|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Get sequence file Get alignment file Get formatted file made by BOXSHADE Sequence file prepared (0 sec required). Alignment has started. CLUSTAL format alignment by MAFFT FFT-NS-2 (v7.475) AT1G68510.1 -------------------------------------------------MRISCNG---- pt000765_POPTR_ -------------------------------------------------MRMSCNG---- Os000273_Os01t0 -------------------------------------------------MRMSCNG---- Sb032897_Sorbi1 -------------------------------------------------MRMSCNG---- Sb033188_Sorbi1 -------------------------------------------------MRLSCNG---- gm023557_Glyma0 MVSNIYPSFPQFYDHNLLFLSYFSASFKIVINFASFFLNSLRFSIGSSKMRMSCNG---- pt034504_POPTR_ ---------------------------------------------------MSCNG---- gm051216_Glyma1 -------------------------------------------------MRMSCNG---- pt000766_POPTR_ -------------------------------------------------MRMSCNG---- pt019114_POPTR_ -------------------------------------------------MRMSCNG---- pt042067_POPTR_ -------------------------------------------------MRMSCNG---- Sb021354_Sorbi1 ---------------------YRTQRNK--------------------EILGRCSAALFF gm035214_Glyma1 -------------------------------------------------MRMSCNG---- Sb007439_Sorbi1 -------------------------------------------------MRMSCNG---- *.. AT1G68510.1 ----------------CRVLRKG----------CNQDCTIRPCLQWIKSADSQAN----- pt000765_POPTR_ ----------------CRVLRKG----------CSENCSIRPCLQWIKSSESQAN----- Os000273_Os01t0 ----------------CRVLRKG----------CSDNCAIRPCLQWIRSPDAQAN----- Sb032897_Sorbi1 ----------------CRVLRKG----------CSDACTIRPCLQWIETPDAQAN----- Sb033188_Sorbi1 ----------------CRVLRKG----------CSDACTIRPCLQWIKSSDAQAN----- gm023557_Glyma0 ----------------CRVLRKG----------CSENCSIRPCLQWIKSPESQAN----- pt034504_POPTR_ ----------------CRVLRKG----------CNDNCTIRPCLQWIKSTDSQAN----- gm051216_Glyma1 ----------------CRVLRKG----------CSEDCSIRPCLQWIKNPESQAN----- pt000766_POPTR_ ----------------CRVLRKG----------CSENCSIRPCLQWIKSSESQAN----- pt019114_POPTR_ ----------------CRVLRKG----------CSENCSIRPCLQWIKSPESQAN----- pt042067_POPTR_ ----------------CRVLRKG----------CSDNCTIRPCLQWIKTPDSQAN----- Sb021354_Sorbi1 TEKERKNLGRSLFFVVCLLTRHGPKIVVRHVARCGELAISGRQLQ------AQADEARCG gm035214_Glyma1 ----------------CRVLRKG----------CSEDCSIRPCLQWIKNPESQAN----- Sb007439_Sorbi1 ----------------CRVLRKG----------CSDNCAIRPCLQWIRSPDAQGN----- * : *:* *.: . ** :*.: AT1G68510.1 -----ATLFLAKFYGRAGLLNLIESGP-DHLRPAIFRSLLYEACGRIVNP------VDGS pt000765_POPTR_ -----ATVFLAKFYGRAGLMNLINAGP-EHLRPAIFRSLLYEACGRIVNP------IYGS Os000273_Os01t0 -----ATVFLAKFYGRAGLINLITAGP-EHVRPAIFRSLLYEACGRMLNP------VYGS Sb032897_Sorbi1 -----ATVFLAKFYGRAGLLNLLAAAPDDAARPAVFRSLLYEACGRIVNP------VYGS Sb033188_Sorbi1 -----ATVFLAKFYGRAGLLNLIAAAPNDALRPAVFRSLLYEACGRIVNP------VYGA gm023557_Glyma0 -----ATVFLAKFYGRAGLMNLVNAGP-EHLRPAIFRSLLYEACGRIVNP------IYGS pt034504_POPTR_ -----ATLFLAKFYGRAGLINLIEAAP-QRLRPAIFSSLLYEACGRIVNP------VYGS gm051216_Glyma1 -----ATVFLAKFYGRAGLMNLINAGP-ESLRPAIFRSLLYEACGRIVNP------IYGS pt000766_POPTR_ -----ATVFLAKFYGRAGLMNLINAGP-EHLRPAIFRSLLYEACGRIVNP------IYGS pt019114_POPTR_ -----ATVFLAKFYGRAGLMNLINAGP-EHLRPAIFRSLLYEACGRIVNP------IYGS pt042067_POPTR_ -----ATLFLAKFYGRAGLVNLIEAGP-PKLRPAIFRSLLYEACGRIVNP------VYGS Sb021354_Sorbi1 AQAQPAVVVVARRFGL-----LLLPLPDERLQPE-----------RELQPNLLFLVVLIS gm035214_Glyma1 -----ATVFLAKFYGRAGLMNLINAGP-ENLRPAIFRSLLYEACGRIVNP------IYGS Sb007439_Sorbi1 -----ATVFLAKFYGRAGLINLITAGP-EHVRPAIFRSLLYEACGRMLNP------VYGS *.:.:*: :* *: . * :* * ::* : : AT1G68510.1 VGLMWSGNWAQCQAAVDAVLNGLPITHTPLPSASASH--------QIIPPH--------- pt000765_POPTR_ VGLMWSGSWQLCQAAVEAVLKGAPITPI--NSEAAVN--------GHGPPL--------- Os000273_Os01t0 VGLLWSGNWQLCQSAVESVLRGMPIAQPPP-SATA------------VPPL--------- Sb032897_Sorbi1 VGLLWSRQWHKCVDAVDAVLRGHPVVQVDAGSAAAA-----------APPLLGGGGAGAR Sb033188_Sorbi1 VGLLWSGTWHMCQAAVEAVLKGAPIVQV--SADDAA------------------------ gm023557_Glyma0 VGLLWSGSWQLCQAAVENVLKGAPITPI--TSEAAAS--------GRCPPL--------- pt034504_POPTR_ VGMLWSGNWAQCQAAVDAVLKGLPIISIP-SSDVPTP--------HLISSL--------- gm051216_Glyma1 VGLLWSGSWQLCQAAVEAILKGEPITPI--TSEAAAN--------GRAPPL--------- pt000766_POPTR_ VGLMWSGSWQLCQAAVEAVLKGAPITPI--NSEAAVN--------GHGPPL--------- pt019114_POPTR_ VGLMWSGSWPLCQAAVEAVLRGASITQI--NSETAAN--------AQGPPL--------- pt042067_POPTR_ VGMLWSGNWAQCQAAVDAVLKGSPIMSLPSSSEVPAP--------HLISSL--------- Sb021354_Sorbi1 V-LLGAADWWRM-----ALQLGLGLAHVGVGVGVGVGVRRRLHVGVLLRPLL------LR gm035214_Glyma1 VGLLWSGSWQLCQAAVEAVLKGEPITPI--TSEAAAN--------GRAPPL--------- Sb007439_Sorbi1 VGLLWSGNWQLCQAAVESVLRGMPIAQPPPLAATA------------VPPL--------- * :: : * : * : AT1G68510.1 ------RTYDIRHVAKDPTTGGDSSENLA------------TRVNANKSKTQTGRF---- pt000765_POPTR_ ------KVYDIRHVSKEENSAA-SNDA-------------------NRARTRC-RV---- Os000273_Os01t0 ------PTCDIRHVGARRGDVHGAAAGPV------------ADLHRLDISSRA-KF---- Sb032897_Sorbi1 SAAAPAAAYDIRHVVKDPDAAA------------------AADLLRVARGGRK-RF---- Sb033188_Sorbi1 -------AYDIRHVFPKSSSNKHSAGGGAPPPPAAVDAA--AQSKDDKHTHRQ-RLLHKV gm023557_Glyma0 ------KAYDIRHVFKDENSAAASNETQ-----------------HQRVKTRS-RV---- pt034504_POPTR_ ------NTYDIRHVSRDQNSPE-----------------------LNKVKSRT-RC---- gm051216_Glyma1 ------KAYDIRHVSKDENSA---NET-------------------PKAKTRS-RF---- pt000766_POPTR_ ------KVYDIRHVSKEENSAA-SNDA-------------------NRARTRC-R----- pt019114_POPTR_ ------KAYDIRHVSKDENSAA-SNDA-------------------NRVRTRC-R----- pt042067_POPTR_ ------NTYDIRHVPRDQDSPE-----------------------LTKAKNQT-RF---- Sb021354_Sorbi1 L-----QVVVVVVV---------AAGGLLVVPVVVLNDRLRLLLRLLSRPSRQ-RF--VV gm035214_Glyma1 ------KAYDIRHVSKDQNSA---NET-------------------PKTKTRS-RF---- Sb007439_Sorbi1 ------RSCDIRHVSRREAAGRGAGAGAVD-------AAGPGGLHRMANSSRG-QF---- : * : : AT1G68510.1 ---KR-------------------------------ESVNQ----------LG--ECSHD pt000765_POPTR_ ---RR-------------------VVKP-KASKRAC---------------FG---NGLA Os000273_Os01t0 ---KRPGGGAAAAHRSDHAAFELVFSKP--AAAMAVDVIRQAQ----------------- Sb032897_Sorbi1 ---KRAGS---------------------SSDASSEGKVKPLKPKAE----AGCNERASL Sb033188_Sorbi1 LVSKRT----------------SSSSPPSKTKKSKTTTTTTTQNNK-------------- gm023557_Glyma0 ---KR------------------PLAKP-KSTANQNNNINTKNTGTE----FGSDEPGLV pt034504_POPTR_ ---KR-----------------SIGTRP-SSLAEPTGRLNQ-----------G--ELGFE gm051216_Glyma1 ---NRT---------------GSTLIKP-KASK-------------------GT-PTGFV pt000766_POPTR_ ------------------------------------------------------------ pt019114_POPTR_ ------------------------------------------------------------ pt042067_POPTR_ ---KR-----------------SIATRP-NSQSEPTSRVNP-----------G--EWGFE Sb021354_Sorbi1 VASRRAPL--------------LVAAGLGGGARRRRGALASTRDAEEVCRGGGVRILGDM gm035214_Glyma1 ---KRT---------------SGTLIKP-KASK-------------------G---TGFV Sb007439_Sorbi1 ---KRSG-----AHRSGDSGIELVFSQPPSASSMLVD-IRQAQ----------------- AT1G68510.1 MWQLPSS----------------------------SATHGYGH----------------- pt000765_POPTR_ SI--AVD-TLSARD---------------ELTRCTSHESSVSHQS------------ELA Os000273_Os01t0 ----PLNWAPGAL----------------------SHE-SASHD---------------A Sb032897_Sorbi1 SPSPPLKRQEQEAE----EM----EPVPMVVELEHGEESAGSHDHHHLQLQQG------- Sb033188_Sorbi1 ----PHRAAASLAT----EHHNDDDDMLMMLVADHSCDEEQQHAAVRLASNTNFNSKSRR gm023557_Glyma0 ----ACDWTEEA------------------LNRSGSHDSTLSHQS------------EAA pt034504_POPTR_ ----PVR------------------------------ESWLGHLG------------NGD gm051216_Glyma1 PI-EPVE-PETA-------------------NRTTSHESGLSHLS------------EAA pt000766_POPTR_ --------------------------------------SSVSHQS------------ELA pt019114_POPTR_ --------------------------------------SRVLGES------------PIR pt042067_POPTR_ ----PVR------------------------------DSCLGHLG------------NRG Sb021354_Sorbi1 ADVEPAAAEHQRRCGGGVDLHDG-------LALEHGLDGGLARV-------------PLA gm035214_Glyma1 ----PVE-PEMA-------------------NRTASHESGLSHLS------------EAT