Input
| Putative repression domain
|
|
AT1G79700.2 |
not found |
|
Ortholog
| Putative repression domain
| Reverse top hit
| Relation
| Blast score ratio
| Type
|
Os031633 |
not found in 419aa |
AT1G79700.2 |
1st_1st |
0.523719165 |
Ia |
Os039933 |
not found in 446aa |
AT3G54320.1 |
not_not |
0.428842504 |
III |
Os022569 |
not found in 431aa |
AT3G54320.3 |
not_not |
0.419354838 |
III |
Sb005915 |
not found in 398aa |
AT1G16060.1 |
1st_not |
0.518026565 |
II |
Sb015884 |
not found in 440aa |
AT1G16060.1 |
not_not |
0.451612903 |
III |
Sb019012 |
not found in 443aa |
AT3G54320.1 |
not_not |
0.444022770 |
III |
Sb002937 |
not found in 488aa |
AT3G54320.1 |
not_not |
0.438330170 |
III |
Sb028388 |
not found in 544aa |
AT3G54320.1 |
not_not |
0.430740037 |
III |
Gm017156 |
not found in 287aa |
AT1G16060.1 |
1st_not |
0.588235294 |
II |
Gm022175 |
not found in 296aa |
AT1G16060.1 |
not_not |
0.574952561 |
III |
Gm046315 |
not found in 350aa |
AT1G16060.1 |
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III |
Gm004608 |
RPASATLALELLLQSS in 290/372 |
AT1G16060.1 |
not_not |
0.440227703 |
III |
Gm050360 |
not found in 392aa |
AT3G54320.1 |
not_not |
0.436432637 |
III |
Gm042901 |
not found in 409aa |
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not_not |
0.428842504 |
III |
Gm022256 |
not found in 423aa |
AT3G54320.3 |
not_not |
0.428842504 |
III |
Pt009075 |
not found in 353aa |
AT1G16060.1 |
1st_not |
0.531309297 |
II |
Pt029433 |
not found in 374aa |
AT1G16060.1 |
not_not |
0.531309297 |
III |
Pt011493 |
not found in 354aa |
AT1G16060.1 |
not_not |
0.512333965 |
III |
Pt005285 |
not found in 305aa |
AT1G16060.1 |
not_not |
0.481973434 |
III |
Pt042423 |
not found in 360aa |
AT3G54320.3 |
not_not |
0.436432637 |
III |
Pt033686 |
not found in 402aa |
AT3G54320.3 |
not_not |
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III |
Pt003325 |
not found in 386aa |
AT3G54320.3 |
not_not |
0.417457305 |
III |
Pt035972 |
not found in 418aa |
AT3G54320.1 |
not_not |
0.413662239 |
III |
Pp006331 |
not found in 515aa |
AT3G54320.1 |
1st_not |
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II |
Pp007403 |
not found in 501aa |
AT3G54320.1 |
not_not |
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III |
Pp008855 |
not found in 809aa |
AT1G51190.1 |
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III |
Pp025606 |
not found in 423aa |
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not_not |
0.409867172 |
III |
Sm016617 |
not found in 208aa |
AT3G54320.1 |
1st_not |
0.445920303 |
II |
Sm002244 |
not found in 181aa |
AT3G54320.1 |
not_not |
0.411764705 |
III |
Get sequence file
Get alignment file
Get formatted file made by BOXSHADE
Sequence file prepared (0 sec required). Alignment has started.
