Input
| Putative repression domain
|
|
AT1G56170.1 |
not found |
|
Ortholog
| Putative repression domain
| Reverse top hit
| Relation
| Blast score ratio
| Type
|
Os025982 |
not found in 250aa |
AT1G56170.2 |
not_not |
0.626229508 |
III |
Os031976 |
not found in 205aa |
AT1G56170.2 |
not_not |
0.570491803 |
III |
Os012186 |
not found in 246aa |
AT5G63470.2 |
not_not |
0.560655737 |
III |
Os034147 |
not found in 136aa |
AT1G56170.2 |
not_not |
0.547540983 |
III |
Os030536 |
not found in 249aa |
AT1G56170.2 |
not_not |
0.481967213 |
III |
Sb004169 |
not found in 255aa |
AT1G56170.2 |
not_not |
0.655737704 |
III |
Sb021895 |
not found in 749aa |
AT5G63470.2 |
not_not |
0.560655737 |
III |
Sb031239 |
not found in 365aa |
AT5G63470.2 |
not_not |
0.560655737 |
III |
Sb023436 |
not found in 328aa |
AT1G08970.2 |
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0.554098360 |
III |
Sb030598 |
not found in 231aa |
AT1G56170.2 |
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0.409836065 |
III |
Gm027778 |
not found in 237aa |
AT1G08970.2 |
not_not |
0.596721311 |
III |
Gm053118 |
not found in 294aa |
AT1G08970.2 |
not_not |
0.593442622 |
III |
Gm008069 |
not found in 303aa |
AT1G08970.2 |
not_not |
0.593442622 |
III |
Gm055597 |
not found in 263aa |
AT1G08970.2 |
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0.590163934 |
III |
Gm015491 |
not found in 229aa |
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0.583606557 |
III |
Gm010282 |
not found in 225aa |
AT3G48590.1 |
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0.580327868 |
III |
Gm010283 |
not found in 222aa |
AT3G48590.1 |
not_not |
0.580327868 |
III |
Gm021377 |
not found in 205aa |
AT1G08970.2 |
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0.475409836 |
III |
Gm036665 |
not found in 209aa |
AT1G08970.2 |
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0.462295081 |
III |
Gm036664 |
not found in 243aa |
AT1G54830.3 |
not_not |
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III |
Pt036437 |
not found in 258aa |
AT1G56170.2 |
not_not |
0.698360655 |
III |
Pt042230 |
not found in 226aa |
AT1G08970.2 |
not_not |
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III |
Pt034313 |
not found in 258aa |
AT1G08970.2 |
not_not |
0.613114754 |
III |
Pt022933 |
not found in 237aa |
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III |
Pt027792 |
not found in 248aa |
AT3G48590.1 |
not_not |
0.596721311 |
III |
Pt014120 |
not found in 236aa |
AT1G08970.2 |
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III |
Pt001546 |
not found in 247aa |
AT1G08970.2 |
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III |
Pp015077 |
not found in 321aa |
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III |
Pp013245 |
not found in 194aa |
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III |
Pp013244 |
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III |
Pp013246 |
not found in 185aa |
AT3G48590.1 |
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III |
Pp013243 |
not found in 230aa |
AT3G48590.1 |
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III |
Pp036540 |
not found in 174aa |
AT1G56170.2 |
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III |
Pp036539 |
not found in 174aa |
AT1G56170.2 |
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III |
Pp036538 |
not found in 231aa |
AT1G56170.2 |
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III |
Pp005480 |
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AT1G56170.2 |
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III |
Pp005481 |
not found in 260aa |
AT1G56170.2 |
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III |
Pp005616 |
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AT1G54830.3 |
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III |
Pp005482 |
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AT1G56170.2 |
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0.534426229 |
III |
Sm020043 |
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AT1G56170.2 |
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III |
Sm021821 |
not found in 94aa |
AT5G63470.2 |
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0.514754098 |
III |
Get sequence file
Get alignment file
Get formatted file made by BOXSHADE
Sequence file prepared (1 sec required). Alignment has started.
