Input
| Putative repression domain
|
|
AT1G08970.2 |
not found |
|
Ortholog
| Putative repression domain
| Reverse top hit
| Relation
| Blast score ratio
| Type
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Os006607 |
not found in 259aa |
AT1G56170.2 |
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II |
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AT1G56170.2 |
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III |
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AT1G56170.2 |
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AT1G56170.2 |
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AT1G56170.2 |
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AT1G08970.2 |
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AT1G56170.2 |
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III |
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AT1G08970.2 |
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Ia |
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II |
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II |
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not found in 303aa |
AT1G08970.2 |
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0.704918032 |
II |
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not found in 271aa |
AT1G56170.2 |
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0.613114754 |
III |
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not found in 229aa |
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not found in 222aa |
AT3G48590.1 |
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III |
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AT3G48590.1 |
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0.560655737 |
III |
Gm021377 |
not found in 205aa |
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AT1G08970.2 |
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II |
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AT1G08970.2 |
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AT1G08970.2 |
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AT1G08970.2 |
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II |
Pt000315 |
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AT1G56170.2 |
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AT3G48590.1 |
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Pp013244 |
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III |
Pp013246 |
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0.498360655 |
III |
Get sequence file
Get alignment file
Get formatted file made by BOXSHADE
Sequence file prepared (1 sec required). Alignment has started.
CLUSTAL format alignment by MAFFT FFT-NS-2 (v7.475)
AT1G08970.2 ------------------------------------------------------------
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gm055597_Glyma2 ------------------------------------------------------------
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Sm006602_Selmo1 ------------------------------------------------------------
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Os012186_Os03t0 ------MDNQ------------------------------------QLPYAGQP---AAA
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pp005482_Pp1s37 ---------------MRAL-----------------------AGSFNREFAGAEVWRESL
pp013244_Pp1s15 ---------------MAA---------------------------QQHPHI---------
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Sb021895_Sorbi1 ------------------------------------------------------------
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gm036664_Glyma1 ------MDQNQ----------------------------------------------HDR
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pp013246_Pp1s15 ------------------------------------------------------------
gm021377_Glyma0 ------MDQNQ----------------------------------------------HGQ
Sm021821_Selmo1 ------------------------------------------------------------
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Os030536_Os08t0 ------MDPHS-------------------------------HKKAHEGLIGDN------
Os034147_Os09t0 ------------------------------------------------------------
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gm010282_Glyma0 ------MEN-N-------------------------------------QQQGAQ------
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Sb023436_Sorbi1 ------------------------------------------------------------
pt034313_POPTR_ ------MDQQ---------------------------------GHGQPPTVGM----IGR
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gm036665_Glyma1 PAQEAY---GENQYQSNPVTTPTVLPTQTS--------DSSLSSSYP-------RQHPND
pp015077_Pp1s51 --SQNM--GMQQSYQGPQSL-GGG-PETS------PSQGGQIQGQSP-----GAYPTALA
pt014120_POPTR_ ----GY---GTNPYQPNQMPAASN-PGSV---------PGQPA-------GAQLEQHQLA
Sb004169_Sorbi1 GGSQVY---PASAYPPAATV-A-A-PAV-------ASAGLQSAQPFQANPAHTSAQHQIV
Sm020043_Selmo1 ------------------------------------------------------------
