Input
| Putative repression domain
|
|
AT2G16720.1 |
EKIGPDLNLELRISPP at 188/269 in AT2G16720.1 |
|
Ortholog
| Putative repression domain
| Reverse top hit
| Relation
| Blast score ratio
| Type
|
Sb023642 |
not found in 418aa |
AT4G38620.1 |
1st_not |
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III |
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not found in 288aa |
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not_not |
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III |
Sb016715 |
VVGGIDLNLSLSPPTS in 196/215 |
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not_not |
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III |
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not found in 508aa |
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not found in 445aa |
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III |
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not found in 432aa |
AT1G34670.1 |
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0.408366533 |
III |
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not found in 663aa |
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not found in 342aa |
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III |
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not found in 164aa |
AT1G66230.1 |
not_not |
0.400398406 |
III |
Get sequence file
Get alignment file
Get formatted file made by BOXSHADE
Sequence file prepared (0 sec required). Alignment has started.
CLUSTAL format alignment by MAFFT FFT-NS-2 (v7.475)
AT2G16720.1 ------------------------------------------------------------
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Sb016715_Sorbi1 ------------------------------------------------------------
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Sb010896_Sorbi1 ------------------------------------------------------------
Sb031258_Sorbi1 -------EGASLA------------------S-----YPVVAIDR------SIEIGPVQC
Sb023923_Sorbi1 ------------------------------------------------------------
Sb032167_Sorbi1 ------------------------------------------IWS------SQVLHCIE-
Sb031046_Sorbi1 -------------------------------------LPYPNPT-------SQEPNQT--
Sb023642_Sorbi1 VGDGNYREKERRQNGATRE--SSREDVPRAQILTFFFLPYLSFTHSLLRIFTYEANQIRI
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Sb031258_Sorbi1 -QSR-----------LRRAAMGR---SPCCDE-NGLKKGPWTQEEDEKLLHYIQKN----
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Sb032167_Sorbi1 --------------------MGR---HSCCYK-QKLRKGLWSPEEDEKLMNHITKH----
Sb031046_Sorbi1 -----KEKNSAAGHFDRSYGHGRLIHSLHLEA-SEVEHAGPEPQEAVVAVAAAAAA----
Sb023642_Sorbi1 IQARCKKKNKKG---EITEGETR---SFHLEA-SEVEHGGPESEE----VAALAV-----
* * :
AT2G16720.1 -----GEGCWRS-----------------LP-----------------------------
Sb010610_Sorbi1 -----GHGCWRS-----------------LP-----------------------------
Sb018705_Sorbi1 GFFQLGRGSHGE-----------------VAVLRE--GAHEQG----------------R
Sb027621_Sorbi1 -----GHGSWRA-----------------LP-----------------------------
Sb016715_Sorbi1 -----GEGCWRS-----------------LP-----------------------------
Sb009095_Sorbi1 -----GEGCWRS-----------------LP-----------------------------
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Sb031258_Sorbi1 -----GHGSWRT-----------------LP-----------------------------
Sb023923_Sorbi1 -----GQGNWRT-----------------LP-----------------------------
Sb032167_Sorbi1 -----GHGCWSS-----------------VP-----------------------------
Sb031046_Sorbi1 -----PGGSFLDAQAAAEAEAAAMAGLQHLP-LDDDGGLEVQ--LLVFLLLARRADAEIE
Sb023642_Sorbi1 -------GALGEAQAAAEAEPG-------LP-LH---GLHRHHGLLLLARRRRRADAEVQ
:.
