Input
| Putative repression domain
|
|
AT1G16490.1 |
not found |
|
Ortholog
| Putative repression domain
| Reverse top hit
| Relation
| Blast score ratio
| Type
|
Os009372 |
not found in 340aa |
AT1G79180.1 |
1st_not |
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II |
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not found in 340aa |
AT1G79180.1 |
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0.450819672 |
III |
Os018685 |
not found in 371aa |
AT1G79180.1 |
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III |
Os036343 |
not found in 276aa |
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III |
Os008844 |
not found in 258aa |
AT3G23250.1 |
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III |
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not found in 388aa |
AT1G79180.1 |
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II |
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not found in 376aa |
AT1G79180.1 |
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0.430327868 |
III |
Sb010751 |
not found in 258aa |
AT3G23250.1 |
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0.424180327 |
III |
Sb029619 |
not found in 450aa |
AT3G23250.1 |
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0.407786885 |
III |
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III |
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not found in 282aa |
AT1G79180.1 |
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II |
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not found in 288aa |
AT1G79180.1 |
not_not |
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III |
Gm026385 |
not found in 264aa |
AT3G23250.1 |
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0.409836065 |
III |
Gm028054 |
not found in 275aa |
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III |
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not found in 272aa |
AT3G23250.1 |
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0.407786885 |
III |
Gm002620 |
not found in 264aa |
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III |
Gm007227 |
not found in 294aa |
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III |
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not found in 272aa |
AT2G31180.1 |
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III |
Pt037343 |
not found in 367aa |
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not found in 367aa |
AT1G79180.1 |
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0.467213114 |
III |
Pt001186 |
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AT3G23250.1 |
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0.411885245 |
III |
Pt040508 |
not found in 272aa |
AT2G31180.1 |
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0.407786885 |
III |
Get sequence file
Get alignment file
Get formatted file made by BOXSHADE
Sequence file prepared (0 sec required). Alignment has started.
CLUSTAL format alignment by MAFFT FFT-NS-2 (v7.475)
AT1G16490.1 ---------------------------------------MGKGRAPCC------------
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gm007227_Glyma0 -----------------------------------------MGRAPCC------------
gm052305_Glyma1 -----------------------------------------MGRAPCC------------
Sb014551_Sorbi1 ---------------------------------------MGKGRAPCC------------
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Os018685_Os04t0 ---------------------------------------MGKGRAPCC------------
gm028054_Glyma1 -----------------------------------------MVRAPCC------------
