Input
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Ortholog
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III |
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Get alignment file
Get formatted file made by BOXSHADE
Sequence file prepared (0 sec required). Alignment has started.
CLUSTAL format alignment by MAFFT FFT-NS-2 (v7.475)
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.*: * *.:::*:******* : ** * . * .::**:.::** :
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: ** . ****:***::* *:****:* *** ** **: :.:
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gm046315_Glyma1 LNAVTNFDLSRYIN----------------------------------------------
Sb002937_Sorbi1 INAVTNFDLSTYIR-WLK-------------------PGGGVE-----------------
pt029433_POPTR_ INAVTNFDLSRYIK-WLR-------------------PNN--------------------
Os039933_Os12t0 ANAVTNFDISCYLD-----------Q-----------PQLLAQLQ---------------
gm004608_Glyma0 LLYISNLNESTFAN-YCK-------------------PKPSRSTTL--------------
gm022175_Glyma0 LNAVTNFDLSRYIN-WPR-------------------PKT--------------------
pp008855_Pp1s13 INAVTNFDMSRYNAARIQQGSLNVNHGLGA-------MKAAKETEL-----STTMI----
gm042901_Glyma1 VNAVTNFDISNYMD-KIKKKNDQT-QQQQTEAQTETVPNSSDSEE---------------
Sb028388_Sorbi1 VNAVTNFDISCYLD-----------H----------------------------------
Sm002244_Selmo1 LNAVTNFDLSRYI-----------------------------------------------
Os022569_Os05t0 VNAVTNFDLRSYIT-WLK-------------------PTPAHVAM---------------
pt005285_POPTR_ LNA----DLSRYIK-WLK-------------------PNQ--------------------
pp007403_Pp1s29 PAAVTNFDLTCYTQQLARK------------------PVQSKLAFEEGQGASSVSVGGSC
pp025606_Pp1s26 AAAVTNFELTHYPE-LAK------------------------------------------
: :
AT1G79700.2 ------------------------------------------------------------
pt011493_POPTR_ ------------------------------------------------------------
Sb019012_Sorbi1 -N-------PE-------AALLMQAAP------------------------AEQLL----
pt042423_POPTR_ --------IPID------QILQEQ------------------------------------
gm022256_Glyma0 ------------------AEVEQQ------------------------------------
Sb015884_Sorbi1 VDDVAAFQLPDDLPECPAAAIGVE------------------------------------
pt033686_POPTR_ --------IPID------RILQE-------------------------------------
pt003325_POPTR_ ------------------AN-ELQ------------------------------------
pt035972_POPTR_ ---------PQTQ--------ESK------------------------------------
gm050360_Glyma1 ------------------ENLESH------------------------------------
gm046315_Glyma1 ------------------------------------------------------------
Sb002937_Sorbi1 ------------------------------------------------------------
pt029433_POPTR_ ------------------------------------------------------------
Os039933_Os12t0 -------QEPQLL-----AQLQQE----------------------------PQVV----
gm004608_Glyma0 INCF-HYRIPWTQC---CHQFRSQ------------------------------------
gm022175_Glyma0 ------------------------------------------------------------
pp008855_Pp1s13 -------STPLQ------SRGQTQ---------------------------AAQMIR---
gm042901_Glyma1 ------------------VEVEQQ------------------------------------
Sb028388_Sorbi1 ---------PLFL-----AQLQQE----------------------------PQVV----
Sm002244_Selmo1 ------------------------------------------------------------
Os022569_Os05t0 -N-------PA-------EALAMQ-IP------------------------VDHFL----
pt005285_POPTR_ ------------------------------------------------------------