gm021542_Glyma0 ASQMAY----SSHYPTASMVASGT-PAVT------APSPTQAPAAF------SSSAHQLA
pp013245_Pp1s15 -----------------------------------------------------MMPQLGD
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pt042230_POPTR_ ------------------MMGPSA-TGSL-------QSPTQPAVLTA--SSAHLAQHQLA
Sb015279_Sorbi1 -GSQPY--PAAASYAAPTMV-AGA-PA--------VPPGSQPAAQFP-NPAQLSAQHQMV
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Sb030598_Sorbi1 ---------PSESAVSEGVTNGDAIPSDFQ--------DDAPVIQPP-----LSHHHQVA
Sm006602_Selmo1 -----------------------------------------Y------------------
pp005480_Pp1s37 AAAVAM---ASNQHGLASLS-SAK-PQSS------AGATTTAQQSF------QQGKHQMQ
Os012186_Os03t0 GAGAPV-------------------PGV-------PGAGGPPAVP---------------
pt000315_POPTR_ AGQVAY---ASTPYQTAPMVASGT-PSIA------IPSQTQPPATF------SNSPHQLT
pp005482_Pp1s37 AAAVAM---ASNQHGLASLS-SAK-PQSS------AGATTTAQQSF------QQGKHQMQ
pp013244_Pp1s15 -----------PPSSAPQMS-HPG-AVMP------L--QMHYPQAQ--------------
gm053118_Glyma1 GAQLAY---GSNPYQPGQITGP---PGSVVTSVGTIQST--PA-------GAQLGQHQLA
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Os006607_Os02t0 GGSQAYP-PPAAAYPPQAMV-PGA-PAV-------VPPGSQPSAPFPTNPAQLSAQHQLV
pp013246_Pp1s15 ------------------------------------------------------------
gm021377_Glyma0 PTQEAV---GKNQYQSNPMMAPTNPPSETI--------GPYVTSSFP-------REKQHA
Sm021821_Selmo1 ------------------------------------------------------------
pp036540_Pp1s31 ------------------------------------------------------------
Os025982_Os06t0 GGSQVY-----PAYRPAATV-PTA-PAV-------IPAGSQPAPSFPANPDQLSAQHQLV
Os030536_Os08t0 --PDAY---AVTTYQPVLMVEPSA--------AAAFPPAPQVAPAYPVNPMQLPEHQQHA
Os034147_Os09t0 ------------------------------------------------------------
pt001546_POPTR_ TSQLQY---GTSPYQPNQMLAASN-PGSV---------TGQPV-------GAQLAQHQLA
gm010282_Glyma0 --------AQSGPYP-GGAGGSAG--------------AGAGAGAAP-------------
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Sb023436_Sorbi1 ----------KAPSSSSSSSAPNP-PPRLAT-------GHNPSCPRIHG-----------
pt034313_POPTR_ TAPVPY---GMASYQPNQMMGPSA-TGSV-------QSPTQPAVLAA--ASAQLAQHQLA
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pp005616_Pp1s15 QQQQLQLHY---QQIQKQQLAQFWAQQTQEMEEVN--------------DSKTHQLPLAR
pt036437_POPTR_ YQQAQHFHHQ-QQQQQQQQLQMFWTIQMQEIEQTT--------------DFKNHSLPLAR
Sb031239_Sorbi1 --------------------------QIHHPSPASGHG------RAR--RVPSA--PRRR
gm008069_Glyma0 YQ---HIHQQ-QQHQLQQQLQQFWSSQYQEIEKVT--------------DFKNHSLPLAR
gm055597_Glyma2 -------YQQ-QQQQLQQRLQAFWANQYQEIKKVT--------------DFKNHSLPLAR
pp005481_Pp1s37 GQGQMNSHM------QHQQLQMFWQQQNQEMEQLNEKSSKSELLMTHLTEFKNHQLPLAR
pp036538_Pp1s31 GQQQTQLHY---QQIQKQQLSQFWAQQMQEMEQVN--------------DFKTHQLPLAR
pp016894_Pp1s40 QQQQVQLSYQHLQQHHQQQLQMFWANQMSEIEQAN--------------DFKNHQLPLAR
gm036665_Glyma1 PQL-EAMYEL-RQERLQQQLNNFWAKQCQEIQEAT--------------DLRTHSLPLAR
pp015077_Pp1s51 QQQQAQLSYQHLQQQHQQQLQMFWANQMSEIEQVN--------------DFKNHQLPLAR
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gm015491_Glyma0 ------FQH--LLQQQQQQLQMFWSYQRQEIEHVN--------------DFKNHQLPLAR
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* :
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: . : * :
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Sb023436_Sorbi1 ----------GGAVPRDRGHHRLQEPQPPARPHQEDHE--------GRRGRPHDRRRGPR
pt034313_POPTR_ ----------------RACEMFILELTLRSWNHTEENK--------RRTLQKNDIAAAIT
: :: :
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Sm021821_Selmo1 RADIFDFLVDIVPRE-----------------EL-KV------TF-LS-T----------
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Sb023436_Sorbi1 R--VRPGLRDVHPRAHPPRLGARRGEQAPHASEVRHCRCHRPHRG-VR-LPRGHRSARRR
pt034313_POPTR_ RTDIFDFLVDIVPRE-----------------DL-KD------EV-LASVPRGSLP----
*
AT1G08970.2 ----------------EA-------AAAG---YPY------GYLPAG----TAP-IGNP-
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gm021377_Glyma0 ---------------SSI-------A-----QNFD------LSMPPH----QN-VTYPP-
Sm021821_Selmo1 ------------------------------------------------------------
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Os025982_Os06t0 ----------------LG-------VPAD--SYPYG-----YYVPQ---------QQVP-
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Os034147_Os09t0 ---------------AAG-------VPAT-DPLAY------YYVPQ--------------
pt001546_POPTR_ ----------------VG-------GPVD--ALSY------CYMPPP----HAPQVGAP-
gm010282_Glyma0 ---------------LVG-------ATAS--GVPY------YYPP----------IGQPA
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gm015491_Glyma0 ---------------LVG-------ATAS--GVPY------YYPP----------IGQPA
Sb023436_Sorbi1 KG-----------RRRGGRRSCCGCCCRD---------------PASC---RGSTGHRP-
pt034313_POPTR_ ----------------VG-------GPPD--ALPY------YYMPHQ----LAPQVSAP-
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pp005480_Pp1s37 SIYWFVLESREYSKKCFSCCTQTATEIGIGLVISTRILHSWKEKLLRKGSSLREHALLLI
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