Input
| Putative repression domain
|
|
AT1G66230.1 |
not found |
|
Ortholog
| Putative repression domain
| Reverse top hit
| Relation
| Blast score ratio
| Type
|
Sb023618 |
not found in 488aa |
AT4G22680.1 |
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III |
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not found in 287aa |
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III |
Sb016101 |
not found in 245aa |
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not_not |
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III |
Sb015849 |
not found in 356aa |
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III |
Sb031258 |
not found in 445aa |
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not_not |
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III |
Sb027621 |
not found in 432aa |
AT1G34670.1 |
not_not |
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III |
Sb010610 |
not found in 342aa |
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not_not |
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III |
Sb023923 |
not found in 508aa |
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III |
Sb023642 |
not found in 418aa |
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III |
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III |
Sb025078 |
not found in 599aa |
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0.415778251 |
III |
Sb032167 |
not found in 663aa |
AT1G09540.1 |
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III |
Sb016715 |
VVGGIDLNLSLSPPTS in 196/215 |
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III |
Sb018705 |
not found in 288aa |
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0.407249466 |
III |
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VPRCPDLNLDLCISPP in 216/452 |
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III |
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III |
Sb014116 |
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0.400852878 |
III |
Get sequence file
Get alignment file
Get formatted file made by BOXSHADE
Sequence file prepared (1 sec required). Alignment has started.
CLUSTAL format alignment by MAFFT FFT-NS-2 (v7.475)
AT1G66230.1 ------------------------------------------------------------
Sb031258_Sorbi1 ------------------EGAS------------LASYPVVA-------IDRSIEIGPVQ
Sb027621_Sorbi1 -------QEASRAKGGCRQVVS------------LLPNPTCT-------T-----LPPVP
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Sb025078_Sorbi1 ------------------------------------RIPCCS-------S--SCELCRLQ
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Sb023642_Sorbi1 VGDGNYREKERRQNGATRESSREDVPRAQILTFFFLPYLSFTHSLLRIFTYEANQIRIIQ
AT1G66230.1 ------------------MGR---QPCCDK-VGLKKGPWTAEE-----------------
