Input
| Putative repression domain
|
|
AT1G52520.1 |
not found |
|
Ortholog
| Putative repression domain
| Reverse top hit
| Relation
| Blast score ratio
| Type
|
Os008702 |
LSDKYRLALRLVREME in 640/818 |
AT1G52520.1 |
1st_1st |
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Ib |
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AT1G52520.1 |
1st_1st |
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Ib |
LSDKYRLALRLVRETE in 1394/1885 |
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not found in 668aa |
AT1G52520.1 |
1st_1st |
0.638686131 |
Ia |
Gm023800 |
not found in 672aa |
AT1G52520.1 |
not_1st |
0.635766423 |
II |
Gm041998 |
not found in 706aa |
AT1G80010.1 |
not_not |
0.452554744 |
III |
Gm053645 |
not found in 668aa |
AT1G52520.1 |
not_1st |
0.443065693 |
II |
Gm040679 |
not found in 631aa |
AT1G52520.1 |
not_1st |
0.4 |
II |
Pt010866 |
not found in 658aa |
AT1G52520.1 |
1st_1st |
0.658394160 |
Ia |
Pt005863 |
not found in 670aa |
AT1G52520.1 |
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II |
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AT1G80010.1 |
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III |
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AT1G52520.1 |
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0.414598540 |
II |
Get sequence file
Get alignment file
Get formatted file made by BOXSHADE
Sequence file prepared (0 sec required). Alignment has started.
CLUSTAL format alignment by MAFFT FFT-NS-2 (v7.475)
AT1G52520.1 ----------ME----RSESVDEDVQ---------------------ASAYLENDEV---
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*
AT1G52520.1 ---RE--------------RDDPMSDTLRIGEEALVCSSEHEIDVGFCQNEERKSEEETM
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*
AT1G52520.1 GGFDEQ------SGLLVDERKEFDA-PAVGMEFESYDDAYNYYNCYASEVGFRVRVKNSW
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gm041997_Glyma1 -GFPE-------------GRKEFVA-PAVGMEFESYDDAYNYYICYAKEVGFRVRVKNSW
Os008702_Os02t0 ------------------DGEDIGV-PEVGMVFNNHTEVNRFYRRYARRVGFGVSVRRSS
pt011396_POPTR_ -NRDDATVEDVRNGDF--LGKDYPP-PFVGMQFESYDDAYNYYNCYAKDLGFAIRVKSSW
pt010866_POPTR_ ---TE-------------EKKEFVA-PAVGMEFESYDDAYNYYNCYAKEVGFRVRVKNSW
Sb027511_Sorbi1 ------------------DGEDIGV-PEVGMVFNNHTEVNRFYRKYARRVGFGVSVRRSS
* * : *:.. :. :* ** *: : * :
AT1G52520.1 FKRRSKEKYGAVLCCSSQGFKRINDVNRVRKETRTGCPAMIRMRQVDSKRWRVVEVTLDH
gm041998_Glyma1 TKRNSKEKRGAVLCCNCEGFKTTKEANSHRKETRTGCLAMIRLRLVDSNRWRVDEVKLDH
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pt031775_POPTR_ YR-KSKERYRGKLSCSSAGFKKKSEANRPRPETRTGCPAMVKFRLMENKRWKIIEVELEH
gm041997_Glyma1 FKRNSREKYGAVLCCSSQGFKRIKDVNHLRKETRTGCPAMIRMRLVESQRWRVLEVMLEH
Os008702_Os02t0 FSQEGTCLYLELMCCKG-GRPRYEPKFRKRASSTTNCPAKIRVKLWGDKLLHVELAILDH
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Sb027511_Sorbi1 FSQEGTCLYLELMCCKG-GRPRYEPKFRKRASSTTNCPAKIRVKLWGDKLLHVELAILDH
