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Get sequence file Get alignment file Get formatted file made by BOXSHADE Sequence file prepared (0 sec required). Alignment has started. CLUSTAL format alignment by MAFFT FFT-NS-2 (v7.475) AT1G15580.1 ------------------------------------------------------------ pt040947_POPTR_ ------------------------------------------------------------ pt015555_POPTR_ ------------------------------------------------------------ pt040946_POPTR_ ------------------------------------------------------------ pt028468_POPTR_ ------------------------------------------------------------ pt010911_POPTR_ ------------------------------------------------------------ pt039373_POPTR_ ------------------------------------------------------------ pt001236_POPTR_ ------------------------------------------------------------ pt002787_POPTR_ ------------------------------------------------------------ pt035517_POPTR_ MADHVHTISYMSCCLKGAAIATDRLSLPLSIIHAFEERITRHFSQPLPFVYKIHLFPFTP AT1G15580.1 -------------------------------------------------MANESNNLGLE pt040947_POPTR_ ---------------------------------------------MEGGVAYE-NDLNLK pt015555_POPTR_ -------------------------------------------------MEFE-RDLNLD pt040946_POPTR_ ---------------------------------------------MEGGVAYE-NDLNLK pt028468_POPTR_ MSP----------------------------------------ENGSNLLESDAANVSFK pt010911_POPTR_ -------------------------------------------------MA---QPLGLE pt039373_POPTR_ ---------------------------------------------MERSMAYE-RHLNLK pt001236_POPTR_ -------------------------------------------------MEFE-RDLNLE pt002787_POPTR_ -------------------------------------------------MAYE-SDLNLK pt035517_POPTR_ ASPHRKTSYHFSQESLPKEITRATSKSCIHHLLAVPVFEQRLLENMEGGVAYE-NDLNLK : :.:. AT1G15580.1 ITELRLGLPGDIVVSGES-------ISGKKRASPEVEI---------------------D pt040947_POPTR_ ETELRLGLPGTGCTN-EKGVSG---ARNNKRPFPETREEGGA---NGKSDAQHD-----D pt015555_POPTR_ ATELRLGLPGTATKQSEKQTPNSNLAKSNKRSLPDMNEEPAGSSRENSSTVSSNDKKSHD pt040946_POPTR_ ETELRLGLPGTGCTN-EKGVSG---ARNNKRPFPETREEGGA---NGKSDAQHD-----D pt028468_POPTR_ ETELTLGLPG------ESRGLALIEKTSGKRGFLETVDLNLG--RSSNVDSDHNKYSG-E pt010911_POPTR_ ITELRLGLPGSDDGH----------KNDKKRVFSEVSGEANS---------TTD-----D pt039373_POPTR_ ATELRLGLPGSDEPEKPSTTPS---VRSNKRASPEISEESGS---KGSSSLSSNVENS-E pt001236_POPTR_ ATELRLGLPGTATEQLEKQTPNSNVTKSNKRSLPDMNEDSAG--RRESSSVSSNDKKSHE pt002787_POPTR_ ATELRLGLPGSDEPEKPSTTPS---VRSNKRASPEISEESRS---KGSSSVSSNVENG-E pt035517_POPTR_ ATELRLGLPGTSCTNEEQAVSG---ARNNKRPLPETREERGA---KGKSDPRHD-----D *** ***** . ** : : AT1G15580.1 LKCE-------PAKK------------------------------SQVVGWPPVCSYRRK pt040947_POPTR_ QETA-------SAPN----------TY---SF------DMHATCRVQIVGWPPIRSY-RK pt015555_POPTR_ QETA-------PPIK------------------------------AQVVGWPPIRSY-RK pt040946_POPTR_ QETA-------SAPKVQIVGWPPIRSYRKNSFQPKKAEDEAAAGMVQIVGWPPIRSY-RK pt028468_POPTR_ SETDVPNTAKPPAAK------------------------------AQVVGWPPVRAY-RK pt010911_POPTR_ RKVQ---------TK------------------------------SQVVGWPPVCSY-RK pt039373_POPTR_ GDDA-------PPAK------------------------------AQVVGWPPIRSY-RK pt001236_POPTR_ QETA-------PPTK------------------------------TQVVGWPPIRSY-RK pt002787_POPTR_ RDSA-------PPAK------------------------------AQVVGWPPIRSY-RK pt035517_POPTR_ QETA-------PAPK------------------------------AQIVGWPPIRSY-RK . : *:*****: :* ** AT1G15580.1 NSLERTKSS-------YVKVSVDGAAFLRKIDLEMYKCYQDLASALQILFGC---YI--- pt040947_POPTR_ NSLQPKKAEDEAAAGMYVKVSMDGAPYLRKIDLKVYKGYPELLKALENMFKL---TIGEY pt015555_POPTR_ NCLQAKKLE-AEAAGLYVKVSMDGAPYLRKIDLKVYKGYPELLKALEEMFKS---KVGEY pt040946_POPTR_ NSLQPKKAEDEAAAGMYVKVSMDGAPYLRKIDLKVYKGYPELLKALENMFKL---TIGEY pt028468_POPTR_ NAMKSCK---------YVKVAVDGAPYLRKVDLEMYNSYQQLLNALQDMFSCFSFTIRNY pt010911_POPTR_ NISFNERDRHHETSKIYVKVSMDGAPFLRKIDLGMHKEYSDLVVALERLFGC-------Y pt039373_POPTR_ NCLQPKKNDRVDGAGMYVKVSVDGAPYLRKIDLKVYRSYPELLKALEDMFKL---TIGEY pt001236_POPTR_ NCLQARKLE-AEAAGLYVKVSMDGAPYLRKIDLKVYKGYPELLEVVEEMFKF---KVGEY pt002787_POPTR_ NCLQPKKNDQVDGAGMYVKVSVDGAPYLRKIDLKVYKSYPELLKALENMFKL---TIGEY pt035517_POPTR_ NTLQPKKAEAEAAAGMYVKVSMDGAPYLRKIDLKVYKGYPELLKALENMFKL---TIGEY * : ****::***.:***:** ::. * :* .:: :* AT1G15580.1 ------NFDDTLKESECVPIYEDKDGDWMLAGDVPWEMFLGSCKRLRIMKRSCNRG---- pt040947_POPTR_ ------SEREGYKGSEYAPTYEDKDGDWMLVGDVPWDMFLSSCKKLRIMKGSEAIGLGCG pt015555_POPTR_ ------SEREGYNGSEHVPTYEDKDGDWMLVGDVPWDMFINSCKRLRIMKESEARGLGCA pt040946_POPTR_ ------SEREGYKGSEYAPTYEDKDGDWMLVGDVPWDMFLSSCKKLRIMKGSEAIGLGCG pt028468_POPTR_ LNERTIMEQEVNNGVEYVPTYEDKDGDWMMLGDVPWKMFVESCKRLRLMKSSEATGFAPR pt010911_POPTR_ ------GIGKALK-DEYVPIYEDKDGDWMLVGDVPWEMFFESCKRLRIMKSSEAKGFGLQ pt039373_POPTR_ ------SEKEGYNGSDFAPTYEDKDGDWMLVGDVPWDMFISTCKRLRIMKGSEARGLGC- pt001236_POPTR_ ------SEREGYNGSEYVPTYEDKDGDWMLVGDVPWEMFINSCKRLRIMKESEARGLGCA pt002787_POPTR_ ------SENEGYNGSEFAPTYEDKDGDWMLVGDVPWDMFISSCKRLRIMKGSEARGLGC- pt035517_POPTR_ ------SEREGYKGSEYAPTYEDKDGDWMLIGDVPWDMFLSSCKKLRIIKGSEATG---- . : : .* *********: *****.**. :**:**::* * * AT1G15580.1 -------------- pt040947_POPTR_ A------------- pt015555_POPTR_ V------------- pt040946_POPTR_ A------------- pt028468_POPTR_ TPSKCSSSS----- pt010911_POPTR_ PRGALKGISKDERH pt039373_POPTR_ -------------- pt001236_POPTR_ V------------- pt002787_POPTR_ -------------- pt035517_POPTR_ --------------
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