Input
| Putative repression domain
|
|
AT2G26580.1 |
not found |
|
Ortholog
| Putative repression domain
| Reverse top hit
| Relation
| Blast score ratio
| Type
|
Os014122 |
not found in 186aa |
AT2G26580.2 |
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III |
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not found in 207aa |
AT2G26580.2 |
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III |
Os041929 |
not found in 207aa |
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not_not |
0.525222551 |
III |
Os008985 |
not found in 256aa |
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III |
Os018243 |
not found in 266aa |
AT2G45190.1 |
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III |
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not found in 169aa |
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III |
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III |
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not found in 280aa |
AT1G08465.1 |
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not found in 431aa |
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III |
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not found in 181aa |
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not found in 181aa |
AT1G08465.1 |
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not found in 181aa |
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not found in 183aa |
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III |
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not found in 188aa |
AT1G08465.1 |
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0.554896142 |
III |
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not found in 215aa |
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III |
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not found in 215aa |
AT2G45190.1 |
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AT2G45190.1 |
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AT1G08465.1 |
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III |
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III |
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AT1G23420.1 |
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0.442136498 |
III |
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AT1G23420.1 |
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0.421364985 |
III |
Get sequence file
Get alignment file
Get formatted file made by BOXSHADE
Sequence file prepared (0 sec required). Alignment has started.
CLUSTAL format alignment by MAFFT FFT-NS-2 (v7.475)
AT2G26580.1 ------------------------------------------------------------
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: :
AT2G26580.1 FCNIILAVNVPCSS---LFDIVTVRCGHCTNLWSVNMAAAL-QS----------------
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Sb027997_Sorbi1 CCDTILAVGVPCSS---LFKTVTVRCGHCANLLSVNLRGLL-LP-PAAPPANHLN----F
Os014122_Os03t0 FCNTIFAVSVPSNS---MLNIVTVRCGHCTSLLSVNLRGLV-QA----------------
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*.:* . *:* **:* : :. .
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pt029907_POPTR_ ---------LPL-Q-------D--P------QKLLLIN--SEDLN-KNFG---SSSKCNK
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