. :.*. * * .: *.* * : .: . :: . *:*
AT1G52520.1 NHLLG---CKLYKSVKR-----KRKC----VSS-PVSDAKTIKLYRACVVDNGSNVNPNS
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pt031775_POPTR_ NHLITPGSGKFYKSHK-IIGPGTKRT----LQLDGPEEVQKIKLFRTVIVDAEGNGGVDT
gm041997_Glyma1 NHMLG---AKILRSVKKMGNGTKRKP----LPS-SDAEGQTIKLYRALVIDAGGNGNSNS
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pt011396_POPTR_ NHLFDPERAQNSKSHKKMDAGAKRKV----EPT-VDVEVRTIKLYRTAAVDPLGYGSTNS
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Sb027511_Sorbi1 NHPVSPAMARFLNSYKQLSGPAKRRMRMGGPGAMPIEESSKVPMDKLGELEQLLFGESKH
** . : .: : : ::
AT1G52520.1 TLNKKFQNSTGSPDLLNLKRGDSAAIYNYFCRMQLTNPNFFYLMDVNDEGQLRNVFWADA
gm041998_Glyma1 TE-GGTS-NISCSRRLKLKKGDPELISNYFCRIQLMNPNFFYVMDLNDDGQLRNVFWIDS
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pt031775_POPTR_ DG-GQFGNDVLLPSQLKLKEGDAQAVQSFFFRLQLMDPNFFYVVELNEKGYMRNLFWTDA
gm041997_Glyma1 CA-REDITFSEFSNKWNLRKGDTQAIYNFLCRMQLTNPNFFYLMDFNDDGHLRNAFWVDA
Os008702_Os02t0 HS-------FVERGRLKFQPGDSEALRLFFTRMQAKNANFFNVIDLDDEGCVRNVFWVDA
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Sb027511_Sorbi1 HS-------FVERGRLKLQPGDSEALRLFFTRMQAKNANFFNVIDLDDEGCTRNVFWADA
::. **. : :: : : .:** :.:.:: * :* ** .
AT1G52520.1 FSKVSCSYFGDVIFIDSSYISGKFEIPLVTFTGVNHHGKTTLLSCGFLAGETMESYHWLL
gm041998_Glyma1 RSRAAYSYFGDVVAFDSTCLSNNYEIPLVAFVGVNHHGKSVLLGCGLLADETFETYIWLF
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Sb027511_Sorbi1 RSRAMCEYYSDVITLDTSYVASKYDMPLATFIGVNHHGQSVLMGCALLSDETAETYSWLL
*: :: * : :*. : .:::** * * *:* :. *:.*.:* :: : : *::
AT1G52520.1 KVWLSVMKR-SPQTIVTDRCKPLEAAISQVFPRSHQRFSLTHIMRKIPEKLGGLHNYDAV
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pt011396_POPTR_ RVWLTCMLGRPPQTIITDQCKAMQGAIAEVFPRAHHRFCLSRVAHKILDNLGMLQDYEGF
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Sb027511_Sorbi1 KAWIACMYGNLPKAIVTDYCRGIQSAVAEVIPGVRHRMCLFQIMRKAAERLGGLSEYRAI
:.*: : *:.::*. :: .: : :* : : : : : :
AT1G52520.1 RKAFTKAVYETLKVVEFEAAWGFMVHNFGVIENEWLRSLYEERAKWAPVYLKDTFFAGIA
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Sb027511_Sorbi1 NKAMHKAVYDSLTIDEFEGEWNTLITYSGLQGNDWLRSLYECRSSWVPVFIKDTFWAGMS
: .:: *** * : :. ::: :: * *.*.: * *:
AT1G52520.1 AAHPGETLKPFFERYVHKQTPLKEFLDKYELALQKKHREETLSDIESQTLNTAELKTKCS
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gm041997_Glyma1 AARPGESISPFFDRYVHKQTPLKEFLDKYELALHRKHKEESFSDIESRSSSPL-LKTRCS
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Sb027511_Sorbi1 ATQRNETITPFFDGYVDLKTTLKQFLGKYEMALQSKYEKEAQADFETFHKQRP-PVSKFY
.: **. :: :*.:*.*. : : : * *::: :
AT1G52520.1 FETQLSRIYTRDMFKKFQIEVEEMYSCFSTTQVHVDGPFVIFLVKERVRGESSRREI-RD
gm041998_Glyma1 YELQLSKLYTNAVFRKFQDEVVMMSSCFSITQTQTSGSIVTYMVKER-EGEEPARDA-RN
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gm041997_Glyma1 FELQLSRMYTREMFMKFQLEVEEVYSCFGTTQLHVDGPIIIFLVKERVLIEGNRREI-RD
Os008702_Os02t0 MEEQLSKVYTHNIFKKFQDEIEAIMYC-HVSFINVDGLISTFDVKEWIFLEDGKRTMSKI
