Input
| Putative repression domain
|
|
AT2G13570.1 |
not found |
|
Ortholog
| Putative repression domain
| Reverse top hit
| Relation
| Blast score ratio
| Type
|
Os028984 |
not found in 224aa |
AT4G14540.1 |
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III |
Os028983 |
not found in 224aa |
AT4G14540.1 |
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0.454787234 |
III |
Os030323 |
not found in 288aa |
AT4G14540.1 |
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III |
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not found in 129aa |
AT4G14540.1 |
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III |
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not found in 143aa |
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III |
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III |
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III |
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AT4G14540.1 |
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III |
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not found in 167aa |
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III |
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not found in 135aa |
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0.409574468 |
III |
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not found in 177aa |
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III |
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III |
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III |
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AT5G47640.1 |
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0.452127659 |
III |
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III |
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AT5G47640.1 |
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AT3G53340.1 |
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AT2G37060.3 |
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III |
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0.436170212 |
III |
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AT2G47810.1 |
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III |
Get sequence file
Get alignment file
Get formatted file made by BOXSHADE
Sequence file prepared (0 sec required). Alignment has started.
CLUSTAL format alignment by MAFFT FFT-NS-2 (v7.475)
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Sb026432_Sorbi1 -----LKG------------PGGGVVGAVHGGAEHEMTG--------------CGAGTG-
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Sb001867_Sorbi1 -----MPD------------------------SDNDSGG-----PSN-------------
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gm028165_Glyma1 ---------SLSGAAR-EQDRYLPIANISR-----------IMKKALPPNGKIAKDAKDT
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Sb015253_Sorbi1 --YCGGG--GGESPAK-EQDRFLPIANVSR-----------IMKRSLPANAKISKEAKET
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Os028984_Os07t0 ----AGEY----ASAR-EQDRFLPIANVSR-----------IMKRALPANAKISKDAKET
Os005512_Os01t0 -QGEAADQAAAE-IIK-EQDRLLPIANVGR-----------IMKQILPPNAKISKEAKET
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gm026530_Glyma1 -TASASGTSAQDGVIK-EQDRLLPIANVGR-----------IMKQILPPNAKISKEAKET
Sb032742_Sorbi1 -----------------SQS-----SSPSS-----------LAKRVTSARGRSGRPSTAT
Sm007604_Selmo1 --------------LQ-RRDGIAP-----------------LEIELEWIDVVLESQRPHR
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pt036929_POPTR_ -----------ESSSKLEQDRFLPIANVSR-----------IMKKSLPANAKISKEAKET
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Sb026432_Sorbi1 ----AGGRGGTRVVVS-AWSGSAPARGCGRGGAVALELAVLVEVPAHGVDVVVEAEGAEG
gm041932_Glyma1 ----SGS--NEFSGCR-EQDRFLPIANVSR-----------IMKKALPANAKISKEAKET
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pt041090_POPTR_ -----------SG-VR-EQDRYLPIANISR-----------IMKKALPANGKIAKDAKDT
Sb001867_Sorbi1 ----AG---GELSSPR-EQDRFLPIANVSR-----------IMKKALPANAKISKDAKET
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Os022924_Os05t0 ----GGG-----GVGK-EQDRFLPIANIGR-----------IMRRAVPENGKIAKDSKES
pt035616_POPTR_ -----------SG-VR-EQDRYLPIANISR-----------IMKKALPANGKIAKDAKDT
Sb008970_Sorbi1 ----GGG--GGGGGYR-EQDRFLPIANISR-----------IMKKAVPANGKIAKDAKET
Sm017738_Selmo1 ----HG-GERDNSNVR-EQDRFLPIANISR-----------IMKKALPANAKIAKDAKET
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pp037984_Pp1s25 ---NHGSGERDNSSVR-EQDRFLPIANISR-----------IMKKALPANAKIAKDAKET
. :
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. *.::. . :. : :
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**
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gm028166_Glyma1 S--MQGHE----------
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BoxShade v3.31 C (beta, 970507) Output
AT2G13570.1 |
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