|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Get sequence file Get alignment file Get formatted file made by BOXSHADE Sequence file prepared (0 sec required). Alignment has started. CLUSTAL format alignment by MAFFT FFT-NS-2 (v7.475) AT1G19350.1 ------------------------------------------------------------ gm030026_Glyma1 ------------------------------------------------------------ pt039869_POPTR_ ------------------------------------------------------------ gm001807_Glyma0 ------------------------------------------------------------ Sb023996_Sorbi1 TTLSTPLQRASRLPPPPPPPPLPRSGSAVASLPPLPPPLVNTTVQYATHHLSIKEKRRQV gm008775_Glyma0 ------------------------------------------------------------ pt037180_POPTR_ ------------------------------------------------------------ pt001731_POPTR_ ------------------------------------------------------------ Os028778_Os07t0 ------------------------------------------------------------ gm013966_Glyma0 ------------------------------------------------------------ gm048065_Glyma1 ------------------------------------------------------------ gm039308_Glyma1 ------------------------------------------------------------ pt017851_POPTR_ ------------------------------------------------------------ pt001732_POPTR_ ------------------------------------------------------------ AT1G19350.1 ----------MTSDGATSTSAAAAAAAMATRRKPSWRERENNRRRERRRRAVAAKIYTGL gm030026_Glyma1 ----------MTGGGST-------------GRLPTWKERENNKRRERRRRAIAAKIYTGL pt039869_POPTR_ ----------MTSDGATSTSAAAAA---TTRRKPSWRERENNRRRERRRRAIAAKIFTGL gm001807_Glyma0 ----------MTGGGST-------------GRLPTWKERENNKRRERRRRAIAAKIYTGL Sb023996_Sorbi1 CGELGAEHQSMTSGAAAA---AAAAG--ALGRTPTWKERENNKRRERRRRAIAAKIFTGL gm008775_Glyma0 ----------MTSDGATS-----AA---TNRRKPSWRERENNRRRERRRRAISAKIYSGL pt037180_POPTR_ ----------MTAGGSS-------------GRLPTWKERENNKRRERRRRAIAAKIYTGL pt001731_POPTR_ ----------MTAGGSS-------------ARLPTWKERENNMRRERRRRAIAAKIYTGL Os028778_Os07t0 ----------MTSGAAAA------------GRTPTWKERENNKRRERRRRAIAAKIFTGL gm013966_Glyma0 ----------MTSDGATS-----AA---THRRKPSWRERENNRRRERRRRAIAAKIYSGL gm048065_Glyma1 ----------MADDGATS-----AA---TSRRKPSWRERENNRRRERRRRAIAAKIYSGL gm039308_Glyma1 ----------MVDDGATS-----AA---TSRRKPSWRERENNRRRERRRRAIAAKIYSGL pt017851_POPTR_ ----------MTSDGATSTSAAMAA---ATRRKPSWRERENNRRRERRRRAIAAKIFTGL pt001732_POPTR_ ----------MTAGGSS-------------ARLPTWKERENNMRRERRRRAIAAKIYTGL *. ..:: * *:*:***** ********::***::** AT1G19350.1 RAQGNYNLPKHCDNNEVLKALCSEAGWVVEEDGTTYRKGHKPLP-GDMAGSSSRATPY-S gm030026_Glyma1 RAQGNYKLPKHCDNNEVLKALCAEAGWIVEEDGTTYRKGCKRPSASEIGGTVANISACSS pt039869_POPTR_ RAQGNYNLPKYCDNNEVLKALCAEAGWVVEEDGTTYRKGHRPPP-IEIVGSSMRVTPY-S gm001807_Glyma0 RAQGNYKLPKHCDNNEVLKALCAEAGWIVEEDGTTYRKGCKRPT-SEIGGTPLNLSACSS Sb023996_Sorbi1 RALGNYKLPKHCDNNEVLKALCREAGWVVEDDGTTYRKGCKPPP-GM-------MSPCSS gm008775_Glyma0 RAQGNYNLPKHCDNNEVLKALCAEAGWAVEEDGTTYRKGCRAPYPGDGVGTSTRNTPF-S pt037180_POPTR_ RTQGNFKLPKHCDNNEVLKALCAEAGWIVEEDGTTYRKGCKPPP-TEIAGTPTNISACSS pt001731_POPTR_ RTQGNYKLPKHCDNNEVLKALCAEAGWIVEEDGTTYRKGCKPPP-SEIAGMPANISACSS Os028778_Os07t0 RALGNYNLPKHCDNNEVLKALCREAGWVVEDDGTTYRKGCKPPP-SSAGGASVGMSPCSS gm013966_Glyma0 RAQGNYNLPKHCDNNEVLKALCAEAGWTVEEDGTTYRKGCRAPLPGDGVGTSTRNTPF-S gm048065_Glyma1 RAQGNFNLPKHCDNNEVLKALCAEAGWCVEEDGTTYRKGCKPPL-ANGAGSSMRNIPFSS gm039308_Glyma1 RAQGNFNLPKHCDNNEVLKALCAEAGWCVEEDGTTYRKGCKPPL-ANGAGSSMRNITFSS pt017851_POPTR_ RAQGNYNLPKYCDNNEVLKALCAEAGWVVEEDGTTYRKGHRPPP-IEIVGTSTRVTPY-S pt001732_POPTR_ RTQGNYKLPKHCDNNEVLKALCAEAGWIVEEDGTTYRKGCKPPP-SEIAGMPANISACSS *: **::***:*********** **** **:******** : . * AT1G19350.1 SHNQSPLSSTFDSPILSYQVSPSSSSFPSPSRV----GDP-----H----------NIST gm030026_Glyma1 IQ-PSPQSSSYPSPVPSYHASPTSSSFPSPTRID---G-------NH---------PSSF pt039869_POPTR_ SQNPSPLSSSFPSPIPSYQVSPSSSSFPSPTR-----GDN-----N----------VSSN gm001807_Glyma0 IQ-ASPQSSSYPSPVPSYHASPTSSSFPSPTRID---G-------NH---------PSSF Sb023996_Sorbi1 SQLLSAPSSSFPSPVPSYHASPASSSFPSPTRLDHSSGSNHHHHHNPGPTAAAAAAAASS gm008775_Glyma0 SQNPSPLSSSFPSPIPSYQVSPSSSSFPSPSRLD---A-------N----------NPSN pt037180_POPTR_ IQ-PSPQSSNFPSPVASYHASPTSSSFPSPSRFD---G-------N----------PSTY pt001731_POPTR_ IQ-PSPQSSNFASPVPSYHASPSSSSFPSPTCFD---G-------N----------SSTY Os028778_Os07t0 TQLLSAPSSSFPSPVPSYHASPASSSFPSPSRID-----------NP---------SASC gm013966_Glyma0 SQNPSPLSSSFPSPIPSYQVSPSSSSFPSPSRLD---A-------N----------NPSN gm048065_Glyma1 SQNPSPLSSSFPSPIPSYQVSPSSSSLPSPFRLD---GDK-----D----------NVSN gm039308_Glyma1 SQNPSPLSSSFPSPIPSYQVSPSSSSFPSPFRLD---VDK-----D----------NVSH pt017851_POPTR_ SQNPSPLSSLFPSPIPSYQASPSSSSFPSPTR-----GDN-----N----------ASSN pt001732_POPTR_ IQ-PSPQSSNFASPVPSYHASPSSSSFPSPTCFD---G-------N----------SSTY : *. ** : **: **:.