Input
| Putative repression domain
|
|
AT1G48000.1 |
not found |
|
Ortholog
| Putative repression domain
| Reverse top hit
| Relation
| Blast score ratio
| Type
|
Os012761 |
not found in 329aa |
AT5G49620.1 |
1st_not |
0.570454545 |
II |
Os039545 |
not found in 285aa |
AT5G49620.1 |
not_not |
0.552272727 |
III |
Os029691 |
not found in 300aa |
AT5G49620.1 |
not_not |
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III |
Os001601 |
not found in 293aa |
AT3G06490.1 |
not_not |
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III |
Os000259 |
not found in 350aa |
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III |
Os002933 |
not found in 228aa |
AT5G40350.1 |
not_not |
0.4 |
III |
Sb021634 |
not found in 485aa |
AT5G49620.1 |
1st_not |
0.568181818 |
II |
Sb017916 |
not found in 428aa |
AT5G49620.1 |
not_not |
0.538636363 |
III |
Sb017917 |
not found in 341aa |
AT3G06490.1 |
not_not |
0.538636363 |
III |
Sb013167 |
not found in 362aa |
AT5G49620.1 |
not_not |
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III |
Sb017362 |
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AT5G49620.1 |
not_not |
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III |
Sb007739 |
not found in 306aa |
AT1G48000.1 |
not_1st |
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II |
Sb024840 |
not found in 489aa |
AT1G68320.1 |
not_not |
0.497727272 |
III |
Sb024375 |
not found in 431aa |
AT5G49620.1 |
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0.486363636 |
III |
Sb008397 |
not found in 293aa |
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III |
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II |
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AT3G06490.1 |
not_not |
0.568181818 |
III |
LFPQGLDLQSMDPNTPWN in 282/322 |
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QSEDEMDLRRGPWTVDE in 24/340 |
AT3G06490.1 |
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0.565909090 |
III |
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QSEDEMDLRRGPWTVDE in 23/341 |
AT3G06490.1 |
not_not |
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III |
Gm007866 |
not found in 237aa |
AT5G49620.1 |
not_not |
0.518181818 |
III |
Gm026431 |
not found in 282aa |
AT5G49620.1 |
not_not |
0.511363636 |
III |
Gm026430 |
not found in 221aa |
AT5G49620.1 |
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III |
Gm002669 |
not found in 260aa |
AT5G49620.1 |
not_not |
0.509090909 |
III |
Gm042134 |
QSEDEMDLRRGPWTVDE in 23/330 |
AT3G06490.1 |
not_not |
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III |
Gm013215 |
not found in 317aa |
AT1G68320.1 |
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III |
Gm020185 |
not found in 312aa |
AT1G25340.1 |
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III |
Gm052909 |
not found in 250aa |
AT3G06490.1 |
not_not |
0.470454545 |
III |
Gm007867 |
not found in 228aa |
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III |
Gm052910 |
not found in 236aa |
AT5G49620.1 |
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0.447727272 |
III |
Gm051380 |
not found in 204aa |
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0.425 |
III |
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0.425 |
III |
Gm051381 |
not found in 206aa |
AT5G40350.1 |
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III |
Gm011693 |
not found in 206aa |
AT3G27810.1 |
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0.420454545 |
III |
Gm025251 |
not found in 306aa |
AT1G25340.1 |
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Gm050848 |
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AT3G27810.1 |
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AT1G25340.1 |
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III |
Pt034806 |
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AT3G06490.1 |
1st_not |
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AT3G06490.1 |
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III |
Pt040360 |
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AT3G06490.1 |
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III |
Pt016907 |
not found in 287aa |
AT3G06490.1 |
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III |
Pt041360 |
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Pt023065 |
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AT1G68320.1 |
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III |
Pt027357 |
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0.486363636 |
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Pt035930 |
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AT1G68320.1 |
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Pt004056 |
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III |
Pt031763 |
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AT3G27810.1 |
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0.409090909 |
III |
Get sequence file
Get alignment file
Get formatted file made by BOXSHADE
Sequence file prepared (1 sec required). Alignment has started.
