|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Get sequence file Get alignment file Get formatted file made by BOXSHADE Sequence file prepared (0 sec required). Alignment has started. CLUSTAL format alignment by MAFFT FFT-NS-2 (v7.475) AT1G28370.1 MAPTVKTAAVK-TN---------------EGNGVRYRGVRKRPWGRYAAEIRDPFKKSRV pt024322_POPTR_ MAPRERSNNNNSPNSP--------------RSEIRFRGVRKRPWGRYAAEIRDPGKKTRV pt004210_POPTR_ MAPKKLNASNS--------GCFKKASGDHDKKEIHYRGVRKRPWGRYAAEIRDPGKKSRV pt032466_POPTR_ MAPIEKPSSSN-PNSP-------------TRSEIRFRGVRKRPWGRYAAEIRDPGKKTRV pt025171_POPTR_ MAPREKTAPGK-VNGGTCGG------AGGGGKEVHFRGVRKRPWGRYAAEIRDPGKKSRV pt036816_POPTR_ MAPKKLNGNDN--------GSLKKASGDHDKKEIHYRGVRKRPWGRYAAEIRDPGKKSRV pt019626_POPTR_ MAPREKTAAVK-ASGGGIVG------GGGGGKEVHFRGVRKRPWGRYAAEIRDPSKKSRV *** . . :::****************** **:** AT1G28370.1 WLGTFDTPEEAARAYDKRAIEFRGAKAKTNFP---CYNINAHCLSL-------------- pt024322_POPTR_ WLGTFDTAEEAARAYDAAAREFRGAKAKTNFP------------TI-------------- pt004210_POPTR_ WLGTFDTAEEAAKAYDKAAREYRGAKAKTNFP------FSGEVVNYDD------------ pt032466_POPTR_ WLGTFDTAEEAARAYDAAAREFRGAKAKTNFP------------TV-------------- pt025171_POPTR_ WLGTFDTAEEAARAYDAAAREFRGSKAKTNYAYPSYENVRKNTISVDSNHKASNKNNSCG pt036816_POPTR_ WLGTFDTAVEAARAYDKAAREYRGAKAKTNFP------IAEKVVDYDD------------ pt019626_POPTR_ WLGTFDTAEEAARAYDTAAREFRGSKAKTNFPYPSCENVKKNVLSIDSNKKAASKNNSGG *******. ***:*** * *:**:*****:. AT1G28370.1 ---------TQSLSQSSTVE---SSFP------------NLN-------LGSDS-VSSRF pt024322_POPTR_ --GELNPNPTRSPSQSSTVE---SSSPPPPRAASPPPPLDLT-------LNISRHKPDRQ pt004210_POPTR_ --------DKQSSSHSSTVE--SSSSPVVSAA--------VTRQVGGGGVGGVV-GMGGF pt032466_POPTR_ --GELIPIPTRSPSQSSTVE---SSSPTHPRAASPPPPLDLT-------LNSAHHNTARH pt025171_POPTR_ GGGGGNSNNNQSPSQSSTVEFSSSDTP-----------LDLN-------LGPAV-STVRL pt036816_POPTR_ --------EKQSSSQSSTVE--SSSSPVVSAVA-----RDVTRQ-----VGGVV-GTGRF pt019626_POPTR_ GGG-----NNQSPSQSSTVEFCSSDAP-----------LDLN-------LGPAV-STVRL .:* *:***** *. * :. :. AT1G28370.1 PFP-----------KI-----QV---------KAG------------MMVFDE------- pt024322_POPTR_ PFPNGVSFPGGAWFPFPAVARPVFFFDAFAHAKNDIPNNNSIVNNINMCRFDR------- pt004210_POPTR_ PFV----YQQQQ--QNVNVVAPVWFFDS-VRPEFV-TQRF-------PVRFDQ------- pt032466_POPTR_ QFPDGVSFHGGAWFPLPAAQRPVFFFDAFAQAKNN--DKISIANNINMCRFDR------- pt025171_POPTR_ PFQ-----------PMVMNHQQVIYFDAVMKSQCQ------------KTVFDNGYHHHHH pt036816_POPTR_ PFV----FQQQP--PHVNAVGPVWFLDSTVKPEFV-AQRF-------PVRYDP------- pt019626_POPTR_ PFQ-----------PMAMNQQQVVYFDAFMKSQYR------------RMVFDHGY--HHH * * : :* AT1G28370.1 ------------RSESDSSSVVMDV----VRYEGRRVVLDLDLNFPPPPEN- pt024322_POPTR_ ---TVMVNGGGAQSDSDSSSVV-DYDH---RRDSKGLSLDLDLNLAPPPEVS pt004210_POPTR_ ---VGLESAGGAQSDSDSSSMV-DCQP-------RRSVLDLDLNLPPPLDA- pt032466_POPTR_ ---TAMVNGGGVQSDSDSSSVL-DYDH---HHDNKGLSLDLDLNLPPPPEVA pt025171_POPTR_ PNQPMGFSCGGIQSDSDSSSIVFDLNHQDIKTPRSSVDLDLNLNLPPPPEIA pt036816_POPTR_ ---VGLE--GGAHSDSDSSSVI-DFKP-------RSSILHLDLNLPPPADA- pt019626_POPTR_ PNQPVIFSCGGVLSDSDSSSVV-DLNHQDVKTPRRSVDLD--LNLPPPPEIA *:*****:: * *. **:.** :
|