pp007403_Pp1s29 TNDQMYPPIPLE------QSCDMQLLPTLDGDDSQLVDRKSIIFDSGSCRDLSQLLQSPF
pp025606_Pp1s26 -------DIPL-------KQRRKNCVTTA-------------------------------
AT1G79700.2 -------------------------------------------------DKADSDSK-PI
pt011493_POPTR_ -------------------------QNNINNPQ----------------QNPNGDANIPI
Sb019012_Sorbi1 HPAETAQML--------------PRVGNPFLLDHGAAPPGSSGGGG-----QDASMSSMV
pt042423_POPTR_ -------------------------------------------------QQQQQLGNNSI
gm022256_Glyma0 -----------------------------HTTTITTPPPS---------ENLHMLPQ---
Sb015884_Sorbi1 -------------------------------------------------ETTGGDAE---
pt033686_POPTR_ ----------------------------------------------------QQLLNNSV
pt003325_POPTR_ -TVTDPQTA--------------ATLTDTYTPREETKPSLFLPNQF-TADYLNSPPK---
pt035972_POPTR_ -PASDPLPM---------------ATFSNHLPSEKPTQLSVLQMDPSLMDNLNTPKNEDI
gm050360_Glyma1 -AVLEHQKL--------------ASPSN-YALTEESK-SLVLPNSFISPDSLDSPVK---
gm046315_Glyma1 ------INL--------------TNINNNNNCTNSFTPSPDQEQEASFFHNKDSLNNTIV
Sb002937_Sorbi1 ----DSAAG--------------TPTSGVRAPGIP--PASLSLQAGGLLQHPHGAAAGML
pt029433_POPTR_ -------------------------HNNVNNPQ----------------QNPNCDAN-PI
Os039933_Os12t0 -PALHEEPQ---------------DDDRSENAVQ---------------ELSSSEANTSS
gm004608_Glyma0 -PNNDQISI--------------NLTNINNNCTNNFIPNPDQEQEVSFFHNQDSLNNTIV
gm022175_Glyma0 ------------------------EENHQNTPSN---------------QNVNSNAE---
pp008855_Pp1s13 HSQIDEDQQ--------------MCTHSTGTPGSQMTS-----------EVLSGQSGMSK
gm042901_Glyma1 ------------------------------TTTITTPPPS---------ENLHMPPQ---
Sb028388_Sorbi1 -PALNQEAQ--------------PDQSETETIAQ---------------ESVSSEAKTPD
Sm002244_Selmo1 ------------------------------------------------------------
Os022569_Os05t0 -PMETQMMM--------------LPQSNPFTSYHNAQSLGGGDGGSSSTNNQEASM--II
pt005285_POPTR_ -------------------------------------------------NNSNGSNDLNL
pp007403_Pp1s29 SPGSDAGGSCIKSLTKLRYACDGGSSNNLQSLAYEDPAQITESRCSSQYQYTDDSMEQDV
pp025606_Pp1s26 -------------------------------------------------TSTDSKPVTKV
AT1G79700.2 R-----------------------------------------------------------
pt011493_POPTR_ QNLDQKLELDFISHQQ----------SSKVNDTE--VAPTRPCGAGG-------------
Sb019012_Sorbi1 SP-----------------------------------------GAGG-------------
pt042423_POPTR_ DP---GIEVEAGVEQP-----------------------------------SP-------
gm022256_Glyma0 ------------EHQV---------------------------------QYTH-------
Sb015884_Sorbi1 ---FHNGEEGYLQHHT--------------------------SGPFGAQQQLPDETGA--
pt033686_POPTR_ DS---SVEVE--VEQP-----------------------------------TPPP-----
pt003325_POPTR_ -------------------------LDAFQNNIF--------------------------
pt035972_POPTR_ FH-RKTLPVSFLTRS---------------------------------------------
gm050360_Glyma1 -------------------------HESFGNKTY--------------------------
gm046315_Glyma1 E------EVTLVPHQ---------------------------------------------
Sb002937_Sorbi1 Q-----VDVDDLYRGQLAAARGAALFSGGIDD----VGSVYAAGSAGP---SPTALCAG-
pt029433_POPTR_ QNLDQKIELDFMPHQQ----------SSNVNGTEELTDPARSGGTGG-------------
Os039933_Os12t0 DN------------------------------------------------NEPLA-----
gm004608_Glyma0 E------EATLVPHQ---------------------------------------------
gm022175_Glyma0 ------LEL-------------------------------------G-------------
pp008855_Pp1s13 NP----HEWQMLYQQQ-------------------------ARNSWG---SCPQGDSQQG
gm042901_Glyma1 ------------QHQV---------------------------------QYTP-------
Sb028388_Sorbi1 DN------------------------------------------------AEP-------
