Input
| Putative repression domain
|
|
AT1G48000.1 |
not found |
|
Ortholog
| Putative repression domain
| Reverse top hit
| Relation
| Blast score ratio
| Type
|
Os039545 |
not found in 285aa |
AT5G49620.1 |
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III |
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not found in 300aa |
AT5G49620.1 |
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III |
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not found in 293aa |
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III |
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not found in 350aa |
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III |
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not found in 228aa |
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III |
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not found in 428aa |
AT5G49620.1 |
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III |
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not found in 341aa |
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0.538636363 |
III |
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not found in 362aa |
AT5G49620.1 |
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III |
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AT5G49620.1 |
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III |
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not found in 489aa |
AT1G68320.1 |
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III |
Sb024375 |
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AT5G49620.1 |
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III |
Sb008397 |
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III |
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III |
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III |
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III |
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not found in 237aa |
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III |
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not found in 282aa |
AT5G49620.1 |
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III |
Gm026430 |
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AT5G49620.1 |
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III |
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not found in 260aa |
AT5G49620.1 |
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III |
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QSEDEMDLRRGPWTVDE in 23/330 |
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III |
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III |
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not_not |
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III |
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AT3G06490.1 |
not_not |
0.470454545 |
III |
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not_not |
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III |
Gm052910 |
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AT5G49620.1 |
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III |
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III |
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0.425 |
III |
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AT5G40350.1 |
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AT3G27810.1 |
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0.420454545 |
III |
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AT3G27810.1 |
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III |
Get sequence file
Get alignment file
Get formatted file made by BOXSHADE
Sequence file prepared (0 sec required). Alignment has started.
CLUSTAL format alignment by MAFFT FFT-NS-2 (v7.475)
AT1G48000.1 --------------------------MN-------------IS-RTEFANCKTLI----N
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Sb017917_Sorbi1 ------------------MD-DMDMAMAMVSFD-DLDQVL--A-----MSP---------
