fioreDB : Database for Flower Bio-engineering by CRES-T system
fioreDB : Database for Flower Bio-engineering by CRES-T system
Input Putative repression domain
AT1G54330.1 not found
Ortholog Putative repression domain Reverse top hit Relation Blast score ratio Type
Sb002685 not found in 682aa AT1G65910.1 1st_not 0.5 II
Sb023690 not found in 332aa AT3G17730.1 not_not 0.473282442 III
Sb006365 not found in 261aa AT3G17730.1 not_not 0.438931297 III
Sb021119 not found in 431aa AT4G17980.1 not_not 0.410305343 III

Get sequence file
Get alignment file
Get formatted file made by BOXSHADE
Sequence file prepared (0 sec required). Alignment has started.

CLUSTAL format alignment by MAFFT FFT-NS-2 (v7.475)


AT1G54330.1     -----------------------------MAPMSLPPGFRFHPTDEELVAYYLDRKVNGQ
Sb006365_Sorbi1 -----------------------------MAPVGLPPGFRFHPTDEELVNYYLKRKIHGL
Sb021119_Sorbi1 -----------------------------MGTMTLPPGFRFHPTDDELVGYYLKRKVDNL
Sb002685_Sorbi1 -----------------------------MAPVSLPPGFRFHPTDEELIIYYLKRKINGR
Sb023690_Sorbi1 EHSGRQQKGKTKGKDRERSARKEAASWEAMAPADLPPGFRFHPTDEELVNYYLKRKVHGL
                                             *..  ***********:**: ***.**:.. 

AT1G54330.1     AIELEIIPEVDLYKCEPWDLPEKSFLPGNDMEWYFYSTRDKKYPNGSRTNRATRAGYWKA
Sb006365_Sorbi1 KIELDIIPEVDLYKCEPWELADKSFLPSRDPEWYFFGPRDRKYPNGFRTNRATRAGYWKS
Sb021119_Sorbi1 KIELEVIPVIDLYKSEPWELPEKSFLPKRDLEWFFFCPRDRKYPNGSRTNRATTTGYWKA
Sb002685_Sorbi1 QIELEIIPEVDLYKCEPWDLPEKSFLPSKDLEWYFFSPRDRKYPNGSRTNRATKSGYWKA
Sb023690_Sorbi1 SIELDIIPEVDLYKCEPWELAEKSFLPSRDSEWYFFGPRDRKYPNGCRTNRATQAGYWKS
                 ***::** :****.***:*.:***** .* **:*: .**:***** ****** :****:

AT1G54330.1     TGKDRTV-ESKKMKMGMKKTLVYYRGRAPHGLRTNWVMHEYRLTHAPSSS---LK-----
Sb006365_Sorbi1 TGKDRRVLHHAGRPIGMKKTLVYYRGRAPQGVRTDWVMHEYRLDDKDAEDTLPIQISRHD
Sb021119_Sorbi1 TGKDRRI-ACDGGVYGLRKTLVFYRGRAPGGERTDWVMHEYRL----CQD---IA-----
Sb002685_Sorbi1 TGKDRKV-NSHRRAVGMKKTLVYYRGRAPHGSRTDWVMHEYRLDERECETDTGLQ-----
Sb023690_Sorbi1 TGKDRRI-NYQNRSIGMKKTLVYYKGRAPQGLRTNWVMHEYRIEESECENTMGIQ-----
                ***** :        *::****:*:**** * **:*******:    ..    :      

AT1G54330.1     -----------ESYALCRVFKKN-------IQIPKRKGEEEE------------------
Sb006365_Sorbi1 LHGLCIDHVHEDTYALCRVFKKN-------AICTEVDGLQAQCSMALLEGACQQLLTSAS
Sb021119_Sorbi1 -HGAC-NFI--GAYALCRVIKRHELQGGEPPAGSRAKGAAASSSSGSARGQMSKVSSSSS
Sb002685_Sorbi1 -----------DAYALCRVFKKT-------APGPKI--IEHY---GAVHHPIEQPQWMAS
Sb023690_Sorbi1 -----------DSYALCRVFKKN-------VALGE---FQKQ-----KQGECSSSQANEK
                            :******:*:            .                         