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Sb027511_Sorbi1 MEEQLSKVYTHNMFKKFQDEIEAIMYC-HVSLIGVDGPVSTFNVKECIFLEDGKRTMSKI
*::::*:. : *: *: : * ..* . : ::* : :
AT1G52520.1 FEVLYNRSVGEVRCICSCFNFYGYLCRHALCVLNFNGVEEIPLRYILPRWRKDYKRLHF-
gm041998_Glyma1 FEVMYDNAGAEVRCICSCFNFKGYLCRHALYILNYNCVEEIPCQYILSRWRRDFKRLYV-
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pt005863_POPTR_ FEVLYDTSQADIRCICSLFNYKGYLCRHALNVLNYNGVEEVPSRYILPRWGKDYKRRGL-
gm053645_Glyma2 FEVLYETTELDIRCICSLFNYKGYLCRHALNVLNYNGIEEIPSRYILHRWRRDFKQMFN-
gm023800_Glyma0 FEVLYSRTAGEVRCICSCFNFYGYLCRHALCVLNFNGVEEIPHKYILSRWKKDYKH----
pt031775_POPTR_ FEVMYNASEMDVLCVCGLFNFSGFLCRHALSVLNQNGLEEIPPQYILTRWRKDMKRSYV-
gm041997_Glyma1 FEVLYSRTAGEVRCICSCFNFYGYLCRHALCVLNFNGVEEIPHKYILSRWKKDFKRLYV-
Os008702_Os02t0 FTVTNNTDKNDLTCICGGFQFNGILCRHSLSVLKFQQVREIPPHYVLDRWKKDFRQLHV-
pt011396_POPTR_ FEVMYDKRGAEVRCICSCFNFKGYLCRHALCILNYNGVEEIPPLYILARWRKDLKRFYV-
pt010866_POPTR_ FEVLYNRSAGEVRCICSCFNFYGYLCRHALCVLNFNGVEEIPCKYILPRWKKDYKRLYI-
Sb027511_Sorbi1 FAVTYKADEKNISCICGGFQFSGILCRHSLSMLKFQLVREIPQHYILDRWKKDFRQLHVK
: * . :: *:*. *:: * ****:* :*. : :.*:* *:* ** :* ::
AT1G52520.1 ------------------------------------------------------------
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gm041997_Glyma1 ------------------------------------------------------------
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pt011396_POPTR_ ------------------------------------------------------------
pt010866_POPTR_ ------------------------------------------------------------
Sb027511_Sorbi1 RRPPSDLVPNNRMDRYDYLSMRCLQLVDSAVLSDKYRLALRLVRETEKFLLNSNTHDDTQ
AT1G52520.1 ------------------------------------------------------------
gm041998_Glyma1 ------------------------------------------------------------
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pt010866_POPTR_ ------------------------------------------------------------
Sb027511_Sorbi1 PRIKSRVPKVNKSNTVPGQTVVGAATGNRNDGLKGPEDPSMEESDGEDIGVPEVGMVFNN
AT1G52520.1 ------------------------------------------------------------
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Sb027511_Sorbi1 HTEVNRFYRKYARRVGFGVSVRRSSFSQEGTCLYLELMCCKGGRPRYEPKFRKRASSTTN
AT1G52520.1 ---------------------ADNG-----------------------------------
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gm040679_Glyma1 ---------------------DDHN-----------------------------------
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Sb027511_Sorbi1 CPAKIRVKLWGDKLLHVELAILDHNHPVSPAMARFLNSYKQLSGPAKRRMRMGGPGAMPI
AT1G52520.1 ------------------------------------------------------------
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pt010866_POPTR_ ------------------------------------------------------------
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: : * : ::: . * : : . .
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