**:***:*** . : AT1G19350.1 IFPFLRNG-GIPSSLPPLRISNSAPVTPPVSSPT--SRNP-K-PLPTWESFTKQSMSMAA gm030026_Glyma1 LIPFIRNITSIPANLPPLRISNSAPVTPPLSSP----RSS-K-RKADFD--------SLH pt039869_POPTR_ LLPFLQS--AIPLSLPPLRISNSAPVTPPLSSPT--SRNP-K-PIPNWD--------FIA gm001807_Glyma0 LIPFIRNITSIPANLPPLRISNSAPVTPPLSSP----RSS-K-RKADFD----------- Sb023996_Sorbi1 LLPFLR---SLP-NLPPLRVSSSAPVTPPLSSPTAASRPPTKVRKPDWD--------AA- gm008775_Glyma0 LIPYIRH--AFPASVPPLRISNSAPVTPPLSSPT--SRNP-K-PIPTWD--------SIA pt037180_POPTR_ LLPFLRNIASIPTNLPPLRISNSAPVTPPLSSPT--SRGS-K-RKADWE--------SLS pt001731_POPTR_ LLPFLRNIASIPTNLPPLRISNSAPVTPPRSSPT--CRSS-K-RKVDWE--------SLS Os028778_Os07t0 LLPFLR---GLP-NLPPLRVSSSAPVTPPLSSPT-ASRPP-KIRKPDWD----------- gm013966_Glyma0 LIPYIRH--AFPSSLPPLRISNSAPVTPPLSSPT--SRNP-K-PIPTWD--------SIA gm048065_Glyma1 LIPYIRN--A-SLSLPPLRISNSAPVTPPLSSPT--SRNS-K-PIPTWE--------SIA gm039308_Glyma1 LIPYIRN--A-SLSLPPLRISNSAPVTPPLSSPT--SRNP-K-PIPTWE--------SIA pt017851_POPTR_ LLPFLRS--AIPLSLPPLRISNSAPVTPPLSSPT--SRNP-K-PIPNWD--------FIA pt001732_POPTR_ LLPFLRNIASIPTNLPPLRISNSAPVTPPRSSPT--CRSS-K-RKVDWE--------SLS ::*::: . . .:****:*.******* *** * . * :: AT1G19350.1 KQSMT-SLN---YPFYAVSAPASPTHHRQFHAPATIPECDESDS-STVD--SGHWISFQK gm030026_Glyma1 N---A-SLR---HPLFATSAPSSPSR-RHHLATSTIPECDESDA-STVDSASGRWVSFQV pt039869_POPTR_ KQSMA-SFS---YPFNAVSAPASPT-HRQFHAPATIPECDESDS-STVE--SGQWISFQK gm001807_Glyma0 ------SLR---HPLFATSAPSSPTR-RHHVATSTIPECDESDA-STVDSASGRWVSFQV Sb023996_Sorbi1 --VAD-PFR---HPFFAVSAPASPTRARRREHPDTIPECDESDVCSTVD--SGRWISFQV gm008775_Glyma0 KASMASSFNHSHHPFFAASAPASPT-HRHLYAPPTIPECDESDT-STVE--SGQWLNFQA pt037180_POPTR_ NGTLN-SLH---HPLLAASAPSSPTR-RHHLTPATIPECDESDA-STVD--SGRWVSFLA pt001731_POPTR_ NGSLN-SFR---HPLFAASAPSSPTR-RPHLTPATIPECDESDA-STVD--SGRWLSFQA Os028778_Os07t0 ---VD-PFR---HPFFAVSAPASPTRGRRLEHPDTIPECDESDV-STVD--SGRWISFQM gm013966_Glyma0 KASMASSFNHSHHPFFAASAPASPT-HRHLYAPPTIPECDESDT-STVE--SGQWLNFQA gm048065_Glyma1 KESMA-SFN---YPFFAASAPASPT-HRHLYTPLTIPECDESDT-SIGE--SGQWVKFQA gm039308_Glyma1 KESMA-SFS---YPFFAASAPASPT-HRHLYTPPTIPECDESDT-STGE--SGQWVKFQA pt017851_POPTR_ KQSMA-SFS---YPFNAVSAPASPT-HRQFHAPATIPECDESDT-STVE--SGQWISFQK pt001732_POPTR_ NGSLN-SFR---HPLFAASAPSSPTR-RPHLTPATIPECDESDA-STVD--SGRWLSFQA .: :*: *.