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Sb018705_Sorbi1 ------------------RGRA--AP-----RRQQQGR-APEP----GQVLAV-------
Sb010610_Sorbi1 ------------------MGR---SPCCEKEAGLKKGPWTPEE-----------------
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Sb023923_Sorbi1 ------------------MGR---APCCEK-SGMKKGPWTPEE-----------------
Sb031046_Sorbi1 ---KEKNSAAGHFDRSYGHGRLIHSLHLEA-SEVEHAGPEPQEAVVAVAAAAAAPGGSFL
Sb023642_Sorbi1 ARCKKKNKKG---EITEGETR---SFHLEA-SEVEHGGPESEE----VAALAV---GALG
:. :
AT1G66230.1 DRKLINFILTNGQCCWRAVPKL--SGLL--------------------------------
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Sb027621_Sorbi1 DQKLMEYIQKHGHGSWRALPRL--AGLN--------------------------------
Sb032167_Sorbi1 DEKLMNHITKHGHGCWSSVPKL--AGLQ--------------------------------
Sb025078_Sorbi1 DEKLMNHITKHGHGCWSTVPKL--AGLQ--------------------------------
Sb016101_Sorbi1 DKKLISFILTHGRCCWRAVPKL--AGLL--------------------------------
Sb005865_Sorbi1 DQKLVTFLLTNGHCCWRAVPKL--AGLL--------------------------------
Sb014116_Sorbi1 DNKLLSYITQYGTRNWRLIPKN--AGLQ--------------------------------
Sb009095_Sorbi1 DQRLIAYIKAHGEGCWRSLPKA--AGLL--------------------------------
Sb016715_Sorbi1 DQRLVAYIKAHGEGCWRSLPKA--AGLL--------------------------------
Sb023618_Sorbi1 DRKLINFILTNGHCCWRAVPKL--AGLL--------------------------------
Sb018705_Sorbi1 DRR---------HEWW--------SGFF--------------------------------
Sb010610_Sorbi1 DQKLLAFIEQHGHGCWRSLPAK--AGLR--------------------------------
Sb015849_Sorbi1 DQKLLAFIEEHGHGSWRALPAK--AGLQ--------------------------------
Sb011138_Sorbi1 DKLLVDYIQTNGHGSWRLLPKL--AGLN--------------------------------
Sb023923_Sorbi1 DEKLIAYIKKHGQGNWRTLPKN--AGLA--------------------------------
Sb031046_Sorbi1 DAQAAAEAEAAAMAGLQHLPLDDDGGLEVQ--LLVFLLLARRADAEIEVEVGAPGHL---
Sb023642_Sorbi1 EAQAAAEAEPG-------LPLH---GLHRHHGLLLLARRRRRADAEVQVEVGALERLPLA
: *:
AT1G66230.1 ---------------RCGKSCRL-RWTNY-LRPD--------LKRGLLSDYEEK------
Sb031258_Sorbi1 ---------------RCGKSCRL-RWTNY-LRPD--------IKRGKFSQEEEQ------
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Sb016101_Sorbi1 ---------------RCGKSCRL-RWTNY-LRPD--------LKRGLLSTAEEQ------
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Sb016715_Sorbi1 ---------------RCGKSCRL-RWINY-LRPD--------LKRGNFTQEEDE------
Sb023618_Sorbi1 ---------------RCGKSCRL-RWTNY-LRPD--------LKRGLLTDAEEQ------
Sb018705_Sorbi1 ---------------QLGRGSH--GEVAV-LREG-------AHEQGRVDQGGGR------
Sb010610_Sorbi1 ---------------RCGKSCRL-RWTNY-LRPD--------IKRGKFTLQEEQ------
Sb015849_Sorbi1 ---------------RCGKSCRL-RWTNY-LRPD--------IKRGKFSLQEEQ------
Sb011138_Sorbi1 ---------------RCGKSCRL-RWTNY-LRPD--------IKRGPFTPEEQK------
Sb023923_Sorbi1 ---------------RCGKSCRL-RWTNY-LRPD--------IKRGRFSFEEEE------
Sb031046_Sorbi1 ---------------NDGRRHRLDRLMLWRLRCDGGV--------GFVGLERDGGDGAGA
Sb023642_Sorbi1 PVAGGVVVLMMIAADRGGRRRR--RLVVL-LQPEHGALILLTVTRGRRRLERDG--YVGR