CLUSTAL format alignment by MAFFT FFT-NS-2 (v7.475)
AT1G48000.1 ----------------------MNISRTE-----FAN-----------CKTLINH-----
Sb024840_Sorbi1 -----KVHARRQAT-------IMSQR-KG-------------------ASM---------
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gm007867_Glyma0 ----------------------MDVK----------------------------------
gm044136_Glyma1 ----------------------MDKKQ-------LCN-----------------------
Os012761_Os03t0 ----------------------MDMAH-------ERD-----------------------
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pt027357_POPTR_ ----------------------MSEDIIM-------------------SSL---------
Sb024375_Sorbi1 ------------------------------------------------------------
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pt023065_POPTR_ ----------------------MRVD-IM-------------------SSS---------
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gm019269_Glyma0 ----------------------MDGKGAR-----SSN-----------------------
gm013215_Glyma0 ----------------------------M-------------------ST----------
Os000259_Os01t0 ----------------------MSQR-RV-------------------AGP---------
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pt031763_POPTR_ ----------------------MDKS--------PCN-----------------------
pt035930_POPTR_ ----------------------MRAS--M-------------------LGV---------
gm020185_Glyma0 ----------------------------M-------------------ST----------
AT1G48000.1 -----------KEEVEEVEKKME--------IEIRRG----------PWTVEEDMKLVSY
Sb024840_Sorbi1 ----------AAAVTSSKHHEDQEMM-----MELRRG----------PWTLEEDNLLMNY
gm026431_Glyma1 ----------LSSATYASEEDM----------KIKKG----------PWTEEEDSVLINY
gm052910_Glyma1 ---------------LDCEEEI------------RKG----------PWSVEEDTILQNH
gm011693_Glyma0 ---------------SSHDPEV------------RKG----------PWTMEEDLILINY
pt034806_POPTR_ -----------SSSTTQSDEEMM--------VDLRRG----------PWTVEEDFKLIDY
Sb013167_Sorbi1 AATAPMMAKQEQVVADEQDQQQAAGEEEGAGDELRRG----------PWTVDEDLTLINY
gm051380_Glyma1 ---------------TSHDPEV------------RKG----------PWTMEEDLILITY
gm042133_Glyma1 -----------TTTTIQSEDEM----------DLRRG----------PWTVDEDLALINY
pt042981_POPTR_ -----------SSSTTQSDEEMM--------GDLRRG----------PWTVEEDFKLINY
Sb008397_Sorbi1 ----------ASSRSCGGDDEP----------AVRKG----------PWTLEEDLILVSY
gm026430_Glyma1 ----------------HNEKEM----------GMRKG----------PWAVEEDTILVNY
Os039545_Os11t0 ------------------EQQEAAAELSSA--ELRRG----------PWTVDEDLTLINY
gm002669_Glyma0 --------------------DM----------VIKKG----------PWTEEEDSVLINY
Sb017362_Sorbi1 GAGGPVEVGEKL--------------------ELRRG----------PWTVDEDLTLVNY
gm051381_Glyma1 ---------------TSQDPEV------------RKG----------PWTMEEDLILMNY
Os001601_Os01t0 ------------------EEE-----------DVRRG----------PWTVEEDAVLAGY
pt016907_POPTR_ -----------LAST--EDQDM----------GTRKG----------PWTVEEDSLLAHY
Sb017916_Sorbi1 AAPPP-----VVAGSSSDDDEAAAVA---VGADLRRG----------PWTVDEDILLVNY
gm042134_Glyma1 -----------TTTTIQSEDEM----------DLRRG----------PWTVDEDLALINY
gm007866_Glyma0 ----------------SSEEEM----------LITKG----------PWTEQEDSLLFNY
