Input
| Putative repression domain
|
|
AT1G54330.1 |
not found |
|
Ortholog
| Putative repression domain
| Reverse top hit
| Relation
| Blast score ratio
| Type
|
Os010934 |
not found in 650aa |
AT1G65910.1 |
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III |
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not found in 682aa |
AT1G65910.1 |
1st_not |
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II |
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not found in 332aa |
AT3G17730.1 |
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III |
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not found in 261aa |
AT3G17730.1 |
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III |
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not found in 431aa |
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III |
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not found in 654aa |
AT1G65910.1 |
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II |
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not found in 584aa |
AT1G65910.1 |
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AT1G65910.1 |
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III |
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not found in 631aa |
AT1G65910.1 |
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0.494274809 |
III |
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not found in 175aa |
AT1G54330.1 |
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II |
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III |
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not found in 237aa |
AT3G17730.1 |
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0.475190839 |
III |
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not found in 302aa |
AT4G17980.1 |
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III |
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AT1G54330.1 |
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Pt003644 |
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AT1G65910.1 |
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III |
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INGQEIDLDIIPEIDLY in 33/241 |
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AT3G17730.1 |
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Pt012227 |
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III |
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AT4G17980.1 |
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III |
Pp037626 |
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AT5G04410.1 |
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0.412213740 |
II |
Get sequence file
Get alignment file
Get formatted file made by BOXSHADE
Sequence file prepared (0 sec required). Alignment has started.
CLUSTAL format alignment by MAFFT FFT-NS-2 (v7.475)
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*. ****:******:**: *** *
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pt033580_POPTR_ TIELEIIPEVDLYKCEPWDLPDKSFLPSKDLEWYFLSPRDKKYPNGSRTNRATKAGYWKA
*::: * :**** :**:* ** . .* **:* .**:***** ****** ****:
AT1G54330.1 TGKDRTV-ESKK--MKMGMKKTLVYYRGRAPHGLRTNWVMHEYRLTH----APSSSLK--
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Sb006365_Sorbi1 TGKDRRVLHHAG--RPIGMKKTLVYYRGRAPQGVRTDWVMHEYRLDDKDA-EDTLPIQIS
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pt033580_POPTR_ TGKDRPV-NSQK--RPVGMKKTLVYYRGRAPHGIRTNWVMHEYRLIDSLCGAAPSSLK--
***** : * :****:* **** * **.*******: .
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.:
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gm004950_Glyma0 MPVD-------AC-SPH-NMGN-ETSLTINSG---IMTR------DHEKWSH--------
pp037626_Pp1s8_ ESFDTDVPRLANGDLDGVSIGS-PTSVQDGFRWEDLLPEQPQATTEDDTWKDLVINNVDE
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gm048662_Glyma1 MPWD-------TCPSPNINIGS-ALNININGG-----TR----DNNIGTWSH--------
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Sb006365_Sorbi1 PSPDV-----PVGSTSG-------------GA----DDD----ADKDESWMQ--------
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gm043243_Glyma1 ------------------------------------------------------------
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pt040979_POPTR_ FPS--------ETSSSDVTQGT-PIETATADD----LLA----P----------------
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AT1G54330.1 -----------DE-ANSSS----------IFAL----HFSSSLLD-----------DHDH
gm031664_Glyma1 -------FLSSEDLLNLPTS-------TSSFPN----YGSMSYPPSK--------VDIAL
gm004950_Glyma0 -------FSSQDPLFSLPT---------SSFSK----FGAIAYPPSK--------VDIAL
pp037626_Pp1s8_ LLSGNDRFIADGS-LGMGTTQHVVHDTDDLLSGPGDYSGDGDFLEIKDLINLEDDIDVSG
pt032744_POPTR_ --------ISPDLILDSSK-----------------------------------------
gm047190_Glyma1 --------ISPDMILDSSK-----------------------------------------
gm048662_Glyma1 -------FL-AEDLPNLPTS-------ASSFPN----YGSMSYPPSK--------VDIAL
pt003644_POPTR_ ---------SMDG-FGMSP---------SQFPS----HSTIPYPPSK--------VNMAL
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gm045461_Glyma1 -------FITEDA-W-YSS-------------------------------------NAAM
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Sb002685_Sorbi1 -------FLSEDA-FNATN---------PFFMNP--ASSSFSCLPSK--------VDVAL
gm025106_Glyma0 -------FITEDA-W-YSS-------------------------------------NAAM
gm040487_Glyma1 -------FSSQDPLFSLPTS--------SSFSN----FGAIAYPPSK--------VDIAL
Sb006365_Sorbi1 -------FISDDA-W-CSS-------------------------------------TAD-
Os034759_Os09t0 -------FIAEDL-W-CTN-------------------------------------KLK-
Os010934_Os03t0 -------FLSEDA-FNATN---------PFLTNP--VSANFSCLPSK--------VDVAL
pt026906_POPTR_ -------FITDEP-W-CSS-------------------------------------NNAM
gm043243_Glyma1 ---------------NSLS-----------YTV---------------------------
Sb021119_Sorbi1 --------LPPPLLLSSSPH-------DTFFIG---------------------------
Sb023690_Sorbi1 -------FIADDL-W-C-N-------------------------------------KTK-
pt040979_POPTR_ --------IASDE-ANSSA---------NIYSVG--VDFSSNLIQ-----------DMQM
pt033580_POPTR_ --------FPSDE-ANSSA---------SLYSMG--VDFSSNLIQ-----------DMQM
AT1G54330.1 -------------LFSNYSHQLPYHPPLQL----QDFPQ---LSMNEAEI---MS-----
gm031664_Glyma1 -------------ECARMQHRFTM-PPLEV---QQDFPQVGISELKMAQA---SASNMCG
gm004950_Glyma0 -------------EYARMQHRFVL-PPLEL---------------KMTQA---SGSMQ--
pp037626_Pp1s8_ SNISVGEYEGFDFSASAIQLR----PPRIVQWPMQFDPQ-GETSRRMLLACRPGSQPEQF
pt032744_POPTR_ -------------DYSQVHETAA-----------QYLPQ---YEYPISMN---TWQPD--
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pt012227_POPTR_ ------------------------------------------YEYPSSMN---TWQPD--
pt022681_POPTR_ ------------------------------------------------------------
gm045461_Glyma1 ------------------------------------------------------------
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Sb002685_Sorbi1 -------------ECARLQHRLSL-PPLEV----EDFPQDVSLDTKTSVL---RSNPN--
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Sb006365_Sorbi1 ------------------------------------------------------------
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gm043243_Glyma1 ---------------SSIGY----------------------------------------
Sb021119_Sorbi1 ----------------------------------DDFPA---------------------
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pt040979_POPTR_ P------------VYSSLLYQFPY-PSLEL----EDFPQ---INIAECVK---PSKP---
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Sb006365_Sorbi1 -------------------------------------
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BoxShade v3.31 C (beta, 970507) Output
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pt022681_POPTR_ |
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gm045461_Glyma1 |
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gm025106_Glyma0 |
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gm040487_Glyma1 |
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Os034759_Os09t0 |
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Os010934_Os03t0 |
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pt026906_POPTR_ |
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