. *: : *: *
AT1G66230.1 MVIDLHSQLGNRWSKIASHLPGRTDNEIKNHWNTHIKKKLRKMGID--------------
Sb031258_Sorbi1 TILHLHSVLGNKWSAIATHLPGRTDNEIKNFWNTHLKKRLIQMGFD--------------
Sb027621_Sorbi1 TILQLHSVLGNKWSAIAKHLPGRTDNEIKNFWNTHLKKKLIQMGFD--------------
Sb032167_Sorbi1 LIIELHAVLGNRWSQIAAQLPGRTDNEIKNLWNSCIKKKLRQKGID--------------
Sb025078_Sorbi1 LIIELHAVLGNRWSQIATRLPGRTDNEIKNLWNSSIKKKLRQKGID--------------
Sb016101_Sorbi1 LVIDLHAKLGNRYTKLHAKLPGRTDNEIKNHWNTHIKKKLIKMGLD--------------
Sb005865_Sorbi1 TVIDLHEQLGNRWSKIASQLPGRTDNEIKNHWNTHIKKKLRKMGID--------------
Sb014116_Sorbi1 TIIKLHSVVGNRWSVIAAQLPGRTDNDVKNHWNTKLKKKLSGMGID--------------
Sb009095_Sorbi1 IIIKLHALLGNKWSLIAGQLPGRTDNEIKNYWNTHIKRKLLSRGID--------------
Sb016715_Sorbi1 LIIKLHQILGNKWSLIAGRLPGRTDNEIKNYWNTHIKRKLIARGID--------------
Sb023618_Sorbi1 VVIDLHGKLGNRWSKIAAKLPGRTDNEIKNHWNTHIKKKLIKMGID--------------
Sb018705_Sorbi1 AAGGVHPGARGRVLALAAQGGG----------PAALRQEL-QAAVDELPPPGPQARQLHR
Sb010610_Sorbi1 TIIQLHALLGNRWSSIATHLPKRTDNEIKNYWNTHLKKRLAKMGID--------------
Sb015849_Sorbi1 TIIQLHALLGNRWSAIATHLPNRTDNEIKNYWNTHLKKRLAKMGID--------------
Sb011138_Sorbi1 SIVQLHAIVGNKWSMIAAQLPGRTDNEIKNYWNTHLKKQLRRMGLDE--PP---------
Sb023923_Sorbi1 TIIQLHSILGNKWSAIAARLPGRTDNEIKNYWNTHIRKRLLRMGID--------------
Sb031046_Sorbi1 GVGD--GAVRDGVDAPAKQLP--PDVRVPVVLDLVVRPPREPRGDE--------------
Sb023642_Sorbi1 VLVD--GAVCHRVDPPAQQLP--PDVRVPVVLDLVVRPSRQPSSDQ--------------
: :: . :
AT1G66230.1 -------PLTHKPLSIV-------------------------------------------
Sb031258_Sorbi1 -------PMTHRPRTDF-----------------------------FAALPQLI------
Sb027621_Sorbi1 -------PMTHRPRTDF-----------------------------FAALPQLI------
Sb032167_Sorbi1 -------PNTHKPLTEA-------------------------------------------
Sb025078_Sorbi1 -------PNTHKPLAEV-------------------------------------------
Sb016101_Sorbi1 -------PATHQPLS---------------------------------------------
Sb005865_Sorbi1 -------PVTHKPLH---------------------------------------------
Sb014116_Sorbi1 -------PVTHKSFSHL-----------------------------MAEI----------
Sb009095_Sorbi1 -------PQTHRP-----------------------------------------------
Sb016715_Sorbi1 -------PRTHQP-----------------------------------------------
Sb023618_Sorbi1 -------PVTHEPLD---------------------------------------------
Sb018705_Sorbi1 RRGRAHHPPAQPPRQQV--------------------VSD-R------------------
Sb010610_Sorbi1 -------PVTHKPRADLGASSGSAAGAGAG------------------------------
Sb015849_Sorbi1 -------PVTHK------SLSGTLTGTTNN------------------------------
Sb011138_Sorbi1 -----PGPAAGSPAA--------------------------R------------------
Sb023923_Sorbi1 -------PVTHAPRLDLLDLSALLKPAAAAYYPTQADLDTLRALEPLANYPDLLRLASTL
Sb031046_Sorbi1 ------RPLVAEEAVQL---------------------DD-----------EVVLVGG--
Sb023642_Sorbi1 ------GPFVAEEAVEL---------------------DD-----------ELVLLFR--
* .