pt042984_POPTR_ -----------------------------------------MVRAPCC------------
pt037343_POPTR_ ---------------------------------------MGKGRAPCC------------
Os009372_Os02t0 ---------------------------------------MGRGRAPCC------------
gm002620_Glyma0 -----------------------------------------MVRAPCC------------
..
AT1G16490.1 -----DKTKVKR--GPWSH---------------------DEDLKLISFIHKN--GHENW
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pt001186_POPTR_ -----EKMGLKK--GPWTA---------------------EEDQILINYIQLH--GHGNW
Os009371_Os02t0 -----AKVGLNR--GSWTP---------------------QEDMRLIAYIQKH--GHANW
gm043201_Glyma1 -----DKTQVKR--GPWSP---------------------AEDLKLIAFIQKY--GHENW
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gm026385_Glyma1 -----EKMGLKK--GPWTP---------------------EEDQILMSYIQKH--GHGNW
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Os018685_Os04t0 -----AKVGLNK--GSWTP---------------------EEDMRLVAYIQKY--GHANW
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pt037343_POPTR_ -----DKSQVKR--GPWSP---------------------AEDLRLIAFIQKH--GHENW
Os009372_Os02t0 -----AKVGLNR--GSWTP---------------------QEDMRLIAYIQKH--GHANW
gm002620_Glyma0 -----EKMGLKK--GPWTP---------------------EEDQILMSYIQKH--GHGNW
: . * .*
AT1G16490.1 RSLPKQAGL-----LRCGKSC-------------------RLRWINYLR-----------
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Sb010751_Sorbi1 RALPKQAGL-----LRCGKSC-------------------RLRWINYLR-----------
Sb020839_Sorbi1 RGGQEEGGA-----QKQARRC-------------------RQEIIRRQEDRRRQRRGQQQ
pt001186_POPTR_ RALPKQAGL-----LRCGKSC-------------------RLRWINYLR-----------
Os009371_Os02t0 RALPKQAGL-----LRCGKSC-------------------RLRWINYLR-----------
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Sb029619_Sorbi1 RLSLSPSSVNWLCPLRC-KTCAEGEEKNHESISQGTENSSRARGLN-LRQFLVHVAGLHE
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Os008844_Os02t0 RALPRQAGL-----LRCGKSC-------------------RLRWINYLR-----------
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Sb014551_Sorbi1 RALPKQAGL-----LRCGKSC-------------------RLRWINYLR-----------
Os036343_Os10t0 RALPKQAGL-----LRCGKSC-------------------RLRWINYLR-----------
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Os018685_Os04t0 RALPKQAGL-----LRCGKSC-------------------RLRWINYLR-----------
gm028054_Glyma1 RALPKQAGL-----LRCGKSC-------------------RLRWINYLR-----------
pt042984_POPTR_ RALPKQAGL-----QRCGKSC-------------------RLRWVNYLR-----------
pt037343_POPTR_ RALPKQAGL-----LRCGKSC-------------------RLRWINYLR-----------
Os009372_Os02t0 RALPKQAGL-----LRCGKSC-------------------RLRWINYLR-----------
gm002620_Glyma0 RALPKLAGL-----LRCGKSC-------------------RLRWINYLR-----------
* .. : : * * . :. .
AT1G16490.1 ------PDVK----------------RGNFSAEEE-------DTIIKLHQSFGN------
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Sb010751_Sorbi1 ------PDIK----------------RGNFTAEEE-------DAIIQLHQMLGN------
Sb020839_Sorbi1 RAAAAVPDSV----------------AGAVEQREQR-----RDDVLHGHGLRGGRVVGRQ
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Os009371_Os02t0 ------PDLK----------------RGNFTADEE-------DTIIKLHGLLGN------
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Sb029619_Sorbi1 HSE---PVVQVAVGANRRRAQRVVGLHGDVEALERHGQRLRPEGVVEL-ELLGVRGGGGE
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gm026385_Glyma1 ------PDIK----------------RGNFSSEEE-------EIIIKMHELLGN------
Os008844_Os02t0 ------PDIK----------------RGNFTREEE-------DAIIHLHDLLGN------
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Os036343_Os10t0 ------PDIK----------------RGNFTADEE-------DLIVRLHNSLGN------
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Os018685_Os04t0 ------PDLK----------------RGNFTAEEE-------ETIIKLHGLLGN------