CLUSTAL format alignment by MAFFT FFT-NS-2 (v7.475)
AT1G79700.2 ------------------------------------------------------------
pt011493_POPTR_ ------------------------------------------------------------
pt033686_POPTR_ ------------------------------------------------------------
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pp008855_Pp1s13 MAQMLTSAFAPIRLMIKRCD-GPLGWTADHWPQTRAMQLDGGIHQHALVTADQLLRSAGK
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pt003325_POPTR_ ------------------------------------------------------------
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Os022569_Os05t0 ------------------------------------------------------------
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pp025606_Pp1s26 ------------------------------------------------------------
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pt011493_POPTR_ ----------------MGKTSKQSLKN---------------------------------
pt033686_POPTR_ ----------------MKRSSSCS------------------------------------
Os039933_Os12t0 ---------------------ASSSPS--------ASS--------------------SP
Sm002244_Selmo1 ------------------------------------------------------------
gm046315_Glyma1 ----------------MAKKSQLRTQK---------------------------------
pp008855_Pp1s13 RGVGDQQMTSSQSHYDMQNNAVETREDPKLEDFLGGSSLGGQYSNRESQQQQLDSMYYNV
pp007403_Pp1s29 ----------------MEPRQRSLMLS----SLVVAE-----------------------
pp006331_Pp1s32 ----------------MELHGRVA------------------------------------
gm004608_Glyma0 ----------------MAKKSQLRTQK---------------------------------
pt003325_POPTR_ --------------MMMIKNEENPGRR--RGCIA--------------------------
Sb028388_Sorbi1 RGEGRDGTETT---MDMERSQQQKSPT--------ESP--------------------PP
Os031633_Os08t0 ----------------MAKRRSNGETA---------------------------------
Sm016617_Selmo1 ----------------MPQVSSQS------------------------------------
pt009075_POPTR_ ----------------MAKLSQKNTKN---------------------------------
gm050360_Glyma1 --------------MVMMKENIIEEKL---------------------------------
gm017156_Glyma0 ----------------MAKKSQKSL-----------------------------------
Sb002937_Sorbi1 ----------------METYSLQVKDELHGGGIGIGGG--------------------GQ
pt029433_POPTR_ ----------------MGKTSKQSLKD---------------------------------
gm022175_Glyma0 ----------------MAKKSQKSLKN---------------------------------
pt042423_POPTR_ ----------------MKRSSSC-------------------------------------
Sb005915_Sorbi1 --------------MAKPRKNSAAANN---------------------------------
Sb015884_Sorbi1 ----------------MARPRKNAGTD---------------------------------
pt035972_POPTR_ --------------MEMTRNTGDQISLGRRRLCMIEEE----------------------
Sb019012_Sorbi1 -------MESS--GMMMVKSEIESCGY--------------------------------P
gm042901_Glyma1 ----------------MKRSPASS------------------------------------
gm022256_Glyma0 ----------------MKRSPASS------------------------------------
Os022569_Os05t0 -------MDHS---IMMVKNEIEN--Y--------------------------------S
pt005285_POPTR_ ----------------MAKLSQQNTKN---------------------------------
pp025606_Pp1s26 ----------------MKSAETETEGA---------------------------------