Sm002244_Selmo1 ------------------------------------------------------------
Os022569_Os05t0 SP-------------------------------------------SG-------------
pt005285_POPTR_ PN--------------------------------------------------PMIIGTD-
pp007403_Pp1s29 IFNANPYLTNDFSHQEYQIV-----------------------------DEKPKICLEDI
pp025606_Pp1s26 DG-------------------------------------------------SP-------
AT1G79700.2 ------------SPSREPESSDDN------KSP--------------------KSEEVIE
pt011493_POPTR_ -------------------SASSALGLLL-QSS--------------------KFKEMLE
Sb019012_Sorbi1 --------------GMRRRGSSTALSLLL-KSS--------------------MFRQLVE
pt042423_POPTR_ ------------QQQEEQEQK-VAPSLQV-QCT--------------------QLDSSLD
gm022256_Glyma0 ------------HVTPRDEESSSLVTIM---------------------------EHVLE
Sb015884_Sorbi1 ------------LAAHQMAPNSSALDMVL-QSP--------------------KFKELME
pt033686_POPTR_ -----------QQQQEEQEQKIVSSSSQL-QCS--------------------QLNSSLD
pt003325_POPTR_ ------------VDSSNKTSSPTALSLLL-RSS--------------------VFRELVE
pt035972_POPTR_ -------------------SSSTALSLLF-KSS--------------------IFKELVE
gm050360_Glyma1 ------------QFSRNKSSSPTALGLLL-RSS--------------------LFRELVE
gm046315_Glyma1 ---------------PRPASATSALELLL-QSS--------------------KFKEMME
Sb002937_Sorbi1 ----------RPSPSPSPSSSTTALSLLL-RSS--------------------VFQELVA
pt029433_POPTR_ -------------------SASSALGLLL-QSS--------------------KFKEILE
Os039933_Os12t0 -----------ADDSAEC--MNEPLPIV----------------------------DGIE
gm004608_Glyma0 ---------------PRPASATLALELLL-QSS--------------------KFKEMVE
gm022175_Glyma0 -------------------SASDEIT-----------------------------EEGVA
pp008855_Pp1s13 WL-------GFGVDSMRAPSTQSKFPAPTNGTS-----LRNL-----------MGLEALP
gm042901_Glyma1 ------------HVSPREEESSSLITIM---------------------------DHVLE
Sb028388_Sorbi1 ------------DDNAEPDDIAEPLITV---------------------------DDSIE
Sm002244_Selmo1 ------------------------------------------------------------
Os022569_Os05t0 --------------SSRKRSSSTALSLLL-KSS--------------------MFRQLVE
pt005285_POPTR_ -------------------NSTHPLGLLL-QSS--------------------KFKEMME
pp007403_Pp1s29 TYVVNECIPGDKIPEMETSGSSVVTTMMIPRES--------------------NYLKSFE
pp025606_Pp1s26 ---------SNNPDVLEKANQSNVHGLKMIQCPQPPSCLDDLDDFHVQRKHRLQFKQEAQ
AT1G79700.2 PSTSP--------------------------------EVIPTRR----------------
pt011493_POPTR_ RTSAS-------------DC----------PLTPPESDRDPPRR----------------
Sb019012_Sorbi1 KNSDA-------------------------------EEGVRDREDA--------------
pt042423_POPTR_ GASPM---------------------VI--------TDTIEEHEQAWSF-----------
gm022256_Glyma0 QDLPW------------------------------------------SF-----------
Sb015884_Sorbi1 QVSAAAAAVASE-----------------SSIGGSMSSSSPSPSLS-SFSPSPLQLPSPS
pt033686_POPTR_ GTPPM---------------------VI--------MDTIEEHELAWSF-----------
pt003325_POPTR_ KNS---------------------------NVCEEETDGNEIKN----------------
pt035972_POPTR_ KNLNT------------------------TSEEIEENDSKNPHN----------------
gm050360_Glyma1 KNS---------------------------NVSGEEADGEVTKDQ---------------
gm046315_Glyma1 MTSVA-------------------------NLSSTQMESELPQC----------------
Sb002937_Sorbi1 RNAGGGAAQQQQLVVADDDGAVSPADVVDAKVEQPEAEGELGRH----------------
pt029433_POPTR_ RTSAA-------------DCPLTPL----PPLTPPESDRDPPRR----------------
Os039933_Os12t0 ESLWS-------------------------PCLDYELDTMPGAYFSNSM-----------
gm004608_Glyma0 MTS-------------------------------------LPQC----------------
