Input
| Putative repression domain
|
|
AT1G73410.1 |
not found |
|
Ortholog
| Putative repression domain
| Reverse top hit
| Relation
| Blast score ratio
| Type
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Os014652 |
not found in 245aa |
AT1G17950.1 |
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II |
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II |
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III |
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AT1G73410.1 |
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II |
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III |
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III |
Get sequence file
Get alignment file
Get formatted file made by BOXSHADE
Sequence file prepared (0 sec required). Alignment has started.
CLUSTAL format alignment by MAFFT FFT-NS-2 (v7.475)
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Sb020348_Sorbi1 ------------------------------------------------------------
AT1G73410.1 ------------------------------------------------------------
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gm045477_Glyma1 ------------------------------------------------------------
pp036679_Pp1s91 GTSNSGSDVTPVACKVSTIPFQALGVMPSEEGHMWWMRS-EYNQEVKQSSDEDMEQGSM-
Sb020348_Sorbi1 ------------------------------------------------------------
AT1G73410.1 --------------------------MIMCSRGHWRPAEDEKLKDLVEQYGPHNWNAIAL
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Os001451_Os01t0 DEVVEETEE---------GGHGGGVQGKLCARGHWRPAEDAKLKDLVAQYGPQNWNLIAE
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gm010780_Glyma0 --MEDSSA----------G---EDTRT--CPRGHWRPAEDEKLRQLVEQYGAQNWNSIAE
pt002308_POPTR_ --MEESLA----------GNSSDDAKSTACPRGHWRPAEDDKLRQLVEQYGAQNWNSIAE
Sb012241_Sorbi1 --MPSSST----------TNTSDGAKSSSCPRGHWRPGEDEKLKQLVEKYGPQNWNSIAE
pt036337_POPTR_ ----------------------------MSSRGHWRLAEDEKLLELVEQYGPHNWNSIAE
Os014652_Os03t0 ----------------------------MCTRGHWRPSEDEKLKELVARYGPHNWNAIAE
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pt003784_POPTR_ ----------------------------MSTRGHWRPAEDEKLRKLVDQYGPHNWNSIAE
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pp036679_Pp1s91 DEMKESTSEDVEHKSVGRDTMDGAVQSKLCPRGHWRPAEDEKLRELVSQYGPQNWNLIAE
Sb020348_Sorbi1 ----------------------------MCTRGHWRPSEDEKLKELVALYGPHNWNAIAE
..***** .** ** .** **.:*** **
AT1G73410.1 KLPGRSGKSCRLRWFNQLDPRINRNPFTEEEEERLLAAHRIHGNRWSIIARLFPGRTDNA
pt026619_POPTR_ KLHGRSGKSCRLRWFNQLDPRINRSPFTEEEEERLLASHRIHGNRWAVIARLFPGRTDNA
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Os001451_Os01t0 KLDGRSGKSCRLRWFNQLDPRINRRAFTEEEEERLMAAHRAYGNKWALIARLFPGRTDNA
gm014930_Glyma0 KLQGRSGKSCRLRWFNQLDPRINRRPFTEEEEERLLAAHRIHGNKWALIARLFPGRTDNA
pp030759_Pp1s76 KLHGRSGKSCRLRWFNQLDPRINRRPFTEEEEDRLLSAHRFHGNKWAMIARLFPGRTDNA