AT1G79700.2 ---VDDEISDKTASA--------SESASI-------------------------------
pt011493_POPTR_ ----SANTS-----------------INP-------------------------------
pt033686_POPTR_ ----SSSSSSSSSCV--------ASESIH-------------------------------
Os039933_Os12t0 SSPSSSSSEDSSSPMSMPCKRRARPRT---EKS---------------------------
Sm002244_Selmo1 ------------------------------------------------------------
gm046315_Glyma1 ----NNVTTNDDNNL--------NVTNTV-------------------------------
pp008855_Pp1s13 GAPGSTFTRDAQSRINVNLPYLSQPRSDTLHDVPPSFQVSYGRAPDQSCLSNPHNYEHPN
pp007403_Pp1s29 ------------------------------------------------------------
pp006331_Pp1s32 ----------------------RAGHSGVM------------------------------
gm004608_Glyma0 ----NNATNDDIN-L--------NATNTV-------------------------------
pt003325_POPTR_ -----------------------DSEAQV-------------------------------
Sb028388_Sorbi1 PSPSSSSSSVSADTVLPPPGKRRRAATTAKAKA---------------------------
Os031633_Os08t0 ----AASSDDSSSGVCGGG---GGGEVEP-------------------------------
Sm016617_Selmo1 ---------------------------TP-------------------------------
pt009075_POPTR_ ----TASNNNNT--------------TNG-------------------------------
gm050360_Glyma1 ----GRSQMSMV-----------EGEFQG-------------------------------
gm017156_Glyma0 ------------------------------------------------------------
Sb002937_Sorbi1 GLYCGATPRPAAPAATGGG---GGGGDGA-------------------------------
pt029433_POPTR_ ----TANTS-----------------TNP-------------------------------
gm022175_Glyma0 ----NN---------------------NN-------------------------------
pt042423_POPTR_ ----SSSSSSSPYCV--------ASESIQ-------------------------------
Sb005915_Sorbi1 ----NNSSSNGAG------------DLTP-------------------------------
Sb015884_Sorbi1 ----EDNPNAATG----------VSVTGK-------------------------------
pt035972_POPTR_ -----------------------RRAGEA-------------------------------
Sb019012_Sorbi1 GP--SSSTAPAAGVVIGGSATTERGEGGHHHHH---------------------------
gm042901_Glyma1 ---CSSSTSSVGFEA---------------------------------------------
gm022256_Glyma0 ---CSSSTSSVGFEVH--------------------------------------------
Os022569_Os05t0 G----SSPAMIINALEGGA------EAGP-------------------------------
pt005285_POPTR_ ----TAINRNNT--------------TNG-------------------------------
pp025606_Pp1s26 ----CSSSRSGSGSASGSY---SGAEIGAVG-----------------------------
AT1G79700.2 ------------------------------------------------------------
pt011493_POPTR_ ------------------------------------------------------------
pt033686_POPTR_ ------------------------------------------------------------
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pp008855_Pp1s13 TRAQLEFQEGNLLPGTRLHPQNLLQATLDQSATAELLSDCALQSPSGGSLNTGSEDYKLK
pp007403_Pp1s29 ------------------------------------------------------------
pp006331_Pp1s32 ------------------------------------------------------------
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gm042901_Glyma1 ------------------------------------------------------------
gm022256_Glyma0 ------------------------------------------------------------