***:**: * . ********* * : **:*:.* AT1G19350.1 -----FAQQQPFSASMVPTSPTFNLVKPAPQQL------SPNTAAIQEIGQS-------- gm030026_Glyma1 QTTM----------AAAPPSPTFNLMKPAMQQIAAQEG-------MLWGSVAER---VRG pt039869_POPTR_ -----FA---PSVAAAMPTSPTYNLVKPVARQI------LSNN-LVKDNGMS-------- gm001807_Glyma0 QTTMVAA------AAAAPPSPTFNLMKPAMQQIAAQEG-------MQWGSVAER---GRG Sb023996_Sorbi1 -----GA------ATTAPASPTYNLVHPAG------GGASASN-SMELDGMAAADIGGRG gm008775_Glyma0 -----FA---PS-VSPVPISPTMNFIKPVVSQQHKHNLNLPGN-GIQEMRIS-------- pt037180_POPTR_ -----GA------PHVAPPSPTFNLVKPVAQQSGFQDGVDRHG-GLSWGAAAER---GR- pt001731_POPTR_ -----VA------PQVAPPSPTFNLVKPVDQQCAFQIGVDRHE-GLSWGVAAER---GR- Os028778_Os07t0 -------------ATTAPTSPTYNLVNP---------GASTSN-SMEIEGTA-----GRG gm013966_Glyma0 -----FA---PS-VSAVPISPTMNFIKPVVSQQHKHNLNLSGN-GIQEMRIS-------- gm048065_Glyma1 -----FA---PS-ASVFPTSPTFNLVKPVIPHR------MPDN-SIQVMRTS-------- gm039308_Glyma1 -----FA---PS-SSVLPISPTFNLVKPVVPPG------MPDN-SIQEMRTS-------- pt017851_POPTR_ -----FA---PSVAAAMPTSPTYNLVIPVAQQI------SSSN-LVKESAVP-------- pt001732_POPTR_ -----VA------PQVAPPSPTFNLVKPVDQQCAFQIGVDRHE----------------- * *** *:: * AT1G19350.1 ---SEFKFENSQVKPWEGERIHDVAMEDLELTLGNGKAHS-------------- gm030026_Glyma1 G--SDFDFENGRVKPWEGERIHEVGMDDLELTLGVGKA---------------- pt039869_POPTR_ ---MDFEFGSEQVKPWEGERIHEVGLDDLELTLGGGKARS-------------- gm001807_Glyma0 G--SDFDFENGRVKPWEGERIHEVGMDDLELTLGVGKA---------------- Sb023996_Sorbi1 GGPAEFEFDKGRVTPWEGERIHEVAAEELELTLGVGAK---------------- gm008775_Glyma0 ---EP-EFA-MQVKPWVGERIHEVGLDDLELTLGSGKTPA-------------- pt037180_POPTR_ G--AEFEFENCRVKPWEGERIHEIGVDDLELTLGGGKARG-------------- pt001731_POPTR_ G--AEFEFENCRVKPWEGERIHEIGVDDLELTLGSGKVHGQASIDDLAWERSNK Os028778_Os07t0 G--AEFEFDKGRVTPWEGERIHEVAAEELELTLGVGAK---------------- gm013966_Glyma0 ---EP-EFA-MQVKPWVGERIHEVGLDDLELTLGSGKTPA-------------- gm048065_Glyma1 ---SE-EFG-VQVKPWVGEKIHEVALDDLELTLGSGKVRS-------------- gm039308_Glyma1 ---SD-EFG-VQVKPWVGEKIHEVALDDLELTLGSGKVRS-------------- pt017851_POPTR_ ---MDFEFGSEQVKPWEGERIHEVGLDDLELTLGSGKAQS-------------- pt001732_POPTR_ G--AEFEFENCRVKPWEGERIHEIGVDDLELTLGSGKVHGQASIDDLAWERSNK .* :*.** **:**::. ::****** *
|