AT1G54330.1     --------------------------------------------AEEESTSVG---KEEE
Sb006365_Sorbi1 ---QEYQT------------PSPDV--------------------PVGSTSGG---ADDD
Sb021119_Sorbi1 LVTSEQLSASFTPSNSNSPPPTLDV-----------GMFQF--QSPVGVGYAGVTATATT
Sb002685_Sorbi1 ---SVDRS------------PTLDLSSDVRGDDFESSSFSFPTEAPMDSMHGGFGMQMSA
Sb023690_Sorbi1 ---QEQFT------------SVRD----------------------AGQSSG-----SNE
                                                                            

AT1G54330.1     EEKEKKWRKC-----------DGNYIEDESLKRASAETSS-SELTQGVLLDEANSSSIFA
Sb006365_Sorbi1 ADKDESWMQ---------------FISDDA------------------------------
Sb021119_Sorbi1 GTGGLPWSPLPPPLLLSSSPHDTFFIGDDFPATAADESRSHAHLFGGDIMGLGSIS----
Sb002685_Sorbi1 PHEDGKWMQ---------------FLSEDAFNA-----------TNPFFMNPASSS----
Sb023690_Sorbi1 HGKDNTWMQ---------------FIADDL------------------------------
                      *                 :: ::                               

AT1G54330.1     LHFSSSLLDDHDHLF--SNYSHQLPYHPPLQLQDFPQ----------LSMNEAEIMSIQQ
Sb006365_Sorbi1 ------------------------------------------------------------
Sb021119_Sorbi1 --------------------EHELKW------DSFPN-----------------------
Sb002685_Sorbi1 ---FSCLPSKVDVALECARLQHRLSL-PPLEVEDFPQDVSLDTKTSVLRSNPNEV-DILQ
Sb023690_Sorbi1 ------------------------------------------------------------
                                                                            

AT1G54330.1     DFQ---------------------------------------------------------
Sb006365_Sorbi1 ------------------------W-----------------------------------
Sb021119_Sorbi1 ----------------TFSSGADTWNTAAVAASPT-------------------------
Sb002685_Sorbi1 EFLSVASASQELINGTSSSYAAEMWPGAGPSSTSTHYINELSSLVELGVKAKEEADNFYH
Sb023690_Sorbi1 ------------------------W-----------------------------------
                                                                            

AT1G54330.1     --CRDSMNG------TLDE-----------------------------------------
Sb006365_Sorbi1 --CSSTADG-------------------------------------------------AE
Sb021119_Sorbi1 MLCRQASDG-----------------------------IEDLAA----------------
Sb002685_Sorbi1 MDCIGTSVGFASKPVHVDEPVRLVEIADMEEFKEEKRQVENLRGVRLHNNDLGEIVVEGD
Sb023690_Sorbi1 --CNKTK-----------------------------------------------------
                  *  :                                                      

AT1G54330.1     ---------------------------------------IFSSSAT--------------
Sb006365_Sorbi1 ES--TSCV----------------------------------------------------
Sb021119_Sorbi1 ---------------------------------------IF-------------------
Sb002685_Sorbi1 ESNPTDCITQYPISDAADNSGEAGHLTDPTNAGGLDTTPIFSQSQPDDFAIGFSDDVNPN
Sb023690_Sorbi1 ------------------------------------------------------------
                                                                            

AT1G54330.1     -------------------------------------------------------FPASL
Sb006365_Sorbi1 ------------------------------------------------------------
Sb021119_Sorbi1 -------------------------------------------------------FPDDN
Sb002685_Sorbi1 ASFDLYEKVDVKHGLFVSTVGAPKTFFHHVEPSKKVSFHLNPVASDVSKAIEKFHFPISV
Sb023690_Sorbi1 ------------------------------------------------------------
                                                                            

AT1G54330.1     ------------------------------------------------------------
Sb006365_Sorbi1 ------------------------------------------ALAS--------------
Sb021119_Sorbi1 -------------------------------------------------RIVF-------
Sb002685_Sorbi1 TTKVSGSSISIFSKLKALIRDKFLVKKLPSLSYQRSLSSKETAAASELLQIVSSLLLTPM
Sb023690_Sorbi1 ------------------------------------------------------------
                                                                            

AT1G54330.1     ------------------------------------------------------------
Sb006365_Sorbi1 ------------------------------------------------------------
Sb021119_Sorbi1 ------------------------------------------------------------
Sb002685_Sorbi1 EVTGPTTMTTEQELVKKAKKVMKPGPGCDGSHAWLLPFSKRSKGISSMFFSGKWAFLTSA
Sb023690_Sorbi1 ------------------------------------------------------------
                                                                            