Os022569_Os05t0 ------------------------------------------------------------
pt005285_POPTR_ ------------------------------------------------------------
pp025606_Pp1s26 ------------------------------------------------------------
AT1G79700.2 ------ALTSKR--------------------------------------------KRKS
pt011493_POPTR_ ------ATKVKR--------------------------------------------TRKS
pt033686_POPTR_ ------KPKAKR--------------------------------------------IRKN
Os039933_Os12t0 ------TGKAKR--------------------------------------------PKKE
Sm002244_Selmo1 ------------------------------------------------------------
gm046315_Glyma1 ------TTKVKR--------------------------------------------TRRS
pp008855_Pp1s13 MWLRHQAAVDKRKLDGLASLQPLTLSMSSGSHETNISNAVQTAGLFLTTDCTAVAEPRKR
pp007403_Pp1s29 ------DKVCKR-------------------------------------------TVRQY
pp006331_Pp1s32 ------ATTFKR-------------------------------------------TVRQY
gm004608_Glyma0 ------ITKVKR--------------------------------------------TRRS
pt003325_POPTR_ ------ARCVKR--------------------------------------------RRRD
Sb028388_Sorbi1 ------GAKPKR--------------------------------------------ARKD
Os031633_Os08t0 ------RRRQKR--------------------------------------------PRRS
Sm016617_Selmo1 ------VVKRKRGPAG--------------------------------------TSSRER
pt009075_POPTR_ ------VTKVKR--------------------------------------------TRRS
gm050360_Glyma1 ------TWGVKR--------------------------------------------RRRE
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Sb002937_Sorbi1 ------VKSNKR--------------------------------------------SRKR
pt029433_POPTR_ ------TNKVKR--------------------------------------------TRKT
gm022175_Glyma0 ------NTTRKR--------------------------------------------TRKS
pt042423_POPTR_ ------KPKVKR--------------------------------------------IRKN
Sb005915_Sorbi1 ------RAKPKR--------------------------------------------TRKS
Sb015884_Sorbi1 ------PPKLKR-------------------------------------------VRRKG
pt035972_POPTR_ ------GKCIKR--------------------------------------------RRRD
Sb019012_Sorbi1 -----HQVVVRR--------------------------------------------RRRE
gm042901_Glyma1 -------PIEKRRPKH----------------------------------------PRRN
gm022256_Glyma0 ------HPIEKRRPKH----------------------------------------PRRN
Os022569_Os05t0 --------VVRR--------------------------------------------RRRE
pt005285_POPTR_ ------VTKVKR--------------------------------------------TRRS
pp025606_Pp1s26 ------IGVVGR-------------------------------------------SRRKR
AT1G79700.2 ------------------PPRNAPL---------------------------------QR
pt011493_POPTR_ ------------------VPRDSPP---------------------------------QR
pt033686_POPTR_ ------------QKSNQGKSQNAAAAAANNSHNSG-----------------------KR
Os039933_Os12t0 SKEVAD-------------PSSNGG-------GGG-----------------------KR
Sm002244_Selmo1 ------------------MPPCTAG---------------------------------KR
gm046315_Glyma1 ------------------VPRDSPP---------------------------------QR
pp008855_Pp1s13 GA--------GRSGRKEPSPRKSID-------TFG-----------------------QR