Os002933_Os01t0 ----------MATRMCGRAGEP----------AVRKG----------PWTLEEDLILVSY
pt040360_POPTR_ -----------YAGTLSEDQGM----------GIRKG----------PWTIEEDSLLAHY
gm050848_Glyma1 ---------------SSHDPEV------------RKG----------PWIMEEDLILINY
Sb017917_Sorbi1 AQ--P-----AAAGSSS-DDEAAAIC-----ADLRRG----------PWTADEDILLVNY
gm007867_Glyma0 ----------------DCEEDI------------RKG----------PWSVEEDTILQNY
gm044136_Glyma1 ---------------TSQDPEV------------RKG----------PWTMEEDLILINY
Os012761_Os03t0 ---------------ASSEEEVMG-------GDLRRG----------PWTVEEDLLLVNY
pt004056_POPTR_ ----------------SQDVEV------------RKG----------PWTLEEDLILTNH
pt027357_POPTR_ ----------KKSMTSSKEDGS----------ELRRG----------PWTLEEDTLLVHY
Sb024375_Sorbi1 ----------------SPRAEQ------------RRGVGGGGGRRPPPRAVDGG------
gm045910_Glyma1 -------------TLLSCEDEM----------DLRRG----------PWTVDEDLTLINY
Sb021634_Sorbi1 ---------------ASSEEEVMA-------GELRRG----------PWTVEEDLLLVNY
pt041360_POPTR_ ----------RKRICNPREEES----------ELRRG----------PWTLEEDTLLTHY
pt023065_POPTR_ ----------KKT-TSSKEDDA----------ELRRG----------PWTLEEDTLLVHY
Sb007739_Sorbi1 ---------------PAAEAEL-----------LRRG----------PWTVDEDALLAGY
Os029691_Os07t0 ---------------VSSEEEAGG------GDELRRG----------PWTVEEDLLLVNY
gm019269_Glyma0 -------------TLLSSEDEM----------DLRRG----------PWTVDEDLTLINY
gm013215_Glyma0 ----------SKSVSSSSEDDN----------ELRRG----------PWTLEEDNLLSQY
Os000259_Os01t0 ----------MGVMSKQQQEAMAEEM-----MELRRG----------PWTLEEDNLLMNY
gm017948_Glyma0 ----------SKSIICSSEDDY----------ELRRG----------PWSVEEDYLLTHY
gm023935_Glyma0 -----------TTTTIQSEDEM----------DLRRG----------PWTVDEDLALINY
gm025251_Glyma0 ----------SKSIICSREDDY----------ELRRG----------PWSVEEDDLLISY
gm052909_Glyma1 ---------------GSSEEEM----------SITKG----------PWTEEEDSVLFNY
pt031763_POPTR_ ----------------SQDVEV------------RKG----------PWTLEEDLILTNY
pt035930_POPTR_ ----------TRRICNSREEEG----------ELRRG----------PWTLEEDTLLTRY
gm020185_Glyma0 ----------SKSVSSSSEDDN----------ELRRG----------PWTLEEDNLLSQY
:* * : .
AT1G48000.1 ISLHGEGRWNSLSRSAGLNRTGKSCRLRWLNYLRPDIRRGDISLQE--------------
Sb024840_Sorbi1 IACHGEGRWNLLARCSGLKRTGKSCRLRWLNYLKPDIKRGNLTPEE--------------
gm026431_Glyma1 VNFQGEGQWNSLARSAGLKRTGKSCRLRWLNYLRPNVRRGNITLQE--------------
gm052910_Glyma1 VATHGD----------GLKRSGKSCRLRWLNYLRPDVRRGNITLQE--------------
gm011693_Glyma0 IANHGEGVWNSLAKASGLKRTGKSCRLRWLNYLRPDVRRGNITPEE--------------
pt034806_POPTR_ IATHGEGRWNSLARCAGLKRTGKSCRLRWLNYLRPDVRRGNITLEE--------------
Sb013167_Sorbi1 IADHGEGRWNALARAAGLKRTGKSCRLRWLNYLRPDVKRGDFTADE--------------
gm051380_Glyma1 IANHGEGVWNSLAKAAGLKRTGKSCRLRWLNYLRPDVRRGNITPEE--------------
gm042133_Glyma1 IANHGEGRWNSLARSAGLKRTGKSCRLRWLNYLRPDVRRGNITLEE--------------
pt042981_POPTR_ IATHGEGRWNSLARCAGLKRTGKSCRLRWLNYLRPDVRRGNITLEE--------------
Sb008397_Sorbi1 ISQHGEGSWDNLARSAGLNRNGKSCRLRWLNYLRPGVRRGSITAGE--------------
gm026430_Glyma1 IATHGEGHWNSVARC--LRRSGKSCRLRWLNYLRPDVRRGNITLQE--------------
Os039545_Os11t0 ISDHGEGRWNALARAAGLKRTGKSCRLRWLNYLRPDVKRGNFTAEE--------------