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Sb010610_Sorbi1 -------AK-----AGLR---------RCGKSCRL-RWT---------------------
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Sb027621_Sorbi1 -------RL-----AGLN---------RCGKSCRL-RWT---------------------
Sb016715_Sorbi1 -------KA-----AGLL---------RCGKSCRL-RWI---------------------
Sb009095_Sorbi1 -------KA-----AGLL---------RCGKSCRL-RWM---------------------
Sb010896_Sorbi1 -------KL-----AGLL---------RCGKSCRL-RWT---------------------
Sb031258_Sorbi1 -------RL-----AGLN---------RCGKSCRL-RWT---------------------
Sb023923_Sorbi1 -------KN-----AGLA---------RCGKSCRL-RWT---------------------
Sb032167_Sorbi1 -------KL-----AGLQ---------RCGKSCRL-RWI---------------------
Sb031046_Sorbi1 VEVGAPGHL------------------NDGRRHRLDRLMLWRLRCDGGV--------GFV
Sb023642_Sorbi1 VEVGALERLPLAPVAGGVVVLMMIAADRGGRRRR--RLVVL-LQPEHGALILLTVTRGRR
. * *
AT2G16720.1 ---------------------------NYLRPDL-------------------KRGNFTH
Sb010610_Sorbi1 ---------------------------NYLRPDI-------------------KRGKFTL
Sb018705_Sorbi1 --------------------------PAALRQELQAAVDELPPPGPQARQLHRRRGRAHH
Sb027621_Sorbi1 ---------------------------NYLRPDI-------------------KRGKFTQ
Sb016715_Sorbi1 ---------------------------NYLRPDL-------------------KRGNFTQ
Sb009095_Sorbi1 ---------------------------NYLRPDL-------------------KRGNFTD
Sb010896_Sorbi1 ---------------------------NYLRPDL-------------------KRGLLSE
Sb031258_Sorbi1 ---------------------------NYLRPDI-------------------KRGKFSQ
Sb023923_Sorbi1 ---------------------------NYLRPDI-------------------KRGRFSF
Sb032167_Sorbi1 ---------------------------NYLRPDL-------------------KRGAFSQ
Sb031046_Sorbi1 GLERDGGDGAGAGVGDGAVRDGVDAPAKQLPPDVRV---------PVVLDLVVRPPREPR
Sb023642_Sorbi1 RLERDG--YVGRVLVDGAVCHRVDPPAQQLPPDVRV---------PVVLDLVVRPSRQPS
* :: :
AT2G16720.1 DEDELIIKLHSLLGNKWSLIAARLPGRTDNEIKNYWNTHIKRKLLSKGIDPATHRG----
Sb010610_Sorbi1 QEEQTIIQLHALLGNRWSSIATHLPKRTDNEIKNYWNTHLKKRLAKMGIDPVTHKP----
Sb018705_Sorbi1 PPAQP--PRQQVVSDRRA--AAGPDGQRDQEL-------LEHAHQAQAPGPR-HRPADAP
Sb027621_Sorbi1 EEEQTILQLHSVLGNKWSAIAKHLPGRTDNEIKNFWNTHLKKKLIQMGFDPMTHRP----
Sb016715_Sorbi1 EEDELIIKLHQILGNKWSLIAGRLPGRTDNEIKNYWNTHIKRKLIARGIDPRTHQP----
Sb009095_Sorbi1 DDDEIIIKLHALLGNKWSLIAGQLPGRTDNEIKNYWNTHIKRKLLSRGIDPQTHRP----
Sb010896_Sorbi1 EEEALVIDLHAQLGNRWSKIAARLPGRTDNEIKNHWNTHIKKKLKKMGIDPVTHRP----
Sb031258_Sorbi1 EEEQTILHLHSVLGNKWSAIATHLPGRTDNEIKNFWNTHLKKRLIQMGFDPMTHRP----
Sb023923_Sorbi1 EEEETIIQLHSILGNKWSAIAARLPGRTDNEIKNYWNTHIRKRLLRMGIDPVTHAP----
Sb032167_Sorbi1 DEEELIIELHAVLGNRWSQIAAQLPGRTDNEIKNLWNSCIKKKLRQKGIDPNTHKPL---
Sb031046_Sorbi1 GDERPLVAEEAV--------------QLDDEVVLVGGEVAALEVGAEVVDPA--------
Sb023642_Sorbi1 SDQGPFVAEEAV--------------ELDDELVLLFREVAALEVGAEVVDPP--------
. . *:*: .*
AT2G16720.1 -------------------INEAKISDLKKTKDQIV------------------------
Sb010610_Sorbi1 ------------------RADLGASSGSAAGAGAGARYRAAAHLNHTASW----------