AT1G66230.1 -------------EKEDEEPL---------KKLQNNTVPFQETMERPLENNIKNISRLEE
Sb031258_Sorbi1 ----ALAALRQHLQLGDQQ--------------QAAKLQYLQSLLQ--SAA--TTISS--
Sb027621_Sorbi1 ----ALANLR---QLVEQRPWDDHTARIQVEAVQAAKLQCLQNLLQ--SAA--SIATSPS
Sb032167_Sorbi1 ---------------------------------DRSGAAPTVSTERTSGSS---------
Sb025078_Sorbi1 ---------------------------------EHSKAAPTISTERTSESS---------
Sb016101_Sorbi1 ---------------------------------NSNATSSQSTVTD--ESAKSSDFREEL
Sb005865_Sorbi1 ---------------------------------QPASPPPPPPLTRQEQEEKDTGGSPEE
Sb014116_Sorbi1 ATTLAPPQVA-HLA-------------------EAALGCFKDEMLHLLTKKRPTDFPSPA
Sb009095_Sorbi1 LSGGAAA---------------------------GSGLTTSSTAGF--PAQ----APAPT
Sb016715_Sorbi1 ASAGAVA---------------------------PAPGAAASAA-----------APSSH
Sb023618_Sorbi1 ---------------------------------RK--TSSSPATTS--QSAKSDEATKQQ
Sb018705_Sorbi1 ---------------------------------RAAAGPDGQRDQELLEHAHQAQAPGPR
Sb010610_Sorbi1 ARYRAAAHLN-HTASWE-----------------SARLEAEARLAR--EAKLRAIVSPPP
Sb015849_Sorbi1 KSAKAAASLS-HMAQWE-----------------SARLEAEARLAR--ESKIRTATPTPT
Sb011138_Sorbi1 -----------HMAQW-----------------ETARLQAEARLSLLATASSSSGATATA
Sb023923_Sorbi1 LSSGPPAIGD-HHQNGQLLPW-----------ILQAQMAQQAAAAM--AQQ---VAPPPQ
Sb031046_Sorbi1 ---------------------------------EVAALEVGAEVVDPAEAA---------
Sb023642_Sorbi1 ---------------------------------EVAALEVGAEVVDPPEAA---------
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Sb031258_Sorbi1 ----------SDTEAPALGLGAIC------CSPPQ-------------------------
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Sb032167_Sorbi1 ------------------------------DVNPS--------------------SAGAL
Sb025078_Sorbi1 ------------------------------DVDPS--------------------SGGAL
Sb016101_Sorbi1 SLKDDS-----------------------HREVPL-------------------------
Sb005865_Sorbi1 EEEEEIVTA--------ITAGH---DASCTDEVPMALLLDDMDIVLPGDDVVGAQAAACV
Sb014116_Sorbi1 VPPDMATIAGGSGAG-ALGAPPC-----GFPAPPQ------------TDDTI--------
Sb009095_Sorbi1 RPA-----------------------------RPV-------------------------
Sb016715_Sorbi1 RQHG--------------------------DDKAA-------------------------
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Sb010610_Sorbi1 APAPGPGTGPAFISG---------------LESPT-------------------------
Sb015849_Sorbi1 ALHAQPTNVPASAASPCLDVLHGWQGAKIDLESPT-------------------------
Sb011138_Sorbi1 TTAAATTSASSSST---VDLKAC-------CAKPADIFL---------------------
Sb023923_Sorbi1 QQAEQFMQAGAACQMP--DLVHM-------NSNPT-------------------------
Sb031046_Sorbi1 ----------------ALAAAHQ--SGRLGQRPPAPFAV--------RADVRH-------
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.
AT1G66230.1 ET----ESLDLICSNSTM------------------SSSTSTSS-----------HSSND
Sb031258_Sorbi1 --------LTTTPLDSCTAPVSSS-----------LLPCTFPEA-APP-------VSSEE
Sb027621_Sorbi1 ------SSLSTLPSPSFLESISGQDIAAAGQLPDIQIPSSFFEQ-QP-----------TS
Sb032167_Sorbi1 GNLS--HLLSETAQSSMLMPMYDK-----NR---TETPNLARPKVPPKELFLEQLTAGHE
Sb025078_Sorbi1 GNLS--HLLSETAQSPELLPVLGK-----HR---KETTSLAHLRVPPKELFLDQLVSGHE
Sb016101_Sorbi1 ------------STDSSE------------------QSSWPESS-----------TNGCD
Sb005865_Sorbi1 GTVYSPES----SSSSSSYSASAA----------ALSGGSSSSS-----------VDGEC
Sb014116_Sorbi1 ------ERIKLGLSRAIM----------------SEPGAPPGKQQQPP-WAPADVTEGLA