pp007403_Pp1s29 PA-------RSKSKRKSFAERELAG----ADACGGPL---------------------KR
pp006331_Pp1s32 PA-------RNKTARKPVVEKDSGD------ARSGPV---------------------KR
gm004608_Glyma0 ------------------VPRDSPP---------------------------------QR
pt003325_POPTR_ PAIVALGS--DDNQSQQQMPQKQTD----------------------QTSAATTV---KR
Sb028388_Sorbi1 AAAAADP-----------PPPPAAA-------AAG-----------------------KR
Os031633_Os08t0 ------------------APRDCPS---------------------------------QR
Sm016617_Selmo1 SC---------------KIPAPTAG---------------------------------KR
pt009075_POPTR_ ------------------VPRDSPP---------------------------------QR
gm050360_Glyma1 VAAAASSG--DDNH-HQQLPQQEVG----------------------ENSSISTT---KR
gm017156_Glyma0 ------------------VPRDSPP---------------------------------QR
Sb002937_Sorbi1 ------------------EPPPPPPSSLVTMSNGGKDE---AVAGSGDKSASSNSNASKR
pt029433_POPTR_ ------------------VPRDSPP---------------------------------QR
gm022175_Glyma0 ------------------VPRDSPP---------------------------------QR
pt042423_POPTR_ ------------QKSNQGKSHKNAAAAA-NSPNSG-----------------------KR
Sb005915_Sorbi1 ------------------VPRESPT---------------------------------QR
Sb015884_Sorbi1 ------------------EPRESSTPS-------------------------------QR
pt035972_POPTR_ PSTFALSCNINDQQSDQQQQQQSLG---------------------DRTAAVATTV--KR
Sb019012_Sorbi1 PPLL--------------API-----------AGG---------GIGK-PLPSITV--KR
gm042901_Glyma1 ------------NLKSQKCKQNQTT-------TGG-----------------------RR
gm022256_Glyma0 ------------NLKSQKCKQNQTT-------TGG-----------------------RR
Os022569_Os05t0 PSLL--------------APINGDG-----DTNGG---------GIGKSSLSGITV--KR
pt005285_POPTR_ ------------------VPRDSPP---------------------------------QR
pp025606_Pp1s26 ------------SSRMRTFSSGTAALALVVSTAEGQTRERKH----------------ER
.*
AT1G79700.2 SSPYRGV---T--------------RHRWTGRYEAHLWDKNSWNDTQT-KKGRQVYLGAY
pt011493_POPTR_ SSIYNHILFSL--------------KHRWTGRYEAHLWDKNCWNESQN-KKGRQVYLGAY
pt033686_POPTR_ SSIYRGV---T--------------RHRWTGRFEAHLWDKSSWNSIQN-KKGKQ---GAY
Os039933_Os12t0 SSIYRGV---T--------------RHRWTGRFEAHLWDKNCSTSLQNKKKGRQVYLGAY
Sm002244_Selmo1 SSIYRGV---T--------------RHRWTGRYEAHLWDKGTWNHTQN-KKGKQGILHSY
gm046315_Glyma1 SSIYRGV---T--------------RHRWTGRYEAHLWDKHCWNESQN-KKGRQG---AY
pp008855_Pp1s13 TSVFRGV---T--------------RHRWTGRYEAHLWDNTCRKEGQT-RKGRQVYLGGY
pp007403_Pp1s29 SSSFRGV---T--------------RHRWTGRFEAHLWDKNCWNDKQK-KKGRQG---AY
pp006331_Pp1s32 SSGFRGV---T--------------RHRWTGRFEAHLWDKNCWNHKQN-KKGRQVYLGAY
gm004608_Glyma0 SSIYRGV---T--------------RHRWTGRYEAHLWDKHCWNESQN-KKGRQG---AY
pt003325_POPTR_ SSRFRGV---S--------------RHRWTGRFEAHLWDKLSWNVTQK-KKGKQG---AY
Sb028388_Sorbi1 SSVYRGV---T--------------RHRWTGRFEAHLWDKHCLAALHNKKKGRQVYLGAY
Os031633_Os08t0 SSAFRGV---T--------------RHRWTGRFEAHLWDKNTWNESQS-KKGRQVYLGAY
Sm016617_Selmo1 SSIYRGV---T--------------RHRWTGRYEAHLWDKSTWNHTQN-KKGKQG---AY
pt009075_POPTR_ SSIYRGV---T--------------RHRWTGRYEAHLWDKNCWNESQN-KKGRQG---AY
gm050360_Glyma1 SSRFRGV---S--------------RHRWTGRYEAHLWDKLSWNITQK-KKGKQVYLGAY
