Input
| Putative repression domain
|
|
AT1G66230.1 |
not found |
|
Ortholog
| Putative repression domain
| Reverse top hit
| Relation
| Blast score ratio
| Type
|
Sb005866 |
not found in 311aa |
AT1G66230.1 |
1st_1st |
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Ia |
Sb023618 |
not found in 488aa |
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not_not |
0.541577825 |
III |
Sb005865 |
not found in 287aa |
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not_not |
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III |
Sb010896 |
not found in 164aa |
AT1G66230.1 |
not_1st |
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II |
Sb003360 |
not found in 298aa |
AT1G66230.1 |
not_1st |
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II |
Sb030835 |
not found in 380aa |
AT1G66230.1 |
not_1st |
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II |
Sb016101 |
not found in 245aa |
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III |
Sb015849 |
not found in 356aa |
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III |
Sb031258 |
not found in 445aa |
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III |
Sb027621 |
not found in 432aa |
AT1G34670.1 |
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III |
Sb010610 |
not found in 342aa |
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III |
Sb023923 |
not found in 508aa |
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III |
Sb023642 |
not found in 418aa |
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III |
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AT4G38620.1 |
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III |
Sb025078 |
not found in 599aa |
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III |
Sb032167 |
not found in 663aa |
AT1G09540.1 |
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VVGGIDLNLSLSPPTS in 196/215 |
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III |
Sb018705 |
not found in 288aa |
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0.407249466 |
III |
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III |
Sb011138 |
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AT3G61250.1 |
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III |
Sb014116 |
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AT5G56110.1 |
not_not |
0.400852878 |
III |
Get sequence file
Get alignment file
Get formatted file made by BOXSHADE
Sequence file prepared (0 sec required). Alignment has started.
CLUSTAL format alignment by MAFFT FFT-NS-2 (v7.475)
AT1G66230.1 --------------------------------------------------MGR-------
Sb023642_Sorbi1 VGDGNYREKERRQNG--------------------------ATRESSREDVPRAQILTFF
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Sb016101_Sorbi1 ------------------------------------------------------------
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Sb015849_Sorbi1 -SPCCEK-IGL-KKGPWTPEEDQK-LLAFIEEHGHGSWRALPAKAGLQRCGKSCR-----
Sb031046_Sorbi1 -LPYPNPT---------SQEPNQT-------KEKNSAAGHFDRSYGHGRLIHSLHLE---
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Sb018705_Sorbi1 -APEPGQVLAVDRRHEW--------------------W------SGFFQLGRGSHGEVAV
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Sb030835_Sorbi1 ----------------WTAEEDQK-LVSFILGNGQCCWRAVPKLAGLLRCGKSCR-----
Sb011138_Sorbi1 -APCCDSTKGL-KKGPWTPEEDKL-LVDYIQTNGHGSWRLLPKLAGLNRCGKSCR-----
Sb016101_Sorbi1 ------------MRGPWTAEEDKK-LISFILTHGRCCWRAVPKLAGLLRCGKSCR-----
* : . :
AT1G66230.1 LRWTNYLRPDLKR-------------GLLSDYEEKMV-----------IDLH---SQLGN
Sb023642_Sorbi1 ASEVEHGGPESEE----VAALAV---GALGEAQAAAEAEPG-------LPLH---GLHRH
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Sb031046_Sorbi1 ASEVEHAGPEPQEAVVAVAAAAAAPGGSFLDAQAAAEAEAAAMAGLQHLPLDDDGGLEVQ
Sb003360_Sorbi1 LRWTNYLRPDLKR-------------GLLSDDEERLV-----------IDLH---AQLGN
Sb018705_Sorbi1 LREGAH-----EQ-------------GRVDQGGGRAA-----------GGVH---PGARG
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Sb031258_Sorbi1 LRWTNYLRPDIKR-------------GKFSQEEEQTI-----------LHLH---SVLGN
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Sb005866_Sorbi1 LRWTNYLRPDVKR-------------GLLSSEEERTV-----------IDLH---EQLGN
Sb023618_Sorbi1 LRWTNYLRPDLKR-------------GLLTDAEEQVV-----------IDLH---GKLGN
Sb027621_Sorbi1 LRWTNYLRPDIKR-------------GKFTQEEEQTI-----------LQLH---SVLGN
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Sb014116_Sorbi1 LRWTNYLRPDLKH-------------GEFTDAEEQTI-----------IKLH---SVVGN
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Sb016101_Sorbi1 LRWTNYLRPDLKR-------------GLLSTAEEQLV-----------IDLH---AKLGN
: :. * . :.