Sb018705_Sorbi1 RARSQSRRRHGSRRRRGAPPGGGAAAPPRGRRRRPGG-PGQAPRREAGARGV-----VIR
Sb027621_Sorbi1 ------------------RTDFFAALPQLIALANLRQLVEQRPWDDHTARI-------QV
Sb016715_Sorbi1 -------------------ASAGAVAPAPGAAASAA-----APSSHRQHG----------
Sb009095_Sorbi1 -------------------LSGGAAAGSGLTTSSTAGFPAQAPAPTRPA-----------
Sb010896_Sorbi1 ------------------------------------------------------------
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Sb032167_Sorbi1 -----------------TEADRSGAAPTVSTERTSG----SSDVNPSSAGALGNLSHLLS
Sb031046_Sorbi1 ------------------EAAALAAAHQSGRLGQ--------------------------
Sb023642_Sorbi1 ------------------EAAALAAAQEAGGLGQ--------------------------
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Sb010610_Sorbi1 --ES-ARLEAEARLAREAK--------------LRAIVSPPPAPAPGPGTGPAFISGLES
Sb018705_Sorbi1 RRRQQQHRQQRRRQRRGAT-------VPR------------PQPQPRPVRGLAA------
Sb027621_Sorbi1 EAVQAAKLQCLQNLLQSA----------------ASIATS--------------------
Sb016715_Sorbi1 DDKAAAVVRSSGCSSRDS------------------------SGDDDSTSGSSV------
Sb009095_Sorbi1 --RPVIIIPPNVMFARPA-----------------------PSEDGHSSSGGSTD-----
Sb010896_Sorbi1 ------------------------------------------------------------
Sb031258_Sorbi1 DQQQAAKLQYLQSLLQSA----------------ATTISSSDTEAPALGLGAIC------
Sb023923_Sorbi1 --EPLANYPDLLRLAST------------------LLSSGPPAIGDHHQNGQLLPWILQA
Sb032167_Sorbi1 ETAQSSMLMPMYDKNRTETPNLARPKVPPKELFLEQLTAGHESPSTCRSSGQTLYFPFQQ
Sb031046_Sorbi1 --RPPAPFAVRADVRHQAVVLLL---GPR-------------------------------
Sb023642_Sorbi1 --RAPATLAVRLDVRHEAVVLLL---GPR-------------------------------
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Sb010610_Sorbi1 PTSTLS------FSESAQLFANA-----PPHDTHGTP--RHALTPPRS--YEEAFGELQP
Sb018705_Sorbi1 ---------AGGGCRHAHLAV--------------------PVLPP--------------
Sb027621_Sorbi1 -------------PSSSSINTNTI-----PSDLEQIG----LLSPP----------QMSS
Sb016715_Sorbi1 -------------PHQHQLVV-------GGIDLNL------SLSPP-----------TSQ
Sb009095_Sorbi1 ------------APRCPDL----------NLDLDL------SVGPP-----------CSP
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Sb031258_Sorbi1 -------------CSPPQLTTTPLDSCTAPVSSSLLPCTFPEAAPPVS--SEEDEANNHQ
Sb023923_Sorbi1 QMAQQA------AAAMAQ-----------------------QVAPP-------------P
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Sb031046_Sorbi1 ----------------------------ALVRVRLLA----ARRPPHR------------
Sb023642_Sorbi1 ----------------------------ALVGVRLLA----ARRPPHDGGVVVRSAGRAP
**
AT2G16720.1 QRE-------------ISTCTA--SRFYMENDME----------C---------------
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Sb027621_Sorbi1 LST----------LPSPSFLES-----ISGQDIAAA------------------------
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Sb009095_Sorbi1 PKT-------------PAAAVT--TPTSQQQEMQRA----TICLCYH-------------
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Sb031258_Sorbi1 QQQT------------AGLSSS-------YGGLGSA---DDVFACH--------------
Sb023923_Sorbi1 QQQAEQFMQAGAACQMPDLVHMNSNPTTVQQQLAAAHQDMAAAACHSMQPPNNTG-----