gm022175_Glyma0 RSS--------------------------------ESESNPSRR----------------
pp008855_Pp1s13 QDRNAGAGES--------SCSAN------QALMGHGMQSSSSMISSSGFQ----------
gm042901_Glyma1 QDLPW------------------------------------------SF-----------
Sb028388_Sorbi1 ESLWS-------------------------PCMDYELDTMSRSNFGSSI-----------
Sm002244_Selmo1 ------------------------------------------------------------
Os022569_Os05t0 KNSDAG-----------------------------EENGGEMRE----------------
pt005285_POPTR_ MTAVT-------------DCPPT-----------SSSDLELTPC----------------
pp007403_Pp1s29 IDFDD-------------DS---------HTECESQIESQVDNN---SFWDEFL------
pp025606_Pp1s26 RISLD-------------DFC--------FEGHSEDVHTKSARNFC-SFS----------
AT1G79700.2 ------------------------------------SFPD-DI--------------QTY
pt011493_POPTR_ ------------------------------------SFPD-DI--------------QTY
Sb019012_Sorbi1 -----AAAAAAAHPAG---PGDAY-EYHN--FFQGEAPP--DMCDLFSSGGGGDHARNAG
pt042423_POPTR_ ---CMDSGWNLTMLDL---PFENSCELPD--LFNHTGFED-NI--------------DLM
gm022256_Glyma0 ---MYTGLSQFQDPNLALSKGDDD--LAG--MFDGAGFEE-DI--------------DFL
Sb015884_Sorbi1 SLSSFSPSSPLQQPSP---PLQQP-EFVEGAPAARCSFPD-DV--------------QTF
pt033686_POPTR_ ---CMDSGLSLTMPDL---PLENSCELPD--LFDHTGFED-NI--------------DLI
pt003325_POPTR_ ------------QPMA---GSDDE---------YGGIFYD-GI------G-------DIP
pt035972_POPTR_ --------------------GNNN---------AGEAFYD-GLSPIPHTGT----SNEDP
gm050360_Glyma1 ------------QPQL---ASDDD---------LDGIFFD-SF------G-------DIP
gm046315_Glyma1 ------------------------------------TFPD-HI--------------QTY
Sb002937_Sorbi1 --------------------GDQL---------YGAARAD-ED--------------EDA
pt029433_POPTR_ ------------------------------------SFPD-DI--------------QTV
Os039933_Os12t0 -------------------------NFSE--WFNDEAFEG-GM--------------EYL
gm004608_Glyma0 ------------------------------------TFPD-HI--------------QTY
gm022175_Glyma0 ------------------------------------TFPE-DI--------------QTI
pp008855_Pp1s13 -----GGSSGVYQ------DGDGR-ALNS-PPMSNSAYPQ-QQQQQQQQGSLDRGAVDSP
gm042901_Glyma1 ---MYTGLSQFQDPNLAFCKGDDD--LVG--MFDSAGFEE-DI--------------DFL
Sb028388_Sorbi1 -------------------------NLSE--WFNDADFDS-NI--------------GCL
Sm002244_Selmo1 ------------------------------------------------------------
Os022569_Os05t0 ---------PGAH------PGEGY-EYHN--FFQGDAAPDMDMCDLLSSGNVHAASGSAG
pt005285_POPTR_ ------------------------------------SFPE-DV--------------QTY
pp007403_Pp1s29 -------------------GSNDP-------LLQETSFPD-------------VFDEQQT
pp025606_Pp1s26 -------------------------------HIKDEDLPD--------------------
AT1G79700.2 FGC---------QDSGKLA---------TEEDV---------------------------
pt011493_POPTR_ FDC---------QDSSSYT---------DGDDI---------------------------
Sb019012_Sorbi1 FHG---------EIAACYD---------DGEGLD-------------------------G
pt042423_POPTR_ FDACC---YGN-------------------------------------------------
gm022256_Glyma0 FSTQPGDHETESDVNNMSAVLD----SVECGDTNGAG------GRSMVYHHVDNNNKQKK
Sb015884_Sorbi1 FDF-----ENESDMSFMYA---------EVDTF---------------------------
pt033686_POPTR_ FDACC---YGKEANPAGYTLEDNSTGGVEEDRLS-------------------------S
pt003325_POPTR_ FVY----------SSNKYSL------GLEEREL---------------------------
pt035972_POPTR_ FLC---------SEQGETN---------TSPPYS-----------------------GME
gm050360_Glyma1 FVC----------DPTRYNL------ELQERDL---------------------------
gm046315_Glyma1 FEY---------EDSNRYE---------EGDDL---------------------------
Sb002937_Sorbi1 FAC------------SMYE---------LDDSFA-----------------------RME
