMYQLRQEPLQQQLTNFWAKKRQE
pp013245_Pp1s15 --------MMPQL---------------GDQQMQPQLHY---QQIQKQQLSQFWQQQMQE
pp005616_Pp1s15 ----------PH------------------QQQQLQLHY---QQIQKQQLAQFWAQQTQE
gm015491_Glyma0 -------------------------------------QH--LLQQQQQQLQMFWSYQRQE
Sm021821_Selmo1 ------------------------------------------------------------
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pp013244_Pp1s15 ------------------------------QQMQPQLHY---QQIQKQQLSQFWQQQMQE
Os034147_Os09t0 ---------------------------------------------------MFWAEQYRE
Os030536_Os08t0 ------MQLPEHQ------------------QHAIQQVQQ-LQQQQKEQLQAFWADQMAE
pp036540_Pp1s31 ---------------------------------------------------------MQE
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pt027792_POPTR_ IEQ--------------VNDFKNHQLPLARIKKIMKA----------DEDV--------R
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pp036540_Pp1s31 MEQ--------------VNDFKTHQLPLARIKKIMKS----------DEDV--------K
:* : : :
AT1G08970.2 MISAEAPVVFA-------RACEMFILELTLRSWNHTEENKRRTLQKNDIAAAVTRTDIFD
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pp005480_Pp1s37 MIAAEAPVLFA-------KACEMFILELTLRSWIHTEENKRRTLQRNDIAGAITRGDIFD
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Sb004169_Sorbi1 MISAEAPVVFA-------KACEIFILELTLRSWMHTEENKRRTLQKNDIAAAITRTDIYD
Sb030598_Sorbi1 RVAGEAPLLFA-------KACEMFIQELTLRAWLHTEEDMRRTLQKKDVTAALASTEVFD
gm010283_Glyma0 MISAEAPILFA-------KACELFILELTIRSWLHADENKRRTLQKNDIAAAITRTDIFD
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pp013243_Pp1s15 MIAAEAPVLFS-------KACEMFILELTLRSWIHTEENKRRTLQRNDIAGAITRGDIFD
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pp013246_Pp1s15 MIAAEAPVLFS-------KACEMFILELTLRSWIHTEENKRRTLQRNDIAGAITRGDIFD
Sb031239_Sorbi1 RGRAHD----------------------RRRGARRLRPRLRDVHPR----AHPPR--LGA
Sm020043_Selmo1 MISGEAPVLFA-------KACEMFILELTLRAWMHTEENKRRTLQKNDIAAAVTRTDIFD
Sb021895_Sorbi1 LGGDHAHVLVGLHDLLDPGQRQLVVLEVRRRRALRLLALVR-----------PERLQLGL
gm021542_Glyma0 MISAEAPVIFA-------KACEMFILELTLRSWIHTEENKRRTLQKNDIAAAISRNDVFD
pt036437_POPTR_ MISAEAPVIFA-------KACEMFILELTLRSWIHTEENKRRTLQKNDIAAAISRTDVFD
pt027792_POPTR_ MISAEAPILFA-------KACELFILELTIRSWLHAEENKRRTLQKNDIAAAITRTDIFD
Os025982_Os06t0 MISAEAPVIFA-------KACEIFILELTLRSWMHTEENKRRTLQKNDIAAAITRTDMYD
pt022933_POPTR_ MISAEAPILFA-------KACELFILELTIRSWLHAEENKRRTLQKNDIAAAITRTDIFD
Os031976_Os08t0 MIAAEAPVVFA-------RACEMFILELTHRGWAHAEENKRRTLQKSDIAAAIARTEVFD
pp005481_Pp1s37 MIAAEAPVLFA-------KACEMFILELTLRSWIHTEENKRRTLQRNDIAGAITRGDIFD
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pp013245_Pp1s15 MIAAEAPVLFS-------KACEMFILELTLRSWIHTEENKRRTLQRNDIAGAITRGDIFD
pp005616_Pp1s15 MIATEAPVLFS-------KACEMFILELTLRSWIHTEENKRRTLQRNDIAGAITRGDIFD
gm015491_Glyma0 MISAEAPILFA-------KACELFILELTIRSWLHAEENKRRTLQKNDIAAAITRTDIFD
Sm021821_Selmo1 MISAEAPVLFA-------KACELFILELTFRAWMHTEENKRRTLQRNDVAGAISRADIFD
Os012186_Os03t0 MISAEAPVLFA-------KACELFILELTIRSWLHAEENKRRTLQRNDVAAAIARTDVFD
pp013244_Pp1s15 MIAAEAPVLFS-------KACEMFILELTLRSWIHTEENKRRTLQRNDIAGAITRGDIFD
Os034147_Os09t0 MIAAEAPVVFA-------RACEMFILELTHRGWAHAEENKRRTLQKSDIAAAIARTEVFD
Os030536_Os08t0 MIAGEAPALFA-------KACEMFILDMTLRSWQHTEEGRRRTLQRSDVEAVIKKTDIFD
pp036540_Pp1s31 MIAAEAPVLFS-------KACEMFILELTLRSWIHTEENKRRTLQRNDIAGAITRGDIFD
. * * :
AT1G08970.2 FLVDIVPREDL-RDE------VLGSIPRGTVP--EAAAAG-YPYG------YLPAGT---
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pt000315_POPTR_ FLVDIIPRDEL-KEE-------GLGVTKSTIPVVGSPAD--LPY-------YYVPQ----
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Sb021895_Sorbi1 LLLEQVV----VRHRRR----AGCAGHARHY---WGSSGG--------------------
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pt036437_POPTR_ FLVDIIPRDEL-KEE-------GLGVTKATIP-VGPPAD--LPY-------YYVPQ----
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pp013244_Pp1s15 FLVDIVPRDEL-KEE-------DLGVPWTGVP--G---DGSVPYGG----IFYPPMAGQQ
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