AT1G54330.1     ----------
Sb006365_Sorbi1 ----------
Sb021119_Sorbi1 ----------
Sb002685_Sorbi1 LAIRTPGCNH
Sb023690_Sorbi1 ----------
                          


BoxShade v3.31 C (beta, 970507) Output
AT1G54330.1     - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - M A P M S L P P G F R F H P T D E E L V A Y Y L D R K V N G Q
Sb006365_Sorbi1    - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - M A P V G L P P G F R F H P T D E E L V N Y Y L K R K I H G L
Sb021119_Sorbi1    - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - M G T M T L P P G F R F H P T D D E L V G Y Y L K R K V D N L
Sb002685_Sorbi1    - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - M A P V S L P P G F R F H P T D E E L I I Y Y L K R K I N G R
Sb023690_Sorbi1    E H S G R Q Q K G K T K G K D R E R S A R K E A A S W E A M A P A D L P P G F R F H P T D E E L V N Y Y L K R K V H G L
 
AT1G54330.1     A I E L E I I P E V D L Y K C E P W D L P E K S F L P G N D M E W Y F Y S T R D K K Y P N G S R T N R A T R A G Y W K A
Sb006365_Sorbi1    K I E L D I I P E V D L Y K C E P W E L A D K S F L P S R D P E W Y F F G P R D R K Y P N G F R T N R A T R A G Y W K S
Sb021119_Sorbi1    K I E L E V I P V I D L Y K S E P W E L P E K S F L P K R D L E W F F F C P R D R K Y P N G S R T N R A T T T G Y W K A
Sb002685_Sorbi1    Q I E L E I I P E V D L Y K C E P W D L P E K S F L P S K D L E W Y F F S P R D R K Y P N G S R T N R A T K S G Y W K A
Sb023690_Sorbi1    S I E L D I I P E V D L Y K C E P W E L A E K S F L P S R D S E W Y F F G P R D R K Y P N G C R T N R A T Q A G Y W K S
 
AT1G54330.1     T G K D R T V - E S K K M K M G M K K T L V Y Y R G R A P H G L R T N W V M H E Y R L T H A P S S S - - - L K - - - - -
Sb006365_Sorbi1    T G K D R R V L H H A G R P I G M K K T L V Y Y R G R A P Q G V R T D W V M H E Y R L D D K D A E D T L P I Q I S R H D
Sb021119_Sorbi1    T G K D R R I - A C D G G V Y G L R K T L V F Y R G R A P G G E R T D W V M H E Y R L - - - - C Q D - - - I A - - - - -
Sb002685_Sorbi1    T G K D R K V - N S H R R A V G M K K T L V Y Y R G R A P H G S R T D W V M H E Y R L D E R E C E T D T G L Q - - - - -
Sb023690_Sorbi1    T G K D R R I - N Y Q N R S I G M K K T L V Y Y K G R A P Q G L R T N W V M H E Y R I E E S E C E N T M G I Q - - - - -
 
AT1G54330.1     - - - - - - - - - - - E S Y A L C R V F K K N - - - - - - - I Q I P K R K G E E E E - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Sb006365_Sorbi1    L H G L C I D H V H E D T Y A L C R V F K K N - - - - - - - A I C T E V D G L Q A Q C S M A L L E G A C Q Q L L T S A S
Sb021119_Sorbi1    - H G A C - N F I - - G A Y A L C R V I K R H E L Q G G E P P A G S R A K G A A A S S S S G S A R G Q M S K V S S S S S
Sb002685_Sorbi1    - - - - - - - - - - - D A Y A L C R V F K K T - - - - - - - A P G P K I - - I E H Y - - - G A V H H P I E Q P Q W M A S
Sb023690_Sorbi1    - - - - - - - - - - - D S Y A L C R V F K K N - - - - - - - V A L G E - - - F Q K Q - - - - - K Q G E C S S S Q A N E K
 
AT1G54330.1     - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - A E E E S T S V G - - - K E E E
Sb006365_Sorbi1    - - - Q E Y Q T - - - - - - - - - - - - P S P D V - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - P V G S T S G G - - - A D D D
Sb021119_Sorbi1    L V T S E Q L S A S F T P S N S N S P P P T L D V - - - - - - - - - - - G M F Q F - - Q S P V G V G Y A G V T A T A T T
Sb002685_Sorbi1    - - - S V D R S - - - - - - - - - - - - P T L D L S S D V R G D D F E S S S F S F P T E A P M D S M H G G F G M Q M S A
Sb023690_Sorbi1    - - - Q E Q F T - - - - - - - - - - - - S V R D - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - A G Q S S G - - - - - S N E
 
