|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Get sequence file Get alignment file Get formatted file made by BOXSHADE Sequence file prepared (0 sec required). Alignment has started. CLUSTAL format alignment by MAFFT FFT-NS-2 (v7.475) AT1G13260.1 ----------------------------------------------------------ME Sb024795_Sorbi1 RRILSITGRRAAAGSRVPKQKSKKPKAARLQGAARAVALA-HLIMGIESMSPTAAPA-ED Os000363_Os01t0 -----------------MEQE-----------------------AAMVVFSCNSG----- Os000364_Os01t0 --------------------------------------------MGVVSFSSTS------ gm028283_Glyma1 ----------------------------------------------------------MD gm001006_Glyma0 ----------------------------------------------------------MD Sb025645_Sorbi1 -----------------------------------------------PASSSGALK--MD pt035978_POPTR_ -----------MPLSLVNKNTS-------------SISLSFSFSLAPPSFTTTTRKKNMD gm055124_Glyma2 ----------------------------------------------------------MD AT1G13260.1 S-------SSVDESTTST-----------GSICET---PAIT----------PA----KK Sb024795_Sorbi1 SSSSSSRFSAASTATTESGAA-------QPRAASA------------------------- Os000363_Os01t0 --------SGGSSSTTDSKQE----EEEEEELAAM------------------------- Os000364_Os01t0 --------SGASTATTESGGAV--RMSPEPVVAVA------------------------- gm028283_Glyma1 GG------CVTDETTTSS-----------DSLSV------------------PP------ gm001006_Glyma0 AI------SCLDESTTT------------ESLSISQAKPSSTIMSSEKASPSPP------ Sb025645_Sorbi1 SAS-----SLVDDTSSGSGGGGGASTDKLRALAVA------------AAASGPP------ pt035978_POPTR_ G-------SCIDESTTSSA---------DNSISIT---PTS-------LPPFPPTATTTK gm055124_Glyma2 GG------SVTDETTTTS-----------NSLSVP-------------ANLSPP------ . . ::: . AT1G13260.1 SSVGNLYRMGSGSSVVL-DSE----NG-VEAESR------------KLP----------- Sb024795_Sorbi1 -APGGG-AVVVGRDASLADEQ--------AVTSQ--------------PLAASTAAAVAQ Os000363_Os01t0 -EEDELIHVVQAAELRLPSS---------TTATR--------------P----------- Os000364_Os01t0 -AAAQQLPVVKGVDS--ADE---------VVTSR--------------P-----AAAAAQ gm028283_Glyma1 -P----SRVGSVASAVV-DPDGCCVSG--EAESR------------KLP----------- gm001006_Glyma0 -PPNRLCRVGSGASAVV-DSDGGGGGGSTEVESR------------KLP----------- Sb025645_Sorbi1 -----LERMGSGASAVL-DAAE---PG-AEADSAAAAAPGAVGVGGKLP----------- pt035978_POPTR_ SPPESLCRVRSGNSSVILDSE----SG-VEAESR------------KLP----------- gm055124_Glyma2 -P---LSLVGSGATAVV-YPDGCCVSG--EAESR------------KLP----------- : . : * AT1G13260.1 -SSKYKGVVPQPNGRWGAQIYEKHQRVWLGTFNEEDEAARAYDVAVHRFRRRDAVTNFKD Sb024795_Sorbi1 GSSRFKGVVPQPNGRWGAQIYERHARVWLGTFADEEAAARAYDVAALRYRGREAATN-FP Os000363_Os01t0 -SSRYKGVVPQPNGRWGAQIYERHARVWLGTFPDEEAAARAYDVAALRFRGRDAVTNRAP Os000364_Os01t0 QSSRYKGVVPQPNGRWGAQIYERHARVWLGTFPDEEAAARAYDVAALRYRGRDAATN-FP gm028283_Glyma1 -SSKYKGVVPQPNGRWGAQIYEKHQRVWLGTFNEEDEAARAYDIAALRFRGPDAVTNFKP gm001006_Glyma0 -SSKYKGVVPQPNGRWGSQIYEKHQRVWLGTFNEEDEAARAYDVAVQRFRGKDAVTNFKP Sb025645_Sorbi1 -SSRYKGVVPQPNGRWGAQIYERHQRVWLGTFAGEADAARAYDVAAQRFRGRDAVTNFRP pt035978_POPTR_ -SSKYKGVVPQPNGRWGAQIYEKHQRVWLGTFNEENEAARAYDIAAQRFRGRDAVTNFKQ gm055124_Glyma2 -SSKYKGVVPQPNGRWGAQIYEKHQRVWLGTFNEEDEAARAYDIAAHRFRGRDAVTNFKP **::************:****:* ******* * ******:*. *:* :*.** AT1G13260.1 VKM----DEDEVDFLNSHSKSEIVDMLRKHTYNEELEQSKR-----RRNGNGNMTRTLLT Sb024795_Sorbi1 GA-GA--SAPELTFLAAHSKAEIVDMLRKHTYADELRQGLR-----RGRGMGARAQ---- Os000363_Os01t0 AAEGA--SAGELAFLAAHSKAEVVDMLRKHTYDDELQQGLR-----R----GSRAQ---- Os000364_Os01t0 GA-AA--SAAELAFLAAHSKAEIVDMLRKHTYADELRQGLR-----RGRGMGARAQ---- gm028283_Glyma1 PAAS---DDAESEFLNSHSKFEIVDMLRKHTYDDELQQSTRGG---RRRLDADTAS---- gm001006_Glyma0 LSGTD-DDDGESEFLNSHSKSEIVDMLRKHTYNDELEQSKRSRGFVRRRGSAAGAGNGNS Sb025645_Sorbi1 LADADPDAAAELRFLASRSKAEVVDMLRKHTYFDELAQNKRAFAA-AAAAAASSAATTTA pt035978_POPTR_ VNETE-DDEIEAAFLNAHSKAEIVDMLRKHTYSDELEQSKRNH---RSNNGGNGKQYKNT gm055124_Glyma2 LAGA---DDAEAEFLSTHSKSEIVDMLRKHTYDNELQQSTRGG---RRRRDAETAS---- * ** ::** *:********* :** *. * . AT1G13260.1 ----SGLSNDGVSTTG--FRSAEALFEKAVTPSDVGKLNRLVIPKHHAEKH--FPLP--- Sb024795_Sorbi1 ---------------PTPAWARSLLFEKAVTPSDVGKLNRLVVPKQHAEKH--FPLKRAP Os000363_Os01t0 ---------------PTPRWAREPLFEKAVTPSDVGKLNRLVVPKQQAERHFPFPLRRHS Os000364_Os01t0 ---------------PTPSWAREPLFEKAVTPSDVGKLNRLVVPKQHAEKH--FPLRRAA gm028283_Glyma1 ----SGVFD---------AKAREQLFEKTVTPSDVGKLNRLVIPKQHAEKH--FPLSGSG gm001006_Glyma0 ---ISGACV---------MKAREQLFQKAVTPSDVGKLNRLVIPKQHAEKH--FPLQSAA Sb025645_Sorbi1 SSLANNNNNHSSLASPSPATAREHLFDKTVTPSDVGKLNRLVIPKQHAEKH--FPLQ--- pt035978_POPTR_ ANYENNSYDHGC---GRVLKAREQLFEKAVTPSDVGKLNRLVIPKQHAEKH--FPLQS-- gm055124_Glyma2 ----SGAFD---------AKAREQLFEKTVTQSDVGKLNRLVIPKQHAEKH--FPLSGSG : . **:*:** **********:**::**:* *** AT1G13260.1 -------SSNVSVKGVLLNFEDVNGKVWRFRYSYWNSSQSYVLTKGWSRFVKEKNLRAGD Sb024795_Sorbi1 