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Sb012241_Sorbi1 KLDGRSGKSCRLRWFNQLDPRINKRPFTEEEEERLLNAHRAHGNKWALIARHFPGRTDNA
pt036337_POPTR_ KLQGRSGKSCRLRWFNQLDPRINRSPFTEEEEERLLACHRIHGNKWAVIAKQFPGRTDNA
Os014652_Os03t0 KLQGRSGKSCRLRWFNQLDPRINRSPFTEEEEELLLASHRAHGNRWAVIARLFPGRTDNA
pt026618_POPTR_ KLHGRSGKSCRLRWFNQLDPRINRSPFTEEEEERLLASHRIHGNRWAVIARLFPGRTDNA
pt023852_POPTR_ KLQGRSGKSCRLRWFNQLDPRINRSPFTEEEEERLLASHRIHGNRWAIIARFFPGRTDNA
pt003784_POPTR_ KLQGKSGKSCRLRWFNQLDPRINRSPFTEEEEERLLACQQIHGNKWAVIAKQFPGRTDNA
gm045477_Glyma1 KLRGRSGKSCRLRWFNQLDPRINRNPFTEEEEERLLASHRIHGNRWAVIARHFPGRTDNA
pp036679_Pp1s91 KLHGRSGKSCRLRWFNQLDPRINRRPFTEDEEERLLAAHRFHGNKWAMIARLFPGRTDNA
Sb020348_Sorbi1 KLQGRSGKSCRLRWFNQLDPRINRSPFSEEEEELLLASHRVHGNRWAVIARLFPGRTDNA
** *:******************: .*:*:**: *: .:: :**:*::**: ********
AT1G73410.1 VKNHWHVIMARRTRQTSKPR----------------------------------LLPST-
pt026619_POPTR_ VKNHWHVIMARRYRERSR-------------------------------------LHAK-
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Os001451_Os01t0 VKNHWHVLMARRHREQSG-------------------------------------AFRR-
gm014930_Glyma0 VKNHWHVIMARKQREQSKLC-------------------------------------GK-
pp030759_Pp1s76 VKNHWHVVMARKFRERSR-------------------------------------QFGR-
pp004489_Pp1s20 VKNHWHVVMARKFRERSR-------------------------------------VYGR-
gm010780_Glyma0 VKNHWHVIMARKQREQSKLYMLFS-------------------------TTRFGLENGRF
pt002308_POPTR_ VKNHWHVIMARRQREQSKLCGKRSYQDNLSESNATNSSHAGKSRAQDVFNSRIGFDDSRV
Sb012241_Sorbi1 VKNHWHVVMARRSRERSRLLA---------------------------------------
pt036337_POPTR_ VKNHWHVIMARRCRERSK-------------------------------------IHAK-
Os014652_Os03t0 VKNHWHVIMARRCRERMR-------------------------------------LSNR-
pt026618_POPTR_ VKNHWHVIMARRYRERSR-------------------------------------LHAK-
pt023852_POPTR_ VKNHWHVIMARRYRERSR-------------------------------------LHAK-
pt003784_POPTR_ VKNHWHIIMARKCRERSR-------------------------------------IHAK-
gm045477_Glyma1 VKNHWHVMMARIRRERSK-------------------------------------INNP-
pp036679_Pp1s91 VKNHWHVVMARKFRERSR-------------------------------------SSGR-
Sb020348_Sorbi1 VKNHWHVIMARRCRERMR-------------------------------------LSNR-
******::*** *:
AT1G73410.1 ----------------T------------------SSSSLMASEQIMM------------
pt026619_POPTR_ ----------------R------------------TAQA-LVNEQKFS------------
gm025122_Glyma0 ----------------K-------------------QPLFPPN-----------------
Os001451_Os01t0 ----------------RK--------------P--SSSSA----------------SPA-
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pp030759_Pp1s76 ----------------RKPQAN-----RRGELR--SSNSDVSNYHSSADFLTSWIEKHAV
pp004489_Pp1s20 ----------------RKTQVN-----RRGKLR--SSNSGGNHQHGSTDSLTAWIEKYAL
gm010780_Glyma0 FDFRSLDNNKDDDNNYRIVSDTT------------SSTSLASWNFASV------------
pt002308_POPTR_ LEFR--NPGKD-----RILSISP------------SGSS-PSWNFAPS------------
Sb012241_Sorbi1 ----------------RAASSAA------------SSPSAGGYLFGAG------------
