Input
| Putative repression domain
|
|
AT2G16720.1 |
EKIGPDLNLELRISPP at 188/269 in AT2G16720.1 |
|
Ortholog
| Putative repression domain
| Reverse top hit
| Relation
| Blast score ratio
| Type
|
Sb031046 |
VPRCPDLNLDLCISPP in 216/452 |
AT4G34990.1 |
not_not |
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III |
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not found in 288aa |
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not_not |
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III |
Sb016715 |
VVGGIDLNLSLSPPTS in 196/215 |
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III |
Sb023923 |
not found in 508aa |
AT4G05100.1 |
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III |
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not found in 445aa |
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III |
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not found in 432aa |
AT1G34670.1 |
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0.408366533 |
III |
Sb032167 |
not found in 663aa |
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III |
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not found in 342aa |
AT5G15310.1 |
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III |
Sb010896 |
not found in 164aa |
AT1G66230.1 |
not_not |
0.400398406 |
III |
Get sequence file
Get alignment file
Get formatted file made by BOXSHADE
Sequence file prepared (0 sec required). Alignment has started.
CLUSTAL format alignment by MAFFT FFT-NS-2 (v7.475)
AT2G16720.1 -------------------------------------------------MGRSPCCEK-E
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Sb010610_Sorbi1 -------------------------------------------------MGRSPCCEKEA
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Sb018705_Sorbi1 -----------------EDPRGRAAP-------------------RRQQQGRAP------
Sb031258_Sorbi1 EGASLA-----------------SYPVVAIDRSIEIGPVQCQSRLRRAAMGRSPCCDE-N
Sb009095_Sorbi1 -------------------------------------------------MGRSPCCEK-A
Sb016715_Sorbi1 -------------------------------------------------MGRSPCCEK-A
Sb027621_Sorbi1 QEASRAKGGCRQVVSLLPNPTCTTLPPVPFHLS----------------MGRSPCCDE-N
Sb031046_Sorbi1 ----------------LPYPN----P-----------------------TSQEP--NQ--
Sb023923_Sorbi1 -------------------------------------------------MGRAPCCEK-S
.: .
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Sb018705_Sorbi1 ----------EPGQVLAVDRRHEWWSGFFQLGRG--------------------------
Sb031258_Sorbi1 GLKKGPWTQEEDEKLLHYIQKN---------GHG--------------------------
Sb009095_Sorbi1 HTNKGAWTKEEDQRLIAYIKAH---------GEG--------------------------
Sb016715_Sorbi1 HTNKGAWTKEEDQRLVAYIKAH---------GEG--------------------------
Sb027621_Sorbi1 GLKKGPWTPEEDQKLMEYIQKH---------GHG--------------------------
Sb031046_Sorbi1 -------TKEKNSAAGHFDRSY---------GHGRLIHSLHLEASEVEHAGPEPQEAVVA
Sb023923_Sorbi1 GMKKGPWTPEEDEKLIAYIKKH---------GQG--------------------------
: *.
AT2G16720.1 --CWRSLP--------------------RAAGLLRC------------------------
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Sb010610_Sorbi1 --CWRSLP--------------------AKAGLRRC------------------------
Sb032167_Sorbi1 --CWSSVP--------------------KLAGLQRC------------------------
Sb018705_Sorbi1 --SHGEVAVLREGAH---EQGRVDQGGGRAAGGVHP------------------------
Sb031258_Sorbi1 --SWRTLP--------------------RLAGLNRC------------------------
Sb009095_Sorbi1 --CWRSLP--------------------KAAGLLRC------------------------
Sb016715_Sorbi1 --CWRSLP--------------------KAAGLLRC------------------------
Sb027621_Sorbi1 --SWRALP--------------------RLAGLNRC------------------------
Sb031046_Sorbi1 VAAAAAAP----GGSFLDAQAAAEAEAAAMAGLQHLPLDDDGGLEVQLLVFLLLARRADA
Sb023923_Sorbi1 --NWRTLP--------------------KNAGLARC------------------------
. ** :
AT2G16720.1 --------------GKSCRL----RWI---------------------------------
Sb010896_Sorbi1 --------------GKSCRL----RWT---------------------------------
Sb010610_Sorbi1 --------------GKSCRL----RWT---------------------------------
Sb032167_Sorbi1 --------------GKSCRL----RWI---------------------------------
Sb018705_Sorbi1 --------------GARGRV----LALAAQGGG---------------------------
Sb031258_Sorbi1 --------------GKSCRL----RWT---------------------------------
Sb009095_Sorbi1 --------------GKSCRL----RWM---------------------------------
Sb016715_Sorbi1 --------------GKSCRL----RWI---------------------------------
Sb027621_Sorbi1 --------------GKSCRL----RWT---------------------------------
Sb031046_Sorbi1 EIEVEVGAPGHLNDGRRHRLDRLMLWRLRCDGGVGFVGLERDGGDGAGAGVGDGAVRDGV
Sb023923_Sorbi1 --------------GKSCRL----RWT---------------------------------
* *:
AT2G16720.1 ----NYLRPDL---------------------------KRGNFTHDEDELIIKLHSLLGN
Sb010896_Sorbi1 ----NYLRPDL---------------------------KRGLLSEEEEALVIDLHAQLGN
Sb010610_Sorbi1 ----NYLRPDI---------------------------KRGKFTLQEEQTIIQLHALLGN
Sb032167_Sorbi1 ----NYLRPDL---------------------------KRGAFSQDEEELIIELHAVLGN
Sb018705_Sorbi1 ---PAALRQELQAAVDELP--------PPGPQARQLHRRRGRAHHPPAQP--PRQQVVSD
Sb031258_Sorbi1 ----NYLRPDI---------------------------KRGKFSQEEEQTILHLHSVLGN
Sb009095_Sorbi1 ----NYLRPDL---------------------------KRGNFTDDDDEIIIKLHALLGN
Sb016715_Sorbi1 ----NYLRPDL---------------------------KRGNFTQEEDELIIKLHQILGN
Sb027621_Sorbi1 ----NYLRPDI---------------------------KRGKFTQEEEQTILQLHSVLGN
Sb031046_Sorbi1 DAPAKQLPPDV-----RVPVVLDLVVRPP----RE---PRG-----DERPLVAEEAV---
Sb023923_Sorbi1 ----NYLRPDI---------------------------KRGRFSFEEEETIIQLHSILGN
* :: ** .