AT1G66230.1 RWSKIASHLPGRTDNEIK------------------------NHWNTHIKKK--------
Sb023642_Sorbi1 HGLLLLARRRRRADAEVQVEVGALERLPLAPVAGGVVVLMMIAADRGGRRRR--RLVVL-
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Sb031046_Sorbi1 --LLVFLLLARRADAEIEVEVGAPGHL------------------NDGRRHRLDRLMLWR
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Sb023923_Sorbi1 KWSAIAARLPGRTDNEIK------------------------NYWNTHIRKR--------
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Sb027621_Sorbi1 KWSAIAKHLPGRTDNEIK------------------------NFWNTHLKKK--------
Sb016715_Sorbi1 KWSLIAGRLPGRTDNEIK------------------------NYWNTHIKRK--------
Sb014116_Sorbi1 RWSVIAAQLPGRTDNDVK------------------------NHWNTKLKKK--------
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Sb011138_Sorbi1 KWSMIAAQLPGRTDNEIK------------------------NYWNTHLKKQ--------
Sb016101_Sorbi1 RYTKLHAKLPGRTDNEIK------------------------NHWNTHIKKK--------
: ::.
AT1G66230.1 -------------------LRKMG----------------IDPL----------------
Sb023642_Sorbi1 LQPEHGALILLTVTRGRRRLERDG--YVGRVLVDGAVCHRVDPPAQQLPPDVRVPVVLDL
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Sb015849_Sorbi1 -------------------LAKMG----------------IDPV----------------
Sb031046_Sorbi1 LRCDGGV--------GFVGLERDGGDGAGAGVGDGAVRDGVDAPAKQLPPDVRVPVVLDL
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Sb018705_Sorbi1 -------------------L-QAA----------------VDELP---PPG---PQARQL
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Sb010610_Sorbi1 -------------------LAKMG----------------IDPV----------------
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* . .*
AT1G66230.1 ------THKPLS------------------------------------------------
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Sb023923_Sorbi1 ------THAPRLDLLDLSALLKPAAAAYYPTQADLDTLRALEPLANYPDLLRLASTLLSS
Sb005866_Sorbi1 ------THKPL-------------------------------------------------
Sb023618_Sorbi1 ------THEPL-------------------------------------------------
Sb027621_Sorbi1 ------THRPRTDFF---------------------------------------------
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Sb014116_Sorbi1 ------THKSFSHLM---------------------------------------------
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Sb011138_Sorbi1 ------PPGPAA------------------------------------------------
Sb016101_Sorbi1 ------THQPL-------------------------------------------------
.
AT1G66230.1 -----------------IVEKEDEEPLKK---LQNNTVPFQET-----------------
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Sb010896_Sorbi1 -----------------------AQPLAP-------------------------------
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Sb018705_Sorbi1 --------------PPRQQVVSDRRAAAGPDGQRDQELLEHAHQA----QAPGPRHRPAD
Sb032167_Sorbi1 --------------TERTSGSSDVNPSSAGALGNLSHLLSETAQS-SMLMPMYDKNRTET
Sb009095_Sorbi1 ----------------GAAAGSGLTTSSTAGFPAQAPAPTRPA-----RPVIIIPPNVMF
Sb005865_Sorbi1 -----------------------HQPASP---PPPPPLTRQEQE------------EKDT
Sb010610_Sorbi1 ----------------GAGAGARYRAAAH-------------------------LNHTAS
Sb025078_Sorbi1 --------------TERTSESSDVDPSSGGALGNLSHLLSETAQS-PELLPVLGKHRKET
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Sb023923_Sorbi1 GPPAIGDHHQNGQLLPWILQAQMAQQAAAAMAQQVAPPPQQQAEQFMQAGAACQMPDLVH
Sb005866_Sorbi1 -----------------------HQPAS------PPPLTRQEQ---------------DT
Sb023618_Sorbi1 -----------------------DRKTSS-----SPATTSQSAKS-----------DEAT
