Input
| Putative repression domain
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AT1G10320.1 |
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Ortholog
| Putative repression domain
| Reverse top hit
| Relation
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| Type
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Os008307 |
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not found in 259aa |
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not found in 803aa |
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Ib |
Get sequence file
Get alignment file
Get formatted file made by BOXSHADE
Sequence file prepared (0 sec required). Alignment has started.
CLUSTAL format alignment by MAFFT FFT-NS-2 (v7.475)
AT1G10320.1 MEQANEKEEEERHEEAAGEKESFEESKEKAAEMSRKEKRKAMKKLKRKQVRKEIAAKERE
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pt019020_POPTR_ EEERR---LNDPEEQRR-LKEMEEEEKERMERERKAFEERERQWMEVMERK-----RKEE
pp027408_Pp1s33 EEVE---------------EHAEEEEEEVLAKERAEHEEQERLWLLREEESHKEWLRKQE
gm021516_Glyma0 EEEER---LNNPEEQRR-MQLLEQQEAERMQRDMILFREREKAWMDTVITQ-----KQQQ
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pp027408_Pp1s33 EEIERKRKEDERTCK-----------GED--GEDLEEGWEYV-EDGPAEIIWQGNEIIVK
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pp027408_Pp1s33 KPRKKV-------KKGTNSGVLAIEE---------KDRPASNPLPPQSTAFSSYQANA--
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pp027408_Pp1s33 ------QDLTDQNTNFGTEQDKRNCPFYIKTGVCRFGVRCSRLHPVFNEACTLLMRSMYT
gm021516_Glyma0 ---LTLENVAQQIPNFGTEQDKAHCPFHLKTGACRFGIRCSRVHFYPDKSSTLLIKNMYS
Sm021624_Selmo1 ------------------MQDKTHCPFHTKTGACRFGPRCSRLHVYPEKSCTLLIKNMYT
Os008307_Os02t0 ------------------------------------------------------------
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Sm021624_Selmo1 GPGLA--WEHDEGLECTDEEIEQKFEEFYEDVHSEFLKFGELVNFKVCRNSSPHLRGNVY
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Sm021624_Selmo1 VHYQSEADAVAACLALSGRFYASKQV------LARYSI----------------------
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Sm021624_Selmo1 ------------------------------------------------------------
Os008307_Os02t0 IHCFRNPGGDYEWADWDNPPPRYWIRKMAALFGPS-------------------------
Sb010531_Sorbi1 ------------------------------------------------------------
AT1G10320.1 ----LNDSISDLSTDSHR-------------------QPSRRSRSRDHDHANVGSTPSYR
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pp027408_Pp1s33 MVRHRGDSVS--TYDDDRRKDR------HMKESVREDEHRRRSDGREQ------------
gm021516_Glyma0 -----NMSLS--KTDSDRWKFELFNVLIYLFYHILTCHSRRRSRSREMDQLNCG------
Sm021624_Selmo1 ------------------------------------------------------------
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Sb010531_Sorbi1 ------------------------------------------------------------
AT1G10320.1 SRKYHGDTQDSTREDKLRRHAENCHDGDDSPSRDGSLEREMYKERRYAKDTLHR--DSRW
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gm021516_Glyma0 ------------------------HSG----------RRKQRDERK--------------
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Sb010531_Sorbi1 ------------------------------------------------------------
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pp027408_Pp1s33 STH---HDDSARDKSASRSMDDDDDDANDDERYFQGHKKFERWSPGRHGETDGREAVYSK
gm021516_Glyma0 ------HRTPNEDWNGSF-------------------KRKSRGRTPDSGAVSDREWLEKE
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gm021516_Glyma0 ENRETH------------------------------------------------------
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pp027408_Pp1s33 SRRRSRSPDGHKSRRSRSRDRSMSHSARGEDGYYSVGEHQHRY--------SKTIRDNE-
gm021516_Glyma0 ------------------HEYTMNSRRHEEDS------------------------DVE-
Sm021624_Selmo1 ------------------------------------------------------------
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Sb010531_Sorbi1 ------------------------------------------------------------
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pt019020_POPTR_ ------------------------------------------------------------
pp027408_Pp1s33 ------------------RSSKESKQHRQRSSTQSSNDA----FGNQEASQTLEGRVDED
gm021516_Glyma0 ---------------------------------WVTRD--------NEKQHGREGRNSRK
Sm021624_Selmo1 ------------------------------------------------------------
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Sb010531_Sorbi1 ------------------------------------------------------------
AT1G10320.1 ENSDRETHKERRHRHRKRRR-----------TQNSDDQNPKESEE---------------
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Sm021624_Selmo1 ------------------------------------------------------------
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Sm021624_Selmo1 ------------------------------------------------------------
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BoxShade v3.31 C (beta, 970507) Output
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pt019020_POPTR_ |
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pp027408_Pp1s33 |
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gm021516_Glyma0 |
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Sm021624_Selmo1 |
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Os008307_Os02t0 |
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Sb010531_Sorbi1 |
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