AT2G16720.1 KWSLIAARLPGRTDNEIKNYWNTHIKRKLLSKGIDPATHRG-------------------
Sb010896_Sorbi1 RWSKIAARLPGRTDNEIKNHWNTHIKKKLKKMGIDPVTHRP-------------------
Sb010610_Sorbi1 RWSSIATHLPKRTDNEIKNYWNTHLKKRLAKMGIDPVTHKP-------------------
Sb032167_Sorbi1 RWSQIAAQLPGRTDNEIKNLWNSCIKKKLRQKGIDPNTHKPL------------------
Sb018705_Sorbi1 RRA--AAGPDGQRDQEL-------LEHAHQAQAPGPR-HRPADAPRARSQSRRRHGSRRR
Sb031258_Sorbi1 KWSAIATHLPGRTDNEIKNFWNTHLKKRLIQMGFDPMTHRP-------------------
Sb009095_Sorbi1 KWSLIAGQLPGRTDNEIKNYWNTHIKRKLLSRGIDPQTHRP-------------------
Sb016715_Sorbi1 KWSLIAGRLPGRTDNEIKNYWNTHIKRKLIARGIDPRTHQP-------------------
Sb027621_Sorbi1 KWSAIAKHLPGRTDNEIKNFWNTHLKKKLIQMGFDPMTHRP-------------------
Sb031046_Sorbi1 -----------QLDDEVVLVGGEVAALEVGAEVVDPA-----------------------
Sb023923_Sorbi1 KWSAIAARLPGRTDNEIKNYWNTHIRKRLLRMGIDPVTHAP-------------------
: *:*: .*
AT2G16720.1 ----INEAKISDLKKTKDQIV--------------------------KDVSFVTKFEETD
Sb010896_Sorbi1 ------------------------------------------------------------
Sb010610_Sorbi1 ---RADLGASSGSAAGAGAGARYRAAAHLNHTASW------------ES-ARLEAEARLA
Sb032167_Sorbi1 --TEADRSGAAPTVSTERTSG----SSDVNPSSAGALGNLSHLLSETAQSSMLMPMYDKN
Sb018705_Sorbi1 RGAPPGGGAAAPPRGRRRRPGG-PGQAPRREAGARGV-----VIRRRRQQQHRQQRRRQR
Sb031258_Sorbi1 ---RTDFFAALPQLIALAALR--------QHLQLG----------DQQQAAKLQYLQSLL
Sb009095_Sorbi1 ----LSGGAAAGSGLTTSSTAGFPAQAPAPTRPA-------------RPVIIIPPNVMFA
Sb016715_Sorbi1 ----ASAGAVAPAPGAAASAA-----APSSHRQHG----------DDKAAAVVRSSGCSS
Sb027621_Sorbi1 ---RTDFFAALPQLIALANLRQLVEQRPWDDHTARI-------QVEAVQAAKLQCLQNLL
Sb031046_Sorbi1 ---EAAALAAAHQSGRLGQ----------------------------RPPAPFAVRADVR
Sb023923_Sorbi1 ---RLDLLDLSALLKPA-AAAYYPTQADLDTLRAL------------EPLANYPDLLRLA
AT2G16720.1 KSG-----------------------DQKQNKYIRNGLV-------------------CK
Sb010896_Sorbi1 ------------------------------------------------------------
Sb010610_Sorbi1 REAK--------------LRAIVSPPPAPAPGPGTGPAFISGLESPTSTLS------FSE
Sb032167_Sorbi1 RTETPNLARPKVPPKELFLEQLTAGHESPSTCRSSGQTLYFPFQQPLGYNSESGSGDGAN
Sb018705_Sorbi1 RGAT-------VPR------------PQPQPRPVRGLAA---------------AGGGCR
Sb031258_Sorbi1 QSA----------------ATTISSSDTEAPALGLGAIC-------------------CS
Sb009095_Sorbi1 RPA-----------------------PSEDGHSSSGGSTD-----------------APR
Sb016715_Sorbi1 RDS------------------------SGDDDSTSGSSV-------------------PH
Sb027621_Sorbi1 QSA----------------ASIATS---------------------------------PS
Sb031046_Sorbi1 HQAVVLLL---GPR----------------------------------------------
Sb023923_Sorbi1 ST------------------LLSSGPPAIGDHHQNGQLLPWILQAQMAQQA------AAA
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Sb032167_Sorbi1 MNSLWFNQ-----SDFNCSTIS----TVMPPVS--------------------------P
Sb018705_Sorbi1 HAHLAV--------------------PVLPP-----------------------------
Sb031258_Sorbi1 PPQLTTTPLDSCTAPVSSSLLPCTFPEAAPPVSSEEDEANNHQQQQT------------A