Sb009095_Sorbi1 ------IIIPPNVMFA------------------RPAPSEDGHS-----------SSGGS
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Sb023618_Sorbi1 PT----ES----STNTVS------------------TGGSSSSS-----------SGGHD
Sb018705_Sorbi1 --------------------------HGSRR--RRGAPPGGGAAAPPRGRRRRPGGPGQA
Sb010610_Sorbi1 ------STLSF-----------------------SESAQLFANA-PPH------DTHGT-
Sb015849_Sorbi1 ------STLTFTGSNSGMLPTPRT-----NRLEVSESNSVMWHQ-RSD------ELEGEE
Sb011138_Sorbi1 ------RLWSSDIGDS------------FRRSRKTAAAAPAVPALLPP----APVVVKRK
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Sb031046_Sorbi1 ------QAVVLLLGPRALVRVRLL---AARR--------------PPHR-----------
Sb023642_Sorbi1 ------EAVVLLLGPRALVGVRLL---AARR--------------PPHDGGVVVRSAGRA
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Sb031258_Sorbi1 DE------------ANNHQQQQTAGLSSSYGGLGSADDVFACHGG---------------
Sb027621_Sorbi1 ND------------ANQHSDFTPK--SSVEGENGTPKTLLL-------------------
Sb032167_Sorbi1 SPSTCRSSGQTLYFPFQQPLGYNSESGSG-----------------DGANMNSLWFNQS-
Sb025078_Sorbi1 NLTSCRSTGPIPNFPFQQLMCYNNEFGHK-----------------NGGSNNSFWFNQN-
Sb016101_Sorbi1 QDPE-----LLVNWPDLLM----------------DEPWLNFMSS--NDELGNVEGA---
Sb005865_Sorbi1 PDWL-----PMMDWP--------------------EPIW----------QLEDVVTA---
Sb014116_Sorbi1 GMYATYN-------PATHAQEEFRYDNGAV----PEYVLGGAGAGGDADQGTSMWSHQSM
Sb009095_Sorbi1 TD-----------APRCPDL--------------------------------NLDLDLS-
Sb016715_Sorbi1 V-------------PHQHQLVV-----------------------------GGIDLNLS-
Sb023618_Sorbi1 QDP-------LVKW--LLEEEPPT----------GDEPWLNFSGSVDVDEFSSIAAGPE-
Sb018705_Sorbi1 PRREAGARGVVIRRRRQQQHRQQRRRQRR-------------------------------
Sb010610_Sorbi1 ---------------PRHALTPPRSYEEAFGELQPQQQRFGDAAA-PGFVLAGVLLDSS-
Sb015849_Sorbi1 ND---------WQIFSKHQVLELDSKEREDDFIGCEEPWFSGMAG-VGSGFTSMLFDVS-
Sb011138_Sorbi1 QDAMM-------------------------------------------------------
Sb023923_Sorbi1 VDS--------LDVPALMQMVQAADASNL-------QQWSSTVTS---SSNNNNNNNNN-
Sb031046_Sorbi1 ------------------------------------------------------------
Sb023642_Sorbi1 PNQ---------------------------------------------------------
AT1G66230.1 -IENNMMSLW--EISDFSSLD------------------------------------LLL
Sb031258_Sorbi1 -----SSSSSLPPLTDLSDAHA----------------------------GSL---LQVD
Sb027621_Sorbi1 ------SENSLPPLTDFPISNL----------------------------G---------
Sb032167_Sorbi1 DFNCSTISTVMPPVSPSALSTSMGLNLPPDNPRHGGTGIGSTAVDSFYWDGT----NPSS
Sb025078_Sorbi1 ESSGSTISTVMPPVSPSTLSTSTGLNGSPDNPHSGGTGIQNT---QFYWETA----NPSS
Sb016101_Sorbi1 -LPWDGTTDWLLDYQDFGMCSS----------------------------NS------VD
Sb005865_Sorbi1 ------RTPW--EFED----------------------------------------PFVY
Sb014116_Sorbi1 YSGSSGTEAAPRPMAALPEKGNDSVGSS------GGGG------------GGGGD-EEAD
Sb009095_Sorbi1 -VGPPCSPP-KTPAAAVTTPTSQQQEM------------QRATICLCYHLGV--------
Sb016715_Sorbi1 -LSPPTSQP-SSPAAAN-------------------------------------------
Sb023618_Sorbi1 LLPWDGATDWLLDYQDFGLGDS----------------------------ATLVDGYMVN
Sb018705_Sorbi1 GATVPRPQPQPRPVRGLAAAGGGCRHAHLA--------------------------VPVL
Sb010610_Sorbi1 -VAGADQQRFAASSTDASVSVSEQQE----------------EEDKGYWSSIL---NMVN
Sb015849_Sorbi1 -NEHDASECWGESNNGHTEHSNQASD----------------EEDKNYWNGVL---DMVN
Sb011138_Sorbi1 -IKQEAQAPLLGPVGDDSSAASNETEVA-----------EALEEYQMFLDFAGEELGLFH
