Input
| Putative repression domain
|
|
AT1G74650.1 |
not found |
|
Ortholog
| Putative repression domain
| Reverse top hit
| Relation
| Blast score ratio
| Type
|
Os031589 |
not found in 262aa |
AT3G47600.1 |
1st_not |
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II |
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not found in 447aa |
AT3G28910.1 |
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III |
Os037426 |
not found in 308aa |
AT1G08810.1 |
not_not |
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III |
Os039920 |
not found in 311aa |
AT1G08810.1 |
not_not |
0.44 |
III |
Os038958 |
not found in 330aa |
AT1G08810.1 |
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III |
Os029176 |
not found in 152aa |
AT3G28910.1 |
not_not |
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III |
Sb015859 |
not found in 304aa |
AT3G28910.1 |
1st_not |
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II |
Sb024175 |
not found in 559aa |
AT3G28910.1 |
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III |
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not found in 306aa |
AT3G28910.1 |
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III |
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AT1G08810.1 |
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III |
Sb015860 |
not found in 306aa |
AT3G28910.1 |
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III |
Sb011512 |
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AT1G08810.1 |
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III |
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AT1G08810.1 |
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III |
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AT3G47600.1 |
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III |
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AT3G47600.1 |
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III |
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AT3G47600.1 |
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III |
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not found in 332aa |
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III |
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III |
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not found in 334aa |
AT3G28910.1 |
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III |
Gm051010 |
not found in 337aa |
AT3G28910.1 |
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III |
Gm051842 |
not found in 314aa |
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III |
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AT1G08810.1 |
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0.447619047 |
III |
Pt003833 |
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AT3G47600.1 |
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II |
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AT3G28910.1 |
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III |
Pt014861 |
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III |
Pt013243 |
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AT1G08810.1 |
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0.447619047 |
III |
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Get alignment file
Get formatted file made by BOXSHADE
Sequence file prepared (1 sec required). Alignment has started.
CLUSTAL format alignment by MAFFT FFT-NS-2 (v7.475)
AT1G74650.1 ------------------------------------------------------------
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: * . : : *** : * *
AT1G74650.1 LVSYIQQHGPGNWRSVPANTGLLRCSKSCRLRWTNYLRPGIKRGNFTQPEEKMIIHLQAL
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gm015751_Glyma0 LVSYIQEHGPGNWRSVPSNTGLMRCSKSCRLRWTNYLRPGIKRGNFTDHEEKMIIHLQAL
* ::.** : . * * * *:** : ::
AT1G74650.1 LGNR-WA-AIASYLPQRTDNDIKNYWNTHLKKKLVMMKFQN-GIINENKTNLATDISS--
gm050379_Glyma1 LGNR-WA-AIASYLPQRTDNDIKNYWNTHLRKKLK--KMQV-------GCEGGSF-----
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pt014861_POPTR_ LGNK-WA-AIASYLPQRTDNDIKNYWNTHLKKKLK--KFQSA-----------------L
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gm011049_Glyma0 LGNR-WA-AIASYLPQRTDNDIKNYWNTHLKKKLK----QS-------GSDEGVD-----
Sb005890_Sorbi1 LGNRWWA-AIASYLPERTDNDIKNYWNTHLKKKLK--KMQA-------GEGGGGGK----
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gm015751_Glyma0 LGNR-WA-AIASYLPQRTDNDIKNYWNTHLKKKLK--KMQI---------GGGSDDD---
*:. *: :: : .*: : ::.
AT1G74650.1 CNNNNNGCNHNKRTTNKGQWEKKLQTDI-NMAKQALFQALSLDQPSSL------IPPDP-
gm050379_Glyma1 ----GEGF-SASRQIPRGQWERRLQTDI-QMAKRALSEALSPE------------KPSCN
Sb015860_Sorbi1 --KTKGDGAAAPAPAPKGQWERQLQTDM-HTARQALQEALSIDTAPPP---PAAIKPEP-