gm028054_Glyma1 ------PDIK----------------RGNFTIEEE-------ETIIKLHDMLGN------
pt042984_POPTR_ ------PDIK----------------RGNFSKEEE-------EAIIKLHEILGN------
pt037343_POPTR_ ------PDVK----------------RGNFSEVEE-------DTIIKLHQTLGN------
Os009372_Os02t0 ------PDLK----------------RGNFTADEE-------DTIIKLHGLLGN------
gm002620_Glyma0 ------PDIK----------------RGNFSSEEE-------EIIIKMHELLGN------
* * . *. : :: *
AT1G16490.1 ----------------KWSKIASKLP----GR---------------------TDNEIKN
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Sb010751_Sorbi1 ----------------RWSAIAARLP----GR---------------------TDNEIKN
Sb020839_Sorbi1 R----GHHQPPARARARAGAGAARRQQGGDGH---------------------GDGEL--
pt001186_POPTR_ ----------------RWSAIAARLP----GR---------------------TDNEIKN
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Sb029619_Sorbi1 ALLLDGE---PAG---RAPRVALLLLLLRHGRRLGHRRRGRRPFRRHRRGGSWDDGDV--
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: * *: *.::
AT1G16490.1 VWHTHLKKRLSSETNLNADE--------------------------------AGSKGS--
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Sb020839_Sorbi1 ----HQLRRVPAH-----------RRHLLVVGGRDGHG--------PRRHGRGAGPRA--
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Sb029619_Sorbi1 -----VGRRLLGG-----------------------------PALGPVLLAGATCLRPVL
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Sb014551_Sorbi1 VWNTHLKKRVSPAGGGEERGAKKKKKKKEAAAG----GGAEEPLPSP----SPSPSSS--
Os036343_Os10t0 VWHTHLKKRLDDE---------------------------------RKLAAAGGGGGR--
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Os018685_Os04t0 VWNTHLKKRVSPE---QKKGGGKSKKKTTCT-----------DVLVP----SPSPSSS--
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pt037343_POPTR_ VWNTHLKKKLACKDDGEHSEGDESKGSSSTS--------------------SSSSSSSTI
Os009372_Os02t0 VWNTHLKKRVS-----QREKPGDTKKKGKAADASDD-----ADAHSP----SSSASSS--
gm002620_Glyma0 VWHTHLKKRLLNS---DI------QKRVSK----------------PRIKRSDSNSST--
::
AT1G16490.1 -----------LNEEEN--------------SQESSP-----------------------
Sb010993_Sorbi1 ------------TTTTTTNNSSAGSDNSGD-QCGTSREP----DVIDASLLQLEDI--DV
Sb010751_Sorbi1 -----------KPKKQQQQPE---TTAVTALEGPTTGA----------------------
Sb020839_Sorbi1 ------------------------------------------------------------
pt001186_POPTR_ -----------FDHELNTDQELLDSSN-LAAGSDQTEE----------------------
Os009371_Os02t0 ------------TTTAANNNNSG--DTAGE-QCGTSKEP----ENVDVSFFE-QDI--DI
gm043201_Glyma1 ---------------RNYQWKIK-WTRI---QKNNCPTNL--------------------
pt001892_POPTR_ VSSGKRNLEMELYQQKNQGSSTK-KPRILEKAKDSSPREVS-------------------
gm021564_Glyma0 --------------ESNYQLKIK-WSRI---QKNKCPMNL--------------------
Sb029619_Sorbi1 LLRLGGGLQ---------------------------------------PLLEVRVP----
gm055362_Glyma2 -----------ITQSEPAHLRFREMDT-TSTA-CNT------------------------
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Os008844_Os02t0 -----------APKRKATKKA---AAVAVAIDVPTT------------------------
gm007227_Glyma0 -----------DAKLEQQQEP---VNNNFPFHASNSED----------------------
gm052305_Glyma1 -----------DAKLE-QQDP---VN----IHGSNSEDM---------------------
Sb014551_Sorbi1 -----------TTTTTTTNCSSG--DDSGEQQSNTSKEEPDD-DELDLENLEMMRMLDDP
Os036343_Os10t0 -----------RPHTRKQPKA---AKSAAAVKREAT------------------------
pt040508_POPTR_ -----------FNHELKTGPEIVSSSNVVAAGCDQSKE----------------------
Os018685_Os04t0 -------------TTTTTNCSSG--DSAGE-QSNTSKEEEEETDKIEIPMLEL-----DP
gm028054_Glyma1 -----------ITQSEPDNFNFREMDTITSSA-CTT------------------------
pt042984_POPTR_ -----------LSQSAN--------STIPSLSGCKSIE----------------------
pt037343_POPTR_ MSSGKRALEMELDEQKNQGFSTQ-KPRILENEEDSSPRGVS-------------------