Sb023923_Sorbi1 -VGSGVSTPSSSPVARLNHSTS--------------------TTTTTY------------
Sb031046_Sorbi1 ------------PASCLAFRFRFGYRF---------------------------------
Sb023642_Sorbi1 ------SDAATLPAAFLVLPFGSRRRFS--SP------------------------SSPL
AT1G66230.1 ND----ESS-------STFGL---------------F-----------------------
Sb031258_Sorbi1 GSMRSATAS-------SSFGG---------GSSCSPL-----------------P-WPEL
Sb027621_Sorbi1 ----DACGA-------SSCDG---------SS--IPF-----------------PSWPEL
Sb032167_Sorbi1 SSSTGSRGS-------NSMGFEPQSTSSILENSVFPWTNIGQEKDTRAHLVEELK-WPDL
Sb025078_Sorbi1 SSSRGSSGS-------NSLGFERQSTSSLLESSVFPWTDLTPDKNSQVHLEEELK-WPDL
Sb016101_Sorbi1 NSTFHASNG-------SNF-----------------------------------------
Sb005865_Sorbi1 QRIALFDHQ-------ETF-----------------------------------------
Sb014116_Sorbi1 DVKDGGKGG-------SDMSG-------LFGSDCVLWD------------------LPDE
Sb009095_Sorbi1 --RSGDACS-------CKTAA---------SPAGFRFL---------------RP-LEE-
Sb016715_Sorbi1 ------------------------------------------------------------
Sb023618_Sorbi1 NS----SNG-------AKL-----------------------------------------
Sb018705_Sorbi1 PPRPPRRGG-------VRLRG---------------------------------------
Sb010610_Sorbi1 SSMSSSSSS-------LTSDAVTDPAMYLPAAAAAEF-----------------------
Sb015849_Sorbi1 SELTPQSPP-------LV------------------------------------------
Sb011138_Sorbi1 GRHGGFSLF-------PPLDVLAE------ASLDTAFK----------------------
Sb023923_Sorbi1 ---GGASAS-------TSNDA---------AAAAALFN---------------MQ-LSEL
Sb031046_Sorbi1 ---AVWSGG-------RRLR-----RAGRGASSAIGLEN---------------------
Sb023642_Sorbi1 GCVAGGSGGWLLLLLLLRVRSRCEPRPKLG------------------------------
AT1G66230.1 ------------------------------------------------------------
Sb031258_Sorbi1 FFP--DDDP-----------------------------------------FITDFL----
Sb027621_Sorbi1 F-----DEQ-----------------------------------------FICEFV----
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Sb025078_Sorbi1 LHGTFTDTPATMQNLSQSLYEDVIKAESQFNIEGLCAAWSQNLQPQQHLQVVSDLYDKDL
Sb016101_Sorbi1 ------------------------------------------------------------
Sb005865_Sorbi1 ------------------------------------------------------------
Sb014116_Sorbi1 LTN----------------------------------------------HMV--------
Sb009095_Sorbi1 ----------------------------------------------------GQYI----
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Sb015849_Sorbi1 ------------------------------------------------------------
Sb011138_Sorbi1 ------------------------------------------------------------
Sb023923_Sorbi1 L-----D--------------------------------------------VSDYM----
Sb031046_Sorbi1 ------------------------------------------------------------
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Sb023923_Sorbi1 |
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Sb031046_Sorbi1 |
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Sb023642_Sorbi1 |
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AT1G66230.1 |
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Sb031258_Sorbi1 |
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Sb025078_Sorbi1 |
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Sb031046_Sorbi1 |
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