Sb032167_Sorbi1 ----------------PSALST-----SMGLNLPPDN-------------PRHGG-----
Sb031046_Sorbi1 ----------------PASCLA--FRFRFGYRF----------------AVWSGG-----
Sb023642_Sorbi1 NQS-----DAAT---LPAAFLV--LPFGSRRRFSSP---SSPLGC---VAGGSGGWLLLL
AT2G16720.1 ------SSE-------------------------------------TVKCQTENSSSISY
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Sb018705_Sorbi1 --VRLRG-----------------------------------------------------
Sb027621_Sorbi1 --GQLPDIQIPS--SFFEQQPTSNDANQHSDFTP------------KSSVEGENGTPKTL
Sb016715_Sorbi1 ------------------------------------------------------------
Sb009095_Sorbi1 --LGVRSGD-------------------------------------ACSCKT--------
Sb010896_Sorbi1 --LQIESIE---------------------------------------------------
Sb031258_Sorbi1 --GGSSSSSLPPLTDLSDA-------HAGSLL------------QVDGSMRSATAS--SS
Sb023923_Sorbi1 --YEVDSLDVPALMQMVQAADASNLQQWSSTVTSSSNNNNNNNNNVGSGVSTPSSSPVAR
Sb032167_Sorbi1 --TGIGSTAVDSF-------------YWDGT------------NPSSSSSTGSRGSNSMG
Sb031046_Sorbi1 --RRLR--------------------------------------------RAGRGASSA-
Sb023642_Sorbi1 LLLRVRS---------------------------------------RCEPRPKLG-----
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Sb009095_Sorbi1 -----AASPAGF-----------------------------RF-L--------------R
Sb010896_Sorbi1 -----------------------------------------RFSIEM-------------
Sb031258_Sorbi1 FGGGSSCSPLPW---------------------------PELF------------FPDDD
Sb023923_Sorbi1 LNHSTSTTTTTYG-----------GASA--STSNDAAAAAALFNMQLS-----------E
Sb032167_Sorbi1 FEPQSTSSILENSVFPWTNIG---QEKDTRAHLVEELKWPDLLHGPLPRRPQPCRTRARR
Sb031046_Sorbi1 -------------------IG---------------------------------------
Sb023642_Sorbi1 ------------------------------------------------------------
AT2G16720.1 SLEMK---
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Sb018705_Sorbi1 --------
Sb027621_Sorbi1 QF-ICEFV
Sb016715_Sorbi1 --------
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Sb010896_Sorbi1 ---VYKFV
Sb031258_Sorbi1 PF-ITDFL
Sb023923_Sorbi1 LLDVSDYM
Sb032167_Sorbi1 SM-MT---
Sb031046_Sorbi1 ---LEN--
Sb023642_Sorbi1 --------
BoxShade v3.31 C (beta, 970507) Output
AT2G16720.1 |
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Sb023923_Sorbi1 |
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Sb032167_Sorbi1 |
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Sb031046_Sorbi1 |
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Sb023642_Sorbi1 |
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Sb010610_Sorbi1 |
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Sb027621_Sorbi1 |
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Sb010896_Sorbi1 |
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Sb031258_Sorbi1 |
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Sb023923_Sorbi1 |
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Sb032167_Sorbi1 |
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