pt036337_POPTR_ ----------------R------------------ASPSLLVNEQKPS------------
Os014652_Os03t0 ----------------RGGAAA------AGAAKGDESPARISNGEKTA------------
pt026618_POPTR_ ----------------R------------------TAQA-LVNEQKFS------------
pt023852_POPTR_ ----------------R------------------AAQT-LVNDNKLS------------
pt003784_POPTR_ ----------------RA-----------------ASQALLVNEQTHS------------
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Sb020348_Sorbi1 ----------------RGGGAAGAAVAGAGAVEDDNNP---RNAKK--------------
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pt026619_POPTR_ ----------------SKQD--MQINCETR-S-----------FS---------------
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Os001451_Os01t0 ---------------PA--------------------------PAP--------------
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pp004489_Pp1s20 SGEQSVEACDGSGDALAKPRASLSGSRSPT-SLPS-----TF-TNP---QVSSSNLQQVS
gm010780_Glyma0 --------------PTTTSTTTKG-------ARDY------F-NTS--------------
pt002308_POPTR_ --------------TIAASNNSSSVDLSRREGRDNYFNSSLF-CTT--------------
Sb012241_Sorbi1 --------------TPATSSLCFG--FSKLGGGGS--GGGLF-SSP--------------
pt036337_POPTR_ ---------------FSNQDV-RIMNCEPR-N-----------NAP--------------
Os014652_Os03t0 ----------------TRPPA----------TNGS-----GM-AMA--------------
pt026618_POPTR_ ----------------SKQD--MQINCETR-S-----------FS---------------
pt023852_POPTR_ ----------------SKQDH-MHMDCETR-N-----------FS---------------
pt003784_POPTR_ ---------------FSNQDVMRIVNCEPR-N-----------LAP--------------
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pp036679_Pp1s91 ---------------PTIPSGEVSDTSLPT-DHSQ-----LFNPSPGNRSVNNSNV----
Sb020348_Sorbi1 ----------------PRPDA----------S-----------SMA--------------
AT1G73410.1 ----------ADFIN---FPYKF----SH----IN-H-LHFL---KEFFTGKIALNHKA-
pt026619_POPTR_ ----------SFL---------------LLLMFLT-YMA----------------I----
gm025122_Glyma0 ----------SFVDK---YYEKY----SHPCVPLT-H-SSFQFPTKNFYFQDPSSAGSTV
Os001451_Os01t0 -------------P-----------PPPQPVVALHHH-H-------HRYSQQYSGYSGAA
gm014930_Glyma0 --------SITLLV----LLVIYPNPA-------------F-------------------
pp030759_Pp1s76 DVVNNVSDASSILPR---FSGFGSVPLAAPSLL--------PSSGGVIADPRAVYLSGLT
pp004489_Pp1s20 GVGSNLCETSSLSPK---FSSGGSVPLMAPSLL--------PNLGGAIGGSKPAYLPGSC
gm010780_Glyma0 --------RSSSVY----LSEIYPNPA-------------F-------------------
pt002308_POPTR_ --------ESSKLISDQPIYRYYTNSSVCGSYRSS---SIF-------------------
Sb012241_Sorbi1 --------AASPPTS---LFKSFGTATGSKGFLGA---S-FE------------------
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Os014652_Os03t0 ----------SLLDK---YRREC---GAAGLFAIGRH-----------HNSKEDYCSSTN
pt026618_POPTR_ ----------SFVKK---YCEKF---GQYPLITHS-YLPAFW---KEFYNDDLSNC----
pt023852_POPTR_ ----------SFSKK---YCEKY---GQYPMVTHS-YLPAFC---KEFYNEDPSHC----
pt003784_POPTR_ ----------SFFHK---FCESYC-DCYHRPFCLN-YPTSFC-------NENTSHH----