EA-SA--AAATTGKGVLLNFEDGEGKVWRFRYSYWNSSQSYVLTKGWSRFVREKGLRAGD Os000363_Os01t0 SD--------AAGKGVLLNFEDGDGKVWRFRYSYWNSSQSYVLTKGWSRFVREKGLRPGD Os000364_Os01t0 SSDSA--SAAATGKGVLLNFEDGEGKVWRFRYSYWNSSQSYVLTKGWSRFVREKGLRAGD gm028283_Glyma1 DESSPCVAGASAAKGMLLNFEDVGGKVWRFRYSYWNSSQSYVLTKGWSRFVKEKNLRAGD gm001006_Glyma0 NGVS---ATATAAKGVLLNFEDVGGKVWRFRYSYWNSSQSYVLTKGWSRFVKEKNLKAGD Sb025645_Sorbi1 ---LP--SAGGESKGVLLNLEDAAGKVWRFRYSYWNSSQSYVLTKGWSRFVKEKGLQAGD pt035978_POPTR_ -------TSSNSTKGVLLNLEDVSGKVWRFRYSYWNSSQSYVLTKGWSRFVKEKNLKAGD gm055124_Glyma2 GGALPCMAAAAGAKGMLLNFEDVGGKVWRFRYSYWNSSQSYVLTKGWSRFVKEKNLRAGD **:***:** ***************************:**.*:.** AT1G13260.1 VVSFSRSN----GQDQQLYIGWKSRSG-SDLDAG-------------------------- Sb024795_Sorbi1 TIVFSHS---TYSSEKQLFIDCKKTKTTTVATT-----------DGAPVPAPAEKKPSEA Os000363_Os01t0 TVAFSRSA-AAWGTEKHLLIDCKKMERNNLATV-----------DD------------DA Os000364_Os01t0 TIVFSRS---AYGPDKLLFIDCKKNNAAAATTTC--------AGDERPTTSGA-----EP gm028283_Glyma1 AVQFFKST----GPDRQLYIDCKARSGEVNNNAGGLFV------PIGPVVEPV------- gm001006_Glyma0 TVCFQRST----GPDRQLYIDWKTRNV-VNEVA--LF---------GPVVEPI------- Sb025645_Sorbi1 VVGFYRSSAVGAGADTKLFIDCKLRPN-SVATASTTTGPAVGSSPPAPAPAPV-----AT pt035978_POPTR_ IVCFQRST----GPDNQLYIDWKARCG-SNQ------------------VQPV------- gm055124_Glyma2 AVQFFKST----GLDRQLYIDCKARSG--------------------------------- : * :* . : * *. * AT1G13260.1 R-VLRLFGVNI----SPESSRN-------DVVGNKR-VNDTEML---SL--VCSKKQRI- Sb024795_Sorbi1 R-VVRLFGVDI-----AGDGCQ------------KR-ARPVEIAFEHGPQQELLKKKQCV Os000363_Os01t0 RVVVKLFGVDI-----AGDKTR-------------------------------------- Os000364_Os01t0 R-VVRLFGVDI-----AGGDCR------------KR-ERAVEMG-----QEVFLLKRQC- gm028283_Glyma1 Q-MVRLFGVNLLKLPVPGSDGV-----------GKR--KEMELF---AF--ECCKKLKV- gm001006_Glyma0 Q-MVRLFGVNILKL--PGSDSIANNNNASGCCNGKR--REMELF---SL--ECSKKPKI- Sb025645_Sorbi1 K-AVRLFGVDLLTA--PAATAAA---PAEAMAAGCK--RARDLA---SPPQAAFKKQLV- pt035978_POPTR_ Q-MVRLFGVNIFNV--PGMENG---------CDGKRSIRDMELL---SIDRQYSKKQRI- gm055124_Glyma2 K-MVRLFGVDLLKLPVPGSDGIGVG------CDGKR--KEMELF---AF--ECSKKLKV- : ::****:: . AT1G13260.1 ---------FHAS-- Sb024795_Sorbi1 GVAHHRSPALGAFLL Os000363_Os01t0 --------------- Os000364_Os01t0 -VVHQRTPALGALLL gm028283_Glyma1 ---------IGAL-- gm001006_Glyma0 ---------IGAL-- Sb025645_Sorbi1 ---------ELALV- pt035978_POPTR_ ---------VGAL-- gm055124_Glyma2 ---------IGAL--
|