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gm022175_Glyma0 SSIYRGV---T--------------RHRWTGRYEAHLWDKNCWNESQS-KKGRQG---AY
pt042423_POPTR_ SSIYRGV---T--------------RHRWTGRFEAHLWDKSSWNSIQN-KKGKQVYLGAY
Sb005915_Sorbi1 SSVYRGV---T--------------RHRWTGRFEAHLWDKNSWNESQN-KKGKQVYLGAY
Sb015884_Sorbi1 SSAYRGV---T--------------RHRWTGRFEAHLWDKDARNGSRN-KKGKQG---AY
pt035972_POPTR_ SSRFRGV---S--------------RHRWTGRFEAHLWDKGTWNPTQR-KKGKQG---AY
Sb019012_Sorbi1 SSRFRGV---S--------------RHRWTGRFEAHLWDKNSWNPTQR-KKGKQVYLGAY
gm042901_Glyma1 SSIYRGV---T--------------RHRWTGRFEAHLWDKSSWNNIQS-KKGRQG---AY
gm022256_Glyma0 SSIYRGV---T--------------RHRWTGRFEAHLWDKSSWNNIQS-KKGKQG---AY
Os022569_Os05t0 SSRFRGV---SRFRACRDDKKMLSCRHRWTGRFEAHLWDKNSWNPTQR-KKGKQVYLGAY
pt005285_POPTR_ SSIYRGV---T--------------RHRWTGRYEAHLWDKNCWNESQN-KKGRQG---AY
pp025606_Pp1s26 SSQYRGV---T--------------KHRGTGRFEAHLWDKTGWNQKQH-KKGKQVYLGAY
:* :. : :** ***:******: : :**:* .*
AT1G79700.2 DEEEAAARAYDLAALKYWGRDTLLNFPLPSYDEDVKEMEGQSKEEYIGSLRR----KSSG
pt011493_POPTR_ DDEEAAGHAYDLAALKYWGQDTILNFPLSTYEEEFKEMEGHSKEEYIGSLRR----KSSG
pt033686_POPTR_ DNEEAAAHTYDLAALKYWGSETTLNFPIETYTKEIEEMQKVTKEEYLASLRR----QSSG
Os039933_Os12t0 DSEEAAARAYDLAALKYWGPETVLNFPLEEYEKERSEMEGVSREEYLASLRR----RSSG
Sm002244_Selmo1 DDEEAAARAYDLAALKYWGPGTLINFPVTDYTRDIEEMQNVSREEYLASLRRQEEQRARA
gm046315_Glyma1 DNEEAAAHAYDLAALKYWGQDTILNFPLSNYLNELKEMEGQSREEYIGSLRR----KSSG
pp008855_Pp1s13 DKEEKAARAYDLAALKYWGPSTTINFPLGTYEKELEEMKNMSRQEYVASLRR----KSSG
pp007403_Pp1s29 DEEEAAARAYDLAALKYWGQSTVINFKLEDYQQQLEEMRNITREEYLATLRR----KSSG
pp006331_Pp1s32 DEEEAAARAYDLAALKYWGPGTIINFKLEDYERQIQEMAVISPEEYLASLRR----KSSG
gm004608_Glyma0 DNEEAAAHAYDLAALKYWGQDTILNFPLSNYLNELKEMEGQSREEYIGSLRR----KSSG
pt003325_POPTR_ DEEESAARAYDLAALKYWGTSTFTNFPISDYEKEIEIMQTVTKEEYLASLRR----KSSG
Sb028388_Sorbi1 DSEEAAARAYDLAALKYWGPETLLNFPVEDYSSEMPEMEGVSREEYLASLRR----RSSG
Os031633_Os08t0 DGEEAAARAYDLAALKYWGHDTVLNFPLSTYDEELKEMEGQSREEYIGSLRR----KSSG
Sm016617_Selmo1 DDEEAAARAYDLAALKYWGPGTLINFPVTDYAKDIDEMQSVTREEYLASLRR----KSSG
pt009075_POPTR_ DDEEAAAHAYDLAALKYWGPETILNFPLSTYQNELKEMEGQSREECIGSLRR----KSSG
gm050360_Glyma1 DEEESAARAYDLAALKYWGNSTFTNFPISDYEKEIEIMQTMTKEEYLATLRR----KSSG
gm017156_Glyma0 DDEEAAARAYDLAALKYWGQDTILNFPLSNYEEKLKEMEGQSKEEYIGSLRR----KSSG
Sb002937_Sorbi1 NEEDAAARAYDLAALKYWGPTTYTNFPVVDYERELKVMQNVSKEEYLASIRR----KSNG
pt029433_POPTR_ DDEEAAAHAYDLAALKYWGQDTILNFPWSTYKEELKEMEGQSKEEYIGSLRR----KSSG
gm022175_Glyma0 DDEEAAARAYDLAALKYWGQDTILNFPLSNYEEKLKEMEGQSKEEYIGSLRR----KSSG
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Sb005915_Sorbi1 DDEEAAARAYDLAALKYWGPDTILNFPASAYEGEMKGMEGQSREEYIGSLRR----KSSG
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pp025606_Pp1s26 EKETAAARAYDMAALKYWGPETVINFELEDYTQELKEMAKISKEEYLATLRR----KSTG
: * *.:::*:******* : ** * . * . :* :.::** ::
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** . ****:***::* *:****:* *** ** **: :.:
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: :
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pp025606_Pp1s26 A----QRISLDDFCFEGHSEDVHTKSARNFCSFSHIKDEDLPDFYTDPEDLSIDYLDSKA
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