gm002669_Glyma0 VNVHGEGHWNSLARSSGLKRTGKSCRLRWFNYLRPNVRRGNITLQE--------------
Sb017362_Sorbi1 IADNGEGRWNNLARAAGLKRTGKSCRLRWLNYLRPDVKRGNFSADE--------------
gm051381_Glyma1 IANHGEGVWNSLAKAAGLKRNGKSCRLRWLNYLRPDVRRGNITPEE--------------
Os001601_Os01t0 VAANGEGRWNELARAAGLRRTGKSCRLRWLNYLRPDVRRGDFTPQE--------------
pt016907_POPTR_ ITNHGEGQWNTAARCAGLKRTGKSCRLRWLNYLRPNVRRGNITLQE--------------
Sb017916_Sorbi1 IAAHGEGRWNSLARSAGLKRTGKSCRLRWLNYLRPDVRRGNITAEE--------------
gm042134_Glyma1 IANHGEGRWNSLARSAGLKRTGKSCRLRWLNYLRPDVRRGNITLEE--------------
gm007866_Glyma0 ITVHGEGHWNSVARYTGLKRTGKSCRLRWLNYLRPNVRRGNITLQE--------------
Os002933_Os01t0 ISQNGEGSWDNLARSAGLNRNGKSCRLRWLNYLRPGVRRGSITPEE--------------
pt040360_POPTR_ ITIHGEGHWNSAARCAGLKRTGKSCRLRWLNYLRPNVRRGNITLQE--------------
gm050848_Glyma1 IANHGEGVWNSLAKASGLKRTGKSCRLRWLNYLRPDVRRGNITPEE--------------
Sb017917_Sorbi1 IAVHGEGRWNSLARSAGLKRTGKSCRLRWLNYLRPDVRRGNITAEE--------------
gm007867_Glyma0 VATHGD----------GLKRSGKSCRLRWLNYLRPDVRRGNITLQE--------------
gm044136_Glyma1 IANHGEGVWNSLAKAAGLKRTGKSCRLRWLNYLRPDVRRGNITPEE--------------
Os012761_Os03t0 IAAHGEGRWNSLARSAGLKRTGKSCRLRWLNYLRPDLRRGNITPQE--------------
pt004056_POPTR_ IANHGEGVWNSLAKAAGLKRTGKSCRLRWLNYLRPDLRRGNITPEE--------------
pt027357_POPTR_ IGRHGEGRWNLLAKRAGLRRTGKSCRLRWLNYLKPDVKRGNLTPQE--------------
Sb024375_Sorbi1 -GGHAPRQLRRRARRGTLERAGT-------------MRRAPADGQELPAAVAQLPAAGPA
gm045910_Glyma1 IATHGEGRWNTLALSAGLKRTGKSCRLRWLNYLRPDVRRGNITLEE--------------
Sb021634_Sorbi1 VAAHGEGRWNSLARSAGLKRTGKSCRLRWLNYLRPDLRRGNITPQE--------------
pt041360_POPTR_ ITRHGEGRWNMLARGAGLKRTGKSCRLRWLNYLKPDIKRGNLTPQE--------------
pt023065_POPTR_ IARHGEGRWNLLAKRAGLRRTGKSCRLRWLNYLKPDVKRGNLTPQE--------------
Sb007739_Sorbi1 VAAHGEGRWNELARAAGLRRTGKSCRLRWLNYLRPGVRRGDFTPRE--------------
Os029691_Os07t0 IAAHGEGRWNALARCAGLKRTGKSCRLRWLNYLRPDVRRGNMTAEE--------------
gm019269_Glyma0 VATHGEGRWNTLALSAGLKRTGKSCRLRWLNYLRPDVRRGNITLEE--------------
gm013215_Glyma0 ISSHGEGRWNLLAKRSGLKRTGKSCRLRWLNYLKPDVKRGNLTPQE--------------
Os000259_Os01t0 IACHGEGRWNLLARCSGLKRTGKSCRLRWLNYLKPDIKRGNLTPEE--------------
gm017948_Glyma0 IANHGEGRWNLLAIRSGLRRTGKSCRLRWLNYLKPNVKRGNLTSEE--------------
gm023935_Glyma0 IANHGEGRWNSLARSAGLKRTGKSCRLRWLNYLRPDVRRGNITLEE--------------
gm025251_Glyma0 IANNGEGRWNLLAIRSGLRRTGKSCRLRWLNYLKPNVKRGNLTSEE--------------
gm052909_Glyma1 ITVHGE----------GLKRTGKSCRLRWLNYLRPNVRRGNITLEE--------------
pt031763_POPTR_ IANHGEGVWNSLAKAAGLKRTGKSCRLRWLNYLRPDLRRGNITPEE--------------
pt035930_POPTR_ IARNREGRWNMLAKCAGLKRTGKSCRLRWLNYLKPDVKRGNLTPQE--------------
gm020185_Glyma0 IFNHGEGRWNLLAKRSGLKRTGKSCRLRWLNYLKPDVKRGNLTPQE--------------
: *.* *. ::*. *
AT1G48000.1 --------------------QFII--------------LELHSRWGNRWSKIAQ------
Sb024840_Sorbi1 --------------------QLLI--------------LELHSKWGNRWSRIAQ------
gm026431_Glyma1 --------------------QLLI--------------LELHSRWGNRWAKIAE------
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: : :* : *
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* ::: : * : :.
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