gm045477_Glyma1 ----------SFVEK---YYEKY----SHPCVTLT-H-SSFQFPGKKFYFQDPSSAGSTV
pp036679_Pp1s91 ----------SMSP-----------PSFHPGFLFPQH-ETFRNLGAARFSEH--SMEGAV
Sb020348_Sorbi1 ----------SLLDK---YRREF---SVVP-FAIN-H-----------NSNQQDYCSTTN
AT1G73410.1 -NQSKKPMEFYNFLQVNTDSN---------------------------------------
pt026619_POPTR_ -ADQNRPIEFYDFLQVNTESN---------------------------------------
gm025122_Glyma0 PRDNCESVEFYDFLQVNTDSN---------------------------------------
Os001451_Os01t0 ESD---ESASTCTTDLSLSSG--S---AAAA-----------------------------
gm014930_Glyma0 --------SLPNYKRVVPTSPLISTF------LGSSD-HD--------------------
pp030759_Pp1s76 NSEKHQQALVNNPTDRQGSTGHLK---EEHADKG--SFHRLLP---------TESSTSGL
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gm010780_Glyma0 --------SLPNYKRVVPTSPF-RTF------LGSSDHHD--------------------
pt002308_POPTR_ --------GLPNYRRVVP-SPF-GSY------LKLGDDYEN-------------------
Sb012241_Sorbi1 ------ASGRYNYSGKQLTAPLSITFASPSEALGMDIGHH--------------------
pt036337_POPTR_ -EGKNQPLEFYDFLQVKTESS---------------------------------------
Os014652_Os03t0 E-DTSKSVEFYDFLQVNASSS---------------------------------------
pt026618_POPTR_ -KDQNRPIEFYDFLQVNTESN---------------------------------------
pt023852_POPTR_ -EDQSRPIEFYDFLQVNTDSN---------------------------------------
pt003784_POPTR_ -EGK--PLEFYDFLQVKTDSS---------------------------------------
gm045477_Glyma1 PPGKSQSVEFYDFLQVNTDSN---------------------------------------
pp036679_Pp1s91 PS----SSATTTPLAPSLSSRRLS---QPAAHLGLQMLHEQKPPLQDDTSPPSTDSLVGV
Sb020348_Sorbi1 EADTNKSVEFYDFLQVNANSS---------------------------------------
:
AT1G73410.1 ----------------------------------------------KSEIIDQDS-----
pt026619_POPTR_ ----------------------------------------------KSEVID--------
gm025122_Glyma0 ----------------------------------------------KSEVTD--------
Os001451_Os01t0 --------AAAAAAANIPCCF----------------------------YQR--------
gm014930_Glyma0 -----GR--------------------------------------IKKDLMS--------
pp030759_Pp1s76 KTTLQG--SLYGSHWNRPSPPNPSGYSQTNGDEVVELHETYADHPHRSEMARPLSLG---
pp004489_Pp1s20 KTTFQG--SLYAGRWGGPSLPNPFGNNPTNGDKGDELYKSYSNVSCRSEMQKQLSLG---
gm010780_Glyma0 -----GW-------------------------------------IIKRDLMS--------
pt002308_POPTR_ ----HGM--------------------------------------IKKELAS--------
Sb012241_Sorbi1 -----GR-----------------------------------------------------
pt036337_POPTR_ ----------------------------------------------KSEVID--------
Os014652_Os03t0 ----------------------------------------------DTKCGS--S-----
pt026618_POPTR_ ----------------------------------------------KSEVID--------
pt023852_POPTR_ ----------------------------------------------KSEVID--------
pt003784_POPTR_ ----------------------------------------------KSEALD--------
gm045477_Glyma1 ----------------------------------------------ESEVTD--------