AT1G54330.1     E E K E K K W R K C - - - - - - - - - - - D G N Y I E D E S L K R A S A E T S S - S E L T Q G V L L D E A N S S S I F A
Sb006365_Sorbi1    A D K D E S W M Q - - - - - - - - - - - - - - - F I S D D A - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Sb021119_Sorbi1    G T G G L P W S P L P P P L L L S S S P H D T F F I G D D F P A T A A D E S R S H A H L F G G D I M G L G S I S - - - -
Sb002685_Sorbi1    P H E D G K W M Q - - - - - - - - - - - - - - - F L S E D A F N A - - - - - - - - - - - T N P F F M N P A S S S - - - -
Sb023690_Sorbi1    H G K D N T W M Q - - - - - - - - - - - - - - - F I A D D L - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
 
AT1G54330.1     L H F S S S L L D D H D H L F - - S N Y S H Q L P Y H P P L Q L Q D F P Q - - - - - - - - - - L S M N E A E I M S I Q Q
Sb006365_Sorbi1    - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Sb021119_Sorbi1    - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - E H E L K W - - - - - - D S F P N - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Sb002685_Sorbi1    - - - F S C L P S K V D V A L E C A R L Q H R L S L - P P L E V E D F P Q D V S L D T K T S V L R S N P N E V - D I L Q
Sb023690_Sorbi1    - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
 
AT1G54330.1     D F Q - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Sb006365_Sorbi1    - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - W - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Sb021119_Sorbi1    - - - - - - - - - - - - - - - - T F S S G A D T W N T A A V A A S P T - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Sb002685_Sorbi1    E F L S V A S A S Q E L I N G T S S S Y A A E M W P G A G P S S T S T H Y I N E L S S L V E L G V K A K E E A D N F Y H
Sb023690_Sorbi1    - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - W - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
 
AT1G54330.1     - - C R D S M N G - - - - - - T L D E - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Sb006365_Sorbi1    - - C S S T A D G - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - A E
Sb021119_Sorbi1    M L C R Q A S D G - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - I E D L A A - - - - - - - - - - - - - - - -
Sb002685_Sorbi1    M D C I G T S V G F A S K P V H V D E P V R L V E I A D M E E F K E E K R Q V E N L R G V R L H N N D L G E I V V E G D
Sb023690_Sorbi1    - - C N K T K - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
 
AT1G54330.1     - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - I F S S S A T - - - - - - - - - - - - - -
Sb006365_Sorbi1    E S - - T S C V - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Sb021119_Sorbi1    - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - I F - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Sb002685_Sorbi1    E S N P T D C I T Q Y P I S D A A D N S G E A G H L T D P T N A G G L D T T P I F S Q S Q P D D F A I G F S D D V N P N
Sb023690_Sorbi1    - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
 
AT1G54330.1     - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - F P A S L
Sb006365_Sorbi1    - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Sb021119_Sorbi1    - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - F P D D N
Sb002685_Sorbi1    A S F D L Y E K V D V K H G L F V S T V G A P K T F F H H V E P S K K V S F H L N P V A S D V S K A I E K F H F P I S V
Sb023690_Sorbi1    - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
 
AT1G54330.1     - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Sb006365_Sorbi1    - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - A L A S - - - - - - - - - - - - - -
Sb021119_Sorbi1    - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - R I V F - - - - - - -
Sb002685_Sorbi1    T T K V S G S S I S I F S K L K A L I R D K F L V K K L P S L S Y Q R S L S S K E T A A A S E L L Q I V S S L L L T P M
Sb023690_Sorbi1    - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
 
AT1G54330.1     - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Sb006365_Sorbi1    - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Sb021119_Sorbi1    - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Sb002685_Sorbi1    E V T G P T T M T T E Q E L V K K A K K V M K P G P G C D G S H A W L L P F S K R S K G I S S M F F S G K W A F L T S A
Sb023690_Sorbi1    - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
 
AT1G54330.1     - - - - - - - - - -
Sb006365_Sorbi1    - - - - - - - - - -
Sb021119_Sorbi1    - - - - - - - - - -
Sb002685_Sorbi1    L A I R T P G C N H
Sb023690_Sorbi1    - - - - - - - - - -
 
0