pt029433_POPTR_ FDC---------QDSSSYT---------DDDDI---------------------------
Os039933_Os12t0 FEGCSSI-----TEGGNSM---------DNSGMA-------------------------E
gm004608_Glyma0 FE----------------------------DDVIN----------------------QIK
gm022175_Glyma0 FENN--------QDSGIYI---------ENDDI---------------------------
pp008855_Pp1s13 KNSVDES-EEASSKSSGYD-------PVLQGDLSRSGILYLSPGSGS----------QGK
gm042901_Glyma1 FSTQPGD-ETESDVNNMSAVLD----SVECGDTNGAG------GSMM---HVDN---KQK
Sb028388_Sorbi1 FDGCSAV-----DEGGK-----------DGVGLA-------------------------D
Sm002244_Selmo1 ------------------------------------------------------------
Os022569_Os05t0 FEE---------DI-ACY------------------------------------------
pt005285_POPTR_ FEC---------QYSSSYG--D------QGDDM---------------------------
pp007403_Pp1s29 FRCPS-----------------------SDSDLTL-------------------------
pp025606_Pp1s26 FYTDPE------DLSIDYL--D------SKADVLGV---------------------DYE
AT1G79700.2 --IFDCFNSYINPGFYN-EFDYGP------------------------------------
pt011493_POPTR_ --IFGDLHSFASPIFHC-ELDG--------------------------------------
Sb019012_Sorbi1 WNGFGNMSSLQ-------------------------------------------------
pt042423_POPTR_ ------------------------------------------------------------
gm022256_Glyma0 MLSFASSSSPSSTTTTV-SCDYALDL----------------------------------
Sb015884_Sorbi1 --LFGDLGAYAAPIFHF-DLDV--------------------------------------
pt033686_POPTR_ DSVSNSPTSSTTTSVSC-NYSV--------------------------------------
pt003325_POPTR_ QFVL--------------------------------------------------------
pt035972_POPTR_ QSLWNGALSMPSR-FH--------------------------------------------
gm050360_Glyma1 HSIF--------------------------------------------------------
gm046315_Glyma1 --MF-KFNEFSSIVPFY-QCDEFES-----------------------------------
Sb002937_Sorbi1 QSLWGCLRSSDAP---------------------------DNMNNL--------------
pt029433_POPTR_ -NIFGELNPFASPIFHY-ELDGQEMV------------FGPNKSNILTT-----------
Os039933_Os12t0 YNLFEECNMLEKDISDFLDKDISDFLDKDISISDRER-ISPQANNISC---PQKMISVCN
gm004608_Glyma0 MNINAALGTLISLLFSW-DFKICRNF------------AAKFLANFFAGNFP--------
gm022175_Glyma0 --IFGDLGSFGAPIFHF-ELDV--------------------------------------
pp008855_Pp1s13 MANYVESSSLSPWIGSN---------------STTVQGLTERSNLSMGGHMGSGPIFSHS
gm042901_Glyma1 IVSFA--SSPSS-TTTV-SCDYALDL----------------------------------
Sb028388_Sorbi1 FSLLEDFSLFEAG-----DGQLKDVL------SDMEEGIQPPT-----------MISVCN
Sm002244_Selmo1 ------------------------------------------------------------
Os022569_Os05t0 -SGFGSMQSLQQ------------------------------------------------
pt005285_POPTR_ --IFGDYNSFMPPMFHS-DF----------------------------------------
pp007403_Pp1s29 ------------------TFDM--------------------------------------
pp025606_Pp1s26 DYWLADLDSVYSGCSSC-----------------MLEGVQSPI-------LARG------
AT1G79700.2 ---
pt011493_POPTR_ ---
Sb019012_Sorbi1 ---
pt042423_POPTR_ ---
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Sb015884_Sorbi1 ---
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pt035972_POPTR_ ---
gm050360_Glyma1 ---
gm046315_Glyma1 ---
Sb002937_Sorbi1 ---
pt029433_POPTR_ ---
Os039933_Os12t0 ---
gm004608_Glyma0 ---
gm022175_Glyma0 ---
pp008855_Pp1s13 WNE
gm042901_Glyma1 ---
Sb028388_Sorbi1 ---
Sm002244_Selmo1 ---
Os022569_Os05t0 ---
pt005285_POPTR_ ---
pp007403_Pp1s29 ---
pp025606_Pp1s26 ---
BoxShade v3.31 C (beta, 970507) Output
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