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Sb016715_Sorbi1 ----------------GAVAPAPGAAASAA-----APSSHRQHGD--DKAAAVVRSSGCS
Sb014116_Sorbi1 --------------------AEIATTLAP---PQVAHLAEAALGCFKDEMLHLLT-----
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Sb011138_Sorbi1 -----------------------GSPAAR---------------------------HMAQ
Sb016101_Sorbi1 --------------------------------SNSNATSSQSTVT-----------D-ES
AT1G66230.1 -MERPLENNIKNISRLEE---SLGDDQ-----------FME-------INLEYGVEDVPL
Sb023642_Sorbi1 -EVAALEVGAEVVDPPEAAALAAAQEA-------------------GGLG---QRAPATL
Sb010896_Sorbi1 ----PLTQQPRLVRFLQ-------------------------------------------
Sb015849_Sorbi1 WESARLEAEARLARESK-------------------------------------------
Sb031046_Sorbi1 -EVAALEVGAEVVDPAEAAALAAAHQS-------------------GRLG---QRPPAPF
Sb003360_Sorbi1 QEEEPQQQEQQAGKLMQEG--GAGED-----------------------------DVAPM
Sb018705_Sorbi1 APRARSQSRRRHGSRRRRGAPPGGGAA---------------------------------
Sb032167_Sorbi1 PNLARPKVPPKELFLEQL---TAGHES---------PSTC------RSSG---QTLYFPF
Sb009095_Sorbi1 ARPAP----------------SEDGHS--------------------SSG---GSTDAPR
Sb005865_Sorbi1 -GGSPEEEEEEE---IVTAI-TAGHDA-----------SC--------------TDEVPM
Sb010610_Sorbi1 WESARLEAEARLAREAK-------------------------------------------
Sb025078_Sorbi1 TSLAHLRVPPKELFLDQL---VSGHEN---------LTSC------RSTG---PIPNFPF
Sb031258_Sorbi1 -QAAKLQYLQSLLQSAATTISS-------------------------------SDTEAPA
Sb023923_Sorbi1 MNSNPTTVQQQLA--------AAHQDM--------AAAACHSMQPPNNTGYEVDSLDVPA
Sb005866_Sorbi1 GGGSPEKEEKEKEKAVVAATPSVGHET-----------FC--------------ADEVLM
Sb023618_Sorbi1 KQQSPEND----------------------------------------------------
Sb027621_Sorbi1 VQAAKLQCLQNLLQSAASIATSPSSSS-------------------INTNTIPSDLE--Q
Sb016715_Sorbi1 SRDS-----------------SGDDDS--------------------TSG---SSV--PH
Sb014116_Sorbi1 -KKRPTDFPSPAVPPDMATI-AGGSGA-------------------GALGAPPCGFPAPP
Sb030835_Sorbi1 -AAAPVTTPPPAATIAASRQELAGDDADGLLLSNSDPGFC--------------TDEVPM
Sb011138_Sorbi1 WETARLQAEARLSLLATASSSSGATATA--------------------------------
Sb016101_Sorbi1 AKSSDFREEL-----------SLKDDS---------------------------HREVPL
AT1G66230.1 IETES---------------------------LDLICS----------------------
Sb023642_Sorbi1 AVRLDV------------------------RHEAVVLL----------LGPRALVGVR--
Sb010896_Sorbi1 ------------------------------------------------------------
Sb015849_Sorbi1 --------------------------------IRTATP-----------TPTAL------
Sb031046_Sorbi1 AVRADV------------------------RHQAVVLL----------LGPRALVRVR--
Sb003360_Sorbi1 VQPHE----------------------------TIMAP------------PPPP------
Sb018705_Sorbi1 -------------------------------------------------APPRGRRRRP-
Sb032167_Sorbi1 QQPLGYNSESGSGDGANMNSLWFNQSDFNCSTISTVMP---------PVSPSAL------
Sb009095_Sorbi1 CPDL---------------------------NLDLDLS----------VGP---------
Sb005865_Sorbi1 ALLLD--------------------------DMDIVLPGDDVV------GAQ--------
Sb010610_Sorbi1 --------------------------------LRAIVS-----------PPPAP------
Sb025078_Sorbi1 QQLMCYNNEFGHKNGGSNNSFWFNQNESSGSTISTVMP---------PVSPSTL------
Sb031258_Sorbi1 L------------------------------GLGAICC-----------SPPQ-------
Sb023923_Sorbi1 L-------------------------------MQMVQA-ADASNLQQW-SSTVT------
Sb005866_Sorbi1 AHLLD----------------------------DIVLP------------PP--------
Sb023618_Sorbi1 ---------------------------------DVVVM-RDV--------PA--------
Sb027621_Sorbi1 I------------------------------GL----L-----------SPPQM------