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gm051381_Glyma1 --------------------------MDK-------------KQQCK-TSQD--------
Os002933_Os01t0 ------------------------------------------------------------
gm025251_Glyma0 -----------------------------------------MS----------------T
AT1G48000.1 HKEEVEEV------------------------EKKME-------IEIRRG----------
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Os039545_Os11t0 -------------------------------EQQEAAAELSSA--ELRRG----------
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gm011693_Glyma0 --------------------------------------------PEVRKG----------
pt027357_POPTR_ LKKSMTSS-----------------------KEDGS---------ELRRG----------
pt040360_POPTR_ -YAGTLSE------------------------DQGM---------GIRKG----------
gm026430_Glyma1 ------HN------------------------EKEM---------GMRKG----------
Sb008397_Sorbi1 -TTRVASSRSCG-------------------GDDEP---------AVRKG----------
gm026431_Glyma1 LSSATYAS------------------------EEDM---------KIKKG----------
pt016907_POPTR_ -LAST--E------------------------DQDM---------GTRKG----------
gm045910_Glyma1 ---TLLSC------------------------EDEM---------DLRRG----------
gm050848_Glyma1 --------------------------------------------PEVRKG----------
gm002669_Glyma0 ----------------------------------DM---------VIKKG----------
Sb017362_Sorbi1 -SAAAAKAAACSPGAGGPVEVGEKL--------------------ELRRG----------
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gm052910_Glyma1 --SIVLDC------------------------EEEI-----------RKG----------
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Sb013167_Sorbi1 VAAAACRRGPSRPAATAPMMAKQEQVVADEQDQQQAAGEEEGAGDELRRG----------
Sb024840_Sorbi1 MAAAVTSS-----------------------KHHEDQEMM----MELRRG----------
Os001601_Os01t0 -AAAVAEE------------------------------------EDVRRG----------
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gm051380_Glyma1 --------------------------------------------PEVRKG----------
Sb024375_Sorbi1 -------S---------PR-------------------------AEQRRGVGGGGGRRPP
gm052909_Glyma1 -----GSS------------------------EEEM---------SITKG----------
pt042981_POPTR_ -SSSTTQS------------------------DEEMM-------GDLRRG----------
gm013215_Glyma0 -SKSVSSS-----------------------SEDDN---------ELRRG----------
gm007866_Glyma0 ------SS------------------------EEEM---------LITKG----------
Sb017917_Sorbi1 -SSSATSSAPVAAAQ--PAAAGSSS-------DDEAAAIC----ADLRRG----------
gm042134_Glyma1 -TTTTIQS------------------------EDEM---------DLRRG----------
gm051381_Glyma1 --------------------------------------------PEVRKG----------
Os002933_Os01t0 -----MATRMCG-------------------RAGEP---------AVRKG----------
gm025251_Glyma0 PSKSIICS-----------------------REDDY---------ELRRG----------
:*
AT1G48000.1 PWTVEEDMKLVSYISLHGEGRWNSLSRSAGLNRTGKSCRLRWLNYLRPDIRRGDISLQE-
Sb017916_Sorbi1 PWTVDEDILLVNYIAAHGEGRWNSLARSAGLKRTGKSCRLRWLNYLRPDVRRGNITAEE-
pt035930_POPTR_ PWTLEEDTLLTRYIARNREGRWNMLAKCAGLKRTGKSCRLRWLNYLKPDVKRGNLTPQE-
pt023065_POPTR_ PWTLEEDTLLVHYIARHGEGRWNLLAKRAGLRRTGKSCRLRWLNYLKPDVKRGNLTPQE-
gm017948_Glyma0 PWSVEEDYLLTHYIANHGEGRWNLLAIRSGLRRTGKSCRLRWLNYLKPNVKRGNLTSEE-
pt004056_POPTR_ PWTLEEDLILTNHIANHGEGVWNSLAKAAGLKRTGKSCRLRWLNYLRPDLRRGNITPEE-
Os039545_Os11t0 PWTVDEDLTLINYISDHGEGRWNALARAAGLKRTGKSCRLRWLNYLRPDVKRGNFTAEE-
pt041360_POPTR_ PWTLEEDTLLTHYITRHGEGRWNMLARGAGLKRTGKSCRLRWLNYLKPDIKRGNLTPQE-
gm007867_Glyma0 PWSVEEDTILQNYVATHGD----------GLKRSGKSCRLRWLNYLRPDVRRGNITLQE-
gm044136_Glyma1 PWTMEEDLILINYIANHGEGVWNSLAKAAGLKRTGKSCRLRWLNYLRPDVRRGNITPEE-
gm011693_Glyma0 PWTMEEDLILINYIANHGEGVWNSLAKASGLKRTGKSCRLRWLNYLRPDVRRGNITPEE-
pt027357_POPTR_ PWTLEEDTLLVHYIGRHGEGRWNLLAKRAGLRRTGKSCRLRWLNYLKPDVKRGNLTPQE-
pt040360_POPTR_ PWTIEEDSLLAHYITIHGEGHWNSAARCAGLKRTGKSCRLRWLNYLRPNVRRGNITLQE-
gm026430_Glyma1 PWAVEEDTILVNYIATHGEGHWNSVARC--LRRSGKSCRLRWLNYLRPDVRRGNITLQE-
Sb008397_Sorbi1 PWTLEEDLILVSYISQHGEGSWDNLARSAGLNRNGKSCRLRWLNYLRPGVRRGSITAGE-
gm026431_Glyma1 PWTEEEDSVLINYVNFQGEGQWNSLARSAGLKRTGKSCRLRWLNYLRPNVRRGNITLQE-