CLUSTAL format alignment by MAFFT FFT-NS-2 (v7.475)
AT1G56170.1 ------------------------------------------------------------
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Os031976_Os08t0 ------------------------------------------------------------
pp015077_Pp1s51 ------------------------------------------------------------
gm036664_Glyma1 ------------------------------------------------------------
gm053118_Glyma1 MSRNRSHSFCSRTSLSEVLDSQCLRSAASSFGE---------------------------
pp013243_Pp1s15 ------------------------------------------------------------
gm027778_Glyma1 ------------------------------------------------------------
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Os034147_Os09t0 ------------------------------------------------------------
pp013246_Pp1s15 ------------------------------------------------------------
pp005481_Pp1s37 ------------------------------------------------------------
pp005480_Pp1s37 ------------------------------------------------------------
pp013245_Pp1s15 ------------------------------------------------------------
pt027792_POPTR_ ------------------------------------------------------------
Sb030598_Sorbi1 ----------GPLPPSSGCTLKCI------------------------------------
pp036540_Pp1s31 ------------------------------------------------------------
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Sm021821_Selmo1 ------------------------------------------------------------
pt022933_POPTR_ ------------------------------------------------------------
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gm008069_Glyma0 MRRNRSHSFCSSTSLSEVLDSQCLRSAASSFREEKDTLVSFSHGACVILEHCIRGPFFIP
pp005482_Pp1s37 ------------------------------------------------------------
Sb031239_Sorbi1 ------------------------------IRS---------------------------
Os012186_Os03t0 ------------------------------------------------------------
Os025982_Os06t0 ------------------------------------------------------------
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AT1G56170.1 ------MEQSE--------EG----QQQQQQGVMDYVPPHAY------------QSGPVN
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pt034313_POPTR_ ------MDQ----------------QGHGQPPTVGMIGRTAPVPYGMASYQPNQMMGPSA
Sm020043_Selmo1 ------------------------------------------------------------
pt001546_POPTR_ ------MDGQ----------------P----PA--IVSSTSQLQY---------GTSPYQ
Sb021895_Sorbi1 ------LGARR------RRREASGAAMACSKPCLS------------------FLAEAAA
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gm010282_Glyma0 ------MEN-N----------Q--QQGAQAQS----------------------GPYP-G
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Os030536_Os08t0 ------MDPHS--------------HKKAHEGLIGDNPDAYAVTT----YQPVLMVEPSA
Sb004169_Sorbi1 ------ME-----------------PSSQPQPAMGVAPGGSQV-------YPASAYPPAA
Os031976_Os08t0 ------MEPKS--------TTP---PPPPPPPVLG-----APVPYPPAGAYPP-PVGPYA
pp015077_Pp1s51 ------MENHQ--------QLA--QQQAQQQQQQDVQQQQQQ------------QQHQQQ
gm036664_Glyma1 ------MDQNQ---HDRLAQEA----QYQSNPMMA----------------P--TILPTQ
gm053118_Glyma1 ---GNKMDHQ----------------GHSQNPSMGVVGSGAQLAY---------GSNPYQ
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gm027778_Glyma1 ------MDHQG--------HG----HGHGQNPSMGVVGNGPQFPY---------GSNPYQ
pp013244_Pp1s15 -------------------------MAAQQHPHIP----------------------PSS
Os034147_Os09t0 ------------------------------------------------------------
pp013246_Pp1s15 ------------------------------------------------------------
pp005481_Pp1s37 ------MRALAGSFNREFAGAE--VWRESLAAAVAMASNQHGLASLS-------SAKPQS
pp005480_Pp1s37 ------MRALAGSFNREFAGAE--VWRESLAAAVAMASNQHGLASLS-------SAKPQS
pp013245_Pp1s15 ------------------------------------------------------------
pt027792_POPTR_ ------MD--N----------T--TTNHQPQP----------------------TAYPTQ
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Sm021821_Selmo1 ------------------------------------------------------------
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pp036539_Pp1s31 ------------------------------------------------------------
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Sb031239_Sorbi1 ------LSPEH------PSNGA-------------------------------QIHHPSP
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Sb023436_Sorbi1 ------SAPNP------PPRLATGHNPSCPRIHGSQ-----------------QIQHPSA
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pp005616_Pp1s15 TA-QM---SPHAAPTIRLQQQM-----------------------------HYPN-HA--
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Sm020043_Selmo1 ------------------------------------------------------------
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pp015077_Pp1s51 TMNNM---MAQQQPQMQYSQNMGMQQSYQGPQSLGGGPETSPSQGGQIQ-GQSPG-AY--
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pp013244_Pp1s15 AP-QM---S-HPGAVMPL--QM-----------------------------HYPQ-AQ--
Os034147_Os09t0 ------------------------------------------------------------
pp013246_Pp1s15 ------------------------------------------------------------
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Sb030598_Sorbi1 SA---------------------------------------VSEG-VTNGDAIPS----D
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Sm021821_Selmo1 ------------------------------------------------------------
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pt036437_POPTR_ TA-PM---VASGTPSIAIPSPT-----------------------------QSPA-TF-S
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gm036665_Glyma1 TSDSS---LSSSYPRQH---------------------------------PNDPQ-----
pt042230_POPTR_ TG-SL---QSPTQPAVLTASSA-------------------------------------H
pp036539_Pp1s31 ------------------------------------------------------------
gm008069_Glyma0 PG-QI---TGP--PGSVVTSVG------------------------TIQSTGQPA-GA-Q
pp005482_Pp1s37 SA------------------------------------------G-----ATTTAQQSFQ
Sb031239_Sorbi1 ASGHG---RARRVPS-----------------------------------A--PRRRV--
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Sb030598_Sorbi1 FQDDAPVIQPPLSHHHQVASQSQQDDHCHCQQPLQAFWSGQLAEIKQ-------------
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.* : * :
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.
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