Sb024175_Sorbi1 PPWQQVGGHRVVPAGADGQRHQELLEHA-PQAQAAERRRRRGGQAAGAQAAVVVQGPVG-
gm035044_Glyma1 ---HNIGV-SVSQPMSRGQWERRLQTDI-RMAKRALIEALSSNKASS--------SSTLL
pt014861_POPTR_ DP--MAQGSASSQFMSKSFNERKC-LD---------------------------------
Os038958_Os11t0 -----------QQSHPDHHHHHSFQTTP------SSSNAAA----------VATTSPNYY
Sb015859_Sorbi1 ---------SGRCAAPKGQWERRLQTDI-HTARQALREALS-------------LDPDP-
Sb011512_Sorbi1 TPPRPRPSSSCPPPPSAAAAEAAMSTTT-----TVTCSAAAPISSDSYY-----ARPSG-
Sb016493_Sorbi1 PPSESPIIPAVVPTATTGSHADCHHDDMMTLSKDSYGRPAS-------------STPAP-
Sb012725_Sorbi1 -----------AAA-------ESFQTTA------AASNA-------------VTCSPNYY
gm046616_Glyma1 --HEGHSSSSSSNSHPKGQWERRLQTDI-QMAKKALCDALSLHKPATAT-TTTLVVPDD-
gm051842_Glyma1 DPHSASDSTASGQFLPKSFSDRRS-LDI--------------------------------
pt018670_POPTR_ -------------QISRGQWERRLQTDI-HMARQALSEALSPEKPNSL---LTELKPSC-
gm051010_Glyma1 -GHNNIGFSSVSQPMSRGQWERRLQTDI-HMAKKALSEALSPNKASS--------SSSTL
pt013243_POPTR_ DP--MAQDSTSSQFTSKSFNDRKS-LD---------------------------------
pt003833_POPTR_ ---DGLSS-TGSQQISRGQWERRLQTDI-NMARQALCEALSPGKPSSL---LTGLKPSC-
gm025830_Glyma0 ----GEGF-SASRQIPRGQWERRLQTDI-QMAKRALSEALSPEK-----------KPSC-
Os013249_Os03t0 TSSSSSPPTPTTPLVARGQWERKLQTDI-DLARRALRDALSVDDA---------ASPAMI
Os029176_Os07t0 ------------------------------------------------------------
gm005808_Glyma0 DPHSASDSTASGQFLPKSFSDRRSTLDI--------------------------------
Os037426_Os11t0 -NRHPIFADATFPSAA-GSHTVSSNSDVNQMAAIARRSPFA-------------DCPSS-
gm010026_Glyma0 --NNDDKLNSC-NSQIKGQWERRLQTDI-HMAKQALCEALSLDKPTQ-------IFPET-
gm011049_Glyma0 --QEGHSSSSSSNSHPKGQWERRLQTDI-QMAKKALCDALSLHKPATAT-ATNLVVPDD-
Sb005890_Sorbi1 -----------RPAVPKGQWERRLQTDI-HTARQALRDALS-------------LEPS--
Os039920_Os12t0 -NRHPIFADATFPSAAGGSYTVSSNSDVTQMAAIARRSPFA-------------DCPSS-
Os031589_Os08t0 ---------KTRAAAPKGQWERRLQTDI-HTARQALRDALS-------------LDPSP-
gm015751_Glyma0 --NNDDKSNSSNNSQIKGQWERRLQTDI-HMAKQALCEALSLDKPTQ-------IFPET-
AT1G74650.1 ------------------------DSPKPHHHST------TTYASSTDN--------ISK
gm050379_Glyma1 LSASNSNPSDSSSSF---------SSTKPTTTQT------VCYASSADN--------IAR
Sb015860_Sorbi1 ----------------------LPLAQLPAPALS-----PAMYACSIEN--------VVR
Sb024175_Sorbi1 -----EEAADGHQ------PGAPRASRGPHPARRPQ----AATAAARRH--------RRR
gm035044_Glyma1 LAESNSNLSSENSIFY------NSNTNKP-TTQS------MCYASSADN--------IAR
pt014861_POPTR_ ------DFTTDSS-----------VLNRPNQV--------STYASSTEN--------ISR
Os038958_Os11t0 N---PNNSNSNSSNYLHNNNHNLESMQS--------------MATAPSNEATT----IPK
Sb015859_Sorbi1 -VPPSAKPEQVPQ-----------QPPAPAATQAAG---QATYASSAEN--------IAR
Sb011512_Sorbi1 GAGCCSNPAEVAQLI---------ARRSPFAADGGGDSSSSSYASSMDN--------ISK
Sb016493_Sorbi1 -------ADEVTQFI---------GLCSPPFAATNG----DTFSSPMDN--------ISK
Sb012725_Sorbi1 -------SSSSSS------HHSLQGMQQPMSSYPNT----ACSSSTPSNHETTTTTGVSD
gm046616_Glyma1 ----ATKPSSSSH-------------HQPYNHAS------SSYASSYEN--------ISR
gm051842_Glyma1 --SS-SNNNHGSS-----------IRLS-HQSQSSS----TTYASSTEN--------ISR
pt018670_POPTR_ ------------------------GYEKPAPAS--------LYASSTEN--------IAK
gm051010_Glyma1 LAESNSNLSNENSTFY------NSNTNKPTTTQS------MCYASSADN--------IAR
pt013243_POPTR_ ------NFTTNSS-----------SALRPNQA--------STYASSTEN--------ISR
pt003833_POPTR_ ------------------------GYEKPATEP--------IYASSTEN--------ISR
gm025830_Glyma0 LSASNSNPSDSSSSF---------SSTKPTTTQS------VCYASSADN--------IAR
Os013249_Os03t0 ------------------------SSGPPAPAAA------AAYALSERN--------ISV
Os029176_Os07t0 ------------------------------------------------------------
gm005808_Glyma0 --SSNNNNNHGSS-----------IRLSHHQSQSSS---TTTYASSTEN--------ISR
Os037426_Os11t0 -----------------------------------------SYASSMDN--------ISK
gm010026_Glyma0 -----KLPSTSSH-----------N---PTTTPNQ----TSLYASSTEN--------IAK
gm011049_Glyma0 ----ATKPSSTS--------------HQPYKHAS------SSYASSYEN--------ISR
Sb005890_Sorbi1 -----AQPLAPAK-----------VEPLPTTPPGC-----TTYASSAEN--------IAR
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AT1G74650.1 L--LQNW-TSSSSSK---PN------------------------TSSVSNNR--------
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AT1G74650.1 TTDDQGSLSLIEKWLFD-----------------DQGLVQCDDS--QEDLID---V----
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gm035044_Glyma1 ADGIDMPFSLLEKWLLD-----------------D-AACQEK-----LGF----------
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gm046616_Glyma1 ------PLTLLENWLFD-----------------D-GAAQCH-----EDLMN---M----
gm051842_Glyma1 N-SGAPPLSFLEKWLLD-----------------ESVGHQV------EEMMELS------
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Os031589_Os08t0 --------------------------------
gm015751_Glyma0 SLEESRN-------------KIHVTKSTTKGL
BoxShade v3.31 C (beta, 970507) Output
AT1G74650.1 |
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