pt016907_POPTR_ PWTVEEDSLLAHYITNHGEGQWNTAARCAGLKRTGKSCRLRWLNYLRPNVRRGNITLQE-
gm045910_Glyma1 PWTVDEDLTLINYIATHGEGRWNTLALSAGLKRTGKSCRLRWLNYLRPDVRRGNITLEE-
gm050848_Glyma1 PWIMEEDLILINYIANHGEGVWNSLAKASGLKRTGKSCRLRWLNYLRPDVRRGNITPEE-
gm002669_Glyma0 PWTEEEDSVLINYVNVHGEGHWNSLARSSGLKRTGKSCRLRWFNYLRPNVRRGNITLQE-
Sb017362_Sorbi1 PWTVDEDLTLVNYIADNGEGRWNNLARAAGLKRTGKSCRLRWLNYLRPDVKRGNFSADE-
Os000259_Os01t0 PWTLEEDNLLMNYIACHGEGRWNLLARCSGLKRTGKSCRLRWLNYLKPDIKRGNLTPEE-
gm052910_Glyma1 PWSVEEDTILQNHVATHGD----------GLKRSGKSCRLRWLNYLRPDVRRGNITLQE-
Os029691_Os07t0 PWTVEEDLLLVNYIAAHGEGRWNALARCAGLKRTGKSCRLRWLNYLRPDVRRGNMTAEE-
gm020185_Glyma0 PWTLEEDNLLSQYIFNHGEGRWNLLAKRSGLKRTGKSCRLRWLNYLKPDVKRGNLTPQE-
Sb013167_Sorbi1 PWTVDEDLTLINYIADHGEGRWNALARAAGLKRTGKSCRLRWLNYLRPDVKRGDFTADE-
Sb024840_Sorbi1 PWTLEEDNLLMNYIACHGEGRWNLLARCSGLKRTGKSCRLRWLNYLKPDIKRGNLTPEE-
Os001601_Os01t0 PWTVEEDAVLAGYVAANGEGRWNELARAAGLRRTGKSCRLRWLNYLRPDVRRGDFTPQE-
gm042133_Glyma1 PWTVDEDLALINYIANHGEGRWNSLARSAGLKRTGKSCRLRWLNYLRPDVRRGNITLEE-
gm023935_Glyma0 PWTVDEDLALINYIANHGEGRWNSLARSAGLKRTGKSCRLRWLNYLRPDVRRGNITLEE-
pt031763_POPTR_ PWTLEEDLILTNYIANHGEGVWNSLAKAAGLKRTGKSCRLRWLNYLRPDLRRGNITPEE-
gm051380_Glyma1 PWTMEEDLILITYIANHGEGVWNSLAKAAGLKRTGKSCRLRWLNYLRPDVRRGNITPEE-
Sb024375_Sorbi1 PRAVDGG-------GGHAPRQLRRRARRGTLERAGT-------------MRRAPADGQEL
gm052909_Glyma1 PWTEEEDSVLFNYITVHGE----------GLKRTGKSCRLRWLNYLRPNVRRGNITLEE-
pt042981_POPTR_ PWTVEEDFKLINYIATHGEGRWNSLARCAGLKRTGKSCRLRWLNYLRPDVRRGNITLEE-
gm013215_Glyma0 PWTLEEDNLLSQYISSHGEGRWNLLAKRSGLKRTGKSCRLRWLNYLKPDVKRGNLTPQE-
gm007866_Glyma0 PWTEQEDSLLFNYITVHGEGHWNSVARYTGLKRTGKSCRLRWLNYLRPNVRRGNITLQE-
Sb017917_Sorbi1 PWTADEDILLVNYIAVHGEGRWNSLARSAGLKRTGKSCRLRWLNYLRPDVRRGNITAEE-
gm042134_Glyma1 PWTVDEDLALINYIANHGEGRWNSLARSAGLKRTGKSCRLRWLNYLRPDVRRGNITLEE-
gm051381_Glyma1 PWTMEEDLILMNYIANHGEGVWNSLAKAAGLKRNGKSCRLRWLNYLRPDVRRGNITPEE-
Os002933_Os01t0 PWTLEEDLILVSYISQNGEGSWDNLARSAGLNRNGKSCRLRWLNYLRPGVRRGSITPEE-
gm025251_Glyma0 PWSVEEDDLLISYIANNGEGRWNLLAIRSGLRRTGKSCRLRWLNYLKPNVKRGNLTSEE-
* : . : *.* *. ::*. *
AT1G48000.1 ---------------------------------QFII--------------LELHSRWGN
Sb017916_Sorbi1 ---------------------------------QLLI--------------LDLHSRWGN
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Os039545_Os11t0 ---------------------------------QLLI--------------LDLHSRWGN
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gm007867_Glyma0 ---------------------------------QITI--------------LELHSRWGN
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gm026431_Glyma1 ---------------------------------QLLI--------------LELHSRWGN
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gm050848_Glyma1 ---------------------------------QLLI--------------IELHAKWGN
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Os002933_Os01t0 ---------------------------------DMVI--------------RELHSRWGN
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: : :* : *
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pt027357_POPTR_ RWSKIAQ---------HLPG------------RTDNEIKNYWRTRVQKQARHLKIDA---
pt040360_POPTR_ RWSKIAQ---------MLPG------------RTDNEIKNYWRTRVQKQAKQLKCDV---
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Sb008397_Sorbi1 KWSKISK---------QLPG------------RTDNEIKNYWRTRIQKKKKQHQAPMA--
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* ::: : * : :.
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Sb017916_Sorbi1 ATVTGGPHDDSSSMDMIGLPEFGFGDLE-DR-----------------------------
pt035930_POPTR_ Y-------EEGSCYDLDGFNQASAGMGTYDNSPL-ECQMAGGNWVFDSR-----------
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gm011693_Glyma0 S-------PPSYQGTFEPFQP-QFPTIT-DQSS-----------------------CCTT
pt027357_POPTR_ Y-------VDSNCYDMEAINLATMPVPGELGISAGDRHMEDGDWGAYDF-----------
pt040360_POPTR_ C---------QDGVDMQGMEQER---YG-----------------------------FIG
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BoxShade v3.31 C (beta, 970507) Output
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