Input
| Putative repression domain
|
|
AT1G53160.1 |
not found |
|
Ortholog
| Putative repression domain
| Reverse top hit
| Relation
| Blast score ratio
| Type
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Sb019887 |
not found in 1062aa |
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II |
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not found in 418aa |
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III |
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0.479508196 |
III |
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not found in 445aa |
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III |
Sb004141 |
not found in 444aa |
AT1G02065.1 |
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III |
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RGTAPELQLHLASSRP in 7/247 |
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not_not |
0.467213114 |
III |
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not found in 546aa |
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III |
Sb031191 |
not found in 507aa |
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0.459016393 |
III |
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not found in 325aa |
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III |
Get sequence file
Get alignment file
Get formatted file made by BOXSHADE
Sequence file prepared (0 sec required). Alignment has started.
CLUSTAL format alignment by MAFFT FFT-NS-2 (v7.475)
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AT1G53160.1 ------------------------------------------------------------
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Sb023522_Sorbi1 LGE----FG---------------AVADGTKEPAAAATATAAPSAPSAS-----------
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Sb026748_Sorbi1 --AVTPLASAKKAK---------------------SAPNTQKSYCQVEGCKVDL-SSAKE
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Sb031118_Sorbi1 ----------QQGQG--------------------QHQQQQCPSCAVEGCKADL-SKCRD
Sb009754_Sorbi1 --VDRLLTRSRLGGGVGVGMGMGLGMGVLGLGLGAAHHHHQPPKCQAEGCKADL-SAAKH
Sb019887_Sorbi1 ----------RNGKKIRVQGG-----------------GSSGPACQVEGCGADL-TAAKD
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Sb031191_Sorbi1 ----------RRGR--AAGGPSP--------APA-------PARCQVDGCNVDL-TDVKP
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* .: * : :
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Sb025093_Sorbi1 YHKRHKVCEAHTRTTVVCIK-NVEHRFCQQCSRFHLLQEFDEGKKSCRSRLAKHNGRRRK
* :*:** *:: . . ********** : *** *:*** ** ** ***:
AT1G53160.1 ------------------------------------------------------------
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AT1G53160.1 ------------------------------------------------------------
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Sb031176_Sorbi1 HSTEPATVVNSHDKPTRDFPAAGFMRSNSTHESRPHIYKQIEQETRPYLSLQLFGSTEAD
Sb026837_Sorbi1 ------------------------------------------------------------
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Sb031118_Sorbi1 -------------------QQHFVGSTTPAYAKEGRRF----------------------
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Sb034309_Sorbi1 --------DRFM-----------------P---------FKGTNT-----------KVLN
Sb006468_Sorbi1 ---------------------------------------------------------GGG
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Sb026837_Sorbi1 --------DEPW-----------------P---------MK-------------------
Sb026748_Sorbi1 --------DGFT-----------------A---------FKETSA-----------KVLD
Sb014399_Sorbi1 ----------FL-----------------P-PCGG----------------------LSG
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Sb019887_Sorbi1 ------------------PVQSKATMVVTPEPASCKLKDFDLNDTCNDMEGFEDG--QEG
Sb023522_Sorbi1 -----------------------------P---------FLQDGD------------QVS
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Sb012427_Sorbi1 ---GS-TLH--------------AARPG---------HLLAEGSSHT-----GSSTCSNP
Sb004141_Sorbi1 GSITS-----------------------------------SYSTDNK----NLSTAKSTM
Sb034309_Sorbi1 QVSGV------------------------------E----------------ASATASNS
Sb006468_Sorbi1 AGAGA-------------------------------------------------------
Sb031176_Sorbi1 ATMGEVSTSQA-WCAPPLDLFKDSERPVENGSPPNPGYQSCYASTSCSD---HSPSTSNS
Sb026837_Sorbi1 ---GP------------------------------D----------------MSITASKF
Sb026748_Sorbi1 Q--GA------------------------------E----------------ASAVVSNP
Sb014399_Sorbi1 SSAGA------------LSLLS-SARSGATSAAP---WQ--VTTSDISAR--SSAALDDL
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Sb009754_Sorbi1 TCITT-----------------------------------SYSNDLKTGASNTAAAKSTA
Sb019887_Sorbi1 SPTPAFKTADSPNCA--SWMQQDSTQS-----PP----QTSGNSDSTST---QSLSSSNG
Sb023522_Sorbi1 FSAGAGTLEVSTVCQPLLKTAAAAAPP-------------PESSSS-------NKMFSDG
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Sb014768_Sorbi1 DGLGTQIL--------------------------------------------GSALLSKE
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