Input
| Putative repression domain
|
|
AT1G54330.1 |
not found |
|
Ortholog
| Putative repression domain
| Reverse top hit
| Relation
| Blast score ratio
| Type
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Os034759 |
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AT3G17730.1 |
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III |
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AT3G17730.1 |
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III |
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III |
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III |
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not found in 600aa |
AT1G65910.1 |
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III |
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not found in 631aa |
AT1G65910.1 |
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0.494274809 |
III |
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III |
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not found in 237aa |
AT3G17730.1 |
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0.427480916 |
III |
Get sequence file
Get alignment file
Get formatted file made by BOXSHADE
Sequence file prepared (0 sec required). Alignment has started.
CLUSTAL format alignment by MAFFT FFT-NS-2 (v7.475)
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*. ***********:*** *** ** .
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*:*::* :**** :**:* **::* .* **:*: .**:***** ****** :****:
AT1G54330.1 TGKDRTV-ESKK--MKMGMKKTLVYYRGRAPHGLRTNWVMHEYRLTHAP---SSSLK---
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Sb021119_Sorbi1 TGKDRRI-ACDG--GVYGLRKTLVFYRGRAPGGERTDWVMHEYRLCQDIAHGACNFI---
***** : * :****:* **** * **.*******: . :
AT1G54330.1 -------------ESYALCRVFKKNI---------QIPKRKG----------EEEEAEEE
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pt003644_POPTR_ -------------DAYALCRVSKKTT---------TI-PKIG-EHYVST---TYRMPCEH
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Sb021119_Sorbi1 -------------GAYALCRVIKRHELQG-------GEPPAG--------SRAKGAAASS
:***:: *:
AT1G54330.1 STS---------VGKEEEEEK-----EKKWRKC-D-------------------------
pt019412_POPTR_ SSS--IEQYSENHGRCEEYESTNYTMHRNVGNC-STSYRAIGSPL-NIGE----------
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pt003644_POPTR_ SSS--IELYSD-HGRSEEFESSNYPMHKNVDTC-STSYRAVGSPL-DISE----------
Sb023690_Sorbi1 ------------NVALGEFQ-----KQK-QGEC-S-------------------------
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gm004950_Glyma0 SSS--IEIYP--EGRGEDLDSTNYFMP--VDAC-S--------PH-NMGN-ETSLTINSG
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Os034759_Os09t0 ------------------------------------------------------------
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gm047190_Glyma1 ------LQNAMAECFPRYDLPSVMAPWQSLEHPETSSSLSYSN-FNG-----EVEFADNL
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Sb021119_Sorbi1 -------HDT---FFIGDDFPATAA----------DESRSHAHLFGG-----DIMGLGSI
AT1G54330.1 ----LSMNEAEIMSIQQDFQCRDSMNGT-------LDEIFSSSATF--------------
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gm048662_Glyma1 HNNNKELNDTDIDDFSMGFINGDDHNENFIDEGN-I-NYSNS-TNFEVVEETKVSHGMFV
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pt022681_POPTR_ -----CIEEEDKDDSWMQFITDD-------------------------------------
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gm025106_Glyma0 -----CLEEEDKDDSWMQFITED-------------------------------------
Sb021119_Sorbi1 S-E-----------HELKWDSFPNTFSSGADTWN-TAAVAASPTML--------------
AT1G54330.1 ------------------------------------------------------------
pt019412_POPTR_ STRQATETFFHQLVPSQTVKIYL-NPAVVAANFSIEKVE----NSQRYDKKPSKTTAKEN
gm040487_Glyma1 STRQVVETFFHQIVPSQTVQVHLINSVMAH-NHYVENAEAMLMIMENQG-SLLRNKVKAY
Sb006365_Sorbi1 ------------------------------------------------------------
pt012227_POPTR_ ------------------------------------------------------------
gm045461_Glyma1 ------------------------------------------------------------
pt032744_POPTR_ -CKQASG------------------------DGSLGEYG---------------------
pt003644_POPTR_ STRQATETFFHQLVPSQTVKIYL-NPAVVTSNFSIEKAD----STKSYGKETTISTAKEY
Sb023690_Sorbi1 ------------------------------------------------------------
Os034759_Os09t0 ------------------------------------------------------------
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gm004950_Glyma0 STHQVVETFFHQIVPSQTVQVHLINSVMAHNNHYVENAEAMLMIMENKG-SSLRNKVKAY
gm047190_Glyma1 ------------------------------------------------------------
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Sb021119_Sorbi1 -CRQAS-------------------------DG-IEDLA---------------------
AT1G54330.1 ----------PA------------------------------------------------
pt019412_POPTR_ FTGRKSSAQYPWRYLSSNVVCMIVILLMHCFYLGENVE----NGKLTDDFMRSGSVEEEG
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pt003644_POPTR_ FVGSKSSVQYPWRNLARNVVCLIVIILMHCSYLGENVE----NGKLMDGFMGSGRVGDEG
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gm004950_Glyma0 VMGKLIK---PSKTIASAIVFVFALVLMHCVYLKEEVE----------------------
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Sb021119_Sorbi1 ------------------------------------------------------------
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pt019412_POPTR_ FCPSKNVNPMKKPAGKLIIKRDDNEKEKDLLVTIRGGEGSKLGLFLKKLGLFLTISFALC
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Sb023690_Sorbi1 -C-NKTK-----------------------------------------------------
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