Sb016715_Sorbi1 QHQLVV------------------------GGIDLNLS----------LSP---------
Sb014116_Sorbi1 QTDDTI------------------------ERIKLGLS-RAIMSEPG--APPGKQQQPPW
Sb030835_Sorbi1 MHPD-----------------------------EIMVP---VLGDQRLHTPPL-------
Sb011138_Sorbi1 ------------------------------------------------------------
Sb016101_Sorbi1 ------------------------------------------------------------
AT1G66230.1 -----------NSTMSSSTSTSSH--------------------------------SSND
Sb023642_Sorbi1 -----------LLAARRPPHDGGVVVRS-----------------------AGRAPNQSD
Sb010896_Sorbi1 ------------------------------------------------------------
Sb015849_Sorbi1 HAQ----------PTNVPASAASPCLDVLH--------------GWQGAKIDLESPTSTL
Sb031046_Sorbi1 -----------LLAARRPPHR---------------------------------------
Sb003360_Sorbi1 TTAASNCG-----SAAVSSASAGSASVV------------------------SPSCSSSS
Sb018705_Sorbi1 -----------GGPGQAPRREAGARGVV------------------------IRRRRQQQ
Sb032167_Sorbi1 STSMGLNL-----PPDNPRHGGTGIGSTAV------DSFYW----------DGTNPSSSS
Sb009095_Sorbi1 -------------PCSPPKTPAAA----------------------------VTTPTSQQ
Sb005865_Sorbi1 --AAACVG-----TVYSPESSSSS--------------------------------SSYS
Sb010610_Sorbi1 APG----------PGTGPAFISG-----------------------------LESPTSTL
Sb025078_Sorbi1 STSTGLNG-----SPDNPHSGGTGIQNT---------QFYW----------ETANPSSSS
Sb031258_Sorbi1 --LTTTPL-----DSCTAPVSSS------------------------------LLPCTFP
Sb023923_Sorbi1 SSSNNNNNNNNNVGSGVSTPSSSPVARL------------------------NHSTSTTT
Sb005866_Sorbi1 --ATSNSGLTNDTTASSPDSSSSSSSSS------------------------SSSPSSYS
Sb023618_Sorbi1 -------------DGCSPTESSTN--TV------------------------STGGSSSS
Sb027621_Sorbi1 SSLSTLPS-----PSFLESISGQDIAAA-------------------GQLPDIQIPSSFF
Sb016715_Sorbi1 -------------PTSQPSSPAAA----------------------------N-------
Sb014116_Sorbi1 APADVTEGLAGMYATYNPATHAQEEFRYDNGAV---PEYV---LGGAGAGGDADQGTSMW
Sb030835_Sorbi1 -------------PTFSPATAAAAAAAV------------------------STTPTTTT
Sb011138_Sorbi1 -------------TTAAATTSASSSSTVDLKACCAKPADIFLRLWSSDIGDSFRRSRKTA
Sb016101_Sorbi1 -------------STDSSEQSSWPE-------------------------------SSTN
AT1G66230.1 SS----------------------------------FLKDLQF-----------------
Sb023642_Sorbi1 AATLPAAFLVLPFGSRRRF-----------------------------------------
Sb010896_Sorbi1 -------------------------------------IESIERF----------------
Sb015849_Sorbi1 TFTGSNSGMLP-TPRTNRLEVSESNSVMWHQRSDELEGEENDWQIFSKHQVLELDSKERE
Sb031046_Sorbi1 ----PASCLAFRFRFGYRF-----------------------------------------
Sb003360_Sorbi1 ASAPAVT-----------------------------GVEATEW-----------------
Sb018705_Sorbi1 HRQQRRRQ-------------RRGATVPRPQ-----------------------------
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Sb023923_Sorbi1 |
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Sb005866_Sorbi1 |
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Sb023618_Sorbi1 |
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Sb027621_Sorbi1 |
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Sb016715_Sorbi1 |
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Sb014116_Sorbi1 |
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Sb030835_Sorbi1 |
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Sb011138_Sorbi1 |
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V |
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A |
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Sb016101_Sorbi1 |
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