Sb009095_Sorbi1 CPDL----------NLDLDL------SVGPP---------CSPPKT-------------P
Sb016715_Sorbi1 QHQLVV-------GGIDLNL------SLSPP---------TSQPSS-------------P
Sb027621_Sorbi1 SSSINTNTI-----PSDLEQIG----LLSPP--------QMSSLST----------LPSP
Sb031046_Sorbi1 -------------ALVRVRLLA----ARRPP--------------------------HRP
Sb023923_Sorbi1 MAQ-----------------------QVAPP-----------PQQQAEQFMQAGAACQMP
**
AT2G16720.1 STCTA--SRFYMENDME----------C--------------SSE---------------
Sb010896_Sorbi1 RLVRF---------------------------------LQIESIE---------------
Sb010610_Sorbi1 GFV------------LAGVLLDSSVAGADQQR------FAASSTD--ASVSVSEQQEEED
Sb032167_Sorbi1 SALST-----SMGLNLPPDN-------------PRHGGTGIGSTAVDSF-----------
Sb018705_Sorbi1 -------------------------------RPPRRGGVRLRG-----------------
Sb031258_Sorbi1 GLSSS-------YGGLGSA---DDVFACH---------GGSSSSSLPPLTDLSDA-----
Sb009095_Sorbi1 AAAVT--TPTSQQQEMQRA----TICLCYH--------LGVRSGD---------------
Sb016715_Sorbi1 AAAN--------------------------------------------------------
Sb027621_Sorbi1 SFLES-----ISGQDIAAA-------------------GQLPDIQIPS--SFFEQQPTSN
Sb031046_Sorbi1 ASCLA--FRFRFGYRFAVWS----------------GGRRLRRAG---------------
Sb023923_Sorbi1 DLVHMNSNPTTVQQQLAAAHQDMAAAACHSMQPPNNTGYEVDSLDVPALMQMVQAADASN
AT2G16720.1 ----------------------TVKCQTENSSSISYSSIDISSSNVGY------------
Sb010896_Sorbi1 ------------------------------------------------------------
Sb010610_Sorbi1 KGYWSSIL-----------NMVNSSMSSSSSS----LTSDAVTDPAMY------------
Sb032167_Sorbi1 --YWDGT------------NPSSSSSTGSRGSNSMGFEPQSTSSILENSVFPWTNIG---
Sb018705_Sorbi1 ------------------------------------------------------------
Sb031258_Sorbi1 --HAGSLL------------QVDGSMRSATAS--SSFGGGSSCSPLPW------------
Sb009095_Sorbi1 ----------------------ACSCKT-------------AASPAGF------------
Sb016715_Sorbi1 ------------------------------------------------------------
Sb027621_Sorbi1 DANQHSDFTP------------KSSVEGENGTPKTLLLSENSLPPLTDF--PISNLGDAC
Sb031046_Sorbi1 -------------------RGASSAIGLEN------------------------------
Sb023923_Sorbi1 LQQWSSTVTSSSNNNNNNNNNVGSGVSTPSSSPVARLNHSTSTTTTTYG-----------
AT2G16720.1 -----------------DF-LGLKT-----RILDFRSLEMK---
Sb010896_Sorbi1 -----------------RFSIEM----------------VYKFV
Sb010610_Sorbi1 ----------LPAAAAAEF-------------------------
Sb032167_Sorbi1 QEKDTRAHLVEELKWPDLLHGPLPRRPQPCRTRARRSM-MT---
Sb018705_Sorbi1 --------------------------------------------
Sb031258_Sorbi1 ---------------PELF------------FPDDDPF-ITDFL
Sb009095_Sorbi1 -----------------RF-L--------------RPLEEGQYI
Sb016715_Sorbi1 --------------------------------------------
Sb027621_Sorbi1 GASSCDGSSIPFPSWPELF---------------DEQF-ICEFV
Sb031046_Sorbi1 --------------------------------------------
Sb023923_Sorbi1 GASA--STSNDAAAAAALFNMQLS-----------ELLDVSDYM
BoxShade v3.31 C (beta, 970507) Output
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