Os009372_Os02t0 ------------TTTAANNNNSG--DTAGE-QCGTSKEP----ENVDVSFFE-QDI--DI
gm002620_Glyma0 -----------LTQLEP-----------TSSA-CTT------------------------
AT1G16490.1 --------------------------NASMSFAGSNIS------------SKDDDAQISQ
Sb010993_Sorbi1 S----DMLVD--------APPAAAQPCQAPMLSSP------CSSSSL-------------
Sb010751_Sorbi1 --------------VVPVSPEQSLSTSTTS--TT--------TDYS---AASSM------
Sb020839_Sorbi1 ------------------------------------------------------------
pt001186_POPTR_ --------------HRPISPQQCSSDTSSL--ITG------DIDIS--------------
Os009371_Os02t0 S----DMLVD--------APTEAPL-VAAPMPPSP------CSSSSL-------------
gm043201_Glyma1 --------------------------LTSLRIQKSHQFHCLLLNQTFI------------
pt001892_POPTR_ ---------------NQYRPTKKPKELSSSSISSNNSN---ITNSSQVDVSKSEDDQIGS
gm021564_Glyma0 --------------------------LTSLRIQK--------VNTSQIVEHKPEEEQLAS
Sb029619_Sorbi1 -----DVL------DLVVRPPGQPGGDRGPPVAE------LLVEGDD------------G
gm055362_Glyma2 ----------------------SSSDFSSVTVG---------------------------
gm026385_Glyma1 ----------------------S-SDFSSFSEGT--------------------------
Os008844_Os02t0 ---------------VPVSPEQSLSTTTTSAATT--------EEYSYSMASSAD------
gm007227_Glyma0 --------------MMPLSPPQCSSHMSSSSLTT--------SDNN----GS--------
gm052305_Glyma1 --------------MMPLSPPHCSSDM-SSSLTT--------SDNN----SNVN------
Sb014551_Sorbi1 ITFGFDMLVDPVPPPAPYGPAV-------SSPTSP------CASS---------------
Os036343_Os10t0 -------------------PSVSVDTSSGVTCST-------VTESS---PSSADGDHR--
pt040508_POPTR_ --------------HRPISPQQCSSDVSSV--TT--------VDTS--------------
Os018685_Os04t0 CCFDFDMLVDPVVPDT-YCPAVSAS-ASASAPTSP------CSSTSP-------------
gm028054_Glyma1 ----------------------SSSDFSSVTVG---------------------------
pt042984_POPTR_ --------------YAQISPQPSSSDHSSVTDTS--------VTTS--------------
pt037343_POPTR_ --------------NNQFKPAMKPNELSSSSFSSNNSS---ITNSSQADVSEPDGEKTGS
Os009372_Os02t0 S----DMLVD--------APTEAPL-VAAPMPPSP------CSSSSL-------------
gm002620_Glyma0 ----------------------SLSDFSSFSEGT--------------------------
AT1G16490.1 MFEHILTYSEFTGMLQEVDK---PELL--EMPF------------------DLDPDI---
Sb010993_Sorbi1 ---------TTTCVGGGVEE------LI-ELPV----------------I-EIEPEI---
Sb010751_Sorbi1 -----ENNADSSTSEEEEEE-----------------------------DYQIDDSF---
Sb020839_Sorbi1 ------------------------------------------------------------
pt001186_POPTR_ --------NNMCMKIESSDD-----------------------------FPEMDESF---
Os009371_Os02t0 --------TTTTCVGAVSDE------LL-DLPE----------------I-DIEPDI---
gm043201_Glyma1 --------------LEEVDK---PNHLI-EIPW------------------EPDYDF---
pt001892_POPTR_ LLNFRGLY-DVHSSSEEVNK---PEEITAEIPL------------------ESDYDF---
gm021564_Glyma0 PLPYLGHY-DVGSMLEEVDK---PNQLI-EIPW------------------EPDYDF---
Sb029619_Sorbi1 VLFLLAEVAALDVRAQVVDP---PEPAALAAPQQPGLLGQRAPVAVAEALDVVDQDLVLL
gm055362_Glyma2 -------DSKNIIKSEDIES-------M-ET------------------MPVIDESF---
gm026385_Glyma1 ------KNMDNMIKREDIES-------M-ETV-----------------KPPIDESF---
Os008844_Os02t0 -----HNTTDSFTSEEE---------------------------------FQIDDSF---
gm007227_Glyma0 ----INNNHDMSLNVND-DI---------DTPE---------------NNLALDEDF---
gm052305_Glyma1 ---IINNNHDMSLNVNDYDI---------DTPE---------------NNLALDEDF---
Sb014551_Sorbi1 ----------------GVDD-----HLL-VLPE----------------I-DIDHEL---
Os036343_Os10t0 --RQQQQTQHAAVKEESFSSGGELPAAA-AAPT---------------AAADMDESF---
pt040508_POPTR_ --------NDMCTKVAESDD-----------------------------FLEMDEIF---
Os018685_Os04t0 -----------SCARAGVDP------LL-DLPE----------------IVDLGPEL---
gm028054_Glyma1 -------DSKN-IKSEDTES-------T-ET------------------MPVIDESF---
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