Sb007439_Sorbi1 ----PLNWAPRQP----------------------SHEYSASHDD------------DGG AT1G68510.1 -----------FTLENVESRRE-APFNQSSPN------------LGFDDQVDIN------ pt000765_POPTR_ VL-DGDSKESDESMVSVETAEA-SLLFPPNPESKN------DCKAHDVASNGISG----- Os000273_Os01t0 APPESEG----HSNDTADTVDG-SHVSQSEP-EP----------RATSAATEVH------ Sb032897_Sorbi1 -----------SSEEDTDVEAA-SHVSQAEAEPP--------VSSHSQSQVLVAADQEEE Sb033188_Sorbi1 ASSDDDCDDRHSASASLDTEEAASHVSQAAAEEA---------EPQQDDQLAEAEQQ--P gm023557_Glyma0 NAVES------ESILSAETSI----LFRDEPESN----------PKRLDRTD-------- pt034504_POPTR_ SRIKDE-----DSILAAENVED-SLWSRVEPDQV----------FKFNGQSDDS------ gm051216_Glyma1 VMVEGESKES-ESDVSVETSN----LFHEEPESV----------AKTSDRTGESG----- pt000766_POPTR_ VL-DGDSKESDESM------------------------------AHDVASNGISG----- pt019114_POPTR_ VG-NG-------------------------------------------GRNEIAG----- pt042067_POPTR_ SYIKDE-----DSIFSVETVEG-SLWSQVEPDSF----------FKFNGQGDGS------ Sb021354_Sorbi1 GPEQAD-----GAVDRVDDAAA-RLVEEGAEDGRAEVVLGGWRRGQQVEQPRAAVEL-GE gm035214_Glyma1 AMVEGESKES-ESVVSMDTSN----LIHEEPEWV----------AKTSDGTGESG----- Sb007439_Sorbi1 AVRESD------SNASVDTVDV-SHVSQSEPAEP----------PRESHDERAA------ AT1G68510.1 -EVGLELRL-G------------------------------------------------- pt000765_POPTR_ LELGLDLTL-GL-----EPVSRAHHVVPVKKRRV---EAYG-SGDVDTCKMELRL----E Os000273_Os01t0 -DAGLDLTL-GLP----PPPPPVQKTEPADSDGGSQQQHDHRKEK----PVELGLAISTK Sb032897_Sorbi1 EEVGLELTL-GF-----EPVVRQQ-----------PRSSCCDRSGLSAASSLIGLRL--Q Sb033188_Sorbi1 PPMGLDLTL-GLLTSSAPP--------PIGCR-----QGGGSSAAVDEPAGVIGF----R gm023557_Glyma0 -DVGLELTL-GF-----EPVSGAQHVVPVKKRRI-DLKDFSGS----SCKMELGL----E pt034504_POPTR_ -DLSLELTL-AL-------VSE-------------------------------------- gm051216_Glyma1 NEIGLELTL-GF-----EPVSRVHHVVPMKKRKIIASKSYGDSAEKDSCKMELGL----E pt000766_POPTR_ LELGLDLTL-GL-----EPVSRAHHVVPVKKRRV---EAYG-SGDVDTCKMELRL----E pt019114_POPTR_ --LGLDLAL-GL-----EPVSRAHHVVPVKKRRI---EALG-SGDIDTCKMELGL----D pt042067_POPTR_ -DVRLDLTL-GL-------VSE-------------------------------------- Sb021354_Sorbi1 EDGGVGLRLRGL-----DPLQAGPDRARVAAALAQDAAAVAAHPHVSRSSSLLAIVGVWS gm035214_Glyma1 NEIGLELTL-GF-----EPVSRLHHVVPMKKRKIIELKSCGDSAEKDSCKMELGL----E Sb007439_Sorbi1 -EDGLDLTL-GL--------PLAHKVEPSDVD---DDQPCHRGGE----PM--------K : * * . AT1G68510.1 ------ pt000765_POPTR_ ------ Os000273_Os01t0 VAAQ-- Sb032897_Sorbi1 LPAA-- Sb033188_Sorbi1 FL---- gm023557_Glyma0 CSA--- pt034504_POPTR_ ------ gm051216_Glyma1 YPA--- pt000766_POPTR_ ------ pt019114_POPTR_ YAA--- pt042067_POPTR_ ------ Sb021354_Sorbi1 MMSFGR gm035214_Glyma1 YPA--- Sb007439_Sorbi1 NWAW--
|