|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Get sequence file Get alignment file Get formatted file made by BOXSHADE Sequence file prepared (0 sec required). Alignment has started. CLUSTAL format alignment by MAFFT FFT-NS-2 (v7.475) AT2G24430.1 ----MEQ-----GDHQQHKKEEEALPPGFRFHPTDEELISYYLVNKIADQNFTGKAIADV pt025992_POPTR_ ----MESY-HHFDSGD------AHLPPGFRFHPTDEELITYYLLKKVLDSNFTGRAIAEV pt005566_POPTR_ ----ME------GD-----AKDETLPPGFRFHPTDEELITYYLQSKISDADFSCRAIGDV pt002040_POPTR_ ----MEELLCELSSEG---LNDQGLPPGFRFHPTDEELITFYLASKVFNGSFCGVEIAEV pt023097_POPTR_ ----MENI-SGLGKED---DDKMDLPPGFRFHPTDEELISHYLYKKVLDINFSARAIGDV pt023978_POPTR_ ----ME----------------ENLPPGFRFHPTDEELITCYLTRKVSDTSFTSKAMVDV pt009519_POPTR_ MEKDME------GD-----AKEETLPPGFRFHPTDEELITYYLQNKISDADFSCRAIGDV pt037992_POPTR_ MLA-MEELLCELTCED---INEQGLPPGFRFHPTDEELITFYLASKVFNGSFCGVDIAEV pt026936_POPTR_ ----ME----------------ESLPPGFRFHPTDEELITCYLTRKVSDISFTSKAVVDV pt031417_POPTR_ ----MESY-HHFGDGD------THLPPGFRFHPTDEELITYYLLKKVLDRNFTGRAIAEV ** ***************: ** *: : .* : :* AT2G24430.1 DLNKSEPWELPEKAKMGGKEWYFFSLRDRKYPTGVRTNRATNTGYWKTTGKDKEIFNSTT pt025992_POPTR_ DLNKCEPWELPGKAKMGEKEWYFFNLRDRKYPTGLRTNRATEAGYWKATGKDREIYSSKT pt005566_POPTR_ DLNKCEPWDLPGKAKMGEKEWYFFSLRDRKYPTGVRTNRATNTGYWKTTGKDKEIFNSVT pt002040_POPTR_ DLNRCEPWELPDVAKMGEREWYFFSLRDRKYPTGLRTNRATGAGYWKATGKDREVYSAST pt023097_POPTR_ DLNKSEPWELPWKAKMGEKEWYFFCVRDRKYPTGLRTNRATEAGYWKATGKDKEIYRGKS pt023978_POPTR_ DLNKCEPWDLPGKASMGEKEWYFFSLRDRKYPTGLRTNRATEAGYWKTTGKDKEIFRAGV pt009519_POPTR_ DLNKCEPWDLPGKAKMGEKEWYFFSLRDRKYPTGVRTNRATNTGYWKTTGKDKEIFNSVT pt037992_POPTR_ DLNRCEPWELPDVAKMGEREWYFFSLRDRKYPTGLRTNRATGAGYWKATGKDREVYSAST pt026936_POPTR_ DLNKCEPWDLPGKASMGEKEWYFFSLRDRKYPTGLRTNRATEAGYWKTTGKDREIFRAGV pt031417_POPTR_ DLNKCEPWELPGKAKMVEKEWYFFSLRDRKYPTGLRTNRATEAGYWKATGKDREIHSSKT ***:.***:** *.* :***** :********:****** :****:****:*:. . AT2G24430.1 SELVGMKKTLVFYRGRAPRGEKTCWVMHEYRLHSKSSY----RTSKQDEWVVCRVFKKTE pt025992_POPTR_ GALVGMKKTLVFYRGRAPKGEKSNWVMHEYRLEGKFAYHYLSRCSK-DEWVISRVFQKSC pt005566_POPTR_ SQLVGMKKTLVFYRGRAPRGEKTNWVMHEYRFHSKAAF----RASK-DEWVVCRVFQKSA pt002040_POPTR_ GALLGMKKTLVFYKGRAPRGEKTKWVMHEYRLDGDFSYR---HTCK-DEWVICRIFHKKG pt023097_POPTR_ --LVGMKKTLVFYKGRAPKGEKTNWVMHEYRLEGKFSAHNLPKTAK-NEWVICRVFQKSS pt023978_POPTR_ --LVGMKKTLVFYRGRAPRGEKSNWVMHEYRLDDKHPF----KSTK-EEWVVCRVFQKST pt009519_POPTR_ SQLVGMKKTLVFYRGRAPRGEKTNWVMHEYRVHAKAGF----RASKQDEWVVCRIFQKSA pt037992_POPTR_ GALLGMKKTLVFYKGRAPRGEKTKWVMHEYRLDGDFSYR---HSCK-EEWVICRIFHKKG pt026936_POPTR_ --LVGMKKTLVFYKGRAPRGEKSNWVMHEYRLENRHPF----KSTK-EEWVVCRIFQKST pt031417_POPTR_ GALVGMKKTLVFYRGRAPEGGKSNWVMHEYRLEGKFAYHYLSGCSK-DEWVISRVFQKSC *:*********:****.* *: *******.. * :***:.*:*:*. AT2G24430.1 ATKKYISTSSSSTS---------------------------------------------- pt025992_POPTR_ SGAASGG--SGSAPKKNRFNTTINLYTEASSPS-SVSLPPLL-DATTTLTT---AASTTT pt005566_POPTR_ GVKKYPS----------------------------------------------------- pt002040_POPTR_ EKKDVFLQAEQGYH-----------LWEVYSPANSGSLPPLL-DASASLFD-QCQSKNKV pt023097_POPTR_ AGKKTYI--SGLVRLGS--------FGNEFSP---YGLPPLT-DSSPSNGKIRPVAESAY pt023978_POPTR_ EVKKPQQEPSSQQSLGSPCDTN-SIVNDKFGD-----------IANSSSG---------- pt009519_POPTR_ GAKKYPS----------------------------------------------------- pt037992_POPTR_ EKKNVFLQAGQGYH-----------LMEASSPANSGSLPPLL-EASASIFD-QCQSKNTV pt026936_POPTR_ AVKKPQQEPSSQQSLGSLCDTN-SIVNDQYGD---IELPNLNRIANSSSG---------- pt031417_POPTR_ GGAAA-S--SGNITKKNRFDTTINLYTEANSPS-SVSLPPLL-DATTTVT-------TTT AT2G24430.1 ---------HHHNNHTRASILST--------NNNNP-NYSSDLLQLP----PHLQ-P--- pt025992_POPTR_ LNDRDSCSYDSHTQHEHVSCFSTIAAAASAAAKHNSNNFDLAPLPPPPMTDSFSRFPRNT pt005566_POPTR_ -------------NQSRAA---------------NP--YN---LEIG----PSVI-P--- pt002040_POPTR_ IDALQNAFLIPEHQENDLKSIPNPLVSQSHVLSING-------------LQPSFS-PTPI pt023097_POPTR_ VPCFSNLSDDQRNQQDTTDS------------FNNH-LFAVS-------SNPSEVFPRIP pt023978_POPTR_ ---FNNILAHSYNNESNVNV------------DSHM-NWAAA-REAA--TLPSLAWP--- pt009519_POPTR_ -------------NQSRAG---------------NP-LYN---LEIG----PSVM-P--- pt037992_POPTR_ VEAFQNAFLIHEHQENDLKSLLNPLVSQSNAMSING-------------FQPCFS-PTSI pt026936_POPTR_ ---FSNISAHTYNNESNVNM------------NLNM-NWAAA-REAAHTTLPSLSWP--- pt031417_POPTR_ LNDRDSCSYDNHTQHEHVSCFSTIAAAAYAAANNNI-NFDIAQLPPPPMTDPFSTFPGNT :. : . * AT2G24430.1 -------HPSLNINQS------------------------LMANAVHLAELS-RVFR--- pt025992_POPTR_ GANGF--PSLRSLQENL------QLP-------------FFFSSPPSAAPVP-PFHG--- pt005566_POPTR_ -------SQMMQAAENI------QLP---------IGRNYMMSNAELQAELT-RVFR--- pt002040_POPTR_ SIN----STATSTNKNTNTDNNNQSP-------SMLFKSILSYQDCTLK----------- pt023097_POPTR_ LLNSFYSPQAVAASGNL------QYPGSVSIQDRSVLKALIENQGSNMKQQSSKLER--- pt023978_POPTR_ -------SGLLSTN--------------------------LTMNSLLLKALQLRSYQ--- pt009519_POPTR_ -------SQMMQAADNF------QLP---------IGRNYMMSNAELQAELA-RVFR--- pt037992_POPTR_ SIN----STTTSTNKNTDTNTNNQSP-------SMLFKSILSYQDCALKEQSSTLYKQCN pt026936_POPTR_ -------PGLLSSN--------------------------LTTNSLLLKALQLRSYQ--- pt031417_POPTR_ GVNCF--PSLRSIQENL------QLP-------------FLFASPASAVAVP-PFHG--- : . AT2G24430.1 ASTSTT----MDSSHQQLMNYTH------------MPVSGLNLNLGGALVQP------PP pt025992_POPTR_ GGA--A----MNWMVNPEE----------------GRFDGTGAGIGA-GGRVAM----GP pt005566_POPTR_ AGGSTG----INLPMQSPLNNTYSVGGGGPGGGGCFTISGLNLNLGGAASQPMLRPMAPP pt002040_POPTR_ TEASFS----HDATFGGVDKITHPHPYLNNPLFFEMDCSSNVLGFSGSASAA-------- pt023097_POPTR_ DMASVS----QDSAADMNN-----------------EISSVISNLEA-GKRSFDEQEAPP pt023978_POPTR_ QREATT----TNYSFLTNG-IPHEYG------------AALGSNFQA-SSSKVLDSAPQP pt009519_POPTR_ AGGSTG----INLPMQSPLNNSYSVGG---GAGGCFTVSGLNLNLGGATSQPVLRPMPPP pt037992_POPTR_ TEANFSHFQLHDAHLGCVDKIIHPNPYQNNPLFFEMDCSSNILGFSESASAA-------- pt026936_POPTR_ QREATT----TDYSFLTNGNIVHEFG------------TDLGSNFQASSSSKVLDSVPQP pt031417_POPTR_ GGATTT----MNWMLDENE----------------IE-------------KII------- : AT2G24430.1 VVSLEDV---------------AAVSASYNGENGFGN----VEMSQCMDLDG-YWPSY-- pt025992_POPTR_ -----------------------------------------------TELDC-MWTY--- pt005566_POPTR_ VMNQQDA---------------AAYGAEMNTANGHANR--FMGMEQCMDLEN-YWPPY-- pt002040_POPTR_ ----------------------DTIIHDMSTSIGFSRAGLQMMLDTPIRLPGESWPLDP- pt023097_POPTR_ -----------------------------------------CTLVQSMDLDC-FWNY--- pt023978_POPTR_ ------------------------------------------QQEQPFSLDS-INCTGKV pt009519_POPTR_ VMNQHDVTPSMMTSTSSYAVEQAAYGAEMNNANGPSNR--FMGMQQCMDLEN-YWPAY-- pt037992_POPTR_ ----------------------DTIAHDMSTSIAFSRAGLQMMLDTPIRLPAESWPFDP- pt026936_POPTR_ ------------------------------------------QQEQPFNLDS-IW----- pt031417_POPTR_ ------------------------------------------------------------ AT2G24430.1 --------- pt025992_POPTR_ --------- pt005566_POPTR_ --------- pt002040_POPTR_ --------- pt023097_POPTR_ --------- pt023978_POPTR_ SKRSSVKLV pt009519_POPTR_ --------- pt037992_POPTR_ --------- pt026936_POPTR_ --------- pt031417_POPTR_ ---------
|