pp036679_Pp1s91 MMRHGGLCAAPAASQWVPSLVNPFATVRDN--QRDEAARNFLASSCRAEIQRQFE-GQHG
Sb020348_Sorbi1 ----------------------------------------------DTKCGS--S-----
AT1G73410.1 ------------------------------------------------------------
pt026619_POPTR_ ------------------------------------------------------------
gm025122_Glyma0 ------------------------------------------------------------
Os001451_Os01t0 ------GG----------------------------------------------------
gm014930_Glyma0 FCD-NNTNSSSTFTKLK-------------------------------------------
pp030759_Pp1s76 ----RSGNKYEAIHSFRVAPAFSRQDTTKELGNWIPLPVPGHEHQHLQKRLRKDGANPSK
pp004489_Pp1s20 ----RSGHQREASPSLRIAPAFSRQDTTKELGNWMLLPLAGQAQQQLRERLRKDISNSKK
gm010780_Glyma0 FCDNNNNNSSSTFSKLK-------------------------------------------
pt002308_POPTR_ -CH-----NSSTLNNLR-------------------------------------------
Sb012241_Sorbi1 ----------------H-------------------------------------------
pt036337_POPTR_ ------------------------------------------------------------
Os014652_Os03t0 ------------------------------------------------------------
pt026618_POPTR_ ------------------------------------------------------------
pt023852_POPTR_ ------------------------------------------------------------
pt003784_POPTR_ ------------------------------------------------------------
gm045477_Glyma1 ------------------------------------------------------------
pp036679_Pp1s91 HGDPRFGGHSEVSYSIR--------------------------QSAEQPELQRDLGS---
Sb020348_Sorbi1 ------------------------------------------------------------
AT1G73410.1 -------GQSKRS--DSDTKH---------ESHVPFFDFLSV-GNSAS--
pt026619_POPTR_ --------NARRE--DEEVDQREVILEHQSKAGVPFIDFFSA--------
gm025122_Glyma0 --------NARRD--EEEVSQ-DAVGMKNKDNGVPFIDFLST-GGC----
Os001451_Os01t0 -----------AQ--ATTDSH-----------TIPFFDFLGV-GAT----
gm014930_Glyma0 -------ASTEKD--QQQTNE-DETN-NIKPKEVPFIDFLGV-GV-----
pp030759_Pp1s76 LGLTSWVPCEKPE--DTVVAEAATLHSSSVTVPVPFIDFLGV-GAS----
pp004489_Pp1s20 LGSNSWGTCEKSD--DIEFSEVEPSQSSPDSAPVPFIDFLGV-GAS----
gm010780_Glyma0 -------ASTEKDHQQQQTNE-DAT--NVEPKEVPFIDFLGV-GVSSS--
pt002308_POPTR_ -------ATS-----NHQEKG-DHE--SIKHKDAPFIDFLGV-GISS---
Sb012241_Sorbi1 -------EHHQKD--YHAASG-DSADEPLKKKDVPFIDFLGV-GVSS---
pt036337_POPTR_ --------NARRD--DVEVDQ-EAKELPKSRAGFPFIDFLSA-GNQVSGL
Os014652_Os03t0 -------IEEQED--NRDDDQ--------AEGQVQLIDFMEV-GTTSRQ-
pt026618_POPTR_ --------NARRE--DEEVDQREVILEHQSKAGVPFIDFFSA--------
pt023852_POPTR_ --------NARRD--DEEVDQQEALENNQSKADVPFIDFFSVNGKSSS--
pt003784_POPTR_ --------NARRD--DVEVDQ-EARELHQRKANFPFIDFLSA-GNSN---
gm045477_Glyma1 --------NARRD--DEEVSQ-DAVGQKNKDNGVPFIDFLST-GGC----
pp036679_Pp1s91 --LLAWGRTTQGQ--ELALSHPEP------APSVPFIDFLGV-GVV----
Sb020348_Sorbi1 -------IEEQEE--NR-DDQ--------AEGQVQFIDFLEV-GASHRQ-
::**: .
BoxShade v3.31 C (beta, 970507) Output
AT1G73410.1 |
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